DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LAMA1 and Lama1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_005550.2 Gene:LAMA1 / 284217 HGNCID:6481 Length:3075 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001101707.2 Gene:Lama1 / 316758 RGDID:1307207 Length:3083 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3084 Identity:2365/3084 - (76%)
Similarity:2663/3084 - (86%) Gaps:12/3084 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRG---GVLLVLLLC----VAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPG 58
            |||   ||.|::||.    |..:.:||||||||||||:|||||.|||||||||||||||||||||
  Rat     1 MRGSGTGVALLVLLASVLWVTVRSQQRGLFPAILNLATNAHISANATCGEKGPEMFCKLVEHVPG 65

Human    59 RPVRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAYVI 123
            ||||:.|||:|||||.||||||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat    66 RPVRHAQCRVCDGNSTNPRERHPITHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTVTLDLRQVFQVAYVI 130

Human   124 IKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSR 188
            |||||||||||||||||:||..|.|||||||||:|||:||.|||||||||||||:|||||||||:
  Rat   131 IKAANAPRPGNWILERSVDGVKFRPWQYYAVSDTECLTRYKITPRRGPPTYRADNEVICTSYYSK 195

Human   189 LVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIV 253
            ||||||||||||||||||||||.||:||||||||||||||||||||||||||||||:.::|||||
  Rat   196 LVPLEHGEIHTSLINGRPSADDPSPQLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHRDLRDLDPIV 260

Human   254 TRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTV 318
            |||||||||||||||||||.||||||||||..|:||||||||||||||:|||||:|||||||||:
  Rat   261 TRRYYYSIKDISVGGMCICSGHASSCPWDEEAKQLQCQCEHNTCGESCDRCCPGFHQQPWRPGTI 325

Human   319 SSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRP 383
            ||.|.||.|||||||||||||.:|||::||||||||:.||||||||||||.|||||||||.||||
  Rat   326 SSSNQCEECNCHNKAKDCYYDNNVAKERKSLNTAGQYSGGGVCINCLQNTTGINCETCIDQYYRP 390

Human   384 HKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDY 448
            ||||||||:|||||:|||||||||||||||||:||.|||.||||||::||.|:||||||.||:.:
  Rat   391 HKVSPYEDQPCRPCDCDPVGSLSSVCIKDDLHADLANGKWPGQCPCRKGYAGDKCDRCQFGYRGF 455

Human   449 PTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCS 513
            |.||.|.|:.|||.:::|||.||:||:||||:.|||||||||||||:||.||||||||||||||.
  Rat   456 PNCVPCDCSTVGSVNEDPCTEPCLCKKNVEGENCDRCKPGFYNLKERNPEGCSECFCFGVSDVCD 520

Human   514 SLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGN 578
            ||:|.|.||.:||||||||||||.||.|||||||...|:||||||||.|....||||||||||||
  Rat   521 SLTWSVSQVTNMSGWLVTDLISPNKIRSQQDALGRHRQISINNTAVMHRFTSPYYWAAPEAYLGN 585

Human   579 KLTAFGGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPE 643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:||||||||||||.||||||||
  Rat   586 KLTAFGGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKGNGLTISTRAEGLSLQPYEEYFNVVRLVPE 650

Human   644 NFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEH 708
            ||:||:::|:||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.|||||||||||||
  Rat   651 NFRDFNTRREIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLDSVSLDIASPNAIDLVVAADVEH 715

Human   709 CECPQGYTGTSCESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCL 773
            |||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||::||::||:|..|.|||||.||||||
  Rat   716 CECPQGYTGTSCEACLPGYYRVDGILFGGICQPCECHGHSSECDIHGICSGCTHNTTGDHCEQCL 780

Human   774 PGFYGEPSRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGN 838
            |||||.||||||||||||||||:|.||||||||||.|.:|||||.||||||||||||||||||||
  Rat   781 PGFYGTPSRGTPGDCQPCACPLSIDSNNFSPTCHLTDREEVVCDQCAPGYSGAWCERCADGYYGN 845

