DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Muc68E and srap-1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_996064.1 Gene:Muc68E / 2768990 FlyBaseID:FBgn0053265 Length:1799 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001364584.1 Gene:srap-1 / 174709 WormBaseID:WBGene00011522 Length:3532 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2113 Identity:585/2113 - (27%)
Similarity:830/2113 - (39%) Gaps:606/2113 - (28%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    15 VQLESKAVEMKNKKWNFR-EFIICVAVTVVLTKIVH----VKTQHQQSLQKLSNQY--------- 65
            |..:|:.:|.:||::... |..:.|....:.....:    ...::..|.|:.|..|         
 Worm   743 VHFQSQPIEERNKEFTAPFELNLKVPTAEICAHRCYQDGCTAAKYDPSTQQCSLAYEDKPFCGNG 807

  Fly    66 ----VIRDGDTQYI-------------KSRTSEKVSQLNLNKNN-----DTAS-KLKIGAPYYYQ 107
                :.|...|.:|             ...|..:|::.||...:     |||| :.....|    
 Worm   808 RLVNIDRSDKTVWIHCLSCVPLKNSKPAENTDGEVTESNLPDGSGEHGADTASGEEPTSTP---- 868

  Fly   108 IKITSPTKIKSLPVEVENDRK--DSSGIDTTVEDLTPI-PEETTTVA------QETTYDPEGSTT 163
              ||:||       :..||.:  ::||.:||....|.. .|||||.|      :|||......::
 Worm   869 --ITAPT-------DFSNDDQVTEASGEETTTAAATEASSEETTTSAVTEGSGEETTVPTTVESS 924

  Fly   164 REDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVA------QETTYDPEGSTTREDDTTVAI-E 221
            .|:....:....||..:||...|.|   .||:||.|      :|||.......:.|:.||.|: |
 Worm   925 GEEPALSSTSVPTELSKDDQVTEAS---GEETTTAAATEASSEETTTPAVTEASGEESTTSAVTE 986

  Fly   222 TTTEKPEDDTTVE--------DSTPIP--------------EESTTVA------QETTYDPEGST 258
            .:.|:....||||        .||.:|              ||:||.|      :|||.......
 Worm   987 GSGEEITVPTTVESSGEEPALSSTSVPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEASSEETTTPAVTEA 1051

  Fly   259 TRDDETTVAI-ETTTEKPEDDTTVE--------DSTPIPE-------------ESTTVAQETTYD 301
            :.::.||.|: |.:.|:....||||        .||.||.             |.||.|..|...
 Worm  1052 SGEESTTSAVTEGSGEEITVHTTVESSGEEPAISSTSIPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEAS 1116

  Fly   302 PEGSTT-------REDDTTVAIETTTEKPEDDTTV------------EDSTPIP----------- 336
            .|.:||       .|:.||.|:   ||:..::|||            ..||.||           
 Worm  1117 LEATTTPAVTEASGEEITTSAV---TEESGEETTVVAVVESSGEEQASSSTSIPTELSKDDQVTE 1178

  Fly   337 ---EESTTVA-----QETTYDPEGSTTREDDTTV--AIETTTEKPEDDTTVEDSTPIP------- 384
               ||:||.|     .|.|..|..:....::|||  .:|::.|:|     ...||.||       
 Worm  1179 ASGEETTTAAATEASSEATTTPAVTEASGEETTVVAVVESSGEEP-----ASSSTSIPTELSKDN 1238

  Fly   385 -------EESTTVA------QETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTV----------- 425
                   ||:.|.|      :|||......|:.|:.|   |...||...::|||           
 Worm  1239 QVTEASGEETNTAAVTEGSGEETTTAAATETSSEETT---ISAVTEASGEETTVVAVVQSSGEEP 1300

  Fly   426 -EDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTT-------REDDTTVAIETTTEKPEDDTT----VEDSTP 478
             ..||.||.|.:...|.|....|.:||       .|:.||:|:   ||...::||    ||.|..
 Worm  1301 ASSSTSIPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEASSEETTTLAV---TEGSGEETTVVAVVESSGE 1362

  Fly   479 IP-EESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQDTTNDP 542
            .| ..||::..|.:.|.:.:....::||.|  ..||...::|....:|....|:||....|....
 Worm  1363 EPASSSTSIPTELSKDDQVTEASGEETTTA--AVTEGSGEETVTPAATEASSEATTTPAGTEASG 1425

