Protein Alignment Ptp4E and Ptprd

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_525076.2
• Gene: Ptp4E / 31425
• FlyBaseID: FBgn0004368
• Length: 1767
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_063144608.1
• Gene: Ptprd / 313278
• RGDID: 1561090
• Length: 1938
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1745
• Identity: 422/1745 - (24%)
• Similarity: 655/1745 - (37%)
• Gaps: 460/1745 - (26%)

  Fly    98 GFPEPNTT-------IPASDIGKDIK--FSRALPGTEYNFWLYYTNSTHREQLTW----TVNITT 149
            |.|:|..|       :..|:....||  .|.::.||.....|....|...:|..:    |.:..|
  Rat   158 GNPDPEITWFKDFLPVDTSNNNGRIKQLRSESIGGTPIRGALQIEQSEESDQGKYECVATNSAGT 222

  Fly   150 APDPPANLSV-QLRSSKSAFITWRPPGSGRYSGFRIRVLGLTDLPFERSYSLEGNETLQLSAKEL 213
            ....||||.| :||..:..     ||   |:|                         :..:..|:
  Rat   223 RYSAPANLYVRELREVRRV-----PP---RFS-------------------------IPPTNHEI 254

  Fly   214 TPGGSYQVQAYSVYQGKESVAYTSRNFTTKPNTPGKFIVWFRNETTLLVLWQPPFPAGIYTHYRV 278
            .||||..:...:|                  .:|..::.|......|..  :...|.|     |.
  Rat   255 MPGGSVNITCVAV------------------GSPMPYVKWMLGAEDLTP--EDDMPIG-----RN 294

  Fly   279 SITPDDAIQSVLY----VEREGEPPGPAQAAFKGL--VPGREYNISVQTVSEDETSSVPTTARYL 337
            .:..:|..||..|    :...|.....||...|.|  .||      ...|:|...:|:
  Rat   295 VLELNDVRQSANYTCVAMSTLGVIEAVAQITVKALPKPPG------TPVVTESTATSI------- 346

  Fly   338 TVPERVLNVTFDEAYTTSSSFRVRWEPPRT----YSEFDAYQVMLSTSRRIFNVPRAANGDSVYF 398
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  Rat   347 -------TLTWDSGNPEPVSYYIIQHKPKNSEEPYKEIDG----IATTR--YSVA----GLSPYS 394

  Fly   399 DYPDILEPGRTYEVVVKTIADNVNSWPASGEVTLR---------PRPV--RSLGGFLDDRSNALH 452
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  Rat   395 DY--------EFRVVA---VNNIGRGPASEPVLTQTSEQAPSSAPRDVQARMLS------STTIL 442

  Fly   453 ISW-EPAE-TGRQDSYRISY-------------HEQTNASEVPAPFPVAAESQITTNLTEYTLDS 502
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  Rat   443 VQWKEPEEPNGQIQGYRVYYTMDPTQHVNNWMKHN-------------VADSQIT------TIGN 488

  Fly   503 LLAGRRYLIAVQAL-SKGVASNASDITRYTR---PAAPL-IQELRSIDQGLMLSW---RSDVNSR 559
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  Rat   489 LVPQKTYSVKVLAFTSIGDGPLSSDIQVITQTGVPGQPLNFKAEPESETSILLSWTPPRSDTIA- 552

  Fly   560 QDRYEVHYQRNGTREERTMATNE--TSLTIHYLHPGSGYEVKVHAIS-------------HGVRS 609
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  Rat   553 --SYELVY-RDGDQGEEQRITIEPGTSYRLQGLKPNSLYYFRLSARSPQGLGASTAEISARTMQS 614

  Fly   610 EPHSYFQAVFPKPPQNLTLQTVHTNLVVLHWQAP----EGSDFSEYVVRYRT----DASPWQRIS 666
            :|.:        |||:::..:..:..:::.||.|    :....:||.::|..    |..| ..|.
  Rat   615 KPSA--------PPQDISCTSPSSTSILVSWQPPPVEKQNGIITEYSLKYAAVDGEDYRP-HEIL 670

