Protein Alignment Klp3A and cos

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_525053.1
• Gene: Klp3A / 31240
• FlyBaseID: FBgn0011606
• Length: 1212
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_477092.1
• Gene: cos / 35653
• FlyBaseID: FBgn0000352
• Length: 1201
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1144
• Identity: 258/1144 - (22%)
• Similarity: 442/1144 - (38%)
• Gaps: 284/1144 - (24%)

  Fly    60 SQKDLFETCVQAKVKKLLNGYNVTILAYGQTGSGKTYTM-GTAFNGVLDDHV-GVIPRAVHDIFT 122
            ||:.::...|...:...|.|::.:::.|||.|.||:||: |...:..|.|.. ||:...|.|||:
  Fly   147 SQEQVYHQTVFPLITLFLEGFDASVVTYGQRGQGKSYTLYGNVQDPTLTDSTEGVVQLCVRDIFS 211

  Fly   123 AIAEMQSEFRFAVTCSFVELYQEQFYDLFSSKTRDKATVDIREVKNRIIMPGLTELVVTSAQQVT 187
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  Fly   212 HIS-LHPERTYAINVGFVEICGGDVCDLL----------------------GMGNIHCTNVDAVF 253

  Fly   188 DHLIRGSAGRAVAATAMNETSSRSHAIFTLTLVA--TKLDG--KQSVTTSRFNLVDLAGSERCSK 248
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  Fly   254 HWLQVGLSAR---------QSLPAHTLFTLTLEQQWVSKEGLLQHRLSTASFS--DLCGTERC-- 305

  Fly   249 TLASGDRFKEGVNINKGLLALGNVINALGSG----QAAGYIPYRQSKLTRLLQDSLGGNSITLMI 309
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  Fly   306 ----GDQ-PPGRPLDAGLCMLEQVISTLTDPGLMYGVNGNIPYGQTTLTTLLKDSFGGRAQTLVI 365

  Fly   310 ACVSPADYNVAETLSTLRYADRALQIKNKPVVNLDPHAAEVNMLKDVIQKLRVELLSGGKMS--- 371
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  Fly   366 LCVSPLEEHLPETLGNLQFAFKVQCVRNFVIMN--TYSDDNTMIVQPAEPVPESNSSAGPLSQAG 428

  Fly   372 --------------SSLISAVGAAGLGA-----------------------IPCEESLAGSMANA 399
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  Fly   429 PGDNFGLQFAASQWSKLVT--NAEGLFSKLIDSKLITEVEKEQIEEWLFLKQECEECLSSTEA-- 489

  Fly   400 AEIQRLKEQVRTLQ-------------------DRNRKLQQELH--------QSLLDLTEKEMRA 437
              :::.|:.|..|:                   |.......|.|        :||::....:..|
  Fly   490 --MRQQKQLVPILEAEEPEDVNSEAANSESPNSDNENDTDNESHRPDLDDKIESLMEEFRDKTDA 552

  Fly   438 HIAEQAHDKLRSHVSELKNKLDQREQAQFGNENTNGDNEMRDFSL-------------------L 483
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  Fly   553 LILEKHAEYLSKHPKAVMQSQDREIEAQPPEE--NGDD--RKVSIGSRRRSVQPGASLSTAELAM 613

  Fly   484 VNRV-------HVELQRTQEELESQGHES-RQ-RLSSRSHTEGGESGGDEVHEMLHSHSEEYTNK 539
            :|||       .::.:...:.|||...|. || .|::.:.|...|    ::.:.|.....|...|
  Fly   614 LNRVASQQPPPPIDPESVVDPLESSSGEGIRQAALAAAAATAPIE----QLQKKLRKLVAEIEGK 674

  Fly   540 QMNFAGELRNINRQLDLKQELHERIMRNFSRLDSDDEDVKLRLCNQKIDDLEAERRDLMDQLRNI 604
            |.    :||.|...:.:||.:...:::|     ||......:..::|...||||    .|:.:
  Fly   675 QR----QLREIEETIQVKQNIIAELVKN-----SDTRSHAKQRFHKKRAKLEAE----CDKAK-- 724

  Fly   605 KSKDISAKLAEER-RKRLQLLEQEISDLRRKLITQANLLKIRDKEREKIQNLSTEIRTMKESKVK 668
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  Fly   725 --KQLGKALVQGRDQSEIERWTTIIGHLERRLEDLSSMKHIAGESGQKVKKLQQSVGESRKQADD 787

  Fly   669 LIRAMRGESEKFRQWKMVREKELTQLKSKDRKMQSEIVRQQTLHSKQRQVLKRKCEEALAANKRL 733
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  Fly   788 LQKKLRKEC----KLRCQMEAELAKLR-ESRETGKELVKAQGSPEQQGRQLKAVQARITHLNHIL 847

  Fly   734 K---DALERQASAQAQ---RHKYKDNGGSAAGSSNANAKTDSWVDRELEIILSLIDAEHSLEQLM 792
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  Fly   848 REKSDNLEEQPGPEQQETLRHEIRNLRGT----------------RDL---------------LL 881

  Fly   793 EDRAVINNHYHLLQQEKTSDPAEAAEQARIL------ASLEEELEMRNAQISDLQQKVCPTDLDS 851
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  Fly   882 EERC------HLDRKLKRDKVLTQKEERKLLECDEAIEAIDAAIEFKNEMITGHRS----IDTSD 936

  Fly   852 RIRSLAEGVQSLGESRTVSKQLLKTLVQQRRLQASSLNEQRTTLDELRAQLLDAQQQEDAASK-R 915
            ||:            |...:|:|     ..||...|..|.||.|.:...:::|.:   |::.| .
  Fly   937 RIQ------------REKGEQML-----MARLNRLSTEEMRTLLYKYFTKVIDLR---DSSRKLE 981

  Fly   916 LRLLQSQHEEQMLAQQRAYEEKVSVLIRTANQRWAEARSPAEDQQRNQILEELLSSREALQQELD 980
            |:|:|.:.|..      |:|.|..||.....|...|....|...||...::..|..|. :.:|..
  Fly   982 LQLVQLERERD------AWEWKERVLSNAVRQARLEGERNAVLLQRQHEMKLTLMLRH-MAEETS 1039

  Fly   981 KLRAK--NKSKSKAVKSEP----QDLD-DSFQIVDGNETVVLSDVSDDPDWVPSTS-----KSKR 1033
            ...|.  .::.:.|..:.|    .|.| |.|....||.:..|...   |..:|:.|     |.|.
  Fly  1040 ASSASYGERALAPACVAPPVQASSDFDYDHFYKGGGNPSKALIKA---PKPMPTGSALDKYKDKE 1101

  Fly  1034 IQSDSRNVISPPE--KQDANVTSLGNSSIQSLNSTSATE 1070
             |...||:.:...  .:.|:..:.|:|...:..||:..|
  Fly  1102 -QRSGRNIFAKFHVLTRYASAAAAGSSGSTAEESTALIE 1139

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Klp3A	NP_525053.1	KISc_KIF4	7..336	CDD:276823	86/285 (30%)
		Smc	<453..>985	CDD:440809	119/573 (21%)
		Metallothio	<1071..1115	CDD:395080	258/1144 (23%)
cos	NP_477092.1	Kinesin	140..389	CDD:459720	86/282 (30%)
		SMC_N	660..>999	CDD:481474	88/427 (21%)