DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Myh14 and Mhc

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001094160.1 Gene:Myh14 / 308572 RGDID:1306821 Length:2000 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_523587.4 Gene:Mhc / 35007 FlyBaseID:FBgn0264695 Length:1962 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:2028 Identity:766/2028 - (37%)
Similarity:1178/2028 - (58%) Gaps:114/2028 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat    17 PGPV----PEAAQPFLFA---PRTPNVGGPGGPQVEWTARRMVWVPSELHGFEAAALRDEGEEEA 74
            |.||    .|...|:||.   .|..:...|      :.:::..|:|.|..|:....::....:..
  Fly     2 PKPVANQEDEDPTPYLFVSLEQRRIDQSKP------YDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIV 60

  Rat    75 EVELAESGRRLRLPRDQIQRMNPPKFSKAEDMAELTCLNEASVLHNLRERYYSGLIYTYSGLFCV 139
            .|.| :.|....|.:|.:|::||||:.|||||:.||.||:||||||||:|||:.|||||||||||
  Fly    61 SVGL-QGGETRDLKKDLLQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCV 124

  Rat   140 VINPYKQLPIYTEAIVEMYRGKKRHEVPPHIYAVTEGAYRSMLQDREDQSILCTGESGAGKTENT 204
            .|||||:.|:||....:|||||:|:||||||:|:::|||..||.:..:||:|.||||||||||||
  Fly   125 AINPYKRYPVYTNRCAKMYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENT 189

  Rat   205 KKVIQYLAHVASSPKGRKEPGVPASVSTMSYGELERQLLQANPILEAFGNAKTVKNDNSSRFGKF 269
            ||||.|.|.|.:|.|        ...:..|.|.||.|::|.||:||||||||||:||||||||||
  Fly   190 KKVIAYFATVGASKK--------TDEAAKSKGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKF 246

  Rat   270 IRINFDIAGYIVGANIETYLLEKSRAIRQAKDECSFHIFYQLLGGAGEQLK-ADLLLEPYSHYRF 333
            |||:|...|.:.||:||||||||:|.|.|...|.|:|||||::.|:...:| ..||.:....|..
  Fly   247 IRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQSLERSYHIFYQIMSGSVPGVKDICLLTDNIYDYHI 311

  Rat   334 LTNGPSSSPG-QERELFQETLESLRVLGLLPEEITAMLRTVSAVLQFGNIVLKKERNTDQATMPD 397
            ::.|..:... .:.|.|..|.::..:||...:|...:.|..:||:..|.:..|:....:||....
  Fly   312 VSQGKVTVASIDDAEEFSLTDQAFDILGFTKQEKEDVYRITAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDG 376

  Rat   398 NTAAQKLCRLLGLGVTDFSRALLTPRIKVGRDYVQKAQTKEQADFALEALAKATYERLFRWLVLR 462
            .....::.:|.|....:..:.||.||||||.::|.:.:..:|...::.||.|..::|||:|||.:
  Fly   377 EEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTNSIGALCKGVFDRLFKWLVKK 441

  Rat   463 LNRALDRSPRQGASFLGILDIAGFEIFQLNSFEQLCINYTNEKLQQLFNHTMFVLEQEEYQREGI 527
            .|..||...:: ..|:|:|||||||||:.|.|||||||:|||||||.|||.||||||||||||||
  Fly   442 CNETLDTQQKR-QHFIGVLDIAGFEIFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYQREGI 505

  Rat   528 PWTFLDFGLDLQPCIDLIERPANPPGLLALLDEECWFPKATDKSFVEKVAQEQ-GSHPKFQRPRN 591
            .|||:|||:|||.||||||:|.   |:|::|:||..||||||::|.||:.... |....||:|:.
  Fly   506 EWTFIDFGMDLQLCIDLIEKPM---GILSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAPFQKPKP 567

  Rat   592 LR---DQADFSVLHYAGKVDYKANEWLMKNMDPLNDNVAALLHQSTDRLTAEIWKDVEGIVGLEQ 653
            .:   ..|.|::.||||.|.|....||.||.|||||.|.....:|.::|..||:.|..|      
  Fly   568 PKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEKNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAG------ 626

  Rat   654 VSSLGDGPPGGRPRR-GMFRTVGQLYKESLSRLMATLSNTNPSFVRCIVPNHEKRAGKLEPRLVL 717
            .|..|:...|||.:: |.|.||...|||.|:.||.||.:|.|.|||||:||..|:.|.::..||:
  Fly   627 QSGGGEQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVM 691

  Rat   718 DQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRILFQEFRQRYEILTPNAIPKGFMDGKQACEKMIQALELDPNLY 782
            .||.||||||||||||:|||||:::.:|:.||:|:.|..: :|....|:|.|.:|:.::|..:.|
  Fly   692 HQLTCNGVLEGIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYKIMCPKLL-QGVEKDKKATEIIIKFIDLPEDQY 755

