DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GRM1 and Grm1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001264993.1 Gene:GRM1 / 2911 HGNCID:4593 Length:1194 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_058707.2 Gene:Grm1 / 24414 RGDID:2742 Length:1199 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1202 Identity:1133/1202 - (94%)
Similarity:1157/1202 - (96%) Gaps:11/1202 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVGLLLFFFPAIFLEVSLLPRSPGRKVLLAGASSQRSVARMDGDVIIGALFSVHHQPPAEKVPER 65
            ||.|||.|||.||||:|:|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MVRLLLIFFPMIFLEMSILPRMPDRKVLLAGASSQRSVARMDGDVIIGALFSVHHQPPAEKVPER 65

Human    66 KCGEIREQYGIQRVEAMFHTLDKINADPVLLPNITLGSEIRDSCWHSSVALEQSIEFIRDSLISI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 KCGEIREQYGIQRVEAMFHTLDKINADPVLLPNITLGSEIRDSCWHSSVALEQSIEFIRDSLISI 130

Human   131 RDEKDGINRCLPDGQSLPPGRTKKPIAGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFDIPQIAYSATSIDLSDK 195
            ||||||:||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 RDEKDGLNRCLPDGQTLPPGRTKKPIAGVIGPGSSSVAIQVQNLLQLFDIPQIAYSATSIDLSDK 195

Human   196 TLYKYFLRVVPSDTLQARAMLDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESGMDAFKELAAQEGLCIAHSDK 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 TLYKYFLRVVPSDTLQARAMLDIVKRYNWTYVSAVHTEGNYGESGMDAFKELAAQEGLCIAHSDK 260

Human   261 IYSNAGEKSFDRLLRKLRERLPKARVVVCFCEGMTVRGLLSAMRRLGVVGEFSLIGSDGWADRDE 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 IYSNAGEKSFDRLLRKLRERLPKARVVVCFCEGMTVRGLLSAMRRLGVVGEFSLIGSDGWADRDE 325

Human   326 VIEGYEVEANGGITIKLQSPEVRSFDDYFLKLRLDTNTRNPWFPEFWQHRFQCRLPGHLLENPNF 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 VIEGYEVEANGGITIKLQSPEVRSFDDYFLKLRLDTNTRNPWFPEFWQHRFQCRLPGHLLENPNF 390

Human   391 KRICTGNESLEENYVQDSKMGFVINAIYAMAHGLQNMHHALCPGHVGLCDAMKPIDGSKLLDFLI 455
            |::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat   391 KKVCTGNESLEENYVQDSKMGFVINAIYAMAHGLQNMHHALCPGHVGLCDAMKPIDGRKLLDFLI 455

Human   456 KSSFIGVSGEEVWFDEKGDAPGRYDIMNLQYTEANRYDYVHVGTWHEGVLNIDDYKIQMNKSGVV 520
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   456 KSSFVGVSGEEVWFDEKGDAPGRYDIMNLQYTEANRYDYVHVGTWHEGVLNIDDYKIQMNKSGMV 520

Human   521 RSVCSEPCLKGQIKVIRKGEVSCCWICTACKENEYVQDEFTCKACDLGWWPNADLTGCEPIPVRY 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:||||||||||:|||||||||||
  Rat   521 RSVCSEPCLKGQIKVIRKGEVSCCWICTACKENEFVQDEFTCRACDLGWWPNAELTGCEPIPVRY 585

Human   586 LEWSNIESIIAIAFSCLGILVTLFVTLIFVLYRDTPVVKSSSRELCYIILAGIFLGYVCPFTLIA 650
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 LEWSDIESIIAIAFSCLGILVTLFVTLIFVLYRDTPVVKSSSRELCYIILAGIFLGYVCPFTLIA 650

Human   651 KPTTTSCYLQRLLVGLSSAMCYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTRKPRFMSAWAQVIIASILIS 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 KPTTTSCYLQRLLVGLSSAMCYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTRKPRFMSAWAQVIIASILIS 715

Human   716 VQLTLVVTLIIMEPPMPILSYPSIKEVYLICNTSNLGVVAPLGYNGLLIMSCTYYAFKTRNVPAN 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat   716 VQLTLVVTLIIMEPPMPILSYPSIKEVYLICNTSNLGVVAPVGYNGLLIMSCTYYAFKTRNVPAN 780