Human   839 PTVPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCRACE 903
            |||||.:||||:|||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   846 PTVPGGTCVPCNCSGNVDPLEAGHCDSVTGECLKCLWNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCRACN 910

Human   904 CHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEGQ 968
            ||..||.|.:||||||||||||.||||||||||.||||||:|.||.|||||..||:||.||:|||
  Rat   911 CHENGSLSGICHLETGLCDCKPYVTGQQCDQCLPGYYGLDTGLGCVPCNCSGEGSISDNCTEEGQ 975

Human   969 CHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHW 1033
            |||||||:||:||:|:|||||:|:|.||||||.||||.|||::|||:|||||.|:|||:||:..|
  Rat   976 CHCVPGVSGKQCDQCSHGFYAFQNGGCTPCDCAHTQNNCDPDSGECLCPPHTHGLKCEQCEEAFW 1040

Human  1034 GYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTS 1098
            |.|.|.||||||||:||||..:|||::|.|.||..|||::|.|||||||.||||||||||||||.
  Rat  1041 GLDPEQGCQACNCSVVGSTSPQCDVLSGQCSCKEGFGGQSCHQCSLGYRSFPDCVPCDCDLRGTL 1105

Human  1099 GDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELE 1163
            .|.|:||||||.|.|::|.|.|||||.||||::||.||||||||||||||||||.|||.||||||
  Rat  1106 ADTCDLEQGLCSCTEDSGTCSCKENVLGPQCDKCRAGTFALRADNPLGCSPCFCFGLSQLCSELE 1170

Human  1164 DYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGD 1228
            .|||.|:||.||||:|.|||||||:||||||::|.||.||||..|||||.|||||||||:|||||
  Rat  1171 GYVRAPITLASDQPILHVVSQSNLKGTTEGVHFQPPDTLLDAEAVRQHIYAEPFYWRLPKQFQGD 1235

Human  1229 QLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLIKGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENF 1293
            ||:||||||:|:|||||..|.||||:||||||||||.||.:||||||||||||||:.||.|:|.|
  Rat  1236 QLLAYGGKLQYTVAFYSTLGTGTSNYEPQVLIKGGRTRKHIIYMDAPAPENGVRQDYEVGMKEEF 1300

Human  1294 WKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASL 1358
            ||||||||||.||..|||||||:|||||||||||||||||||::|||||||||.:..||.:||..
  Rat  1301 WKYFNSVSEKHVTHSDFMSVLSNIEYILIKASYGQGLQQSRIANISMEVGRKAVEPAPEGKVALQ 1365

Human  1359 LENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCG 1423
            ||.|||||||.|.|||||||||||||||..|.||||||:||||||:||||||.|||.|||||||.
  Rat  1366 LELCVCPPGTAGHSCQDCAPGYHRGKLPESSGRGPRPLLAPCVPCNCNNHSDVCDPETGKCLNCR 1430

Human  1424 DNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHC 1488
            |:||||||::||:||||||.|...||..|.|||.||.|||||||||||..|.|||||.||||::|
  Rat  1431 DHTAGDHCELCTAGYYGKVIGLPGDCTPCTCPHHPPFSFSPTCVLEGDSGFWCDACLPGYEGQYC 1495

Human  1489 ERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDC 1553
            ||||:.|:|||:..|||||||||||.||||.||||.||||||:.||:||.|:||.|||||||:.|
  Rat  1496 ERCSAGYHGNPRAAGGSCQKCDCNPQGSVHSDCDRASGQCVCKPGATGLHCEECLPRHILMESHC 1560

Human  1554 VSCDDECVGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIK 1618
            |||||||||.||||||.||||||||||.|:...|||.|.||||||||.|..||:||.:|...:|:
  Rat  1561 VSCDDECVGALLNDLDSIGDAVLSLNLAGVSLAPYGTLENLENTTKYFQGYLLEENAKKVQAEIQ 1625