  Fly   667 GLHENEAR--IKDMHYGERYLVQVNTVSFGVESPHPLELNVTM---------PPQPVSNVVPLVD 720
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  Rat   671 GIPSDTTKYLLEQLEKWTEYRITV-TAHTDV-GPGPESLSVLIRTDEDVPSGPPRKVE--VEAVN 731

  Fly   721 SRNLTLEWPRP-----DGHVDFYTLKWWPTDEEDRVEFKNVTQLEDLSSPSVRIPIED------- 773
            :..:.:.|..|     .|.:..|.:.:   .:.:..|.|....|:|:.....:...:|
  Rat   732 ATAVKVSWRSPVPNKQHGQIRGYQVHY---VKMENGEPKGQPMLKDVMLADAQWEFDDATEHDMI 793

  Fly   774 ---LSPGRQYRFEVQA---SSNGIRSGTTHLSTRTMPLIQSDVFIANAGHEQGQDETITLSYTPT 832
               |.|...|...|.|   ..:|.||....:|| |..:......:.|    ..|..|..:.:.|
  Rat   794 ISGLQPETSYSLTVTAYTTKGDGARSKPKLVST-TGAVPGRPRLVIN----HTQMNTALIQWHP- 852

  Fly   833 PADS-TRFDIYRFSMGDPTIKDKEKLA----NDTERKLSFSGLTPGKLYNVTVWTVSG----GVA 888
            |.|: .....||...|.   ||.|.|.    ::.|...:.:.:..|..|   ::.:|.    |..
  Rat   853 PVDTFGPLQGYRLKFGR---KDMEPLTTLEFSEKEDHFTATDIHKGASY---IFRLSARNKVGFG 911

  Fly   889 SLPVQRLYRLHPLPI---SDLKAIQVAAREITLHWTAPA-----GEYTDFELQYLSADEEAPQLL 945
            ...|:.:.....:|.   .:|.:....:..:.:.|..|.     |..|.:.|.|  .|...|.|.
  Rat   912 EEMVKEISVPEEVPTGFPQNLHSEGTTSTSVQISWQPPVLAERNGVITKYTLLY--RDINVPLLP 974

  Fly   946 QN---VTKNTEITLQGLRPYHNYTFTVVVRSGSIQGTDFADVSVSTLMRSSAPISASYQTLTAPP 1007
            ..   |..:|.:||.||:  .:.|:.|.||:.:.:|              ..|.|.|.|..|.|.
  Rat   975 MEHLIVPADTSMTLTGLK--SDTTYDVKVRAHTSKG--------------PGPYSPSVQFRTLPV 1023

  Fly  1008 GKVDY---FQPSDVQPGEVTFEWSLEPAEQHGPIDYFRITCQNADDAADVSSYEFPVNATQGKID 1069
            .:..:   |....|....|...|  |..|.:.....|:|.   .||...|.  |....|||..|.
  Rat  1024 DQAVFAKNFHVKAVMKTSVLLSW--EIPENYNSAMPFKIL---YDDGKMVE--EVDGRATQKLIV 1081

  Fly  1070 GLVPGNHYIF--------------RIQAKSALGYGAEREHIQTMP-------------ILAPPVP 1107
            .|.|...|.|              |:.||:|      .:.::|.|             :..|.||
  Rat  1082 NLKPEKSYSFVLTNRGNSAGGLQHRVTAKTA------PDVLRTKPAFIGKTNLDGMITVQLPDVP 1140

  Fly  1108 EPSVTPLEVSRTSSTIEISFRQGYFSNAHGMVRSYTIIIAEDVGKNASGLEMPSWQDVQAYTVWL 1172
                                       |:..::.|.|||..  .|.:.|..:..|:......:
  Rat  1141 ---------------------------ANENIKGYYIIIVP--LKKSRGKFIKPWESPDEMEL-- 1174