Human   781 FNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNYKIITTCFAVSLSVTVALGCMFTPKMYIIIAKPERN 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 FNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYFGSNYKIITTCFAVSLSVTVALGCMFTPKMYIIIAKPERN 845

Human   846 VRSAFTTSDVVRMHVGDGKLPCRSNTFLNIFRRKKAGAGNANSNGKSVSWSEPGGGQVPKGQHMW 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|.|||||:|
  Rat   846 VRSAFTTSDVVRMHVGDGKLPCRSNTFLNIFRRKKPGAGNANSNGKSVSWSEPGGRQAPKGQHVW 910

Human   911 HRLSVHVKTNETACNQTAVIKPLTKSYQGSGKSLTFSDTSTKTLYNVEEEEDAQPIRFSPPGSPS 975
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||::.....||||.|||
  Rat   911 QRLSVHVKTNETACNQTAVIKPLTKSYQGSGKSLTFSDASTKTLYNVEEEDNTPSAHFSPPSSPS 975

Human   976 MVVHRRVPSAATTPPLPSHLTAEETPLFLAEPALPKGLPPPL--QQQQQPPPQQ-----KSLMDQ 1033
            ||||||.|..|||||||.||||||||||||:..:||||||||  ||.|||||||     ||||||
  Rat   976 MVVHRRGPPVATTPPLPPHLTAEETPLFLADSVIPKGLPPPLPQQQPQQPPPQQPPQQPKSLMDQ 1040

Human  1034 LQGVVSNFSTAIPDFHAVLAGPGGPGNGLRSLYPPPPPPQHLQMLPLQLSTFGEELVSPPA-DDD 1097
            |||||:||.:.||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||||.||.:|||. |||
  Rat  1041 LQGVVTNFGSGIPDFHAVLAGPGTPGNSLRSLYPPPPPPQHLQMLPLHLSTFQEESISPPGEDDD 1105

Human  1098 DDSERFKLLQEYVYEHEREGNTEEDELEEEEEDLQAASKLTPDDSPALTPPSPFRDSVASGSSVP 1162
            |||||||||||:||  ||||||||||| ||||||..||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat  1106 DDSERFKLLQEFVY--EREGNTEEDEL-EEEEDLPTASKLTPEDSPALTPPSPFRDSVASGSSVP 1167

Human  1163 SSPVSESVLCTPPNVSYASVILRDYKQSSSTL 1194
            |||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat  1168 SSPVSESVLCTPPNVTYASVILRDYKQSSSTL 1199

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GRM1NP_001264993.1 PBP1_mGluR_groupI 36..510 CDD:380597 467/473 (99%)
NCD3G 521..571 CDD:462210 47/49 (96%)
7tmC_mGluR1 591..840 CDD:320565 247/248 (100%)
TM helix 1 591..616 CDD:320565 24/24 (100%)
TM helix 2 628..649 CDD:320565 20/20 (100%)
TM helix 3 658..682 CDD:320565 23/23 (100%)
TM helix 4 706..726 CDD:320565 19/19 (100%)
TM helix 5 749..775 CDD:320565 24/25 (96%)
TM helix 6 783..806 CDD:320565 22/22 (100%)
TM helix 7 809..834 CDD:320565 24/24 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 883..905 19/21 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1007..1030 18/29 (62%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1113..1173 54/59 (92%)
GluR_Homer-bdg 1144..1194 CDD:431390 48/49 (98%)
Grm1NP_058707.2 PBP1_mGluR_groupI 36..510 CDD:380597 467/473 (99%)
NCD3G 521..571 CDD:462210 47/49 (96%)
7tmC_mGluR1 591..840 CDD:320565 247/248 (100%)
TM helix 1 591..616 CDD:320565 24/24 (100%)
TM helix 2 628..649 CDD:320565 20/20 (100%)
TM helix 3 658..682 CDD:320565 23/23 (100%)
TM helix 4 706..726 CDD:320565 19/19 (100%)
TM helix 5 749..775 CDD:320565 24/25 (96%)
TM helix 6 783..806 CDD:320565 22/22 (100%)
TM helix 7 809..834 CDD:320565 24/24 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 882..905 20/22 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 959..1036 52/76 (68%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1056..1081 22/24 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1120..1177 53/57 (93%)
GluR_Homer-bdg 1149..1199 CDD:431390 48/49 (98%)

Return to query results.
Submit another query.