Protein Alignment Alms1a and Alms1b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_572175.3
• Gene: Alms1a / 31393
• FlyBaseID: FBgn0025388
• Length: 1322
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001259240.1
• Gene: Alms1b / 31392
• FlyBaseID: FBgn0025387
• Length: 987
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1312
• Identity: 897/1312 - (68%)
• Similarity: 927/1312 - (70%)
• Gaps: 344/1312 - (26%)

  Fly    15 GSRHNKLAESSRV-PPLAREYISAMATDRELDRFMALSSTASSGASGSTHSCALGSVPPPGCASM 78
            |||.|:.|:.:|| ||....|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||
  Fly     6 GSRDNRPAKLTRVHPPPGDYYISAMATDRELDRFMALSSTASSGASGSTQSCALGSVQPPGCASM 70

  Fly    79 EHESRPESGHRRRTKSSDHRSPDERGEAKEQLRELSVSPPPSKHKISQFTSPKSEVTKTKPNEYT 143
            |||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||:|||||||
  Fly    71 EHEARPESGHRRRTKSSDHRSPDERGEAKEQLRELSVSPPPSKHNISQFTSPKSEVTQTKPNEYT 135

  Fly   144 IIPIVLASSPSFRSVAVTQTMSQSAEDIRTPTKSPQMQNKKTQTPESVLKSHKRLEWDPSADVGY 208
            |||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||.|||.||||.
  Fly   136 IIPIVLASSPSFRSVAVTQTMSQSAGDIRRPIKSPQMQNKKTQTLESVHKSHKH----------- 189

  Fly   209 CKRAMSMSNISTLERSVLEDCSWRQPTQQRPEANLDGVQPLLAEEPSPMLDKPTPPLACSTFVNR 273
                                                                             
  Fly   190 ----------------------------------------------------------------- 189

  Fly   274 SERTKSLNSGMESSLSSNKGDPRKKCQRKSRRQDSEVSSCQTDCRSSSQKESTQGSSEAKDIRGN 338
                                  .||||.|||||||:|||||||.
  Fly   190 ----------------------TKKCQCKSRRQDSKVSSCQTDI--------------------- 211

  Fly   339 FTTEGTQCSYNRNDTEIDSIMEEEESIDRRKKDDLRISSRVQDPQISSRRPSVSSSRRESLSSYR 403
                                                                             
  Fly   212 ----------------------------------------------------------------- 211

  Fly   404 RDDSRLNSPNSSRLGSEVSSRVESSRSSSRRESQTNSVYGSLSASSFDYHMHMAQEVEVLKHNQR 468
                                                                             
  Fly   212 ----------------------------------------------------------------- 211

  Fly   469 RQQEMEVEPKKQLEKEQHQNDMQQGEPKGRELKDKNHHSGREQQEIQPLMRDQRKAEQRHEKDHQ 533
                                                ||..||||||||||||||||:||||||||
  Fly   212 ------------------------------------HHPEREQQEIQPLMRDQRKAKQRHEKDHQ 240

  Fly   534 LEREQQGIQQLSKGQRKAKKREKEREQERQYTAAQFEKIRSNRRHVNKENQKPENPVVNPSTGVT 598
            |||||||||||::.||||.||||.||||||||||||||||.|||||:||||:|||||||||||||
  Fly   241 LEREQQGIQQLTRDQRKATKREKVREQERQYTAAQFEKIRGNRRHVSKENQQPENPVVNPSTGVT 305

  Fly   599 ASTSTTSLDVGSGSRPGGELDLGIDLLCSLVKSRSLSQGQKKKLVRDIARRISCLELTESSTSSR 663
            ||:|||||||||||||.|.||:||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   306 ASSSTTSLDVGSGSRPRGVLDIGIELVCSLVKSRSLSQGQKKKLVRDIARRISCLELTESSTSSR 370

  Fly   664 SLSSSSKEQLKVPTGSLQQVAATNTNQSNARSSSKAERIAPPVPAPRKRAAIGSSSPLPESVSYS 728
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   371 SLSSSSKEQLKVPTGSLQQVAATNTNQSNARSSSKAERIAPPVPAPRKRAAIGSSSPLPESVSYS 435

