Protein Alignment Ptp4E and tnr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_525076.2
• Gene: Ptp4E / 31425
• FlyBaseID: FBgn0004368
• Length: 1767
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_919364.1
• Gene: tnr / 369191
• ZFINID: ZDB-GENE-030804-1
• Length: 1350
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1166
• Identity: 241/1166 - (20%)
• Similarity: 429/1166 - (36%)
• Gaps: 245/1166 - (21%)

  Fly   143 WTVNITTAPDPPANLSVQLRSSKSAFITWRPPGSGRYSGFRIRVLGLTD--LPFERS----YSLE 201
            :|.:..|:..||.||.|:..|..:..:.|..|..            |||  :.:|.:    ..||
Zfish   313 YTGDDCTSVLPPMNLRVRGVSENTIDLQWEGPAI------------LTDYLITYEPTTPGGVQLE 365

  Fly   202 ----GNETLQLSAKELTPGGSYQVQAYSVYQGKESVAYTSRNFTTKPNTPGKFIVWFRN--ETTL 260
                ||.| .::.|.|.||..|.|..|:|.....|....:...|...|..|   :.|::  ||::
Zfish   366 MRVPGNVT-NITIKGLNPGLEYNVNVYAVIDNIISSPMNTLVSTYLSNPDG---LLFKSIMETSV 426

  Fly   261 LVLWQPPFPAGIYTHYRVSITPDDAIQSVLYVEREG----EPPGPAQAAFK-GLVPGREYNISVQ 320
            .|.|||  ...::..:.:|..|.|         .:|    :.|....:..: ||.||.||.:::.
Zfish   427 EVQWQP--LDYLFDGWEISFIPKD---------NDGGMTAQLPSTITSFHQTGLKPGEEYTVNLV 480

  Fly   321 TVSEDETSSVPTTARYLTVPERVLNVTFDEAYTTSSSFRVRWEPPRTYSEFDAYQVML------- 378
            .: :|:..|:|.||...|:.:..:.:...:...|.:.  |.|.||:...:    |::|
Zfish   481 AL-KDQGRSLPVTATVTTLIDGPIQLIVRDISDTVAF--VEWSPPKAKVD----QIILRYGLVGV 538

  Fly   379 STSRRIFNVPRAANGDSVYFDYPDILEPGRTYEVVVKTIADNVNSWPASGEVTLR---PRPVRSL 440
            ...:..|.:....:..|:     .:|.||.||||.|..:.:...|...|.|.|..   |:.:|
Zfish   539 EGPKTTFRLQPTLSQYSL-----QVLRPGSTYEVSVSGVRNGTESGVISTEFTTEIDAPKNLR-- 596

  Fly   441 GGFLDDRSNALHISWEPAETGRQDSYRISYH----EQTNASEVP---APFPVAAESQITTNLTEY 498
              .|...|.:|.:.|:.:|.. .:.|.:.|.    :|.:...||   .|            .|:.
Zfish   597 --VLSKTSISLELEWDNSEAD-VEGYSVVYSTLAGDQYDKVIVPRNDGP------------STKT 646

  Fly   499 TLDSLLAGRRYLIAVQALSKGVASNASDITRYTRPAAPL-IQELRSIDQGLMLSWRSDVNSRQDR 562
            ||:.|:.|..|.|.:.|:.....|..:.:...|....|| :....|.|..:.|.| ..|....|.
Zfish   647 TLNELMPGTEYGIGISAVLGANQSTPATMNARTGLDVPLDLTVTASTDNTITLLW-GTVQGPIDH 710

  Fly   563 YEVHY-QRNGTREERTMATNETSLTIHYLHPGSGYEVKVHAISHGVRSEPHSYFQAVFP-KPPQN 625
            |.|.| ..:|...|.|:..:.|:.|:..|.||:.|.:.| |...|.:....:...|... :|...
Zfish   711 YRVTYTSSSGVTTELTVPKDVTTTTLTSLQPGTEYTITV-AAQRGRQQSTAATIDAFTGFRPITQ 774

  Fly   626 LTLQTVHTNLVVLHWQAPEGSDFSEYVVRYRTDASPWQRISGLHENEARI--KDMHYGERYLVQV 688
            |....|.::.:.:.|.:| ......:::.|....|.......|..::.||  ..:....||...:
Zfish   775 LFFSEVSSDSLTVAWSSP-APPADAFILNYSAQDSSEDSEIALDGSKTRITLTGLMPSRRYTATL 838

  Fly   689 NTVSFGVES-PHPLELNVTM-PPQPVSNVVPLVDSRNLTLEWPRPDGHVDFYTLKWWPTDEEDRV 751
            .|:...|.| |....:|..| ||:.::  |..|...::|:.|.:|...:|:|.:.:    :..:.
Zfish   839 VTMHGNVTSKPVVGSVNTGMDPPRDIT--VLYVTEESVTITWIQPLALLDYYRMSY----QSSKG 897

