DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment mei-9 and Ercc4l1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_525068.1 Gene:mei-9 / 31373 FlyBaseID:FBgn0002707 Length:961 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063126086.1 Gene:Ercc4l1 / 103693257 RGDID:1304845 Length:881 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:931 Identity:349/931 - (37%)
Similarity:527/931 - (56%) Gaps:117/931 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    40 KRKNMV-LLDYEKQMFLDLVEADGLLVCAKGLSYDRVVISILKAYSDSGNLVLVINSSDWEEQYY 103
            :|::|. ||:||:|..|:|:::|||:|||:||..||::...|:.:.....||||:|:...||   
  Rat     8 ERQSMAPLLEYERQQVLELLDSDGLVVCARGLGADRLLYLFLRLHCHPACLVLVLNTQPAEE--- 69

  Fly   104 KSKIEPKYVHEVASTATERERVYLEGGLQFISTRILVVDLLKQRIPIELISGIIVLRAHTIIESC 168
                             .|.|....||.....:|    |...:.:.   :.||:|.|||.|||||
  Rat    70 -----------------VRPRDGWTGGFGGHRSR----DWCGRNVK---LYGILVYRAHRIIESC 110

  Fly   169 QEAFALRLFRQKNKTGFVKAFSSSPEAFTIGYSHVERTMRNLFVKHLYIWPRFHESVRTVLQPWK 233
            ||||.|||||||||.||:|||:.:..||..|:.||||.|||||:|.||:|||||.:|.:.|:..|
  Rat   111 QEAFILRLFRQKNKLGFIKAFTDNAVAFDTGFCHVERVMRNLFMKKLYLWPRFHVAVNSFLEQHK 175

  Fly   234 IQSIEMHVPISQNITSIQSHILEIMNFLVQEIKRINRTVDMEAVTVENCVTKSFHKILQAQLDCI 298
            .:.:|:.|.::..:.:||:.||:::|..::|:|..|.::::|.:::||.:.|.|.|.:...||.:
  Rat   176 PEVVEIRVSMTLAMLAIQTAILDVLNACLKELKYHNLSLEVEDLSLENALGKPFDKTICHYLDPL 240

  Fly   299 WHQLNSQTKLIVADLKILRSLMISTMYHDAVSAYAFMKRYRSTEYAL-SNSGWTLLDAAEQIFKL 362
            ||||.::||.:|.||||||:|:.....:|.|:....::..|:||... .||||..|||:..:|..
  Rat   241 WHQLGAKTKSLVQDLKILRTLLQYLSQYDCVTFLNLLESLRATEKVFGQNSGWLFLDASTSMFVN 305

  Fly   363 SRQRVF--------------------NGQQEFEPEPCPKWQTLTDLLTKEIPGDMRRSRRSEQQP 407
            :|.||:                    ..::|...|..|||:.||::| |||..:.:.|.......
  Rat   306 ARARVYRVPDVKLSKKTKTSEKMAGTETKKELVLESNPKWEALTEVL-KEIETENKESEALGGPG 369

  Fly   408 KVLILCQDARTCHQLKQYLTQGGPRFLLQQALQHEVPVGKL------------------SDNYAK 454
            :|||...|.|||.||:.|||.|...|||:...:.....||.                  ||...|
  Rat   370 QVLICASDDRTCCQLRDYLTAGAEAFLLRLYRKTFEKDGKAEEVWVNFRKGDGPKRTMKSDKRPK 434

  Fly   455 ESQTRSAPPKNVSSNKELRREEVSGSQPPLAGMDELAQLLSESE---TEGQHFEESYMLTMTQPV 516
            ::|.:........:.|..::.|::           |.|:|..:|   .||...|:.:..|.:.|.
  Rat   435 DAQNKERASTKRGALKRKKKRELT-----------LTQVLGTAEEPPEEGAVEEDLHKQTGSSPE 488

  Fly   517 ----EVGPAAIDIKPDPDVSIFETIPELEQFDVTAALASVPHQPYICLQTFKTEREGSMALEHML 577
                |:...:.|:....|.:          :.:.....::.|....|...:        ||..:|
  Rat   489 VCGGEIQHESFDLNVSSDAA----------YGILKEPLTIIHPLLGCSDPY--------ALTRVL 535

  Fly   578 EQLQPHYVVMYNMNVTAIRQLEVFEARRRLPPADRMKVYFLIHARTVEEQAYLTSLRREKAAFEF 642
            .:::|.|||:|:..:|.:||||::.|.|   |...::|||.::..:.|||.|||:|.:||.|||.
  Rat   536 HEVEPRYVVLYDAELTFVRQLEIYRASR---PGKPLRVYFFVYGGSTEEQRYLTALCKEKEAFEK 597

  Fly   643 IIDTKSKMVIPKYQDGKTDEAFLLLKTYDDEPTDENAKSRQAGGQAPQATKETPKVIVDMREFRS 707
            :|..|:.||:|:.::|: ||..|.| .......|.:..:|:||||....|:  |.::||||||||
  Rat   598 LIREKASMVVPEEREGR-DETNLDL-ARGTAAMDTSTDTRKAGGQERNGTQ--PSIVVDMREFRS 658

  Fly   708 DLPCLIHKRGLEVLPLTITIGDYILTPDICVERKSISDLIGSLNSGRLYNQCVQMQRHYAKPILL 772
            :||.|||:||:::.|:|:.:|||||||::||||||:|||||||:|||||:||:.|.|:|.:|:||
  Rat   659 ELPSLIHRRGIDIEPVTLKVGDYILTPELCVERKSVSDLIGSLHSGRLYSQCLAMSRYYRRPVLL 723

  Fly   773 IEFDQNKPFHL--QGKFMLSQQTSMANADIVQKLQLLTLHFPKLRLIWSPSPYATAQLFEELKLG 835
            ||||.:|||.|  :|.|:    ..|:::|:..||.|||||||:|||:|.|||:|||:||||||..
  Rat   724 IEFDPSKPFSLAPRGAFV----QEMSSSDVSSKLTLLTLHFPRLRLLWCPSPHATAELFEELKQN 784

  Fly   836 KPEPDPQTAAALGSDEPTAGEQLHFNSGIYDFLLRLPGVHTRNIHGLLRKGGSLRQLLLRSQKEL 900
            ||:||..||.|:..|..|..|...:|.|..||:.::|||:.:|...|:.:..::.:|...|.:.|
  Rat   785 KPQPDAATAMAITEDSETLPESDRYNPGPQDFVQKMPGVNAKNCRSLMNQVQNIAELATLSLERL 849

  Fly   901 EELLQSQESAKLLYDILHVAH 921
            ..:|....:||.|:|.||.|:
  Rat   850 TGILGHSGNAKQLHDFLHTAY 870

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
mei-9NP_525068.1 rad1 122..923 CDD:273163 322/848 (38%)
Ercc4l1XP_063126086.1 None

Return to query results.
Submit another query.