DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment G9a and Ash1l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001259088.1 Gene:G9a / 30971 FlyBaseID:FBgn0040372 Length:1657 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063137913.1 Gene:Ash1l / 310638 RGDID:1306350 Length:3000 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2180 Identity:396/2180 - (18%)
Similarity:690/2180 - (31%) Gaps:775/2180 - (35%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     6 ELMNSMSST-------FNSDCATSTAEGGTLLNLNLAEDKTLKWRNLANNQFASKEKKHKDKE-- 61
            ||...:|||       .......|:|.|  |:|.::.  |.|....:| .|..||:..:...|  
  Rat   411 ELGKKLSSTVGLVAKDVTKKIVASSAMG--LVNKDIG--KKLLSCPIA-GQLGSKDALNLKSEAL 470

  Fly    62 ---EEERKEA--------RNQEEIEDIKALLADVVDAAAVKLEEEEAQNAEKVEPHTKCEIEEEG 115
               :|:.|.:        .:||..|.:|       |:|..|..|      :.|..|:|       
  Rat   471 LPTQEQLKASCSANISNHESQELPESLK-------DSATSKTFE------KNVMRHSK------- 515

  Fly   116 RKEMEYDQDVAKQDSEMEKKQNGKATSITV-KMESNER----AEKHATE--IATTSTERWENESF 173
             :.|.....|.|:.:.:||:...:.|.|.. ...||||    ..||..:  :..||.:      |
  Rat   516 -ESMLEKFSVRKEITNLEKEMFNEGTCIQQDSFSSNERGAFETSKHEKQPPVYCTSPD------F 573

  Fly   174 KTEQQNKKAAEKE------EEPILAATQKLEANAEPLTTTRIEVA---VASPLVVSSASVKL--- 226
            :....:..:..|.      |..:.:::..:..|  |||....|.:   |.:||:::|.:.::   
  Rat   574 QIGGASDASTAKSPFGAVGESNLPSSSPTVSVN--PLTRNPPETSSQLVPNPLLLNSTAEQMEEI 636

  Fly   227 -AADATNQMRAAT---SAGAATLA----------DKNVQVSPG------------GTRRSRRTPR 265
             .:...||..|.:   :.|..:|.          ||.:..|..            |.:.|..:..
  Rat   637 SESIGKNQFTAESTHLNVGHRSLGHSISIECKGIDKELNESKSTHLDISRISSSLGKKPSLASDS 701

  Fly   266 PIDTPT---------------------SVTDEHVQVE------------NKKFGKSEQYT----- 292
            .|.|.|                     :..|:|.||.            .|:.|:..::|     
  Rat   702 GIHTITPSVVNFTSLFSNKPFLKLGAVAAPDKHCQVAESLSTSFQSKPLKKRKGRKARWTKVVAR 766

  Fly   293 -DCSS----HLERFTLDDNTAIVRLQLKSEPDK----------------------------PSLT 324
             .|.|    .|||..|..|.:...|...|||.|                            |||.
  Rat   767 STCRSPKGLDLERSELFKNVSCSSLSNSSEPAKFMKTIGASSFVDHDFLKRRLPKLSKSSAPSLA 831

  Fly   325 ALSPEENSAP-----------------------APKRGRGRARK--------------------- 345
            .|:..|.::.                       .|||||.::::                     
  Rat   832 LLADSEKASHKSFITHKLSSSMCVTSDLLSDIYKPKRGRPKSKEMPQLEGPPKRTLKIPASKVFS 896

  Fly   346 -----------IRPDAEVETSEVILPCEDSLGEKKPGRKRKLPDEPIDQQQ--LSDLVVVKTE-- 395
                       ::|:.|:.:.:..|..  |...||.||.::....|:..:.  ||....|.||  
  Rat   897 LQSKEEQEPPILQPEIEIPSFKQSLSV--SPFPKKRGRPKRQMRSPVKMKPPVLSVAPFVATESP 959

  Fly   396 -------------------QEELGDA--------------------------------------- 402
                               :::|.|.                                       
  Rat   960 SKLESESENHRSSSDFFESEDQLQDTDDLEDSHRQSVCSVSDLEMEPDKKISKRNNGQLMKTIIR 1024

  Fly   403 PLGDVKRMRRSVRLGNRLHA--DGSPWEEVKTEALHPQPSAELSFAEVTSEILPLAVLDEKTPPK 465
            .:..:|.::|...|...|.:  :.|...:|:::..:...|...:|.....:.:.::........|
  Rat  1025 KINKMKTLKRKKLLNQILSSSVESSNKGKVQSKLHNTVSSLAATFGSKLGQQINVSKKGTIYIGK 1089

  Fly   466 KRGRKAKT---------------------------------PCVKLESETSCGLPFANGNKKTNS 497
            :||||.||                                 |.:...:.:|..||....::.:.:
  Rat  1090 RRGRKPKTVLNGLLSGSPASLAVLEQTAQQAAGSALGQILPPLLPSPASSSEILPSPICSQSSGT 1154

