DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SETD2 and Setd2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_054878.5 Gene:SETD2 / 29072 HGNCID:18420 Length:2564 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_036010808.1 Gene:Setd2 / 235626 MGIID:1918177 Length:2551 Species:Mus musculus


Alignment Length:2585 Identity:2182/2585 - (84%)
Similarity:2308/2585 - (89%) Gaps:55/2585 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MKQL-QPQPPPKMGDFYDPEHPTPE---------EEENE-----AKIENVQKTGFIKGPMFKGVA 50
            ||.| ..|||||||||||||||||:         |||||     |||||||||||||||:|||||
Mouse     1 MKPLPSQQPPPKMGDFYDPEHPTPDMFSWLNGSREEENETYHKQAKIENVQKTGFIKGPVFKGVA 65

Human    51 SSRFLPKGTKTKVNLEEQGRQKVSFSFSLTKKTLQNRFLTALGNEKQSDTPNPPAVPLQVDSTPK 115
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||:||.||.||||||.||
Mouse    66 SSRFLPKGTKTKVNLEEQGRQKVSFSFSFTKKTLQNRFLTALSNEKQSDSPNSPAPPLQVDSNPK 130

Human   116 MKMEIGDTLSTAEESSPPKSRVELGKIHFKKHLLHVTSRPLLATTTAVASPPTHAAPLPAVIAES 180
            :||:.|||....|||||||||||||:||||||||||||||.||.:|..|||......||||:|||
Mouse   131 VKMDAGDTFPATEESSPPKSRVELGRIHFKKHLLHVTSRPQLAASTTAASPLPPTTQLPAVLAES 195

Human   181 TTVDSPPSSPPPPPPPAQATTLSSPAPVTEPVALPHTPITVLMAAPV-PLPVDVAVRSLKEPPII 244
             .:|||||||||||||.||::.|.||.::||||||..|.|.||.:|. |||.|||||:.||.|:.
Mouse   196 -MIDSPPSSPPPPPPPPQASSPSPPAQISEPVALPQPPATALMTSPPGPLPGDVAVRAQKESPVK 259

Human   245 IVPESLEADTKQDTISNSLEEHVTQILNEQADISSKKEDSHIGKDEEIPDSSKISLSCKKTGSKK 309
            ..||.||.|||||.:|||||||..|.|.||||...:||||||||:||:.|.||||||.||..|||
Mouse   260 SGPEVLEVDTKQDIVSNSLEEHTVQTLKEQADHLLQKEDSHIGKEEEVSDGSKISLSSKKASSKK 324

Human   310 KSSQSEGIFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKFSASIEKERDFKKSSAPLKSEDLGKPSRSKTDRD 374
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.||:|||||||||||.|||||||.|||||:||
Mouse   325 KSSQFEGTFLGSESDEDSVRTSSSQRSHDLKSSTSIDKERDFKKSSAPSKSEDLGKSSRSKTERD 389

Human   375 DKYFSYSKLERDTRYVSSRCRSERERRRSRSHSRSERGSRTNLSYSRSERSHYYDSDRRYHRSSP 439
            |:|.||||||||||||||||||||:||||||.|||:|.|||:||||||||||||||:||||||||
Mouse   390 DRYCSYSKLERDTRYVSSRCRSERDRRRSRSRSRSDRASRTSLSYSRSERSHYYDSERRYHRSSP 454

Human   440 YRERTRYSRPYTDNRARESSDSEEEYKKTYSRRTSSHSSSYRDLRT-SSYSKSDRDCKTETSYLE 503
            |||||||||||||||||||||||:||||||.||||:|  ||||||| |||||.||||||||||||
Mouse   455 YRERTRYSRPYTDNRARESSDSEDEYKKTYPRRTSAH--SYRDLRTSSSYSKFDRDCKTETSYLE 517

Human   504 MERRGKYSSKLERESKRTSENEAIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDSSASRYKSTLSKPIPKSDK 568
            |||||||:||||||||||||:|.|||||||||||||||||||||||:|.|||||.|||.|.|:||
Mouse   518 MERRGKYTSKLERESKRTSEHETIKRCCSPPNELGFRRGSSYSKHDNSTSRYKSALSKSISKNDK 582

