Protein Alignment Nmdar2 and grik5

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001014714.1
• Gene: Nmdar2 / 31107
• FlyBaseID: FBgn0053513
• Length: 1083
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001315085.1
• Gene: grik5 / 798791
• ZFINID: ZDB-GENE-070821-6
• Length: 1067
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1101
• Identity: 250/1101 - (22%)
• Similarity: 438/1101 - (39%)
• Gaps: 257/1101 - (23%)

  Fly    52 ILTPPSGPISL--LLLTVLTLLILDTRSCQGLRLTNGGGSLSKGAAANKEQLNIGLIAPHTNFGK 114
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Zfish    20 VVTMPPSSLSQTPVLSSVRMAAILDDSSVCG-----------RG-----ERLALAL--------A 60

  Fly   115 REYLRSINNAVTGLTKTRGAKLTFLKDYSFEQKNIHFDMMSL-TPSPTAILSTLCKEFLRVNVSA 178
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Zfish    61 RE---NINSVMENPARAR----------------VEVDIFELQKDSQYETTDTMCQILPKGVVSV 106

  Fly   179 ILYMMNNEQFG--HSTASAQYFLQLAGYLGIPVISWNADNSGLERRASQSTLQLQLAPSIEHQSA 241
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Zfish   107 I---------GPASSPASGSIVSHICGEKEIPHVKIGPEET--PRLPYLRFASVTLYPSNEDLSL 160

  Fly   242 AMLSILERYKWHQFSVVTSQIAGHDDFVQAVRERVAEMQEHF-KFTILNSIVVTRTSD------- 298
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Zfish   161 AIGSILRSFSYPSASLVC-----------AKAECLLRLEELIRRFLISRETLSIRMLDDNLDPTP 214

  Fly   299 -LMELVNSEARVMLLYATQTEAITILRAAEEMKLTGENYVWVVS---------QSVIEKKDAHSQ 353
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Zfish   215 LLKEIRDDKIATIIIDANASISYLILKKASELGMTSAFYKYILTTMDFPLLWLDDIVDEQSNIVG 279

  Fly   354 FPVGMLGVHFDTSSAALMN---------------------EISNAIKIYSYGVEAYLTDPANRDR 397
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Zfish   280 FSM------FNTTHPFYLEFIRSLNLSWREGCDINPYPGPALSSALLFDAVHVVVSAVQELNRSQ 338

  Fly   398 RLTTQSLSCEDEGRGRWDNGEIFFKYLRNVSIEGDLNKPNIEFTADGDLRSAELKIMNLRPSANN 462
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Zfish   339 EIGVKPLSCTSP--QIWQHGTSLMNYLRMVEYDGLTGR--VEFNSKGQRTNYTLHILEKHRGGH- 398

  Fly   463 KNLVWEEIGVWKSWETQKLDIRDIAWPGNSHAPPQGVPEKF---HLKITFLEEAPYINLSPADPV 524
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Zfish   399 -----KEIGIWYSNNTLLM---------NSTSLDINVSETLANKSLIITTILENPYV-------- 441

  Fly   525 SGKCLMDRGVLCRVAADHEMAADIDVGQAHRNESFYQCCSGFCIDLLEKFAEELGFTYELVRVED 589
                                ...|:..:...||.:    .|||:|:|.:.::.|.|||.:..|:|
Zfish   442 --------------------MRKINYQEFEGNEQY----EGFCVDMLRELSDILKFTYRIKLVDD 482

  Fly   590 GKWGTLE-NGKWNGLIADLVNRKTDMVLTSLMINTEREAVVDFSEPFMETGIAIV----VAKRTG 649
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Zfish   483 GLYGAPEPNGSWTGMVGELINRKADLAVAAFTITSEREKVIDFSKPFMTLGISILYRVHIGRKPG 547

  Fly   650 IISPTAFLEPFDTASWMLVGIVAIQAATFMIFL------FEWLSPSG--YDMKLYLQNTNVTPYR 706
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Zfish   548 YFS---FLDPFSPAVWLFM-LLAYLAVSCVLFLSARLSPYEWYNPHPCLRERRDLLEN------Q 602

  Fly   707 FSLFRTYWLVWAVLFQAAVHVDSPRGFTSRFMTNVWALFAVVFLAIYTANLAAFMITREEFHEFS 771
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Zfish   603 YTLGNSLWFPVGGFMQQGSEI-MPRALSTRCVSGVWWAFTLIIISSYTANLAAFLTVQRMEVPIE 666

  Fly   772 GLNDSRLVHPFSHKPSFKFGTIPYSHTDSTIHKYFNV-------MHNYMRQYNK------TSVAD 823
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Zfish   667 SPDD------LADQTNIQYGTI---HGGSTMTFFMNSRYQTYQRMWNYM--YSKQPSVFVKSTEE 720

  Fly   824 GVAAVLNGNLDSFIYDGTVLDYLVAQDEDCRLMTVGSWYAMTGYGLAFSRNSKYVQMFNKRLLEF 888
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Zfish   721 GIARVVNSKY-AFLLESTMNEY--HRSLNCNLTQIGGLLDTKGYGIGMPLGSPFRDELSLAVLQL 782

  Fly   889 RANGDLERL-RRYWMTGTCRPGKQEHKSSDPLALEQFLSAFLLLMAGILLAALLLLLEHVYFKYI 952
            :.|..||.| ||:|..|.| |.:::|::.. |.:|.....|::|:.|:::|..:.::|   |.:.
Zfish   783 QENNRLEILKRRWWEGGKC-PKEEDHRAKG-LGMENIGGIFVVLICGLIIAVFVAVME---FVWS 842

  Fly   953 RKRLAKKD---------GGHCCALISLSMGKSLTFRGAV-FEATEILKKHRCNDPICDTHLWKVK 1007
            .:|.|:.|         ..|....:|:.......||.|| .:.:..|::.|   |:
Zfish   843 TRRSAETDEVRPLSCDRQYHSHTTVSVCQEMLTEFRNAVSCKKSSRLRRRR---PL--------- 895

  Fly  1008 HELDMSRLRVRQLEKVMDKHGIKAPQ-LRLASSSDLLNHHHLKERPPLLGNLSLAASAQDL 1067
                .|.|.:|...::.    :.||: |||.....|.|........||.|.........|:
Zfish   896 ----SSSLALRHPTRIT----LGAPRPLRLVREMRLSNGKLYSGTGPLTGGSGPGGGPTDM 948

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Nmdar2	NP_001014714.1	PBP1_iGluR_NMDA_NR2	99..485	CDD:380601	80/427 (19%)
		PBP2_iGluR_NMDA_Nr2	502..908	CDD:270436	119/435 (27%)
grik5	NP_001315085.1	PBP1_iGluR_Kainate_KA1_2	36..414	CDD:380616	87/467 (19%)
		Periplasmic_Binding_Protein_Type_2	427..797	CDD:473866	116/426 (27%)