Protein Alignment Spg7 and yme1l1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_570017.1
• Gene: Spg7 / 31253
• FlyBaseID: FBgn0024992
• Length: 819
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_005162918.2
• Gene: yme1l1a / 793098
• ZFINID: ZDB-GENE-091113-41
• Length: 729
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 784
• Identity: 240/784 - (30%)
• Similarity: 392/784 - (50%)
• Gaps: 128/784 - (16%)

  Fly    46 VMQLQAEYKAIVGLIARSLQ--LTPK------------------EVRLMHLRSLSSTAKPPTASD 90
            |..|::...:.|....:|||  |:|:                  |:|:.|:|.:.....|.|
Zfish    23 VQYLKSSANSAVTASVQSLQKDLSPEHDPLHYEPKVNLKELGLSELRVSHVRDVLERLLPST--- 84

  Fly    91 GKTEKHEQPEKGSAKAKDDSSKEKKSAVAAED--------GDKSSRAAGEEAASTPTSSSTIGEP 147
                  ...||..|....:|:..:.|.::|..        ..|.|...|         ||.....
Zfish    85 ------HPAEKSFASVAQNSTAWRTSHISAPSFFQNKYGFSHKHSGCFG---------SSVFRRG 134

  Fly   148 GEDPNKNSNENDEKMRSVLTKAVLWLFTIYMFVAFFSLLITPRSERPEGSTRYVSWNEFVHHMLA 212
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Zfish   135 GSSP--------------LQAACVDLHHLQLWVQNRGFKTMSKSRHLRSSSE------------- 172

  Fly   213 VGEVKELIIRPDMEMVTIILHEGAVIKGRKVSSTIFHMAVADANKFEEKLRDVEKRLGIKDG--- 274
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Zfish   173 -GPV-------EADNYTPVFMKGLIMKEKTDTGSLEQL--LKQNNLPESHQDAFK-TGFTEGFMK 226

  Fly   275 VPVTYDRQTDTT--GRILMLLLVCALLMSIATRMKSIKSPL--SMDSFNQMGRAKFT-----LVD 330
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Zfish   227 AQALTKRTQDSVKRTRLIIFVLLLAGIYGVS------RSPFFSGKGSFSDTVRFRTTSGLDSSVD 285

  Fly   331 PFDGGRGVLFRDVAGLSEAKQEVKEFVDYLKSPEKYQRLGAKVPRGALLLGPPGCGKTLLAKAVA 395
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Zfish   286 PVQ-MKNITFEHVKGVEEAKNELQDVVEFLRNPQKFTVLGGKLPKGILLVGPPGTGKTLLARAVA 349

  Fly   396 TEAQVPFLSMNGSEFIEMIGGLGAARVRDLFKEGKKRAPCIIYIDEIDAIGRQRSGTESMGQGSS 460
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Zfish   350 GEADVPFYYASGSEFDEMFVGVGASRIRNLFKEAKASAPCVIFIDELDSVGGKR-----IESPMH 409

  Fly   461 GESEQTLNQLLVEMDGMATKEGVLMLASTNRADILDKALLRPGRFDRHILIDLPTLAERKEIFEK 525
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Zfish   410 PYSRQTINQLLAEMDGFKPNEGVIVIGATNFAEALDNALVRPGRFDMQVTVPIPDVKGRTEILEW 474

  Fly   526 HLSSVKLESPPTTFSQRLARLTPGFSGADIANVCNEAALHAARNTQMEVSSKNLEYAVERLVGGT 590
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Zfish   475 YLKKIKVDS--AIDAEIIARGTVGFSGAELENLVNQAALKAAADGKDLVTMKELEFAKDKILMGP 537

  Fly   591 EKRSHALSLAERKVIAYHESGHALVGWMLPNSDILLKVTIVPRTSLALGFAQYTP-SEQHLYSKE 654
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Zfish   538 ERRSVEIDKRNKTITAYHESGHAIVAYYTKDAMPINKATIMPR-GPSLGHVSLLPENDRWSETRA 601

  Fly   655 ELFDKMCMALGGRAAENLVF--NRITTGAQNDLEKVTKIAYSQIKKFGMNDTLGPIYVRDADETE 717
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Zfish   602 QLLAQMDVSMGGRVAEELVFGNDQITSGASSDFDGATKIAQMMVTRFGMSDKLGVMTYSDLTK-- 664

  Fly   718 GGGAMGSGGKKPFSRAMESMIDNEARHVVASAYQTTEGILTTHRDKLEKLAEALLEKETLDYDQV 782
                     ..|.:||   .::.|.|.::.|:|:..:.||.|:..:.:.||:|||..|||:..::
Zfish   665 ---------HSPETRA---AVEQEIRVLLQSSYERAKKILKTYSKEHKLLADALLTYETLNAKEI 717

  Fly   783 VQLI 786
            ..::
Zfish   718 QMIL 721

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Spg7	NP_570017.1	HflB	178..788	CDD:440233	210/624 (34%)
yme1l1a	XP_005162918.2	None