  Fly   498 SGGCE-----------------------------LQLPKRSK--RRIKPTPKILENDELRCEFET 531
            |||..                             |.:.|.:|  ||:.| |.:|.|       ..
  Rat  1155 SGGQSPVSSDAGFVEPSSVPYLHVHSRQGSMIQTLAMKKAAKGRRRLSP-PTLLPN-------SP 1211

  Fly   532 KHIERMTQWESA-----AAVDGDFETPTTGGNGSNSSTSRQKSDKSDGSNFEGGPGHPAGTSAIK 591
            .|:..:|..:.|     :....|...|:..|.|::::::..:::|..|.               |
  Rat  1212 SHLSELTSLKEATPSPVSESHSDETIPSDSGIGTDNNSTSDRAEKFCGQ---------------K 1261

  Fly   592 KRLFSKSQRDIENYGAAMLAKSKLPPCPDVEQFLNDIKASRINANRSPEERKLNKKQQR------ 650
            ||     :...|:.       |.:|  |:....||.:|           |:..:|.::|      
  Rat  1262 KR-----RHSFEHI-------SLIP--PETSTVLNSLK-----------EKHKHKCKRRSHDYLS 1301

  Fly   651 --KLAKQKEKHLKHLGLQKNHRDEPSDNDSSNTDNEFFPTTRVQVGKPS---VTLRVRNSVTKE- 709
              |:.:||.|..|.....:|.:|.           :|.......:.:.|   :|.|..:.:.:: 
  Rat  1302 YDKMKRQKRKRKKKYPQLRNRQDP-----------DFIAELEELISRLSEIRITHRSHHFIPRDL 1355

  Fly   710 LPTTATLKSRR---------NPV--VQAAKLTRRIGARAAGEVTEAARASVPISTPDAEQLHSLD 763
            |||...:....         :|:  ::...|.::   |........|.|.:|.       :|||.
  Rat  1356 LPTIFRINFNSFYTHPSFPLDPLHYIRKPDLKKK---RGRPPKMREAMAEMPF-------MHSLS 1410

  Fly   764 TSIQA-DVTPIRDLDMRPSTSRVSKF----------ICLCQKPSQYYARNAPDSSYCCAIDHIDD 817
            ..:.: ...|...:...||....:..          ......||..:....|..||..| .|:  
  Rat  1411 FPLSSTGFYPSYGMPYSPSPLTAAPIGLGYYGRYPPTLYPPPPSPSFTTPLPPPSYMHA-GHL-- 1472

  Fly   818 QKIGCCN--ELSSEVHNLLR----------------------PSQRVSYMILCDEHKKRLQ---- 854
                ..|  :...:.|.|||                      |.....:|:   |||.|.:    
  Rat  1473 ----LLNPTKYHKKKHKLLRQEAFLTTSRTPLLSMSTYPSVPPEMAYGWMV---EHKHRHRHKHR 1530

  Fly   855 ---------SHNCCAGCGIF----------CTQGKFVLCKQQHFFHPDCAQRFILSTSYEKELGD 900
                     |.:..:...:.          .|.|.....|::|..|..|..   ||.|  |.|.:
  Rat  1531 EHRSEQPQVSMDTGSSRSVLESLKRYRFGKDTVGDRYKHKEKHRCHMSCPH---LSPS--KSLIN 1590

  Fly   901 EEDQGVK---FSSPVLVLKCPHCGLDTPERTSTVTMKCQSLPVFLRTQKYKIKPARLTTSSHLTQ 962
            .|:|.|.   ..|..|.|     ||.||     :.:.|......|....:.......::..|:..
  Rat  1591 REEQWVSREPSESSSLAL-----GLQTP-----LQIDCSESSPSLSLGGFTPNSEPASSDEHMNL 1645

  Fly   963 F----GTVENANTPGATARNK----GGL----STAVTLSAASSPASKTNGAQRGRAGTSNSNSRH 1015
            |    |:...:| |.::.|.|    .||    .||::......|...|..|.:..||:.:::.:.
  Rat  1646 FTSAIGSCRVSN-PNSSCRKKLTDSPGLFPVQDTALSRPHRKEPLPSTERAIQSLAGSQSASDKP 1709

  Fly  1016 ALNSINFAQLIP-------ESVMNVVLRGHVVSASGRVTAEFTPRD---MYYAVQNDDLERVAEI 1070
            :..|.......|       ||..:.|  ..:.|.|.|:.|......   :...||:|:.|.|.:.
  Rat  1710 SQRSSESTNCSPTRKRSSSESTSSTV--NGIPSRSPRLVASLDDSVDCLLQRIVQHDEQESVEKN 1772

  Fly  1071 LAADFNVLTPIREYLNGTCLHLVAHSGTLQMAYLLLCKGASSPDFVNIVDYELRTALMCAVMNEK 1135
            ..|.   :|.:....:.:..|..:...||..:..||.....|....:|.....:.|..|:..:.|
  Rat  1773 GDAP---ITTVSAPPSSSPGHSYSKERTLGKSDSLLVPAVPSDSCNSIPLLSEKLASRCSPHHIK 1834