  Fly   752 EFKNVTQLEDLSSPSVRIPIEDLSPGRQYRFEVQASSNGIRSG-------TTHLSTRTMPLIQSD 809
            ...:|....|:::    ..:..|.|..:|..::    |.:|..       ||..:...||.
Zfish   898 RMDSVVIDSDINN----YTLTSLHPATEYEIKL----NAVRGSQESKVITTTVFTAIDMPA---- 950

  Fly   810 VFIANAGHEQGQDETITLSYTP--------TPADSTRFDIYRFSMGDPTIKDKEKLANDTERKLS 866
                         |...|:.||        .||.|.  |.|..::....:.....|....:::..
Zfish   951 -------------ELTALNVTPQGALLRWNPPASSV--DNYVLTVTRNQVTADTFLVEGNKQEYQ 1000

  Fly   867 FSGLTPGKLYNVTVWTVSGGVASLPVQRLYRLHPLPI-SDLKAIQVAAREITLHWTAPAGEYTDF 930
            .|.|.|...|:|.::...|.:.|..|...: :.|:.. .:|.|.::..|...:.|..|..:..::
Zfish  1001 LSQLIPSTTYSVALYATKGPLTSGTVISNF-VTPMDAPQNLTASEINHRSALISWQPPIADIDNY 1064

  Fly   931 ELQYLSADEEAPQLLQNVTKNTEITLQGLRPYHNYTFTVVVRSGSIQGTDFADVSVSTLMRSSAP 995
            .|.|.:||....:|:.: .::|.|.|:||.....||..:.|..|               :.:|..
Zfish  1065 MLTYKAADGSRKELILD-AEDTWIRLEGLAETTEYTVRLQVARG---------------LETSVI 1113

  Fly   996 ISASYQT---LTAPP--------------GKVDYFQPSDVQPG-----EVTFE---WSLEPAEQH 1035
            :|.|:.|   |...|              |....:...|:..|     ::|.:   |.:....|:
Zfish  1114 VSTSFTTGNRLFPTPQNCAQHLLNGETLGGIYTIYVNRDLSQGVQVYCDMTTDGGGWIVFQRRQN 1178

  Fly  1036 GPIDY-----------------FRITCQNADDAADVSSYEFPVNATQGKIDGLVPGNHYIFRIQA 1083
            |..|:                 |.:...|....|....||..::...|:..  |..|:..|.|..
Zfish  1179 GLTDFSRKWTDYKIGFGSLEDEFWLGLDNIHKIAAQGRYELRIDMKDGQES--VYANYDRFSIGD 1241

  Fly  1084 KSALGY-----------GAEREHIQTMPILAPPVPEPSVTPLEVSRTSSTIEISFRQG-YFSNAH 1136
            ..:| |           |....:.|:.|.        |....:.....:...:|::.. ::.|.|
Zfish  1242 SKSL-YKLRIGEYSGTAGDSLSYHQSRPF--------STKDKDNDIAVTNCALSYKGAWWYKNCH 1297

  Fly  1137 --GMVRSYTIIIAEDVGKNASGLEMPSWQDVQAYTVWLPY--QAIEPYNPFLTSNGSRKSS 1193
              .:...|      ...:::.|:   :|...:.:...:|:  ..:.|:| :.:.:|.|:.|
Zfish  1298 RANLNGKY------GESRHSQGI---NWYHWKGHEFSIPFVEMKMRPFN-YRSISGKRRRS 1348

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptp4E	NP_525076.2	FN3	<94..>334	CDD:442628	52/207 (25%)
		fn3	247..328	CDD:394996	20/87 (23%)
		FN3	319..>749	CDD:442628	101/453 (22%)
		fn3	708..796	CDD:394996	16/94 (17%)
		fn3	902..978	CDD:394996	19/76 (25%)
		fn3	1013..1092	CDD:394996	20/114 (18%)
		PTP_tm	1127..1247	CDD:465889	11/72 (15%)
		R3-PTPc	1358..1579	CDD:350396
tnr	NP_919364.1	EGF_Tenascin	199..226	CDD:480934
		EGF_Tenascin	230..257	CDD:480934
		C_rich_MXAN6577	234..>318	CDD:469225	1/4 (25%)
		fn3	323..401	CDD:394996	26/90 (29%)
		fn3	411..490	CDD:394996	22/93 (24%)
		FN3	<506..947	CDD:442628	104/485 (21%)
		fn3	949..1019	CDD:394996	16/88 (18%)
		fn3	1035..1103	CDD:394996	17/68 (25%)
		FReD	1126..1336	CDD:238040	32/229 (14%)