DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment DAAM and Daam2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001188522.1 Gene:DAAM / 31075 FlyBaseID:FBgn0025641 Length:1463 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038940375.1 Gene:Daam2 / 316201 RGDID:1306128 Length:1107 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1216 Identity:543/1216 - (44%)
Similarity:746/1216 - (61%) Gaps:176/1216 - (14%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   308 KKKMPGFRGRRVWCGCFKDDEPPEICVVEGAFTLQTLTPTQPMPSVDELDTKFAELVEELDLTAP 372
            :|:.|  .|....| ||...:.||| .:..:..||.|..:.|:|:.:||:..|||||:|||||..
  Rat     4 RKRSP--HGLGFLC-CFGSSDLPEI-DLRDSHPLQYLEFSSPIPNPEELNVCFAELVDELDLTDK 64

  Fly   373 NKEAMLSLPAQKKWQIYCSRKLPLDAADGPDAAAVTQPPTAEHYIERLKELVVHISL-SPEDSPS 436
            |:||:.:||.:||||||||:|   ...:.|:..|.:.|   |.||:|:..:....:| ..||..:
  Rat    65 NREAVFALPPEKKWQIYCSKK---KEQEDPNKLATSWP---EFYIDRINAMATMQNLYDTEDEET 123

  Fly   437 HELGNRLDGHAAFVDALKTALRTSTHSFVLRFVELDGLPALLDLLLQLDIRVANSPLHTSLIGCI 501
                   |..:..|:.|||||||....||.||:||:||..||:.|..:|.....|.:||||||||
  Rat   124 -------DKRSQVVEDLKTALRTQPMRFVTRFIELEGLSCLLNFLRGMDHATCESRIHTSLIGCI 181

  Fly   502 KALMNNSMGRAHVLAHPTAIDTIARSLAADNIRTKIAALEILGAVCLVPGGHRKVLQAMLHFQVF 566
            |||||||.|||||||.|.||..||:||..:|.:||:|.||||||||||||||:||||||||:||:
  Rat   182 KALMNNSQGRAHVLAQPEAISIIAQSLRTENSKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQVY 246

  Fly   567 ATERTRFQSIVNDLDRSTYAYRDNVNLKTALMSFVNAVLNYGPGQENLEFRLHLRYEFLMLGIQP 631
            |.||||||:::|:||||...|||.||||||:|||:|||||.|.|::|||||||||||||||||||
  Rat   247 AAERTRFQTLLNELDRSLGRYRDEVNLKTAIMSFINAVLNAGAGEDNLEFRLHLRYEFLMLGIQP 311

  Fly   632 VIDKLRTHENETLDRHLDFFEMVRAEDEKEFARRFKEEHVDTKSAGSMFELLRRKLSHSPAYPHM 696
            ||||||.|||..||:|||||||||.||:.|.||||...|:|||||..||||:.:||.|:.|||.:
  Rat   312 VIDKLRQHENAILDKHLDFFEMVRNEDDLELARRFDMVHIDTKSASQMFELIHKKLKHTEAYPCL 376

  Fly   697 LSLLQHMLLLPY--TGHCTEHWLLIDRVVQQIVLQVEQRPNSDLIVDPDDPEKQLKLAAESPVHD 759
            ||:|.|.|.:||  .|...:.|.|:||::||||||.|:..                        |
  Rat   377 LSVLHHCLQMPYKRNGGYFQQWQLLDRILQQIVLQDERGV------------------------D 417

  Fly   760 PDVAPLQ-IDVAKLVRLLVKEEQLTQARKRADELERENFDVQSRLAKKEQELDLRMQEKEDLETG 823
            ||:|||: .:|..:|.:|:.|.::.|.|.:|::..:|:.::.|||.:||:|.:.:..|||::...
  Rat   418 PDLAPLENFNVKNIVNMLINENEVKQWRDQAEKFRKEHMELLSRLERKERECETKTLEKEEMMRT 482

  Fly   824 LARMRERLEKESAQHSQAVQRAQTAEMRAEDLQHRLISEQQERARLERLVTEGSIPDDQ-KVAGL 887
            |.:|:::|.:||.:..||  |.|.||:...                   |:....|... .::..
  Rat   483 LNKMKDKLARESQELRQA--RGQVAELTGP-------------------VSSPPPPGGPLTLSSS 526

  Fly   888 TGCNGAVSPPPAPPMLKAIPPPPPPMAPSMMPPPP--PPC--PGAPPPPPSMAQTMAPAPPKVDL 948
            |..|....|||..|:....||||||:.|...|.||  |||  .|:|||...::...||      |
  Rat   527 TTTNDLPPPPPPLPLDNCTPPPPPPLPPGGPPIPPGAPPCFSSGSPPPHEPLSSNEAP------L 585

