Protein Alignment DROSHA and Drosha

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_037367.3
• Gene: DROSHA / 29102
• HGNCID: 17904
• Length: 1374
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001101125.2
• Gene: Drosha / 310159
• RGDID: 1307626
• Length: 1373
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1374
• Identity: 1323/1374 - (96%)
• Similarity: 1353/1374 - (98%)
• Gaps: 2/1374 - (0%)

Human     2 MQGNTCHRMSFHPGRGCPRGRGGHGARPSAPSFRPQNLRLLHPQQPPVQYQYEPPSAPSTTFSNS 66
            ||||||||||:||||||||||||||||||||::||||||||||||||.|||||||||||::||||
  Rat     1 MQGNTCHRMSYHPGRGCPRGRGGHGARPSAPTYRPQNLRLLHPQQPPAQYQYEPPSAPSSSFSNS 65

Human    67 PAPNFLPPRPDFVPFPPPMPPSAQGPLPPCPIRPPFPNHQMRHPFPVPPCFPPMPPPMPCPNNPP 131
            .||||:||||||||:|||:.|||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 QAPNFMPPRPDFVPYPPPVAPSAQGPLPPCPVRPPYPNHQMRHPFPVPPCFPPMPPPMPCPNNPP 130

Human   132 VPGAPPGQGTFPFMMPPPSMPHPPPPPVMPQQVNYQYPPGYSHHNFPPPSFNSFQNNPSSFLPSA 196
            |.||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||| |:||||:|||||||.|||.|||
  Rat   131 VSGAPPGQGTFPFMVPPPSMPHPPPPPVMPQQVNYQYPPGYS-HSFPPPNFNSFQNNSSSFPPSA 194

Human   197 NNSSSPHFRHLPPYPLPKAPSERRSPERLKHYDDHRHRDHSHGRGERHRSLDRRERGRSPDRRRQ 261
            ||||:|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||.
  Rat   195 NNSSTPHFRHLPPYSLPKAQSERRSPERLKHYDDHRHRDHSHGRGERHRSLERRERGRSPERRRP 259

Human   262 DSRYRSDYDRGRT-PSRHRSYERSRERERERHRHRDNRRSPSLERSYKKEYKRSGRSYGLSVVPE 325
            :|||||:|||||| |.|||||||||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||.|.||
  Rat   260 ESRYRSEYDRGRTPPPRHRSYERSRERERERHRHRENRRSPSLERAYKKEYKRSGRSYGLPVTPE 324

Human   326 PAGCTPELPGEIIKNTDSWAPPLEIVNHRSPSREKKRARWEEEKDRWSDNQSSGKDKNYTSIKEK 390
            |||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||:|||||:|:|||||||
  Rat   325 PAGCTAELPGEIIKNTDSWAPPQENVNHRSPSREKKRARWEEEKDRWSDSQSSGKEKSYTSIKEK 389

Human   391 EPEETMPDKNEEEEEELLKPVWIRCTHSENYYSSDPMDQVGDSTVVGTSRLRDLYDKFEEELGSR 455
            ||||..|:|.|||:|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   390 EPEEAPPEKTEEEDEELLKPVWIRCTHSESYYSSDPMDQVGDSTVVGTSRLRDLYDKFEEELGNR 454

Human   456 QEKAKAARPPWEPPKTKLDEDLESSSESECESDEDSTCSSSSDSEVFDVIAEIKRKKAHPDRLHD 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   455 QEKAKAARPPWEPPKTKLDEDLESSSESECETDEDSTCSSSSDSEVFDVIAEIKRKKAHPDRLHD 519

Human   521 ELWYNDPGQMNDGPLCKCSAKARRTGIRHSIYPGEEAIKPCRPMTNNAGRLFHYRITVSPPTNFL 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   520 ELWYNDPGQMNDGPLCKCSAKARRTGIRHSIYPGEEAIKPCRPMTNNAGRLFHYRITVSPPTNFL 584

Human   586 TDRPTVIEYDDHEYIFEGFSMFAHAPLTNIPLCKVIRFNIDYTIHFIEEMMPENFCVKGLELFSL 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   585 TDRPTVIEYDDHEYIFEGFSMFAHAPLTNIPLCKVIRFNIDYTIHFIEEMMPENFCVKGLELFSL 649

Human   651 FLFRDILELYDWNLKGPLFEDSPPCCPRFHFMPRFVRFLPDGGKEVLSMHQILLYLLRCSKALVP 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   650 FLFRDILELYDWNLKGPLFEDSPPCCPRFHFMPRFVRFLPDGGKEVLSMHQILLYLLRCSKALVP 714