Human  1619 LEGVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEK-TTLNQTLD 1682
            |.|:.|:|:||||:|.|:|.|.|:||.|.||....||.||..:|:|..:|.||.|| .|||||..
  Rat  1626 LGGIEEQTENLQKELARVLRSHQQVNTAMERTSNRSQALATFLEQLHRNIKEITEKVATLNQTTG 1690

Human  1683 EDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLK 1747
            |||..|.|.||::.||.:|||.:::.|:||::.||||||||||:||||:||:.:|||.|:|:.||
  Rat  1691 EDFQPPVSALQSLHQNISSLLALIKKRNFTEMRQNATLELKAAKDLLSRIQKRFQKPQEKLKALK 1755

Human  1748 EAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQ 1812
            ||:| :||.|..:|:|||.|:|||.:|.|||:.|||:|.|||::|.:|||||||||||||:||.|
  Rat  1756 EASS-LLSNHIADLQAAEELLREAGSKTQESSLLLLLVKANLKDFREKKLHVQEEQNLTSKLIAQ 1819

Human  1813 GRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVDLVYRAEDHAAE 1877
            ||..:|||.....|.||.|..||.|:|:||||::|||.|:|||||.||:|.|.|||:|||.||:|
  Rat  1820 GREWVDAARTHAAAAQDTLTQLEHHRDELLLWASKIRSHVDDLVMQMSKRRARDLVHRAEQHASE 1884

Human  1878 FQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTETSLLSESLVSNGK 1942
            .|..|:.|...|||:||||||||||.:||.|||:|.||:|.||.|||:|..:|||:||||...||
  Rat  1885 LQSAAEALDRDLENVRNVSLNATSAVHVHTNIQTLTEEAESLAADAHKTANKTSLISESLAPRGK 1949

Human  1943 AAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRDK 2007
            |.:||||||:||..:..:|..||.|:|.||:|.|::|||....||||.|:||.:||..|.|:|:|
  Rat  1950 AVLQRSSRFVKESVSTRKKQQGITLKLDELKNLTSQFQERVDNITRQANDSLTVLRESPGGMREK 2014

Human  2008 GAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVK 2072
            ..|.||||.:|:::|..||.|:.|||..:.|||..|||||.|::||..||.:|||.|:|||||::
  Rat  2015 SRKVKELAVAANETAARTLEDMLGLSLRVFNTSEDLSRVNATVQETKDLLHNSTMTTILAGRKMR 2079

Human  2073 DVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISST 2137
            |:|:|||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2080 DMEMQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLSEIKLLISRARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISST 2144

Human  2138 NYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGSSTASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWH 2202
            |||||.||||||||||||||||||::|||||||||||:.|||||||||||||||||..|::::||
  Rat  2145 NYNTLLLNVKTQEPDNLLFYLGSSSSSDFLAVEMRRGKAAFLWDLGSGSTRLEFPDVSINNDKWH 2209

Human  2203 SIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTH 2267
            ||::.||||:|||||||.|:.:..|.:||||||.|||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat  2210 SIYITRFGNMGSLSVKEASAAEDPPVRTSKSPGLANVLDINNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTH 2274

Human  2268 FKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIML 2332
            ||||:||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||:||||:|..||||||:|
  Rat  2275 FKGCMGEAFLNGKSIGLWNYIEREGKCNGCFGSSQNEDASFHFDGSGYAVVEKALRPTVTQIIIL 2339

Human  2333 FNTFSPNGLLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRK 2397
            |:||||||||.||.|.||||||||||.|||||||.||||||:||:||||||||||||||||||||
  Rat  2340 FSTFSPNGLLFYLASNGTKDFLSIELLRGRVKVMVDLGSGPLTLMTDRRYNNGTWYKIAFQRNRK 2404

Human  2398 QGVLAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKNLE 2462
            ||:|||.|||:||:|||||||||||:||||||:||.|||||||.|:.||:||:::|:||||||||
  Rat  2405 QGLLAVFDAYDTSDKETKQGETPGAASDLNRLEKDLIYVGGLPHSKAVRKGVSSRSYVGCIKNLE 2469

