DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GRIN1 and grin1a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001424259.1 Gene:GRIN1 / 2902 HGNCID:4584 Length:959 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_073791110.1 Gene:grin1a / 767745 ZFINID:ZDB-GENE-051202-1 Length:966 Species:Danio rerio


Alignment Length:947 Identity:809/947 - (85%)
Similarity:858/947 - (90%) Gaps:32/947 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     4 MRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHK 68
            ||||.||.|||||..|..|:|||||||||||.:::||:|::||.|||:.:|..|.:|.|.|||||
Zfish     1 MRLLLLAALFSCSCVRGGCEPKIVNIGAVLSQKRYEQVFKDAVTQANQVYGRDKFKLTAISVTHK 65

Human    69 PNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSI 133
            .|||||||||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||||:||||||||||||||
Zfish    66 ANAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPQSNDHLTPTPVSYTAGFYRIPVVGLTTRMSIYSDKSI 130

Human   134 HLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKSKKRNYEN 198
            ||||||||||||||:.|||:|||.:.||||||:||||||||||||||||||||||:|:|||||||
Zfish   131 HLSFLRTVPPYSHQAHVWFDMMREFRWNHIILIVSDDHEGRAAQKRLETLLEERETKNKKRNYEN 195

Human   199 LDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTG 263
            .|||||||||||||||||||:..| |:||||:||||||||||||||||:|||.||:.|..|||||
Zfish   196 QDQLSYDNKRGPKAEKVLQFNQET-NLTALLLEAKELEARVIILSASEEDAAAVYKTARFLNMTG 259

Human   264 SGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKENITDPPRG 328
            |||||||||||:||.||..||||::||||||||||||||||||.||||::.||.||||||:||||
Zfish   260 SGYVWLVGEREMSGKALSEAPDGLIGLQLINGKNESAHISDAVAVVAQSIQELFEKENITEPPRG 324

Human   329 CVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHV 393
            |||||||||||||||||||||||.:|:|||||||:|||||:|:|||:|.|..:|:||||||||.|
Zfish   325 CVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYPEGLTGRVEFNDDGDRKYAHYSILNYQKSRLIQVGIYNGTQV 389

Human   394 IPN-DRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVIC 457
            :.| .|||||||||||:|||:||||||||||||||||||||||..:||||||:|.||..:|||||
Zfish   390 VMNKQRKIIWPGGETERPRGFQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTTLEGTCKEEYTPNGVLIKKVIC 454

Human   458 TGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGM 522
            ||||:|.||.|  .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   455 TGPNETIPGRP--IVPQCCYGFCIDLLIKLALTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGM 517

Human   523 MGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLV 587
            |||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   518 MGELLGGLADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLV 582

Human   588 GLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARI 652
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   583 GLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARI 647

Human   653 LGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQ 717
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   648 LGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQ 712

Human   718 VELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIG 782
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   713 VELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIG 777

Human   783 MRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVA 847
            |||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Zfish   778 MRKDSPWKQNVSLAILSSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIAA 842

Human   848 GIFLIFIEIAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQ---------------------------- 884
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Zfish   843 GIFLIFIEIAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQDNKESSGSQAVGAAGTPSLPSSSVETQD 907

Human   885 DRKSGRAEPDPKKKATFRAITSTLASSFKRRRSSKDT 921
            |||||||:.|||||.:||:|::|||||.|||||||||
Zfish   908 DRKSGRADSDPKKKPSFRSISTTLASSIKRRRSSKDT 944

Return to query results.
Submit another query.