  Fly  1136 CDMLNLFLQ-----CGADVAIKGPDGKTSLHIAAQLGNLEATQLIVDSYRTSRNITSFLSFIDAQ 1195
            ..::....:     |..|            .|.|...||:....|:.:.:..|.           
  Rat  1835 RSVVEAMQRQARKMCNYD------------KILATKKNLDHVNKILKAKKLQRQ----------- 1876

  Fly  1196 DEGGWTAMVWAAELGHTDIVRLASLPQAVFLKLINIFLFISFLLNQDADPNICDNDNNTV-LHWS 1259
                       |..|:..:.|....|:...|:.  :....:|...|..:|.:  |:...| ||.|
  Rat  1877 -----------ARTGNNFVKRRPGRPRKCPLQA--VVSMQAFQAAQFVNPEL--NEGEEVSLHLS 1926

  Fly  1260 TLHNDGLDTITVLLQS---GADCNVQNVEG----------------------------------- 1286
            .      ||:|.::::   ..:.|.::.:|                                   
  Rat  1927 P------DTVTDVIEAVVQSVNLNSEHKKGWKRKNWLLEEQTRKKQKTVPEEEEQENNKSFIEKP 1985

  Fly  1287 -------DTPLHIACRHSVTRMCIALIANGADLMIKNKAEQLPFDCIPNEESECGRTVGFNMQMR 1344
                   :||...:...|..:..:|||..      :.||.:.|                    .:
  Rat  1986 VEIPSPLETPAEPSEPESNLQPVLALIPR------EKKAPRPP--------------------KK 2024

  Fly  1345 SFRPLGLRTFVVCADASNGREARPIQVVRNELAMSENEDEADSLMWP------------DFRYVT 1397
            .::..||.:.|.   .:...::|.||:.:.:|..:..|.|......|            ||:...
  Rat  2025 KYQRAGLYSDVY---KTTDPKSRLIQLKKEKLEYTPGEHEYGLFPAPIHVGKYLRQKRIDFQLPY 2086

  Fly  1398 QCIIQ------------------QNSVQID-RRVS--QMRICSCLDSCSSDRCQCNGASSQNWYT 1441
            ..:.|                  :::|.:| :.:|  :...|:|.......|..|          
  Rat  2087 DILWQWKHNQLYKKPDVPLYKKIRSNVYVDVKPLSGYEATTCNCKKPDDDTRKGC---------- 2141

  Fly  1442 AESRLNADFNYEDPAVIF-ECN-DVCGCNQLSCKNRVVQNGTRTPLQIVECED----QAKGWGVR 1500
            .:..||        .:|| ||: :.|.|.:..|..|:.::      :.|:|.:    :.||||:|
  Rat  2142 GDDCLN--------RMIFAECSPNTCPCGEQCCNQRIQRH------EWVQCLERFRAEEKGWGIR 2192

  Fly  1501 ALANVPKGTFVGSYTGEILTAMEADRRT-------DDSYYFDLDNGHCIDANYYGNVTRFFNHSC 1558
            ....:..|.|:..|.||:::..|...|.       .|.|..:||:|..||:...||..||.||||
  Rat  2193 TKEPLKAGQFIIEYLGEVVSEQEFRNRMIEQYHNHSDHYCLNLDSGMVIDSYRMGNEARFINHSC 2257

  Fly  1559 EPNVLPVRVFYEHQDYRFP---KIAFFSCRDIDAGEEICFDYGEKFWRVEHRSCVGCRCLTTTCK 1620
            :||.       |.|.:...   :|..::.:|:.||.|:.:||....:.||.:..  |:|....|:
  Rat  2258 DPNC-------EMQKWSVNGVYRIGLYALKDVPAGTELTYDYNFHSFNVEKQQL--CKCGFEKCR 2313

  Fly  1621 --YASQSSSTNASPTNATTAPENETGTLSSTNTEK 1653
              ...:|...|..|::..:.|.: |...|:.:.||
  Rat  2314 GIIGGKSQRMNGLPSHKGSQPAS-THRKSARSKEK 2347

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
G9aNP_001259088.1 PTZ00121 <68..>188 CDD:173412 28/140 (20%)
EHMT_ZBD 786..933 CDD:411018 40/206 (19%)
ANKYR 1063..1322 CDD:440430 48/309 (16%)
ANK repeat 1088..1120 CDD:293786 7/31 (23%)
ANK repeat 1124..1153 CDD:293786 5/33 (15%)
ANK repeat 1155..1196 CDD:293786 6/40 (15%)
ANK repeat 1199..1249 CDD:293786 8/49 (16%)
ANK repeat 1251..1283 CDD:293786 8/35 (23%)
ANK repeat 1285..1316 CDD:293786 7/72 (10%)
SET_EHMT 1391..1622 CDD:380941 66/281 (23%)
Ash1lXP_063137913.1 None

Return to query results.
Submit another query.