Human  2463 ISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSSGIILAAL 2527
            |||||||||||||||||||.||||:|||||||||:|:|||||||||..|.||||.||||:|||||
  Rat  2470 ISRSTFDLLRNSYGVRKGCTLEPIQSVSFLKGGYMEMPPKSLSPESSLLATFATKNSSGVILAAL 2534

Human  2528 GGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSISLVRNR 2592
            |.|.||.| ..:|||||||::||.|.||||:|.||||.|||||||||||:.||||.||||:||||
  Rat  2535 GKDAEKAG-ASQAHVPFFSILLIEGRIEVHINSGDGTSLRKALLHAPTGSYSDGQEHSISVVRNR 2598

Human  2593 RIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMRRSFHGCIKNLIFNLELL 2657
            |:||||||||:|||||||.|.|.||||:||||:||:|||:||.::.||.||||||||::.:.:||
  Rat  2599 RVITVQLDENSPVEMKLGPLTEGRTINISNLYIGGLPEGKGTPMIRMRTSFHGCIKNVVIDAQLL 2663

Human  2658 DFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKLAPDAEDSKLLPEPRAFPEQ--CVVDAALEYVPGAHQFGLTQ 2720
            ||..|.|.|||:||||.|:|.|......|..:|.|||...||.  |.||.|..||.|||||||:|
  Rat  2664 DFTRAAGSEQVELDTCLLAEEPTQGLHREHGELPPEPPTLPEPELCAVDTAPGYVAGAHQFGLSQ 2728

Human  2721 NSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIYYMAHQNQADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTK 2785
            |||.:||||||.|||:|.|:|:||||||||||||:|||||.||||||||.|||:|||||||||||
  Rat  2729 NSHLVLPFNQSDVRKRLQVQLNIRTFASSGLIYYVAHQNQMDYAVLQLHEGRLNFMFDLGKGRTK 2793

Human  2786 VSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDGRESPMVTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKI 2850
            |||||||||||||||||:|:|||.|:||||:|||.|||||:.|.||||...||||||:.|:||.|
  Rat  2794 VSHPALLSDGKWHTVKTEYIKRKAFMTVDGQESPSVTVVGNATTLDVERKLYLGGLPAHYRARSI 2858

Human  2851 GNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAFTVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVN 2915
            |.||||||||||||||||:|||||.|.|||.|:||||||||||:|:||||||||||||||:.|:|
  Rat  2859 GTITHSIPACIGDVTVNSQQLDKDRPASAFAVDRCYAVAQEGTFFEGSGYAALVKEGYKVRLDLN 2923

Human  2916 ITLEFRTSSQNGVLLGISTAKVDAIGLELVDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTL 2980
            |||||||||:||||||||:|||||||||:|||||.||||||||||||.|:|:....|||||||||
  Rat  2924 ITLEFRTSSKNGVLLGISSAKVDAIGLEIVDGKVSFHVNNGAGRITATYKPRATRTLCDGKWHTL 2988

Human  2981 QANKSKHRITLIVDGNAVGAESPHTQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLAL 3045
            .|:||:|||.|.|||:||.||||||.|||.|||:|||||||||.|||.||.|:.|||||:|.|.|
  Rat  2989 HAHKSRHRIVLTVDGDAVRAESPHTHSTSADTNDPIYVGGYPAHVKQNCLSSRASFRGCVRNLEL 3053

Human  3046 IKSPQVQSFDFSRAFELHGVFLHSCPGTE 3074
            .:..||||.|.||||:|||||.|||||.|
  Rat  3054 SRGSQVQSLDLSRAFDLHGVFPHSCPGPE 3082

