Protein Alignment dnc and Pde6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_726846.1
• Gene: dnc / 31309
• FlyBaseID: FBgn0000479
• Length: 1209
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001262566.1
• Gene: Pde6 / 41760
• FlyBaseID: FBgn0038237
• Length: 1124
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1210
• Identity: 243/1210 - (20%)
• Similarity: 417/1210 - (34%)
• Gaps: 359/1210 - (29%)

  Fly   163 DLYGGAGGGTKKHSLADTIDTS--VTTPISLKTLINDVDEELDQQLSAADIAAASLASGLVARRA 225
            |:...|||......::.|..:|  .|:..|.|.|.|           .|:..|.|.|:|.|...|
  Fly     3 DVSSPAGGAASPVEMSTTSSSSAATTSASSSKPLTN-----------GANKTAISTAAGGVTPGA 56

  Fly   226 EPETLSDASVSPTAVVQQQQQQQQQLQQPLLQSQPHFVPSSGNILSQVTLYSGSNPSTNPCQSAV 290
            .|...|.|                             :|:|.:..:||.|......|.|. :.||
  Fly    57 VPGPGSGA-----------------------------IPASSSSGNQVKLEHHHRQSNNN-RPAV 91

  Fly   291 QNQGQ--------NSNPNPNQNPNTNPNQNQQRCSCQPQTSPLPHI-KEEEESDQANFKHQTSLK 346
            .|:..        .|:.:|:|:|      :|.:.|.|.|||....: |....:.|.:......|.
  Fly    92 TNRSSETKLMTPTGSSSSPSQSP------SQTQASIQTQTSQQDRLAKASTTASQQDVDEVARLF 150

  Fly   347 EHQP---------LPPPITIATGYCGSCESVHHSSATSSSAGTVPPGGQQTQEYIAGTSSTPSPR 402
            |.:|         ..||..::                            :.||:|..
  Fly   151 EEKPEAFEKWLTERAPPEALS----------------------------RLQEFIEN-------- 179

  Fly   403 IKLKFRKPHK---------SCWSRIVLAPIGSAGGSSSATTVIGSNSNETLASSSTTG------- 451
                 |||||         ..|              .:|:..:...|..:|::||.:.
  Fly   180 -----RKPHKRPSVTSDLFQQW--------------MAASPTVQQKSPRSLSNSSASSLPECRRH 225

  Fly   452 -----------GTATTTQNSSSVSVAAHHRLTS--------SSASALATSHPSNSQLL------- 490
                       .......|...:.|..|..|.:        ..:..||...|:|..|:
  Fly   226 LMDLDEGELFMELIRDVANELDIDVLCHKILVNVGLLTHADRGSLFLAKGTPTNKYLVAKLFDVT 290

  Fly   491 -------PTSKMQAEQ-------GSIGDLQKYHSRYLKNRRHTLANVRF----DVENGQGARSPL 537
                   ..::..||:       |..|.:.:  ::.:.|.:....:.||    |::.|....:.|
  Fly   291 QKTALKDAVTRASAEEIIIPFGIGIAGMVAQ--TKQMINIKEAYKDARFNCEIDLKTGYKTNAIL 353

  Fly   538 -------EGGSPSAGLVLQ-------------NLPQRRESFL---YRSDSDFEMSPKSMSRNS-- 577
                   ||.......::.             .:.:|..:|.   .::...||||.:...||.
  Fly   354 CMPICNYEGDIIGVAQIINKTNGCMEFDEHDVEIFRRYLTFCGIGIQNAQLFEMSVQEYRRNQIL 418

  Fly   578 -SIASERFKEQE----------------------ASILVD-----RSHGEDLIVTPFAQILASLR 614
             ::|...|:||.                      :..|||     .||.|.:|..|......:::
  Fly   419 LNLARSIFEEQNNLECLVTKIMTEARELLKCERCSVFLVDLDCCEASHLEKIIEKPNQPATRAIK 483

  Fly   615 S--------VRNNLLSLTNV----PASNKSRRPNQSSSASRSGNPPGAPLSQGEE--AYTRLATD 665
            |        :||....|..:    .|:|.| ||:.|..:|       :.|:|..:  |.|....:
  Fly   484 SADSFEEKKMRNRFTVLFELGGEYQAANVS-RPSVSELSS-------STLAQIAQFVATTGQTVN 540