Human   716 EEEIANMLQWEELEWQKYAEECKGMIVTNPGTKPSSVRIDQLDREQFNPDVITFPIIVHFGIRPA 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat   715 EEEIANMLQWEELEWQKYAEECKGMIVTNPGTKPSSVRIDQLDREQFNPEVITFPIIVHFGIRPA 779

Human   781 QLSYAGDPQYQKLWKSYVKLRHLLANSPKVKQTDKQKLAQREEALQKIRQKNTMRREVTVELSSQ 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   780 QLSYAGDPQYQKLWKSYVKLRHLLANSPKVKQTDKQKLAQREEALQKIRQKNTMRREVTVELSSQ 844

Human   846 GFWKTGIRSDVCQHAMMLPVLTHHIRYHQCLMHLDKLIGYTFQDRCLLQLAMTHPSHHLNFGMNP 910
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  Rat   845 GFWKTGIRSDVCQHAMMLPVLTHHIRYHQCLMHLDKLIGYTFQDRCLLQLAMTHPSHHLNFGMNP 909

Human   911 DHARNSLSNCGIRQPKYGDRKVHHMHMRKKGINTLINIMSRLGQDDPTPSRINHNERLEFLGDAV 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   910 DHARNSLSNCGIRQPKYGDRKVHHMHMRKKGINTLINIMSRLGQDDPTPSRINHNERLEFLGDAV 974

Human   976 VEFLTSVHLYYLFPSLEEGGLATYRTAIVQNQHLAMLAKKLELDRFMLYAHGPDLCRESDLRHAM 1040
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  Rat   975 VEFLTSVHLYYLFPSLEEGGLATYRTAIVQNQHLAMLAKKLELDRFMLYAHGPDLCRESDLRHAM 1039

Human  1041 ANCFEALIGAVYLEGSLEEAKQLFGRLLFNDPDLREVWLNYPLHPLQLQEPNTDRQLIETSPVLQ 1105
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1040 ANCFEALIGAVYLEGTLEEAKQLFGRLLFNDPDLREVWLNYPLHPLQLQEPNTDRQLIETSPVLQ 1104

Human  1106 KLTEFEEAIGVIFTHVRLLARAFTLRTVGFNHLTLGHNQRMEFLGDSIMQLVATEYLFIHFPDHH 1170
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  Rat  1105 KLTEFEEAIGVIFTHVRLLARAFTLRTVGFNHLTLGHNQRMEFLGDSIMQLVATEYLFIHFPDHH 1169

Human  1171 EGHLTLLRSSLVNNRTQAKVAEELGMQEYAITNDKTKRPVALRTKTLADLLESFIAALYIDKDLE 1235
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  Rat  1170 EGHLTLLRSSLVNNRTQAKVAEELGMQEYAITNDKTKRPVALRTKTLADLLESFIAALYIDKDLE 1234

Human  1236 YVHTFMNVCFFPRLKEFILNQDWNDPKSQLQQCCLTLRTEGKEPDIPLYKTLQTVGPSHARTYTV 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1235 YVHTFMNVCFFPRLKEFILNQDWNDPKSQLQQCCLTLRTEGKEPDIPLYKTLQTVGPSHARTYTV 1299

Human  1301 AVYFKGERIGCGKGPSIQQAEMGAAMDALEKYNFPQMAHQKRFIERKYRQELKEMRWEREHQERE 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1300 AVYFKGERIGCGKGPSIQQAEMGAAMDALEKYNFPQMAHQKRFIERKYRQELKEMRWEREHQERE 1364

Human  1366 PDETEDIKK 1374
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  Rat  1365 PDEAEDIKK 1373

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
DROSHA	NP_037367.3	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..95		81/92 (88%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	130..406		244/276 (88%)
		SF-CC1	220..>278	CDD:273721	51/58 (88%)
		Necessary for interaction with DGCR8 and pri-miRNA processing activity. /evidence=ECO:0000269|PubMed:26027739, ECO:0000269|PubMed:26748718	390..1365		964/974 (99%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	452..497		42/44 (95%)
		RIBOc	959..1079	CDD:238333	118/119 (99%)
		Rnc	1105..1333	CDD:440336	227/227 (100%)
Drosha	NP_001101125.2	SF-CC1	212..>274	CDD:273721	55/61 (90%)
		RIBOc	958..1078	CDD:238333	118/119 (99%)
		Rnc	1104..1332	CDD:440336	227/227 (100%)