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Protein Alignment Mur2B and Mur89F

DIOPT Version :9

Sequence 1:	NP_001284789.1	Gene:	Mur2B / 31111	FlyBaseID:	FBgn0025390	Length:	1795	Species:	Drosophila melanogaster
Sequence 2:	NP_001262662.1	Gene:	Mur89F / 42080	FlyBaseID:	FBgn0038492	Length:	2159	Species:	Drosophila melanogaster

Alignment Length:	1217	Identity:	315/1217 - (25%)
Similarity:	436/1217 - (35%)	Gaps:	343/1217 - (28%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

  Fly   196 DQCPSTEISDSGSYIPQNCELKF---PECAEEGTFRSPTD-CALYYTCRLQESGTYLQTRFKCPG 256
            :|..|.:.|.|........:..|   .:|..|.||.:..: |:.:|.|.....|.:.:..|.||.
  Fly   994 NQSSSNQSSSSNQTSSSTTQKPFKPAEKCESEETFLADNENCSKFYRCVDNGKGGFTKVSFTCPP 1058

  Fly   257 SNSFDLERKLCRPRSEVDCFDFVPGPVQVPYAPQPYYPPYPAAPPLYEEDDYDTGAREQQPALKS 321
            :..:|.|...|.            .|.|:...|                             ||.
  Fly  1059 NTLWDPEANSCN------------HPDQIQTKP-----------------------------LKC 1082

  Fly   322 EKLQVAAEGFEKPSLNVVVLQTTTLEPSTAYHKYPAYPSYPSYEYSSHHRGKER---AAENLELE 383
            :|  |.::|....:       :|:...|::.:...:..|..|...||.:.|...   ::.|....
  Fly  1083 KK--VVSQGGSSSN-------STSNSSSSSNNSGSSSNSGSSSSSSSSNSGSSSNTGSSSNSGAS 1138

  Fly   384 KEGVPRKLKLSENIVI--------QPETPATAATTREPLNDINKYQYKRYTYGTDKNDVTEAPEI 440
            ..|.......|.|...        ...|.::.:::....|:.|:......:..:........|..
  Fly  1139 SSGGSSNQGSSSNSGSSSGSNSSGNQSTSSSTSSSSSSSNNNNQGSSSSSSSSSSSTSSKPNPSE 1203

  Fly   441 KSPLKGLHLSE------------------NIVILPETTTTTTTTTKPV--------VLTCPTISP 479
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  Fly  1204 TCKVNGQFIGDRSDCAKFYRCVDNDRGGFNMV--PFSCGPGTVWDAQMQACNHAWAVKECGGIAP 1266

  Fly   480 PDTTPKPSTTTAVTKSTPKISSTEQHSTTTAKTTT----TKRPTT--VTEKTSSATEKPRTTVVT 538
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  Fly  1267 P-TTSTPTTSRPTTASTSRPSDQTSTSRPTGPPTTARPVTARPTTSSPTTASSSQTTSPVTQAPN 1330

  Fly   539 TTTQKRS------------------------------------------TTTH---NTSPDTKTT 558
            |..:.||                                          |..|   |.|..|::|
  Fly  1331 TDGKCRSEGFMADPNNCSKFYRCVRNNKGGFTSIPFQCGAGTVWDQDLQTCNHNFNNCSTGTEST 1395

  Fly   559 IRSTTLSPKTTTTPSTTTPSTTTPSTTTPSTTTPSTTTPSTTTPSTTTTVKVSTHRPRTTSQKTT 623
            .......|.|..|.:|:|.|||||    |.|||....|.:|..|.|||     |..|.||   ||
  Fly  1396 TPKPPCEPATNGTTATSTSSTTTP----PPTTTDLPPTSTTGLPPTTT-----TELPPTT---TT 1448

  Fly   624 TASTTTKKTTTSPKTTKTTDIPTSTTSKLSTTT---QKTTTTTHKFTAATTSTEKPKTTTEKTST 685
            ....||  ||..|.||.|:..||:||....|||   |.||||....|..:|.|..|::||:..
  Fly  1449 DLPPTT--TTRLPPTTTTSLPPTTTTGLPPTTTTGAQPTTTTLSSETETSTVTTSPESTTQPP-- 1509