Human   569 FKNSFCCTELNEEIKQSHSFSLQTPCSKGSELRMINKNPEREKAGSPAPSNRLNDSPTLKKLDEL 633
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||..||||.|||.|||:||||||.|||||.
Mouse   583 FKNSFCCTELNEENKQSHSFSLQTPCSKGSELRTINKISEREKTGSPTPSNQLNDSPTFKKLDES 647

Human   634 PIFKSEFITHDSHDSIKELDSLSKVKNDQLRSFCPIELNINGSPGAESDLATFCTSKTDAVLMTS 698
            |:.|.|||.||..:|||||: ||||||||||:||.||||:||||..|:|:||||||||||:.|||
Mouse   648 PVLKPEFIGHDGRESIKELE-LSKVKNDQLRNFCSIELNVNGSPETEADVATFCTSKTDAISMTS 711

Human   699 DDSVTGSELSPLVKACMLSSNGFQNISRCKEKDLDDTCMLHKKSESPFRETEPLVSPHQDKLMSM 763
            ||||||||:|||:||||||||||||:.||:|:|.||||..|..|:|||||.|||:|||.|||||:
Mouse   712 DDSVTGSEVSPLIKACMLSSNGFQNVGRCRERDSDDTCRQHNTSKSPFREMEPLLSPHHDKLMSL 776

Human   764 PVMTVDYSKTVVKEPVDTRVSCCKTKDSDIYCTLNDSNPSLCNSEAENIEPSVMKISSNSFMNVH 828
            ||.|:||.||::|||||.|.||||||||||||:.|:      |.||||.|||.|.|||:||:|||
Mouse   777 PVKTIDYPKTLIKEPVDKRHSCCKTKDSDIYCSPNE------NPEAENAEPSAMTISSHSFVNVH 835

Human   829 LESKPVICDSRNLTD-HSKFACEEYKQSIGSTSSASVNHFDDLYQPIGSSGIASSLQSLPPGIKV 892
            ||||.||||:|..|| ||:..|:|||||||||||||.||||.||:||||||| |||||.|.||  
Mouse   836 LESKTVICDNREPTDRHSENTCDEYKQSIGSTSSASHNHFDGLYEPIGSSGI-SSLQSPPSGI-- 897

Human   893 DSLTLLKCGENTSPVLDAVLKSKKSSEFLKHAGKETIVEVGSDLPDSGKGFASRENRRNNGLSGK 957
                  :|.|||||.|||| :|||..:|||:|.|||  :|||.|||||||| |.|||.||.|||:
Mouse   898 ------RCEENTSPTLDAV-ESKKGIDFLKYARKET--DVGSALPDSGKGF-SWENRHNNVLSGQ 952

Human   958 CLQEAQEEGNSILPERRGRPEISLDERGEGGHVHTSDDSEVVFSSCDLNLTMEDSDGVTYALKCD 1022
            .||||||||||||.||||||||.|||. :.||.|.|||||||| ..|||||||||||:||.||||
Mouse   953 SLQEAQEEGNSILHERRGRPEIPLDEE-QRGHTHISDDSEVVF-PYDLNLTMEDSDGITYTLKCD 1015

Human  1023 SSGHAPEIVSTVHEDYSGSSESSNDESDSEDTDSDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCS 1087
            |||:||||||||||||||||.||:||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1016 SSGNAPEIVSTVHEDYSGSSASSSDESDSEDTESDDSSIPRNRLQSVVVVPKNSTLPMEETSPCS 1080

Human  1088 SRSSQSYRHYSDHWEDERLESRRHLYEEKFESIASKACPQTDKFFLHKGTEKNPEISFTQSSRKQ 1152
            |||||||:||||.||| .||:|||.|||::|   ||.|.||:|:|||||||::.|..::|..|| 
Mouse  1081 SRSSQSYKHYSDRWED-GLETRRHAYEEEYE---SKGCSQTEKYFLHKGTERSAESCYSQFGRK- 1140

