DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Muc68E and si:ch73-160p18.3

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_996064.1 Gene:Muc68E / 2768990 FlyBaseID:FBgn0053265 Length:1799 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_021325765.1 Gene:si:ch73-160p18.3 / 100332020 ZFINID:ZDB-GENE-141212-268 Length:1944 Species:Danio rerio


Alignment Length:1899 Identity:431/1899 - (22%)
Similarity:590/1899 - (31%) Gaps:366/1899 - (19%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    80 SEKVSQLNLNKNNDTA-----SKLKIGAPYYYQIKITSPTKIKSLPVEVENDRKDSSGIDTTVED 139
            |.:||:.::.|.:..|     .||:           .|....:.:.:..:|.::..||..|.|. 
Zfish    34 SAEVSRPHITKESSAALAELTRKLR-----------PSGCLSEEIDLSTKNVKQSGSGSLTLVS- 86

  Fly   140 LTPIPEETTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEK-PEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETT 203
             :|.|.|..|.:        ||.     |.|:....||| .|..:....|:|.|.|..|.:...|
Zfish    87 -SPQPTEKLTAS--------GSL-----TVVSNPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKLTESGSLT 137

  Fly   204 Y----DPEGSTTREDDTTVAI-ETTTEK-PEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTY----DPEGST 258
            .    .|....|.....|||: ...||| .|..:....|.|.|.|..|.:...|.    .|....
Zfish   138 VALGPRPTEKLTESGSLTVALGPRPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKL 202

  Fly   259 TRDDETTVAI--ETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTY----DPEGSTTREDDTTVAI- 316
            |.....||.:  :.|.:..|..:....|:|.|.|..|.:...|.    .|..........||.: 
Zfish   203 TESGSLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKVKESGSLTVVLG 267

  Fly   317 -ETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTY----DPEGSTTREDDTTVAI--ETTTEKPEDD 374
             :.|.:..|..:....|:|.|.|..|.:...|.    .|....|.....||.:  :.|.:..|..
Zfish   268 PQPTEKLTESGSLTVVSSPWPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKLTESG 332

  Fly   375 TTVEDSTPIPEESTTVAQETTY----DPEGSTTREDDTTVAI--ETTTEKPEDDTTVEDSTPIPE 433
            :....|.|.|.|..|.:...|.    .|....|.....||.:  :.|.:..|..:....|.|.|.
Zfish   333 SLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVSNPRPT 397

  Fly   434 ESTTVAQETTY----DPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDST-----PIPEESTTVAQE 489
            |..|.:...|.    .|....|.....||   .::.:|.:..|...|.     |.|.|..|.:..
Zfish   398 EKLTESGSLTVALGPRPTEKLTESGSLTV---VSSPRPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKLTESGS 459

  Fly   490 TTY----DPEGSTTREDDTTVAI--ETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQDTT----NDPEG 544
            .|.    .|....|.....||.:  :.|.:..|..:....|:|.|.|..|.:...|    ..|..
Zfish   460 LTVVSSPRPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKLTESGSLTVVSNPQPTE 524

  Fly   545 STTREDDTTVAI--ETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQETTY----DPEGSTTREDDTTVA 603
            ..|.....||.:  :.|.:..|..:....|.|.|.|..|.:...|.    .|....|.....||.
Zfish   525 KLTESGSLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVV 589

  Fly   604 I--ETTTEKREDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTT----NDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDD 662
            :  :.|.:..|..:....|.|.|.|..|.:...|    ..|....|.....||.:   ..:|.:.
Zfish   590 LGPQPTEKLTESGSLTVVSNPRPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVL---GPQPTEK 651

  Fly   663 TTAEDST-----PIPEESTTVAQETTY----DPEGSTTREDDTTVAI--ETTTEKPEDDTTVEDS 716
            .|...|.     |.|.|..|.:...|.    .|....|.....||.:  :.|.:..|..:....|
Zfish   652 VTESGSLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKLTESGTLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVS 716

  Fly   717 TPIPEESTTVAQETTY----DPEGSTTREDDTTVAI--ETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVA 775
            .|.|.|..|.:...|.    .|....|.....||.:  :.|.:..|..:......|.|.|..|.:
Zfish   717 NPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKVKESGSLTVVLGPQPTEKLTES 781

  Fly   776 QDTT----NDPEGSTTREDDTTVAIE-TTTEK-REDDTTVEDSTPIPEE--------TTTVGQET 826
            ...|    ..|....|.....||.:| ..||| .|..:....|:|.|.|        |..:|.:.
Zfish   782 GSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVLEPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKLTESGSLTVVLGPQP 846

  Fly   827 TY--------------DPEGSTTREEDTTVAIE-TTTEK-PEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQETT 875
            |.              .|....|.....||.:| ..||| .|..:....|:|.|.|..|.:...|
Zfish   847 TEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVLEPQPTEKLTESGSLTVVSSPRPTEKLTESGSLT 911

  Fly   876 Y----DPEGSTTREDDTTVAM--ETTTEKREDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTT--NDPEGSTTR 932
            .    .|....|.....||..  :.|.:..|..:......|.|.|..|.:...|  ::|:.:...
Zfish   912 VVLGPQPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVSNPQPTEKL 976

