Protein Alignment Ptp4E and ptrg-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_525076.2
• Gene: Ptp4E / 31425
• FlyBaseID: FBgn0004368
• Length: 1767
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001255470.1
• Gene: ptrg-1 / 177898
• WormBaseID: WBGene00010558
• Length: 1159
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 978
• Identity: 217/978 - (22%)
• Similarity: 387/978 - (39%)
• Gaps: 186/978 - (19%)

  Fly   692 SFGVESPHPLELNVTMPPQP---VSNVVPLVDSRNLT--LEWPRPDGHVDFY--------TLKWW 743
            |..|.|.:..|..:..||..   .:::.|..::..|.  |:|.:.|..|..|        :.:||
 Worm    21 SISVTSKNATEALLRCPPAENFIRTHMAPDFETPRLVRRLDWFQDDSLVASYQQDILADSSRQWW 85

  Fly   744 PTDEEDRVEFKNVTQLEDLSSPSVRIPIEDLSPGRQYRFEVQASSNGIRSGTTHLSTRTMPLIQS 808
            .:|..           ..|..|...:.:..::|.....:..:..::.:.|.....:|:.:.::..
 Worm    86 VSDGR-----------YQLIRPFYTLRVSPVTPEDSGTYRCRLETDPLFSSPQSTATQELAVMVK 139

  Fly   809 DVFIANAGHEQGQDETITLSYTPTPADSTRFDIYRFSMGDPTIKDKEKL---ANDTERKLSFSGL 870
            .|..::...:...:.:|||.:|...|.:.| .|.|||:...|:.|..:.   |......:....|
 Worm   140 PVAPSSPEIKTFTNRSITLVWTHNAARAHR-PILRFSVSVRTVSDNTRFVMAAPSNATTVIVDNL 203

  Fly   871 TPGKLYNVTVWTV-SGGVASLPVQRLYRL------HPLPISDLKAIQVAAREITLHWTAP---AG 925
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 Worm   204 SPYTLYAFSVRAENSAGSSDFGPETTFRTLGESPNRPPQIQKIRNITSECVEVTI--TPPDEMNG 266

  Fly   926 EYTDFELQYLSADEEAPQLLQ-NVTKNTEITLQGLRPYHNYTFTVVVRSGSIQGTDFADVSVSTL 989
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 Worm   267 ELDKYLVLIQAVNETIPRKMTFDKPTSTPLTICALSPSTDYALAIEADNG------FGTSPQATL 325

  Fly   990 M---RSSAPISASYQTLTAPP--GKVDYFQPSDVQPGEVTFEWSLEPAE-QHGPIDYFRITCQNA 1048
            :   ..|.| :.|..|:|..|  ||           .|:|..|...|.. ....|.|........
 Worm   326 VFHTEDSVP-NWSPSTITTLPVVGK-----------PEITVLWPAPPLNATEKVIKYHLYYKAKN 378

  Fly  1049 DDAADVSSYEFPVNATQGK------IDGLVPGNHYIFRIQAKSALGYGAEREHIQTMPILAPPVP 1107
            :|...:.......|..:.|      :| |.|...|..|:.|.:..|.||:.........:..|..
 Worm   379 EDQWKIEHLNVSPNGVKSKLFKYRLVD-LNPNTQYRIRVSASTIKGEGAQSADSVAQTDVGEPGT 442

  Fly  1108 --------------------EPSVTPLEVSRTSSTIEISFRQGYFSNAHGMVRSYTIIIAEDVGK 1152
                                ||||.    |:.|.|..:.     .:|....::..|.:::.|:
 Worm   443 VTFKDLNFDCKNGVKLRWNYEPSVN----SKKSPTFTVK-----VTNQTTSLQFNTTMLSLDI-- 496

  Fly  1153 NASGLEMPSWQDVQAYTVWLPYQAIEPYNPFLTSNGSRKSSLEAEHFTIGTANCDKHQAGYCNGP 1217
                :::..:.:.....:.|                 .:|:::.....||..: |.||
 Worm   497 ----IDLSLYDEYTLRIIVL-----------------ERSTIDNSTILIGKYS-DSHQ------- 532

  Fly  1218 LRAGTTYRIKIRAFTDEDKFT-DTVYSSP------ITTERSDT--VIVAATVSAVLLVAMVLVVV 1273
                         |..:||.: .:.:.||      :|:...:.  :.|...:.|:::.|.:..|:
 Worm   533 -------------FILKDKCSYQSSFCSPGEKCAKLTSSAGNPRYISVLIVIFAIIIFAFICFVI 584

  Fly  1274 YCQHRCQLIRRASKLARMQDELAALPEGYITP-------NRPVHVKDFSEHYRIMSADSDFRFSE 1331
            .  |..:.......|.:.:::...|.|  |:|       ...:.|:.|..:...::.:...:|..
 Worm   585 V--HFARGSMNFKHLLKKKEKCVYLEE--ISPLVYDSAGQEDIPVELFYGYVEDLNRNDSLKFKT 645

  Fly  1332 EFEELKHV-----GRDQACSFANLPCNRPKNRFTNILPYDHSRFKLQPVDDDDGSDYINANYMPG 1391
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 Worm   646 QFQILESQTSGIDSVDSGESNSSSDENSQKNRYNNIGAIEATRIRL---NSPTGNDYINANYVDS 707

  Fly  1392 HNSPREFIVTQGPLHSTREEFWRMCWESNSRAIVMLTRCFEKGREKCDQYWPVDRVA-MFYGDIK 1455
            .|....:|.||.||.||..:||.|.|:..|..||.:|...|.|:.|||||||..:.: ..:|:.:
 Worm   708 CNERNAYIATQAPLPSTFSDFWSMIWQERSNIIVCITNMVEDGKRKCDQYWPSQQDSPQTFGNYQ 772

  Fly  1456 VQLIID-THYH------DWSISEFMVSRNCESRIMRHFHFTTWPDFGVPEPPQSLVRFVRAFRDV 1513
            |.|:.: |:.|      |..|::.:.:   ..|.:...||..|||.|||.....|:.||....|:
 Worm   773 VTLVSESTNAHFSHRILDLKIAKAVPA---VERKVHQLHFMGWPDHGVPSSVFPLLSFVHYTSDI 834

  Fly  1514 IGTDMRPIIVHCSAGVGRSGTFIALDRILQHIHKSDYVDIFGIVFAMRKERVFMVQTEQQYVCIH 1578
            ..|.  |::|||||||||||::|.:|.:.:|:.....:::.|.:..||::|..:|||.:||:..|
 Worm   835 HSTG--PVVVHCSAGVGRSGSYILVDSMRRHLISFRRLNVQGHLTHMRRQRAKLVQTLEQYIFCH 897

  Fly  1579 QCL 1581
            :.:
 Worm   898 EAI 900

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptp4E	NP_525076.2	FN3	<94..>334	CDD:442628
		fn3	247..328	CDD:394996
		FN3	319..>749	CDD:442628	16/69 (23%)
		fn3	708..796	CDD:394996	16/100 (16%)
		fn3	902..978	CDD:394996	16/79 (20%)
		fn3	1013..1092	CDD:394996	17/85 (20%)
		PTP_tm	1127..1247	CDD:465889	15/126 (12%)
		R3-PTPc	1358..1579	CDD:350396	83/228 (36%)
ptrg-1	NP_001255470.1	FN3	40..490	CDD:442628	92/491 (19%)
		FN3	140..232	CDD:238020	21/92 (23%)
		PTPc	642..900	CDD:214550	92/265 (35%)
		PTP_DSP_cys	959..1148	CDD:475123