DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SETD2 and Setd2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_054878.5 Gene:SETD2 / 29072 HGNCID:18420 Length:2564 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001388092.1 Gene:Setd2 / 316013 RGDID:1305576 Length:2535 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2573 Identity:2200/2573 - (85%)
Similarity:2322/2573 - (90%) Gaps:47/2573 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKQLQPQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPMFKGVASSRFLPKGTKTKVNL 65
            ||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||
  Rat     1 MKQLPSQPPPKMGDFYDPEHPTPEEEENEAKIENVQKTGFIKGPIFKGVASSRFLPKGTKTKVNL 65

Human    66 EEQGRQKVSFSFSLTKKTLQNRFLTALGNEKQSDTPNPPAVPLQVDSTPKMKMEIGDTLSTAEES 130
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||:|:.||.| ||||.||.|||.|||....|||
  Rat    66 EEQGRQKVSFSFSLTKKTLQNRFFTALSNEKQSDSPHSPATP-QVDSNPKAKMEAGDTFPATEES 129

Human   131 SPPKSRVELGKIHFKKHLLHVTSRPLLATTTAVAS--PPTHAAPLPAVIAESTTVDSPPSSPPPP 193
            ||||||||||:||||||||||||||.|||||.|||  |||  ..||..|||| ||||||||||||
  Rat   130 SPPKSRVELGRIHFKKHLLHVTSRPQLATTTTVASLLPPT--TQLPVAIAES-TVDSPPSSPPPP 191

Human   194 PPPAQATTLSSPAPVTEPVALPHTPITVLM-AAPVPLPVDVAVRSLKEPPIIIVPESLEADTKQD 257
            |||.|.::.|.|||::|||||||.|:|.|| :.|.|||||.|||:.||||:..||||||.|.|||
  Rat   192 PPPPQVSSPSPPAPISEPVALPHPPVTALMTSTPGPLPVDAAVRAQKEPPMKSVPESLELDMKQD 256

Human   258 TISNSLEEHVTQILNEQADISSKKEDSHIGKDEEIPDSSKISLSCKKTGSKKKSSQSEGIFLGSE 322
            .:|||||||..|.|.||||.:.:||||||||:||:.|.||||||.||..|||||||.||.|||||
  Rat   257 IVSNSLEEHTNQTLKEQADNALQKEDSHIGKEEEVSDGSKISLSSKKASSKKKSSQFEGTFLGSE 321

Human   323 SDEDSVRTSSSQRSHDLKFSASIEKERDFKKSSAPLKSEDLGKPSRSKTDRDDKYFSYSKLERDT 387
            ||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||.|||||:|||||||||||||||
  Rat   322 SDEDSVRTSSSQRSHDLKSSTSIEKERDFKKSSAPSKSEDLGKSSRSKTERDDKYFSYSKLERDT 386

Human   388 RYVSSRCRSERERRRSRSHSRSERGSRTNLSYSRSERSHYYDSDRRYHRSSPYRERTRYSRPYTD 452
            ||||:||||||:||||||.|||:|.|||:||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat   387 RYVSTRCRSERDRRRSRSRSRSDRVSRTSLSYSRSERSHYYDSERRYHRSSPYRERTRYSRPYTD 451

Human   453 NRARESSDSEEEYKKTYSRRTSSHSSSYRDLRT-SSYSKSDRDCKTETSYLEMERRGKYSSKLER 516
            ||||||||||:||||||.||||:|  ||||||| |||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat   452 NRARESSDSEDEYKKTYPRRTSAH--SYRDLRTSSSYSKFDRDCKTETSYLEMERRGKYSSKLER 514

Human   517 ESKRTSENEAIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHD-SSASRYKSTLSKPIPKSDKFKNSFCCTELNE 580
            |||||||:||||||||||||||||||||||||| :|.|||||.|||.|.||||||||||||||||
  Rat   515 ESKRTSEHEAIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDNNSTSRYKSALSKSISKSDKFKNSFCCTELNE 579

Human   581 EIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKNPEREKAGSPAPSNRLNDSPTLKKLDELPIFKSEFITHDS 645
            |.|||||||||||||||||||.|||.|||||.|||:|||:||||||.|||||.||.|.|||.|||
  Rat   580 ENKQSHSFSLQTPCSKGSELRTINKIPEREKTGSPSPSNQLNDSPTFKKLDESPILKPEFIGHDS 644

Human   646 HDSIKELDSLSKVKNDQLRSFCPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTDAVLMTSDDSVTGSELSPL 710
            |:|||||: |.|:||||||:||.||||:||||..|:|:|||.|||.||:.|||||||||||:|||
  Rat   645 HESIKELE-LPKMKNDQLRNFCSIELNVNGSPETETDVATFRTSKPDAISMTSDDSVTGSEVSPL 708

Human   711 VKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDDTCMLHKKSESPFRETEPLVSPHQDKLMSMPVMTVDYSKTVV 775
            :|.|:|||||||::.||:|:|.||.|..|.||:|||||||||:|||.||:||:||.|:|||||::
  Rat   709 IKGCVLSSNGFQSVGRCRERDADDACRQHNKSKSPFRETEPLLSPHHDKVMSLPVKTIDYSKTLI 773