  Rat   783 RVGQSKIFFRAGVLAQLEEERDLKVTDIIVSFQAAARGYLARRAFQRRQQQQSALRVMQRNCAAY 847
            |:|.:|:|||||||.|:||.||.::..|:...||.|||||:|:.|::.|:|:.||:|:|||...|
  Fly   756 RLGNTKVFFRAGVLGQMEEFRDERLGKIMSWMQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVALKVVQRNLRKY 820

  Rat   848 LKLRNWQWWRLFIKVKPLLQVTR-QDEVLQARAQE-LQKVQELQQQSAREVGELQGRVAQLEEER 910
            |:||.|.|::|:.||||||.|:| :||:  ||.:| .:|.:||.....:...||:...|:|..|:
  Fly   821 LQLRTWPWYKLWQKVKPLLNVSRIEDEI--ARLEEKAKKAEELHAAEVKVRKELEALNAKLLAEK 883

  Rat   911 ARLAEQLRAEAELCSEAEETRARLAARKQELELVVTELEARVGEEEECSRQLQSEKKRLQQHIQE 975
            ..|.:.|..|.....:.:|..|:|.|:|.:||..:.:::.|:.:||:...||..:||:..|.|..
  Fly   884 TALLDSLSGEKGALQDYQERNAKLTAQKNDLENQLRDIQERLTQEEDARNQLFQQKKKADQEISG 948

  Rat   976 LETHLEAEEGARQKLQLEKVTTEAKMKKFEEDLLLLEDQNSKLSKERRLLEERLAEFSSQAAEEE 1040
            |:..:|..|...||.:.:|.|.:.:::...:::...::..:||:||:::..|...:...:....|
  Fly   949 LKKDIEDLELNVQKAEQDKATKDHQIRNLNDEIAHQDELINKLNKEKKMQGETNQKTGEELQAAE 1013

  Rat  1041 EKVKSLNKLRVKYEATIADMEDRLKKEEKGRQELEKLKRRLDGESSELQEQMMEQKQRAEELLIQ 1105
            :|:..|||::.|.|.|:.::||.|::|:|.|.::||.||:::|:....||.:.:.::..:||...
  Fly  1014 DKINHLNKVKAKLEQTLDELEDSLEREKKVRGDVEKSKRKVEGDLKLTQEAVADLERNKKELEQT 1078

  Rat  1106 LGRKEEELQSALVRAEEEGGARAQLLKSLREAQAGLAEAQEDLEAERVARAKAEKQRRDLGEELE 1170
            :.||::||.|...:.|:|.....:..:.::|.||.:.|.:|::||||.|||||||||.||..|||
  Fly  1079 IQRKDKELSSITAKLEDEQVVVLKHQRQIKELQARIEELEEEVEAERQARAKAEKQRADLARELE 1143

  Rat  1171 ALRGELEDTLDSTNAQQELRSKREQEVTELKKTLEEEARTHEVAMQELRQRHSQALVELTEQLEQ 1235
            .|...||:...:|:||.||..|||.|:::|::.|||....||..:..||::|:.|:.|:.||::|
  Fly  1144 ELGERLEEAGGATSAQIELNKKREAELSKLRRDLEEANIQHESTLANLRKKHNDAVAEMAEQVDQ 1208

  Rat  1236 ARRGKSVWEKTRLSLEAEVSELKTELSSLQTSRQEGEQKRRRLESQLQEVQGRSSDSERARAEAA 1300
            ..:.|:..||.:.....::::|:..:..:...:...|:..::|:..|.|||.:..::.|...:..
  Fly  1209 LNKLKAKAEKEKNEYYGQLNDLRAGVDHITNEKAAQEKIAKQLQHTLNEVQSKLDETNRTLNDFD 1273

  Rat  1301 EKLQRAQVELESVSTALSEAESKAIRLSKELSSAESQLHDTQELLQEETRAKLALGSRVRALEAE 1365
            ...::..:|...:...|.||||:..:|||...|..:||.||:.|..||:|.:..|..:.|.||.:
  Fly  1274 ASKKKLSIENSDLLRQLEEAESQVSQLSKIKISLTTQLEDTKRLADEESRERATLLGKFRNLEHD 1338

  Rat  1366 AAGLREQMEEEVVARERAGRELQTTQAQLSEWRRRQEEE-AAVLEAGEEARRRAAREAETLAQRL 1429
            ...||||:|||...:....|:|....|:...||.:.|.: .|..|..|||:|:       |..||
  Fly  1339 LDNLREQVEEEAEGKADLQRQLSKANAEAQVWRSKYESDGVARSEELEEAKRK-------LQARL 1396