  Fly   543 EGSTTR-------EDDTTVA-IETTTEKPEDDTTAEDSTPIP--------------EESTTVAQE 585
            |.:||.       |::|.|| :|::.|:|     |..||.||              ||:||.|..
 Worm  1426 EETTTSAVTEGSGEENTVVAVVESSGEEP-----ASSSTSIPTELSNDDQVTEGSGEETTTAAAT 1485

  Fly   586 TTYDPEGST------TREDDTTVAI------ETTTE-----KREDDTTV-----------EDSTP 622
            .|...|.:|      :.|:.||.|:      ||||.     ..|::|.|           ..||.
 Worm  1486 ETSSEETTTSVVTEGSGEETTTSAVTEASGEETTTSAVTEGSGEENTVVAVVQSSGEEPASSSTS 1550

  Fly   623 IPEESTTVAQDTTNDPEGSTT-------REDDTTVAI------ETTT----EKPEDDTTAEDSTP 670
            ||.|.:...|.|....|.:||       .|:.||.|:      ||||    |...|:||...:|.
 Worm  1551 IPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEASSEETTTSAVTEGSGEETTTSAVSEGSGDETTTAAATE 1615

  Fly   671 IPEESTTVAQETTYDPEGSTT--------REDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVA 727
            ...|.|..:..|....|.:||        .|..|..|.|.::|:.......|.|   .||:||.|
 Worm  1616 ASSEETITSAVTEGSGEETTTSAVTEGSGEETTTAAATEASSEETITSAVTEGS---GEETTTSA 1677

  Fly   728 ------QETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGST 786
                  :|.|......::.|:....::...||..:||...|.|   .||:||.|...|:..|.:|
 Worm  1678 VTEGSGEEITVPTTVESSGEEPALSSMSIPTELSKDDQVTEAS---GEETTTAAATETSSEETTT 1739

  Fly   787 ------TREDDTTVAI-------------ETTTEKREDDTTVEDSTPIPEETTTV------GQET 826
                  :.|..|.||:             ...||..:||...|.|   .|||||.      .:||
 Worm  1740 SVVTEGSGEQTTVVAVVESSGEEPASSSTSIPTELSKDDQVTEAS---GEETTTAAATEASSEET 1801

  Fly   827 TYDPEGSTTREEDTTVA-IETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTV 890
            ........:.||.|.|| :|::.|:|     |..||.:|.|.:...|.|....|.:||.......
 Worm  1802 ITSAVTEGSGEETTVVAVVESSGEEP-----ASSSTSVPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEAS 1861

  Fly   891 AMETT----TEKREDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTR-------EEDTTVA-IETT 943
            :.|||    ||...::||....|....|:||....|....|.:||.       ||.|.|| :|::
 Worm  1862 SEETTTSAVTEGSGEETTTSAVTEASSEATTTPAGTEASGEETTTSAVTEGSGEETTVVAVVESS 1926

  Fly   944 TEKPEDDTTVEDSTPIPEE-------TTTVGQET-----TYDPEGSTTR-------EDDTTVAI- 988
            .|:|     ...||.||.|       |...|:||     |...|.:||.       ||.|.||: 
 Worm  1927 GEEP-----ASSSTSIPTELSKNDQVTEASGEETITAAATEASEETTTSAVTEGSGEDTTVVAVV 1986

  Fly   989 ---------------------DTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVA------QDTT------- 1019
                                 |..||...::||...:|...||:||.|      ::||       
 Worm  1987 ELSGEQPASSSTSIPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEASEETTTSAVTEGSGEETTVVAVVES 2051

  Fly  1020 --NDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTIAQETTYDPEGSTTREDDTTV 1082
              .:|..|:|.........|..||...::||...:|...||:||.|.     .|||  .||.|.|
 Worm  2052 SGEEPASSSTSIPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEASEETTTSAV-----TEGS--GEDTTVV 2109

  Fly  1083 A-IETTTEKP------------EDDTTVEDSTPIPEESTTVA-----QDTTNDPEGSTTREDDTT 1129
            | :|::.|:|            :||...|.|   .||:||.|     ::||.......:.||.|.
 Worm  2110 AVVESSGEQPASSSTSIPTELSKDDQVTEAS---GEETTTAAATEASEETTTSAVTEGSGEDTTV 2171