Human   776 KEPVDTRVSCCKTKDSDIYCTLNDSNPSLCNSEAENIEPSVMKISSNSFMNVHLESKPVICDSRN 840
            |||||.|.|||||||||.||:.|:|      |||||.|     ||||.|:||||:||.|:||:|.
  Rat   774 KEPVDKRHSCCKTKDSDRYCSPNES------SEAENRE-----ISSNCFVNVHLDSKTVVCDNRE 827

Human   841 LTD-HSKFACEEYKQSIGSTSSASVNHFDDLYQPIGSSGIASSLQSLPPGIKVDSLTLLKCGENT 904
            ||| ||:|.|:.||||||||||||:|||||||:.:||||| |||||||.||        :|.|||
  Rat   828 LTDQHSEFTCDGYKQSIGSTSSASLNHFDDLYESVGSSGI-SSLQSLPSGI--------RCEENT 883

Human   905 SPVLDAVLKSKKSSEFLKHAGKETIVEVGSDLPDSGKGFASRENRRNNGLSGKCLQEAQEEGNSI 969
            ||.||.| :|||..:|||:.||||  :|.|.||||||.|:|.|| |:|.|||:.|||:||||:|.
  Rat   884 SPALDTV-QSKKGIDFLKYVGKET--DVVSALPDSGKAFSSWEN-RHNMLSGQSLQESQEEGSST 944

Human   970 LPERRGRPEISLDERGEGGHVHTSDDSEVVFSSCDLNLTMEDSDGVTYALKCDSSGHAPEIVSTV 1034
            |.|||||.|:||||..:.||.|.|||||||| ..||||||||||||||.|||||||:||||||||
  Rat   945 LHERRGRSEVSLDEEEQRGHTHISDDSEVVF-PYDLNLTMEDSDGVTYTLKCDSSGNAPEIVSTV 1008

Human  1035 HEDYSGSSESSNDESDSEDTDSDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHYSD 1099
            |.|||.||.||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1009 HGDYSASSASSSDESDSEDTESDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCSSRSSQSYRHYSD 1073

Human  1100 HWEDERLESRRHLYEEKFESIASKACPQTDKFFLHKGTEKNPEISFTQSSRKQIDNRLPELSHPQ 1164
            |||| .||||||.|||||||:|||.|.||:|||||||||:|||.|::|.||| |||.|||::|.|
  Rat  1074 HWED-GLESRRHAYEEKFESMASKGCSQTEKFFLHKGTERNPETSYSQFSRK-IDNHLPEIAHSQ 1136

Human  1165 SDGVDSTSHTDVKSDPLGHPNSEETVKAKIPSRQQEELPIYSSDFEDVPNKSWQQTTFQNRPD-S 1228
            |||||||||||||||.:||.|||:.::||: ||.| |||:|..||||:||.|.||..|.|||| |
  Rat  1137 SDGVDSTSHTDVKSDSVGHLNSEDAIRAKM-SRPQ-ELPVYCDDFEDLPNTSRQQMIFSNRPDSS 1199

Human  1229 RLGKTELSFSSSCEIPHVDGLHSSEELRNLGWDFS-QEKPSTTYQQPDSSYGACGGHKYQQNAEQ 1292
            ||||.||||||||:|..:||||||||||||||||| ||:|:|||||||||||.||.|||||:||.
  Rat  1200 RLGKAELSFSSSCDISRMDGLHSSEELRNLGWDFSQQERPTTTYQQPDSSYGTCGTHKYQQSAEH 1264

Human  1293 YGGTRDYWQGNGYWDPRS-GRPPGTGVVYDRTQGQVPDSLTDDREEEENWDQQDGSHFSDQSDKF 1356
            ||||.||||||||||||| ||||||||||||.||||||||||||||||||||:.|||||..|:||
  Rat  1265 YGGTHDYWQGNGYWDPRSAGRPPGTGVVYDRIQGQVPDSLTDDREEEENWDQRSGSHFSSPSNKF 1329

Human  1357 LLSLQKDKGSVQAPEISSNSIKDTLAVNEKKDFSKNLEKNDIKDRGPLKKRRQEIESDSESDGEL 1421
            ... |||||||||||||||||||:|.:||:||||||.||||||:|||.||||||:||||||||||
  Rat  1330 FFH-QKDKGSVQAPEISSNSIKDSLVINERKDFSKNFEKNDIKERGPPKKRRQELESDSESDGEL 1393

Human  1422 QDRKKVRVEVEQGETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERK 1486
            |.|||||||:|||::|||..|.||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
  Rat  1394 QARKKVRVEIEQGQSSVPQHSELVGPSCAMDDFRDPQRWKEFAKLGKMPCYFDLIEENVYLTERK 1458

Human  1487 KNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHAD 1551
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1459 KNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEVACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHAD 1523