  Fly   729 GSTSGSGEVITQKTNIPNRNASTDADIEPLDLQDWLNPMTLSEIEFEERLKGGTDSERRRQLHWV 793
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   436 GSTSGSGEVITQKTNIPNRNASTDADIEPLDLQDWLNPMTLSEIEFEERLKGGTDSERRRQLHWV 500

  Fly   794 KTEINRMQEFKNLLENISLPSKSQKKANTESATAAQIPSSMRCMGDQKERPDKEYLLRQEMSAEA 858
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   501 KTEINRMQEFKNLLESISLPSKSQKKANTESATAAQIPSSMRCMGDQKERPDKEYLLRQEMSAEA 565

  Fly   859 ESKEMENSETTTTPPPPVRIESVGVNVTNSDPSTLPAPPPTQPPPPPPHLNQRNLQNRKKMATPL 923
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   566 ESKEMENSETTTTPPPPVRIESVGVNVTNSDPSTLPAPPPTQPPPPPPHLNQRNLQNRKKMATPL 630

  Fly   924 LVSGSSTSGGGRSESVCSFVQQRQRQFREHYQNQQQQQFVLLQQQKLYQLQKQLNQQKDILIQRQ 988
            |||||||||||||||||||||||||||.|||:|:|.::|||||:||||||:||||||||||||||
  Fly   631 LVSGSSTSGGGRSESVCSFVQQRQRQFCEHYENEQLEEFVLLQKQKLYQLRKQLNQQKDILIQRQ 695

  Fly   989 QHCGQCAQCGHQRTCIHQQNCPRRQQEAEEQPDEREQYMQMQYAQAAGSAYATPHQSGSSGADKN 1053
            ||||       |||.:|||:||||||||::|.|||||||||||||||| |||       |||..|
  Fly   696 QHCG-------QRTYVHQQHCPRRQQEAQDQHDEREQYMQMQYAQAAG-AYA-------SGAVGN 745

  Fly  1054 EAIYYQVVNSQGVASYVQATMVSTETQNEASATGGAGGSAITRSTTTTTNSSSSMMCISSDMSVP 1118
            ||||:||||.||||||||||||||||||||:||||||||:|||
  Fly   746 EAIYHQVVNPQGVASYVQATMVSTETQNEATATGGAGGSSITR---------------------- 788

  Fly  1119 MGMMNTCETTTTTTTHQYDDVACQRVRRGHKETTMNAESMQRQTLQVRPRAISYVIQFTPTGSSE 1183
                  ||    |||.|||||||||||||||||.||||.|||   ||||||||||||||||||||
  Fly   789 ------CE----TTTRQYDDVACQRVRRGHKETRMNAERMQR---QVRPRAISYVIQFTPTGSSE 840

  Fly  1184 VIEKPPSLQDQLQLARPEFCANAKQRKAILNEMQMIRNARRQELDNVLSQSTSMEALNRHLEQLP 1248
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Fly   841 VIEKPPSLQDQLQLARPEFCANAKQRKAILNEMQMIRNARRQELDNVLSQSTSMEALNRHLEQLP 905

  Fly  1249 PPANTRVRLFTTREMKAITSKRCKNLPEVLAAQSRQEEEQRRRSNRLMRDVFNK------RLKSR 1307
            |.|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||      |||||
  Fly   906 PAANTRVKLFTTREMKAITSKRCKNLPEVLAAQSRQEEEQRRRSNRLMRDAFNKSHLSKQRLKSR 970

  Fly  1308 VASGQISL--NH 1317
            ||||.||.  ||
  Fly   971 VASGNISQRGNH 982

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Alms1a	NP_572175.3	PTZ00121	<457..587	CDD:173412	70/129 (54%)
		ALMS_motif	1190..1312	CDD:464634	118/127 (93%)
Alms1b	NP_001259240.1	ALMS_motif	847..959	CDD:464634	108/111 (97%)