Human  1153 IDNRLPELSHPQSDGVDSTSHTDVKSDPLGHPNSEETVKAKIPSRQQEELPIYSSDFEDVPNKSW 1217
            .||.||:::|.|||||||||.||.:||.|||.|.|:|::|| .||.| |||:||.||||:||||.
Mouse  1141 ADNHLPDIAHAQSDGVDSTSQTDSRSDHLGHLNPEDTLRAK-TSRPQ-ELPVYSDDFEDLPNKSR 1203

Human  1218 QQTTFQNRPD-SRLGKTELSFSSSCEIPHVDGLHSSEELRNLGWDFS-QEKPSTTYQQPDSSYGA 1280
            ||..|.|||| ||||||||||||||:|..:||||||||||||||||| ||:|:|||||||||||.
Mouse  1204 QQMIFSNRPDSSRLGKTELSFSSSCDISRMDGLHSSEELRNLGWDFSQQERPTTTYQQPDSSYGT 1268

Human  1281 CGGHKYQQNAEQYGGTRDYWQGNGYWDPRS-GRPPGTGVVYDRTQGQVPDSLTDDREEEENWDQQ 1344
            ||.|||||:.|.||||.:|||||||||||| |||||||:.|||.||||||||||||||||:|||:
Mouse  1269 CGTHKYQQSTEHYGGTHNYWQGNGYWDPRSAGRPPGTGLAYDRIQGQVPDSLTDDREEEEHWDQR 1333

Human  1345 DGSHFSDQSDKFLLSLQKDKGSVQAPEISSNSIKDTLAVNEKKDFSKNLEKNDIKDRGPLKKRRQ 1409
            .|||||..|:||... |||||||||||||||||||.|.:||:||||||.||||||:|||.|||||
Mouse  1334 SGSHFSSPSNKFFFH-QKDKGSVQAPEISSNSIKDALVMNERKDFSKNFEKNDIKERGPPKKRRQ 1397

Human  1410 EIESDSESDGELQDRKKVRVEVEQGETSVPPGSALVGPSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFD 1474
            |:|||||||||||.|||||||:||||:|||..|.|:||||.||||||||||||.||.||||||||
Mouse  1398 ELESDSESDGELQARKKVRVEMEQGESSVPQHSELMGPSCAMDDFRDPQRWKEFAKLGKMPCYFD 1462

Human  1475 LIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEIACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYC 1539
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
Mouse  1463 LIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEVACGEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYC 1527

Human  1540 SNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHY 1604
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1528 SNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHY 1592

Human  1605 YFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQ 1669
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1593 YFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQ 1657

Human  1670 RYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQ 1734
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1658 RYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQ 1722

Human  1735 VLSLSRLMVRIETLEQKLTCLELIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEE 1799
            |||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1723 VLSLSRLMVRIETLEQKLTCLKLIQNTHSQSCLKSFLERHGLSLLWIWMAELGDGRESNQKLQEE 1787

Human  1800 IIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPPLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSTKL 1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|.
Mouse  1788 IIKTLEHLPIPTKNMLEESKVLPIIQRWSQTKTAVPQLSEGDGYSSENTSRAHTPLNTPDPSAKP 1852

Human  1865 STEADTDTPKKLMFRRLKIISENSMDSAISDATSELEGKDGKEDLDQLENVPVEEEEELQSQQLL 1929
            |||.||||||||:|||||||||||||||:||.|||||.|||||||||||.|.|||:|||||||||
Mouse  1853 STEMDTDTPKKLIFRRLKIISENSMDSAVSDVTSELECKDGKEDLDQLETVTVEEDEELQSQQLL 1917

Human  1930 PQQLPECKVDSETNIEASKLPTSEPEADAEIEPKESNGTKLEEPINEETPSQDEEEGVSDVESER 1994
            ||||.|.||:||..||.|||||||||||.|.|||:||||||||.|.|||||||||||||||||||
Mouse  1918 PQQLCESKVESEATIEVSKLPTSEPEADTETEPKDSNGTKLEETIAEETPSQDEEEGVSDVESER 1982

