DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment HMGCR and hmgcr

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011541659.1 Gene:HMGCR / 3156 HGNCID:5006 Length:908 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002934890.2 Gene:hmgcr / 100380121 XenbaseID:XB-GENE-5840593 Length:883 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:900 Identity:728/900 - (80%)
Similarity:802/900 - (89%) Gaps:29/900 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    21 MLSRLFRMHGLFVASHPWEVIVGTVTLTICMMSMNMFTGNNKICGWNYECPKFEEDVLSSDIIIL 85
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.||||||||||||||||
 Frog     1 MLSRLFRMHGQFVASHPWEVIVGTVTLTICMMSMNMFTGNDKICGWNYACPKFEEDVLSSDIIIL 65

Human    86 TITRCIAILYIYFQFQNLRQLGSKYILGIAGLFTIFSSFVFSTVVIHFLDKELTGLNEALPFFLL 150
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog    66 TITRCIAILYIYFQFQNLRQLGSKYILGIAGLFTIFSSFVFSTVVIHFLDKELTGLNEALPFFLL 130

Human   151 LIDLSRASTLAKFALSSNSQDEVRENIARGMAILGPTFTLDALVECLVIGVGTMSGVRQLEIMCC 215
            |||||:||.|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   131 LIDLSKASALAKFALSSNSQDEVRDNIARGMAILGPTFTLDALVECLVIGVGTMSGVRQLEIMCC 195

Human   216 FGCMSVLANYFVFMTFFPACVSLVLELSRESREGRPIWQLSHFARVLEEEE-NKPNPVTQRVKMI 279
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||| |||||||||||||
 Frog   196 FGCMSVLANYFAFMTFFPACVSLVLELSRESREGRPIWQLSQFASVLEEEEDNKPNPVTQRVKMI 260

Human   280 MSLGLVLVHAHSRWIADPSPQNSTA-DTSKVSLGLDENVSKRIEPSVSLWQFYLSKMISMDIEQV 343
            |||||||||||||||::||.||||: ...:||..||:.:.||:|||:.|||||||:|::||:||:
 Frog   261 MSLGLVLVHAHSRWISEPSSQNSTSIGDHEVSTMLDDMMPKRVEPSMPLWQFYLSRMVTMDVEQI 325

Human   344 ITLSLALLLAVKYIFFEQTETESTLSLKNPITSPVVTQKKVPDNCCRREP-----MLVRNNQKCD 403
            |||.||||||||||||||||||||.||||||.|||..|||..::||||||     ::|.:.:...
 Frog   326 ITLGLALLLAVKYIFFEQTETESTFSLKNPIISPVAVQKKQAESCCRREPEQEKTVIVSSTEDAS 390

Human   404 SVEEETGINRERKVEVIKPLVAETDTPNRATFVVGNSSLLDTSSVLVTQEPE-----IELPREPR 463
            |.||        |..||:||..||..  :|.|:||:||.::.|       ||     .:||.|||
 Frog   391 SKEE--------KEAVIRPLPLETSP--KAKFMVGDSSPVELS-------PEEKNTSFDLPEEPR 438

Human   464 PNEECLQILGNAEKGAKFLSDAEIIQLVNAKHIPAYKLETLMETHERGVSIRRQLLSKKLSEPSS 528
            |.:||::||.|.:|||::|:|||:|.||||||||||||||:||:.||||::|||:|:.||.:||:
 Frog   439 PLDECVRILKNPDKGAQYLTDAEVISLVNAKHIPAYKLETMMESPERGVAVRRQMLADKLPQPSA 503

Human   529 LQYLPYRDYNYSLVMGACCENVIGYMPIPVGVAGPLCLDEKEFQVPMATTEGCLVASTNRGCRAI 593
            ||.|||::||||||||||||||||||||||||||||.|:.||:||||||||||||||||||||||
 Frog   504 LQSLPYKNYNYSLVMGACCENVIGYMPIPVGVAGPLFLNNKEYQVPMATTEGCLVASTNRGCRAI 568

Human   594 GLGGGASSRVLADGMTRGPVVRLPRACDSAEVKAWLETSEGFAVIKEAFDSTSRFARLQKLHTSI 658
            .|||||.|||||||||||||||||.|||:|||||||::.|||.|||:|||||||||||.:|.|.:
 Frog   569 MLGGGARSRVLADGMTRGPVVRLPTACDAAEVKAWLDSMEGFKVIKDAFDSTSRFARLGRLQTCV 633

Human   659 AGRNLYIRFQSRSGDAMGMNMISKGTEKALSKLHEYFPEMQILAVSGNYCTDKKPAAINWIEGRG 723
            |||||||||||::||||||||||||||||||:|.|.|||:.:|||||||||||||||||||||||
 Frog   634 AGRNLYIRFQSKTGDAMGMNMISKGTEKALSRLQEEFPELHVLAVSGNYCTDKKPAAINWIEGRG 698

Human   724 KSVVCEAVIPAKVVREVLKTTTEAMIEVNINKNLVGSAMAGSIGGYNAHAANIVTAIYIACGQDA 788
            |||||||:|||:|||||||::|||::||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   699 KSVVCEAIIPARVVREVLKSSTEALVEVNINKNLIGSAMAGSIGGYNAHAANIVTAIYIACGQDA 763

Human   789 AQNVGSSNCITLMEASGPTNEDLYISCTMPSIEIGTVGGGTNLLPQQACLQMLGVQGACKDNPGE 853
            |||||||||||:|||:||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..:.||:
 Frog   764 AQNVGSSNCITIMEATGPMNEDLYISCTMPSIEIGTVGGGTNLAPQQACLQMLGVQGASTEAPGK 828

Human   854 NARQLARIVCGTVMAGELSLMAALAAGHLVKSHMIHNRSKINLQDLQGACTKKTA 908
            ||.|||:|||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||.|.||||.|
 Frog   829 NACQLAQIVCGTVMAGELSLMAALAAGHLVKSHMVHNRSKMNLQDLPGTCTKKAA 883

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
HMGCRXP_011541659.1 2A060605 21..908 CDD:273339 727/898 (81%)
hmgcrXP_002934890.2 2A060605 1..883 CDD:273339 727/898 (81%)

Return to query results.
Submit another query.