DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mcm6 and Mcm6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_511065.1 Gene:Mcm6 / 31603 FlyBaseID:FBgn0025815 Length:817 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_058983.1 Gene:Mcm6 / 29685 RGDID:61967 Length:821 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:817 Identity:513/817 - (62%)
Similarity:639/817 - (78%) Gaps:26/817 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    13 VKDEVGIRAQKLFQDFLEEFK-EDGEIKYTRPAASLESPDRCTLEVSFEDVEKYDQNLATAIIEE 76
            |:|||..:.||||.||||||: .||||||.:.|..|..|:|.||.|||.|:|:::|.|:|.|.||
  Rat    18 VRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQGSDGEIKYLQFAEELIRPERNTLVVSFADLEQFNQQLSTTIQEE 82

  Fly    77 YYHIYPFLCQSVSNYVKDRIGLKTQKDCYVAFTEVPTRHKVRDLTTSKIGTLIRISGQVVRTHPV 141
            :|.:||:||:::..:||||..:...||.||||.::|||||:|:||:|:||.|.||||||||||||
  Rat    83 FYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIPFAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPV 147

  Fly   142 HPELVSGVFMCLDCQTEIRNVEQQFKFTNPTICRNPVCSNRKRFMLDVEKSLFLDFQKIRIQETQ 206
            |||||||.|:||||||.|::||||||:|.|:|||||||:|||||:||..||.|:||||:||||||
  Rat   148 HPELVSGTFLCLDCQTVIKDVEQQFKYTQPSICRNPVCANRKRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQ 212

  Fly   207 AELPRGCIPRAVEIILRSELVETVQAGDRYDFTGTLIVVPDVSVLAGVGTRAENSSRHKPGEG-- 269
            ||||||.|||::|::||:|.||:.|||||.|||||||||||||.|:..|.|||.:||....:|  
  Rat   213 AELPRGSIPRSLEVVLRAEAVESAQAGDRCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGADGYE 277

  Fly   270 MDGVTGLKALGMRELNYRMAFLACSVQATTARFGGTDLPMSEVTAEDMKKQMTDAEWHKIYEMSK 334
            .:|:.||:|||:|:|:||:.||||.|..|..||||.:|...|.|||.:|.|||..||.|::|||:
  Rat   278 TEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACYVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKVFEMSQ 342

  Fly   335 DRNLYQNLISSLFPSIYGNDEVKRGILLQQFGGVAKTTTEKTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLK 399
            |:|||.||.:||||:|:||||||||:||..||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||
  Rat   343 DKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGDPSTAKSQFLK 407

  Fly   400 QVSDFSPRAIYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESFDFVIEAGALMLADNGICCIDEFDKMDQRDQVA 464
            .|.:|||||:||||||||||||||||||||||.:||||||||||||||:||||||||||.|||||
  Rat   408 HVDEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVCCIDEFDKMDMRDQVA 472

  Fly   465 IHEAMEQQTISIARAGVRATLNARTSILAAANPINGRYDRSKSLQQNIQLSAPIMSRFDLFFILV 529
            ||||||||||||.:|||:|||||||||||||||::|.|||||||:|||.||||||||||||||||
  Rat   473 IHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPVSGHYDRSKSLKQNINLSAPIMSRFDLFFILV 537

  Fly   530 DECNEVVDYAIARKIVDLHSNIEESVERAYTREEVLRYVTFARQFKPVISQEAGHMLVENYGHLR 594
            ||||||.||||||:||||||.||||::|.|:.:::.||:.|||||||.||:|:...:||.|..||
  Rat   538 DECNEVTDYAIARRIVDLHSRIEESIDRVYSLDDIRRYLLFARQFKPKISKESEDFIVEQYKRLR 602

  Fly   595 QRDTGTSGRSTWRITVRQLESMIRLSEAMAKLECSNRVLERHVKEAFRLLNKSIIRVEQPDIHLD 659
            |||.....:|:||||||||||||||||:||::.|.:.|..:|||||||||||||||||.||::||
  Rat   603 QRDGSGITKSSWRITVRQLESMIRLSESMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLD 667

  Fly   660 DDEGLDMD-----DGIQHDIDMENNGAAANVDENNGMDTSASGA----VQKKKFTLSFEDYKNLS 715
            .:|.:.|:     .||        ||.|.:....||.:.|...|    |.|....|.|.:|..:|
  Rat   668 QEEEIQMETDEGPGGI--------NGHADSPAPVNGFNGSGEDASQETVPKPSLRLGFAEYCRIS 724

  Fly   716 TMLVLHMRAEEARCEVEGNDTGIKRSNVVTWYLEQVADQIESEDELISRKNLIEKLIDRLIYHDQ 780
            .::|||:|    :.|.|.:::.:|||.:|.|||:::..:|:||:|||::|.:|||::.||.::|.
  Rat   725 NLIVLHLR----KMEEEEDESALKRSELVNWYLKEIESEIDSEEELINKKRIIEKVVHRLTHYDH 785

  Fly   781 VIIPLKTSTLKPRIQVQKDFVEEDDPLLVVHPNYVVE 817
            |:|.|..:.||...:..:.:  |:||.|||:|||::|
  Rat   786 VLIELTQAGLKGSSEGSESY--EEDPYLVVNPNYLLE 820

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mcm6NP_511065.1 MCM_N 22..109 CDD:464206 47/87 (54%)
MCM 113..649 CDD:475121 393/537 (73%)
MCM6_C 702..816 CDD:465688 44/113 (39%)
Mcm6NP_058983.1 MCM_N 27..116 CDD:464206 48/89 (54%)
MCM 119..657 CDD:475121 395/539 (73%)
MCM6_C 711..817 CDD:465688 41/105 (39%)

Return to query results.
Submit another query.