  Fly   686 VSTTTKKSTESSPKPTSSTGK-----PT--------------------TTPKPS----------- 714
             ||||.|..   |..|..||:     |.                    |.||.:
  Fly  1510 -STTTMKPL---PAGTECTGEGYMADPEDCRKYYRCINAGASYRKYNFTCPKGTGWNEEVQTCDY 1570

  Fly   715 TRTTPTTTKVTTTTQITTTTPLRSSTETTSTQPPTTTTPQPTTTTTLTVTPKTSTTTTTTEKPIT 779
            ....|..:|:  ..:..||||...|.:..||.|  .:|.:|||.|.....|....:|...:||.|
  Fly  1571 VENIPRCSKL--PAEPITTTPSEESKDPGSTTP--QSTDEPTTVTKPITKPTEEPSTEKPQKPTT 1631

  Fly   780 SSP-KPTTTTQKTTSTAPNTTKV--AITTQKETTP--TQSTSTTIFTRK-TTTNNPEPTSTEKPI 838
            ..| |||||.:......|.||:.  ..||.:|.||  .|..:||.:.:| |||..|.|...:||.
  Fly  1632 QYPEKPTTTEEPEKPQKPTTTEYPQKPTTTEEPTPEKPQKPTTTEYPQKPTTTEEPTPEKPQKPT 1696

  Fly   839 TSTTPKPSTTTPKTSTVASSTEKTTISSPKPTTEKSTENPTTNSVKTSALTSSTQRATSTTSEPT 903
            |:..|:..||...|:|.......||.|.|       ..||||..:.....||:.....:||.||
  Fly  1697 TTEYPQKPTTEEPTTTSIPGYNPTTTSVP-------GYNPTTTPIPVETTTSTPGYKPTTTGEP- 1753

  Fly   904 KTTQNITTTTPKPTTLKTSTQEATTSTQKVSTVTITTKKATESSP---LTTLSTE-EPNTT---- 960
                 ||||| .|:|...:.||.|||  |....|.||:....|:|   :|||..| :||..
  Fly  1754 -----ITTTT-LPSTTTDAIQEPTTS--KKPEPTTTTESPESSTPEGSVTTLQPEPQPNYNCSSE 1810

  Fly   961 ---PKPL--------------------------------------------------RTTTPTTT 972
               |.|.                                                  :||||.||
  Fly  1811 GFFPDPEDCSRYYRCVDAAKNGKYQVYAFKCGKGTVWDTSTETCNYADQVSGNCSSGQTTTPGTT 1875

  Fly   973 SVTATTRITTTTISESSTETTSTQKPKSTT---PTSTTRTTPKVTTVIVSTQNPTTTTSKTSTVT 1034
            :...||..||   |....|||| :.|::||   |.:||.::|:.||.:.|  ..|||||.|:|
  Fly  1876 TEPGTTESTT---SSGKPETTS-KAPENTTTWAPETTTTSSPETTTTVAS--ETTTTTSGTTT-- 1932

  Fly  1035 ITTPNPSPSTQRPTTTTRQP----TSITASTTSIGTTRIPTTT-NPQNSTSSTDLTTVTRPPCPD 1094
                     |..|.|||:.|    |:|....||  |::.|||| :|..||:       |..|||:
  Fly  1933 ---------TATPETTTKPPKPETTTIAGEETS--TSKSPTTTESPAPSTN-------TSAPCPE 1979

  Fly  1095 PDSTSDKNTNTACTQELQQVNLLELQSPQKQEQFTHTRTHTALTGSRNTLGGQEVPD---YMDDA 1156
               |........|....:       :.|:|...| :..:.:|.....|.:..| .|:   |.|.:
  Fly  1980 ---TGPGQNVYVCPTGFR-------RHPEKCGMF-YQCSESADNNDLNIVVFQ-CPNGTVYQDKS 2032

  Fly  1157 PSSAEAESG-QATTAKAPTMSTLAAAHLLQKLFHIISTTP--PSREH 1200
            .|..:..:| :.:.....|.:.......||.:..|.:|.|  |...|
  Fly  2033 CSCGKPPAGDKCSKDMKRTTNAFEEETKLQNVVQISTTDPLCPDEGH 2079

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Software error:

Illegal division by zero at /www/www.flyrnai.org/docroot/cgi-bin/DRSC_prot_align.pl line 591.

For help, please send mail to the webmaster (ritg@hms.harvard.edu), giving this error message and the time and date of the error.