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LAMA1NP_005550.2 LamNT 16..268 CDD:214532 225/251 (90%)
EGF_Lam 270..317 CDD:238012 40/46 (87%)
Laminin_EGF 397..456 CDD:278482 44/58 (76%)
Laminin_EGF 454..500 CDD:278482 31/45 (69%)
Laminin_B 568..696 CDD:278481 118/127 (93%)
EGF_Lam 741..789 CDD:238012 37/47 (79%)
Laminin_EGF 791..846 CDD:278482 47/54 (87%)
EGF_Lam 848..900 CDD:238012 48/51 (94%)
Laminin_EGF 902..948 CDD:278482 35/45 (78%)
Laminin_EGF 951..998 CDD:278482 34/46 (74%)
Laminin_EGF 998..1041 CDD:278482 28/42 (67%)
Laminin_EGF 1044..1092 CDD:278482 33/47 (70%)
Laminin_EGF 1090..1147 CDD:278482 42/56 (75%)
LamB 1213..1344 CDD:214597 107/130 (82%)
Laminin_EGF 1403..1449 CDD:278482 33/45 (73%)
Laminin_EGF 1452..1506 CDD:278482 38/53 (72%)
Laminin_EGF 1509..1556 CDD:278482 35/46 (76%)
Laminin_I 1567..1830 CDD:283627 154/263 (59%)
BAR 1609..1841 CDD:299863 130/232 (56%)
Laminin_II 2011..2145 CDD:283628 101/133 (76%)
LamG 2141..2280 CDD:214598 112/138 (81%)
LamG 2307..2463 CDD:238058 127/155 (82%)
Laminin_G_1 2514..2658 CDD:278483 103/143 (72%)
Laminin_G_1 2743..2872 CDD:278483 106/128 (83%)
LamG 2892..3043 CDD:238058 118/150 (79%)
Lama1NP_001101707.2 LamNT 25..275 CDD:214532 225/249 (90%)
EGF_Lam 277..324 CDD:238012 40/46 (87%)
Laminin_EGF 404..463 CDD:278482 44/58 (76%)
Laminin_EGF 461..507 CDD:278482 31/45 (69%)
Laminin_B 575..703 CDD:278481 118/127 (93%)
EGF_Lam <715..739 CDD:214543 21/23 (91%)
EGF_Lam 748..796 CDD:238012 37/47 (79%)
Laminin_EGF 798..853 CDD:278482 47/54 (87%)
EGF_Lam 855..907 CDD:238012 48/51 (94%)
Laminin_EGF 909..955 CDD:278482 35/45 (78%)
Laminin_EGF 958..1005 CDD:278482 34/46 (74%)
EGF_Lam 1004..1049 CDD:238012 30/44 (68%)
Laminin_EGF 1051..1099 CDD:278482 33/47 (70%)
Laminin_EGF 1097..1154 CDD:278482 42/56 (75%)
Laminin_B 1225..1351 CDD:278481 103/125 (82%)
Laminin_EGF 1410..1456 CDD:278482 33/45 (73%)
Laminin_EGF 1459..1513 CDD:278482 38/53 (72%)
Laminin_EGF 1516..>1553 CDD:278482 27/36 (75%)
Laminin_I 1574..1825 CDD:283627 149/251 (59%)
SPEC 1613..1861 CDD:295325 140/248 (56%)
Laminin_I 1838..2092 CDD:283627 149/253 (59%)
Laminin_II 2018..2152 CDD:283628 101/133 (76%)
LamG 2136..2285 CDD:238058 122/148 (82%)
LamG 2314..2470 CDD:238058 127/155 (82%)
LamG 2495..2659 CDD:238058 123/164 (75%)
Laminin_G_1 2751..2880 CDD:278483 106/128 (83%)
LamG 2900..3053 CDD:238058 119/152 (78%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83695232
Domainoid 1 1.000 478 1.000 Domainoid score I7985
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG1836
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H21146
Inparanoid 1 1.050 4939 1.000 Inparanoid score I119
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG43214
OrthoDB 1 1.010 - - D128982at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004257
OrthoInspector 1 1.000 - - oto130874
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100395
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR10574
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X2997
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1717.270

Return to query results.
Submit another query.