Human  1995 SQEQPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKENTTTERGRDAVGFRDQTPAPKTPNR 2059
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|..||||||..||||| |||||||
Mouse  1983 SQEPPDKTVDISDLATKLLDSWKDLKEVYRIPKKSQTEKESTVAERGRDAAAFRDQT-APKTPNR 2046

Human  2060 SRERDPDKQTQNKEKRKRRSSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKL 2124
            |||||||||:|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2047 SRERDPDKQSQNKEKRKRRGSLSPPSSAYERGTKRPDDRYDTPTSKKKVRIKDRNKLSTEERRKL 2111

Human  2125 FEQEVAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPYDSLGYNAPHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLL 2189
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2112 FEQEVAQREAQKQQQQMQNLGMTSPLPFDSLGYNASHHPFAGYPPGYPMQAYVDPSNPNAGKVLL 2176

Human  2190 PTPSMDPVCSPAPYDHAQPLVGHSTEPLSAPPPVPVVPHVAAPVEVSSSQYVAQSDGVVHQDSSV 2254
            ||||||||||||||||||||||||||.|:|||.|||||||||.|||||||||||::.||||||:|
Mouse  2177 PTPSMDPVCSPAPYDHAQPLVGHSTESLAAPPSVPVVPHVAASVEVSSSQYVAQNESVVHQDSNV 2241

Human  2255 AVLPVPAPGPVQGQNYSVWDSNQQSVSVQQQYSPAQSQATIYYQGQTCPTVYGVTSPYSQTTPPI 2319
            .|:||.||||||||||:||:||||||||||||||||||.|||||||||.|||.||||||||||||
Mouse  2242 PVMPVQAPGPVQGQNYNVWESNQQSVSVQQQYSPAQSQTTIYYQGQTCSTVYSVTSPYSQTTPPI 2306

Human  2320 VQSYAQPSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPAAAVTTIVAPGQPQPLQPSEMVVTNNLLDLPPPSPP 2384
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||:||||||||.|||.|||||||||||||||||
Mouse  2307 VQSYAQPSLQYIQGQQIFTAHPQGVVVQPTAAVTSIVAPGQPQSLQPPEMVVTNNLLDLPPPSPP 2371

Human  2385 KPKTIVLPPNWKTARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPM 2449
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2372 KPKTIVLPPNWKTARDPEGKIYYYHVITRQTQWDPPTWESPGDDASLEHEAEMDLGTPTYDENPM 2436

Human  2450 KASKKPKTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTH 2514
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2437 KTSKKPKTAEADTSSELAKKSKEVFRKEMSQFIVQCLNPYRKPDCKVGRITTTEDFKHLARKLTH 2501

Human  2515 GVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE 2564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2502 GVMNKELKYCKNPEDLECNENVKHKTKEYIKKYMQKFGAVYKPKEDTELE 2551

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SETD2NP_054878.5 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..30 25/43 (58%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 180..211 19/30 (63%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 272..561 248/289 (86%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 607..626 14/18 (78%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 964..995 22/30 (73%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1036..1101 60/64 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1133..1233 63/100 (63%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1264..1352 72/88 (82%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1393..1443 40/49 (82%)
Interaction with TUBA1A. /evidence=ECO:0000269|PubMed:27518565 1418..1714 284/295 (96%)
AWS 1495..1549 CDD:197795 52/53 (98%)
SET_SETD2 1549..1690 CDD:380949 140/140 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1831..1872 36/40 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1921..2142 200/220 (91%)
Low charge region. /evidence=ECO:0000269|PubMed:16118227 2137..2366 207/228 (91%)
WW 2391..2420 CDD:459800 28/28 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2439..2465 24/25 (96%)
Interaction with POLR2A. /evidence=ECO:0000269|PubMed:16314571 2457..2564 106/106 (100%)
SRI 2467..2555 CDD:462404 87/87 (100%)
Setd2XP_036010808.1 AWS 1483..1537 CDD:197795 52/53 (98%)
SET_SETD2 1537..1678 CDD:380949 140/140 (100%)
WW 2378..2407 CDD:459800 28/28 (100%)
SRI 2454..2542 CDD:462404 87/87 (100%)

Return to query results.
Submit another query.