Human  1552 VEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIID 1616
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1524 VEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIID 1588

Human  1617 ATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCG 1681
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1589 ATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCG 1653

Human  1682 SANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIE 1746
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1654 SANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIE 1718

Human  1747 TLEQKLTCLELIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPT 1811
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1719 TLEQKLTCLKLIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEEIIKTLEHLPIPT 1783

Human  1812 KNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPPLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSTKLSTEADTDTPKKL 1876
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||
  Rat  1784 KNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPQLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSAKPSTEVDTDTPKKL 1848

Human  1877 MFRRLKIISENSMDSAISDATSELEGKDGKEDLDQLENVPVEEEEELQSQQLLPQQLPECKVDSE 1941
            :|||||||||||||||:||.|||||.|||||||||||.|.|||:||||||||||.||.|.||:||
  Rat  1849 IFRRLKIISENSMDSAVSDVTSELECKDGKEDLDQLETVTVEEDEELQSQQLLPSQLCESKVESE 1913

Human  1942 TNIEASKLPTSEPEADAEIEPKESNGTKLEEPINEETPSQDEEEGVSDVESERSQEQPDKTVDIS 2006
            :.|:.||||.||||||.|.|||:||||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||||
  Rat  1914 STIDVSKLPISEPEADTETEPKDSNGTKLEETIAEETPSQDEEEGVSDVESERSQEPPDKTVDIS 1978

Human  2007 DLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKENTTTERGRDAVGFRDQTPAPKTPNRSRERDPDKQTQN 2071
            ||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||...||||| |||||||||||:||||:||
  Rat  1979 DLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKESTVTERGRDTAAFRDQT-APKTPNRSREREPDKQSQN 2042

Human  2072 KEKRKRRSSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQK 2136
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2043 KEKRKRRGSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKLFEQEVAQREAQK 2107

Human  2137 QQQQMQNLGMTSPLPYDSLGYNAPHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPA 2201
            |||||||||||||||:|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2108 QQQQMQNLGMTSPLPFDSLGYNASHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLLPTPSMDPVCSPA 2172

Human  2202 PYDHAQPLVGHSTEPLSAPPPVPVVPHVAAPVEVSSSQYVAQSDGVVHQDSSVAVLPVPAPGPVQ 2266
            ||||||||||||||.|:|||.||||||.||.||||||||.|||:.||||||||..:||..|||||
  Rat  2173 PYDHAQPLVGHSTESLAAPPSVPVVPHGAASVEVSSSQYAAQSESVVHQDSSVPGMPVQTPGPVQ 2237

Human  2267 GQNYSVWDSNQQSVSVQQQYSPAQSQATIYYQGQTCPTVYGVTSPYSQTTPPIVQSYAQPSLQYI 2331
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2238 GQNYSVWDSNQQSVSVQPQYSPAQSQATIYYQGQTCSTVYGVTSPYSQTTPPIVQSYAQPSLQYI 2302

Human  2332 QGQQIFTAHPQGVVVQPAAAVTTIVAPGQPQPLQPSEMVVTNNLLDLPPPSPPKPKTIVLPPNWK 2396
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2303 QGQQIFTAHPQGVVVQPAAAVTTIVAPGQPQPLQPPEMVVTNNLLDLPPPSPPKPKTIVLPPNWK 2367

Human  2397 TARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMKASKKPKTAEAD 2461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
  Rat  2368 TARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPMKTSKKPKTAEAD 2432

Human  2462 TSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKN 2526
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2433 TSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTHGVMNKELKYCKN 2497

Human  2527 PEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE 2564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2498 PEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE 2535

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SETD2NP_054878.5 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..30 26/28 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 180..211 21/30 (70%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 272..561 252/290 (87%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 607..626 15/18 (83%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 964..995 19/30 (63%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1036..1101 59/64 (92%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1133..1233 69/100 (69%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1264..1352 77/88 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1393..1443 39/49 (80%)
Interaction with TUBA1A. /evidence=ECO:0000269|PubMed:27518565 1418..1714 284/295 (96%)
AWS 1495..1549 CDD:197795 52/53 (98%)
SET_SETD2 1549..1690 CDD:380949 140/140 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1831..1872 36/40 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1921..2142 196/220 (89%)
Low charge region. /evidence=ECO:0000269|PubMed:16118227 2137..2366 211/228 (93%)
WW 2391..2420 CDD:459800 28/28 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2439..2465 24/25 (96%)
Interaction with POLR2A. /evidence=ECO:0000269|PubMed:16314571 2457..2564 106/106 (100%)
SRI 2467..2555 CDD:462404 87/87 (100%)
Setd2NP_001388092.1 AWS 1467..1521 CDD:197795 52/53 (98%)
SET_SETD2 1521..1662 CDD:380949 140/140 (100%)
TCRP1 2136..>2319 CDD:434335 167/182 (92%)
WW 2362..2391 CDD:459800 28/28 (100%)
SRI 2438..2526 CDD:462404 87/87 (100%)

Return to query results.
Submit another query.