  Fly  1173 PYQAIEPYNPFLTSNGSRKSSLE-----------AEHF----TIGTANCDKHQAGYCNGPLRAGT 1222
                    :..|.....::.|:.           |.||    |..|...|||..|:.|..|::|.
  Rat  1175 --------DELLKEISRKRRSIRYGREVELKPYIAAHFDVLPTEFTLGDDKHYGGFTNKQLQSGQ 1231

  Fly  1223 TYRIKIRAFTD--EDK------FTDTVYS-----SPITTERSDTVIVAATVSAVLLVAMVLVVVY 1274
            .|...:.|..|  |.|      ::|.|.|     .|||.|....:.|...|.||:.:..:::.:.
  Rat  1232 EYVFFVLAVMDHAESKMYATSPYSDPVVSMDLDPQPITDEEEGLIWVVGPVLAVVFIICIVIAIL 1296

  Fly  1275 C------QHRCQLIRRASKLARMQD----------ELAAL--------PEGY--------ITPNR 1307
            .      :.|.:...|.|.|...::          ||..|        ..||        :..:.
  Rat  1297 LYKSKPDRKRAESESRKSSLPNSKEVPSHHPTDPVELRRLNFQTPGSDDSGYPGNLHFSSMASHP 1361

  Fly  1308 PVHVKDFSEHYRIMSADSDFRFSEEFEELKHVGRDQACSFANLPCNRPKNRFTNILPYDHSRFKL 1372
            |:.:.:.::|...:.|:.:.:||:|:|.: ..|:......:||..|:||||:.|::.|||||..|
  Rat  1362 PIPILELADHIERLKANDNLKFSQEYESI-DPGQQFTWEHSNLEVNKPKNRYANVIAYDHSRVLL 1425

  Fly  1373 QPVDDDDGSDYINANYMPGHNSPREFIVTQGPLHSTREEFWRMCWESNSRAIVMLTRCFEKGREK 1437
            ..::...||||:||||:.|:.....:|.|||.|..|..:||||.||..|..:||:|:..|:.|.|
  Rat  1426 SAIEGIPGSDYVNANYIDGYRKQNAYIATQGSLPETFGDFWRMIWEQRSATVVMMTKLEERSRVK 1490

  Fly  1438 CDQYWPVDRVAMFYGDIKVQLIIDTHYHDWSISEFMVSRN--CESRIMRHFHFTTWPDFGVPEPP 1500
            |||||| .|....:|.::|.|:.......:.:..|.:.:|  .|.|.:|.|.||.|||.||||.|
  Rat  1491 CDQYWP-SRGTETHGLVQVTLLDTVELATYCVRTFALYKNGSSEKREVRQFQFTAWPDHGVPEHP 1554

  Fly  1501 QSLVRFVRAFRDVIGTDMRPIIVHCSAGVGRSGTFIALDRILQHIHKSDYVDIFGIVFAMRKERV 1565
            ...:.|:|..:.....|..|::|||||||||:|.||.:|.:|:.|.....|||:|.|..||.:|.
  Rat  1555 TPFLAFLRRVKTCNPPDAGPMVVHCSAGVGRTGCFIVIDAMLERIKHEKTVDIYGHVTLMRAQRN 1619

  Fly  1566 FMVQTEQQYVCIHQCLLAVLEGKEHLLADSLELHANDGYEVTKIYLERQPQTKMG 1620
            :|||||.||:.||..||      |.:...:.|:.|.:.|    .|:::..|.:.|
  Rat  1620 YMVQTEDQYIFIHDALL------EAVTCGNTEVPARNLY----AYIQKLTQIETG 1664

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptp4E	NP_525076.2	FN3	<94..>334	CDD:442628	52/255 (20%)
		fn3	247..328	CDD:394996	19/86 (22%)
		FN3	319..>749	CDD:442628	113/506 (22%)
		fn3	708..796	CDD:394996	22/105 (21%)
		fn3	902..978	CDD:394996	21/86 (24%)
		fn3	1013..1092	CDD:394996	24/92 (26%)
		PTP_tm	1127..1247	CDD:465889	31/147 (21%)
		R3-PTPc	1358..1579	CDD:350396	97/222 (44%)
Ptprd	XP_063144608.1	None