  Rat  1430 AEKTEAVER-------LERARRRLQQELDDATVDLGQQKQLLSTLEKKQRKFDQLLAEEKAAVLR 1487
            ||..|.:|.       ||:.::||..|::|..:::.:...:.:..||||:.||:::.|.|..|  
  Fly  1397 AEAEETIESLNQKCIGLEKTKQRLSTEVEDLQLEVDRANAIANAAEKKQKAFDKIIGEWKLKV-- 1459

  Rat  1488 AVEDRERVEAEGREREARALS-----LTRALEEEQEAREELERQNRALRAELEALLSSKDDVGKN 1547
               |....|.:..::|.|..|     |..|.||.||..|.:.|:|:.|..|::.||....:.|:|
  Fly  1460 ---DDLAAELDASQKECRNYSTELFRLKGAYEEGQEQLEAVRRENKNLADEVKDLLDQIGEGGRN 1521

  Rat  1548 VHELERARRVAEQAASDLRTQVTELEDELTAAEDAKLRLEVTVQALKAQHERDLQGRDDAGEERR 1612
            :||:|:||:..|....:|:..:.|.|..|...|:..||.::.:..::.:.:|.:|.:::..|..|
  Fly  1522 IHEIEKARKRLEAEKDELQAALEEAEAALEQEENKVLRAQLELSQVRQEIDRRIQEKEEEFENTR 1586

  Rat  1613 RQLAKQLRDAEVERDEERKQRALAMAARKKLELELEELKAQTSAAGQGKEEAVKQLKKMQAQMKE 1677
            :...:.|...:...:.|.|.:|.|:..:||||.::.||:.....|.:...||.|.:|:.|.|:|:
  Fly  1587 KNHQRALDSMQASLEAEAKGKAEALRMKKKLEADINELEIALDHANKANAEAQKNIKRYQQQLKD 1651

  Rat  1678 LWREVEETRSSREEMFTLSRE----SEKRLKGLEAEVLRLQEELAASDRARRQAQQ---DRDEMA 1735
            :...:||.:.:|::    :||    ||:|...|:.|:...:..|..:||.||||:|   |..|..
  Fly  1652 IQTALEEEQRARDD----AREQLGISERRANALQNELEESRTLLEQADRGRRQAEQELADAHEQL 1712

  Rat  1736 EEVASGNLSKAATLEEKRQLEGRLGQLEEELEEEQNNSELLKDHYRKLVLQVETLTTELSAERSF 1800
            .||::.|.|.:|.   ||:||..|..|..:|:|..|.::..::..:|.::....|..||.||:..
  Fly  1713 NEVSAQNASISAA---KRKLESELQTLHSDLDELLNEAKNSEEKAKKAMVDAARLADELRAEQDH 1774

  Rat  1801 SAKAESGRQQLERQIQELRARLGEEDAGARARQKMLIAALESKLAQAEEQLEQESRERILSGKLV 1865
            :...|..|:.||:||:||:.||.|.:|.|....|..|..||.::.:.|.:|:.|.|....:.|.:
  Fly  1775 AQTQEKLRKALEQQIKELQVRLDEAEANALKGGKKAIQKLEQRVRELENELDGEQRRHADAQKNL 1839

  Rat  1866 RRAEKRLKEVVLQVDEERRVADQLRDQLEKSNLRLKQLKRQLEEAEEEASRAQAGRRRLQRELED 1930
            |::|:|:||:..|.:|:|:..::::|.::|...::|..|||:|||||.|:...|..|:.|:|||:
  Fly  1840 RKSERRVKELSFQSEEDRKNHERMQDLVDKLQQKIKTYKRQIEEAEEIAALNLAKFRKAQQELEE 1904

  Rat  1931 VTESAESMNREVTTLRNRLRRGPLTFTTRTVRQVFRLEEGVASDEEEAEGAEPGSAPTQ-EPE-- 1992
            ..|.|:...:.::..|.:.|.|.:                       ..||.|....|. .|:  
  Fly  1905 AEERADLAEQAISKFRAKGRAGSV-----------------------GRGASPAPRATSVRPQFD 1946

  Rat  1993 --APPP---AAPQ 2000
              |.||   .||:
  Fly  1947 GLAFPPRFDLAPE 1959

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Myh14NP_001094160.1 MYSc_Myh14_mammals 115..792 CDD:276893 334/683 (49%)
Myosin_tail_1 869..1949 CDD:460256 345/1101 (31%)
MhcNP_523587.4 Myosin_N 33..75 CDD:460670 8/42 (19%)
MYSc_Myh1_insects_crustaceans 100..765 CDD:276874 334/683 (49%)
Myosin_tail_1 842..1922 CDD:460256 345/1100 (31%)

Return to query results.
Submit another query.