DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment HADHA and Hadha

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000173.2 Gene:HADHA / 3030 HGNCID:4801 Length:763 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_570839.2 Gene:Hadha / 170670 RGDID:620512 Length:763 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:763 Identity:650/763 - (85%)
Similarity:714/763 - (93%) Gaps:0/763 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVACRAIGILSRFSAFRILRSRGYICRNFTGSSALLTRTHINYGVKGDVAVVRINSPNSKVNTLS 65
            |||.||||.||||||||||||||.||.:||.|||||:||||||||||||||:||||||||||||:
  Rat     1 MVASRAIGSLSRFSAFRILRSRGCICHSFTTSSALLSRTHINYGVKGDVAVIRINSPNSKVNTLN 65

Human    66 KELHSEFSEVMNEIWASDQIRSAVLISSKPGCFIAGADINMLAACKTLQEVTQLSQEAQRIVEKL 130
            ||:.|||.||||||||:||||||||||||||||:|||||||||:|.|.||..::|||.|::.|||
  Rat    66 KEVQSEFVEVMNEIWANDQIRSAVLISSKPGCFVAGADINMLASCTTPQEAARISQEGQKMFEKL 130

Human   131 EKSTKPIVAAINGSCLGGGLEVAISCQYRIATKDRKTVLGTPEVLLGALPGAGGTQRLPKMVGVP 195
            |||.||:||||:|||||||||:||:|||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||
  Rat   131 EKSPKPVVAAISGSCLGGGLELAIACQYRIATKDRKTVLGVPEVLLGILPGAGGTQRLPKMVGVP 195

Human   196 AALDMMLTGRSIRADRAKKMGLVDQLVEPLGPGLKPPEERTIEYLEEVAITFAKGLADKKISPKR 260
            ||.|||||||:||||||||||||||||:|||||:|.|||||||||||||:.|||||||:|:|.|:
  Rat   196 AAFDMMLTGRNIRADRAKKMGLVDQLVDPLGPGIKSPEERTIEYLEEVAVNFAKGLADRKVSAKQ 260

Human   261 DKGLVEKLTAYAMTIPFVRQQVYKKVEEKVRKQTKGLYPAPLKIIDVVKTGIEQGSDAGYLCESQ 325
            .|||:||||:||||||||||||||.|||||:|||||||||||||||.||||:|||:|||||.||:
  Rat   261 SKGLMEKLTSYAMTIPFVRQQVYKTVEEKVKKQTKGLYPAPLKIIDAVKTGLEQGNDAGYLAESE 325

Human   326 KFGELVMTKESKALMGLYHGQVLCKKNKFGAPQKDVKHLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTILK 390
            |||||.:|||||||||||:|||||||||||||||.|:.||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   326 KFGELALTKESKALMGLYNGQVLCKKNKFGAPQKTVQQLAILGAGLMGAGIAQVSVDKGLKTLLK 390

Human   391 DATLTALDRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLTGQLDYQGFEKADMVIEAVFEDLSLK 455
            |.|:|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:||||||||||||||||::|
  Rat   391 DTTVTGLGRGQQQVFKGLNDKVKKKALTSFERDSIFSNLIGQLDYKGFEKADMVIEAVFEDLAVK 455

Human   456 HRVLKEVEAVIPDHCIFASNTSALPISEIAAVSKRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTEKTSKD 520
            |:||||||:|.|:|||||||||||||::|||||:|||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat   456 HKVLKEVESVTPEHCIFASNTSALPINQIAAVSQRPEKVIGMHYFSPVDKMQLLEIITTDKTSKD 520

Human   521 TSASAVAVGLKQGKVIIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQEGVDPKKLDSLTTSFGFPVGAA 585
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||
  Rat   521 TTASAVAVGLKQGKVIIVVKDGPGFYTTRCLAPMMSEVIRILQEGVDPKKLDALTTGFGFPVGAA 585

Human   586 TLVDEVGVDVAKHVAEDLGKVFGERFGGGNPELLTQMVSKGFLGRKSGKGFYIYQEGVKRKDLNS 650
            ||.||||:|||:||||||||.||||||||:.|||..|||||||||||||||||||.|.|.|:|||
  Rat   586 TLADEVGIDVAQHVAEDLGKAFGERFGGGSVELLKLMVSKGFLGRKSGKGFYIYQSGSKNKNLNS 650

Human   651 DMDSILASLKLPPKSEVSSDEDIQFRLVTRFVNEAVMCLQEGILATPAEGDIGAVFGLGFPPCLG 715
            ::|:||.:|:||.|.|||||||||:|::||||||||:||||||||||.|||||||||||||||||
  Rat   651 EIDNILVNLRLPAKPEVSSDEDIQYRVITRFVNEAVLCLQEGILATPEEGDIGAVFGLGFPPCLG 715

Human   716 GPFRFVDLYGAQKIVDRLKKYEAAYGKQFTPCQLLADHANSPNKKFYQ 763
            |||||||||||||:||||:|||:|||.||||||||.|.||:.:|||||
  Rat   716 GPFRFVDLYGAQKVVDRLRKYESAYGTQFTPCQLLRDLANNSSKKFYQ 763

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
HADHANP_000173.2 fa_ox_alpha_mit 27..762 CDD:131494 624/734 (85%)
HadhaNP_570839.2 fa_ox_alpha_mit 29..762 CDD:131494 624/732 (85%)

Return to query results.
Submit another query.