  Fly  1130 VAI----------------------DTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTR 1172
            ||:                      |..||...::||...:|...||:||.|.     .|||  .
 Worm  2172 VAVVESSGEQPASSSTSIPTELSKDDQVTEASGEETTTAAATEASEETTTSAV-----TEGS--G 2229

  Fly  1173 EEDTTVA-IETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEE-------TTTVGQETTYDPEGSTTREDDTTVAID 1229
            ||.|.|| :|::.|:|     ...||.||.|       |...|:|||.......:.|:.||.|: 
 Worm  2230 EETTVVAVVESSGEEP-----ASSSTSIPTELSKDDKVTEASGEETTTAAATDASSEETTTSAV- 2288

  Fly  1230 TTTEKPEDDTT----VEDSTPIP-EESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTV 1289
              ||...::||    ||.|...| ..||::..:.:.|.:.:....::||.|  ..||..|:.||.
 Worm  2289 --TEGSGEETTVVAVVESSDEEPASSSTSIPTELSKDDQVTEASGEETTTA--AATEASEETTTS 2349

  Fly  1290 EDSTPIPEESTTVA--QDTTNDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTIAQ 1352
            ..:....||:|.||  :.:..:|..|:|.........|..||...::||...:|....|.||.:.
 Worm  2350 AVTEGSGEETTVVAVVESSGEEPASSSTSIPTELSKDDKVTEASGEETTTAAATDASSEETTTSA 2414

  Fly  1353 ETTYDPEGSTTREDDTTVA-IETTTEKP------------EDDTTVEDSTPIPEESTTVA----- 1399
            .|    |||  .|:.|.|| :|::.|:|            :||...|.|   .||:||.|     
 Worm  2415 VT----EGS--GEETTVVAVVESSDEEPASSSTSIPTELSKDDQVTEAS---GEETTTAAATEAS 2470

  Fly  1400 QDTTNDPEGSTTREEDTTVA-IETTTEKP------------EDDTTVEDSTPIPEETTT-----V 1446
            ::||.......:.||.|.|| :|::.|:|            :||...|.|   .|||||     .
 Worm  2471 EETTTSAVTEGSGEETTVVAVVESSGEEPASSSTSIPTELSKDDQVTEAS---GEETTTAAATEA 2532

  Fly  1447 GQETTYDPEGSTTREDDTTVA-IETTTEKP------------EDDTTVEDSTPIPEETTTVA--- 1495
            .:|||.......:.||.|.|| :|::.|:|            :||...|.|   .|||||.|   
 Worm  2533 SEETTTSAVTEGSGEDTTVVAVVESSGEQPASSSTSIPTELSKDDQVTEAS---GEETTTAAATE 2594

  Fly  1496 --QETTYDPEGSTTRDDTTV--AIETTTEKPEDDTTAEGSTPIPDTSTTVNQDTTTDESS----T 1552
              :|||.......:.::|||  .:|::.|:|     |..||.||   |.:::|....|:|    |
 Worm  2595 ASEETTTSAVTEGSGEETTVVAVVESSGEEP-----ASSSTSIP---TELSKDDQVTEASGEETT 2651

  Fly  1553 VVTTTNIPKESTTLGDSTLSPGENSTAGQVSTSTTLVYDTTSSPIPSSSRSTT----------LE 1607
            ....|....|.||....|...||.:|...|:..:.  .:||:|.:|....|||          :|
 Worm  2652 TAAATEASSEETTTSAVTEGSGEETTTSAVTEGSG--EETTTSAVPEGENSTTEAPAFVTGSEIE 2714

  Fly  1608 -PSSSSSPETTT--SSLPPLSCSTGYQYLPHPT 1637
             |||..|..|||  .|:|.::        |.|:
 Worm  2715 IPSSEESSSTTTHDPSIPVIT--------PKPS 2739

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc68ENP_996064.1 ChtBD2 <1761..1791 CDD:214696
ChtBD2 1626..1668 CDD:214696 2/12 (17%)
ChtBD2 1688..1734 CDD:214696
srap-1NP_001364584.1 PRK13108 <1876..2013 CDD:237284 38/141 (27%)
PAN_APPLE <3374..3413 CDD:412169
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
11.000

Return to query results.
Submit another query.