  Fly   666 TIEELDW--------CLDQLETIQTHRSVSDMASLK----FKRMLNKELS-HFSESSRSGNQISE 717
            ..:.::|        ..|::::.|....:..|.:.|    ..:::||... .|::|..|..:...
  Fly   541 ICDVIEWVRDHNQIRAEDEIDSTQAILCMPIMNAQKKVIGVAQLINKANGVPFTDSDASIFEAFA 605

  Fly   718 YICSTFLDKQQEFDLPSLRVEDNPELVAANAAAGQQSAGQYARSRSPRGPPMSQISGVKRPLSHT 782
            ..|...:...|.:       |:..:|:|....| .:....:|.:...:...::|
  Fly   606 IFCGLGIHNTQMY-------ENACKLMAKQKVA-LECLSYHATASQDQTEKLTQ----------- 651

  Fly   783 NSFTGERLPTFGVETPRENELGTLLGELDTWGIQIFSIGEFSVNRPLTCVA-YTIFQSRELLTSL 846
                                  .::.|.:::.:..|:..:|.:....||.| ..:|....|::..
  Fly   652 ----------------------DVIAEAESYNLYSFTFTDFELVDDDTCRAVLRMFMQCNLVSQF 694

  Fly   847 MIPPKTFLNFMSTLEDHY--VKDNPFHNSLHAADVTQSTNVLLNTPALEGVFTPLEVGGALFAAC 909
            .||......::.::..:|  ||   :||..||.:|.|:...:|.|..:|...|.||:.|.|.|..
  Fly   695 QIPYDVLCRWVLSVRKNYRPVK---YHNWRHALNVAQTMFAMLKTGKMERFMTDLEILGLLVACL 756

  Fly   910 IHDVDHPGLTNQFLVNSSSELALMYNDESVLENHHLAVAFKLLQNQGCDIFCNMQKKQRQTLRKM 974
            .||:||.|..|.|...:.|.||::|. .|.:|:||......:|.::|.:||..:..:..:::.|.
  Fly   757 CHDLDHRGTNNAFQTKTESPLAILYT-TSTMEHHHFDQCVMILNSEGNNIFQALSPEDYRSVMKT 820

  Fly   975 VIDIVLSTDMSKHMSLLADLKTMVETKKVAGSGVLLLDNYTDRIQVLENLVHCA-DLSNPTKPLP 1038
            |...:||||::.:.........:||..:....|       .::..:|..::..| |:|...||..
  Fly   821 VESAILSTDLAMYFKKRNAFLELVENGEFDWQG-------EEKKDLLCGMMMTACDVSAIAKPWE 878

  Fly  1039 LYKRWVALLMEEFFLQGDKERESGMDISP--MCDRHNA-TIEKSQVGFIDYIVHPLWETWADLVH 1100
            :..:...|:.:|||.|||.|:.. ::..|  |.||... .:.|.||||||.|..||:....| ..
  Fly   879 VQHKVAKLVADEFFDQGDLEKLQ-LNTQPVAMMDRERKDELPKMQVGFIDVICLPLYRVLCD-TF 941

  Fly  1101 PDAQDILDTLEENRDYYQSMI-----------------PPSPPPSGVDENPQEDRIRFQVTLEES 1148
            |....:.:...|||..:|.:.                 |.....:..||..::  |.|.||....
  Fly   942 PWITPLYEGTLENRRNWQDLAEKVEMGLTWIDHDTIDKPVEEFAACADEEIKD--IEFTVTTLNC 1004

  Fly  1149 DQENL-----AELEEGDESGGEST--TTGTTGTTAASALS 1181
            :|::.     :...|...||...:  .||..|....|.||
  Fly  1005 NQQSQHGSEDSHTPEHQRSGSRLSMKKTGALGKAVRSKLS 1044

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
dnc	NP_726846.1	PDE4_UCR	603..725	CDD:465648	27/148 (18%)
		PDEase_I	870..1110	CDD:459723	73/243 (30%)
Pde6	NP_001262566.1	GAF	247..406	CDD:214500	22/160 (14%)
		GAF	431..619	CDD:214500	35/202 (17%)
		PDEase_I	717..950	CDD:459723	73/242 (30%)