  Fly   949 PKKNVPQPTNPLKSFNWSKLPDAKLQGTVWSELDESKLYNNMELESIDKLFSAYQKNG------- 1006
            .||.:|||::|||||||.||.:.::.||||:|:|:|:::..::||..:|:|||||::.       
  Rat   586 RKKRIPQPSHPLKSFNWVKLNEERVSGTVWNEIDDSQVFRILDLEDFEKMFSAYQRHQGCMQEGA 650

  Fly  1007 ----------------------------------VSATD-----GSYEDLRVTGKAAKQKVLSVI 1032
                                              ||||.     ||.||:.:..:  |.|.||||
  Rat   651 QRERGNVRDGGTASRSLPAAETNDHRTEKASRSMVSATGVKKELGSTEDIYLASR--KVKELSVI 713

  Fly  1033 DGRRAQNCTILLSKLKMSDMEISKAILSMDSNEQLQLDMVEQLLKFTPSAEERALLDEHSEDIES 1097
            ||||||||.|||||||:|:.||.:|||.||..|.|..||:||||||.|...:..||:||..:||.
  Rat   714 DGRRAQNCIILLSKLKLSNEEIRRAILRMDEQEDLAKDMLEQLLKFIPEKSDVDLLEEHKHEIER 778

  Fly  1098 LARADRFLYEISKIPHYEQRLKSLHYKKRFMLTINDLVPRITSVMEASREVARSRRLRKLLELVL 1162
            :|||||||||:|:|.||:|||::|.:||:|...:.:..|::.:::.||:|:..|:||:|:||:||
  Rat   779 MARADRFLYEMSRIDHYQQRLQALFFKKKFQERLAEAKPKVEAILLASQELTLSKRLKKMLEVVL 843

  Fly  1163 ALGNYMNRGARGNASGFRLASLNRLADTKSSAAKGTTLLHYLVQVIERKFKDLLKLEDDIPHVRE 1227
            |:||:||:|.||.|.|||:||||::||||||..:..:|||||:.::|:.|.|:|.:..::.|:.:
  Rat   844 AIGNFMNKGQRGGAYGFRVASLNKIADTKSSIDRNISLLHYLIMILEKHFPDILNMPSELLHLSK 908

  Fly  1228 ASKVSLGEMDKDIQMLRTGLADVAREIEFHRSSGPAQQGDRFLPVMREFHAQASVRFAELEDKFQ 1292
            |:||:|.|::|::..||.||..|..|:|:.|... ....|:|:|||.:|...:|..|:|||::..
  Rat   909 AAKVNLAELEKEVGALRRGLRAVEVELEYQRQQA-RDPNDKFVPVMSDFITVSSFSFSELEEQLN 972

  Fly  1293 DMKTRFDRAVRLFGEDGSVLQPDEFFGIFDSFLAAFAEARHDNESFRRRQEEEEKRAKQEAELK- 1356
            :.:.:|.:|:..|||..|.:||||||||||:||.||.|||.|.|:.|||:||:|:||:.|:.|| 
  Rat   973 EARDKFAKALAHFGEQDSKMQPDEFFGIFDTFLQAFLEARQDLEAMRRRKEEDERRARMESMLKE 1037

  Fly  1357 ---KRTIERKNKTGLMTSVARNLGLKSGSSNGDPDSPAKGG--DNKGEFDDLISALRTGDVFGED 1416
               |...:|:.|.                        ..||  :..||||||:||||:|:||.:|
  Rat  1038 QREKERWQRQRKV------------------------LVGGALEESGEFDDLVSALRSGEVFDKD 1078

  Fly  1417 MAKFKRSRKARVLNGGGSSTGHTSPPRHGSLQREESGRERERTVRR 1462
            :.||||:||                 |.|:...|.:   |||.:.|
  Rat  1079 LNKFKRNRK-----------------RPGNQVAEVT---RERAINR 1104

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
DAAMNP_001188522.1 Drf_GBD 349..548 CDD:461886 100/199 (50%)
Drf_FH3 551..737 CDD:461885 125/187 (67%)
Smc <765..>875 CDD:440809 30/110 (27%)
FH2 950..1328 CDD:396655 190/423 (45%)
Daam2XP_038940375.1 Drf_GBD 41..228 CDD:461886 100/199 (50%)
Drf_FH3 231..435 CDD:461885 133/227 (59%)
FH2 587..1008 CDD:396655 190/423 (45%)

Return to query results.
Submit another query.