  Fly   933 EED---TTVAIETTTEK-PEDDTTVEDSTPIPEETTTVGQETT----YDPEGSTTREDDTTV--- 986
            .|.   |.|:....||| .|..:......|.|.|..|.....|    ..|....|.....||   
Zfish   977 TESGSLTCVSYPQPTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKLTESGSLTVVSNLQPTEKLTESGSLTVKSS 1041

  Fly   987 AIDTT-----------TEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTT-----NDPEGSTTREDDTTVA 1035
            |:...           |||.....::..|:|.|.|..|.:...|     ...|..|.....|.|.
Zfish  1042 ALSAACPVSVASSPLPTEKLNHSVSLTLSSPQPTEKLTESGSLTVVLQPQQTEKLTESGSLTVVL 1106

  Fly  1036 IDTTTEKPEDD---TTVEDSTPIPE--ESTTIAQETTYDPEGSTTREDDTTVAI--ETTTEKPED 1093
            ....|||..:.   |.|....|..:  ||.::.......|....|.....|||:  :.:.:..|.
Zfish  1107 GPQQTEKLTESGSLTVVLGPQPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLTESGSLTVALGPQPSEKLAES 1171

  Fly  1094 DTTVEDSTPIPEESTTVAQDTT----NDPEGSTTREDDTTVAI-DTTTEK-PEDDTTVEDSTPIP 1152
            .:......|.|.|..|.:...|    ..|....|.....|||: ...||| .|..:......|.|
Zfish  1172 GSLTVALGPQPTEKLTESGSLTMAVGPQPTEKLTESGSLTVALGPQPTEKLTESGSLTVALGPQP 1236

  Fly  1153 EE------STTVAQDTTNDPEGSTTREEDTTVAI--ETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEE------- 1202
            .|      |.|||...  .|..........|||:  :.|.:..|..:......|.|.|       
Zfish  1237 TEKLAESGSLTVALGP--QPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLAESGS 1299

  Fly  1203 -TTTVGQETTYDPEGSTTREDDTTVAI-DTTTEK-PEDDTTVEDSTPIPEE------STTVAQDT 1258
             |..:|.:    |....|.....|||: ...||| .|..:......|.|.|      |.|||...
Zfish  1300 LTVVLGPQ----PTEKLTESGSLTVALGPQPTEKLAESGSLTVVLGPQPTEKLAESGSLTVALGP 1360

  Fly  1259 TNDPEGSTTREDDTTVAI-DTTTEK-PEDDTTVEDSTPIPEE------STTVAQDTTNDPEGSTT 1315
              .|..........|||: ...||| .|..:......|.|.|      |.|||...  .|.....
Zfish  1361 --QPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLAESGSLTVALGP--QPTEKLA 1421

  Fly  1316 REDDTTVAI-DTTTEKPEDD---TTVEDSTPIPE--ESTTIAQETTYDPEGSTTREDDTTVAI-- 1372
            .....|||: ...|||..:.   |.|....|..:  ||.::.......|....|.....|||:  
Zfish  1422 ESGSLTVALGPQPTEKLAESGSLTVVLGPQPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLTESGSLTVALGP 1486

  Fly  1373 ETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTT----NDPEGSTTREEDTTVAI-----ETTTE--- 1425
            :.|.:..|..:......|.|.|..|.:...|    ..|....|.....|||:     |..||   
Zfish  1487 QPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLTESGSLTVALGPQPTEKLTESGSLTVALGPQPTEKLTESGS 1551

  Fly  1426 -------KPEDDTTVEDST-----PIPEE--------TTTVGQETTY--------------DPEG 1456
                   :|.|..|...|.     |.|.|        |..:|.:.|.              .|..
Zfish  1552 LTVALGPQPTDKLTESGSLTVVLGPQPTEKLAESGSLTVVLGPQPTEKLAESGSLTVALGPQPTE 1616

  Fly  1457 STTREDDTTVAI--ETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEETTTVAQETT-----YDPEGSTTRDDTTVA 1514
            ..|.....|||:  :.|.:..|..:......|.|.|..|.:...|     ...|..|.....|||
Zfish  1617 KLTESGSLTVALGPQPTEKLAESGSLTVALGPQPTEKLTESGSLTVALGPQPTEKLTESGSLTVA 1681

  Fly  1515 I-----ETTTE----------KPEDDTTAEGST-----PIPDTSTTVNQDTT-----------TD 1548
            :     |..||          :|.|..|..||.     |.|....|.:...|           .:
Zfish  1682 LGPQPTEKLTESGSLTVALGPQPTDKLTESGSLTVALGPQPTGKLTESGTLTVVLGPQPTEKLAE 1746

  Fly  1549 ESSTVVTTTNIPKESTTLGDSTLSPGENSTAGQVSTSTTLVYDTTSSPIPSSSRSTTLEPSSSSS 1613
            ..|..|.....|.|..|...|........:.|:::.|.:||   .|.|:|:...:.|  .||.||
Zfish  1747 SGSLTVALGPQPTEKLTESGSLFVVSSPLSTGKLAESGSLV---LSGPLPTDKSTET--ASSVSS 1806

  Fly  1614 PETTTSSLPPLSCSTGYQYLPHPTNCHKYIHCSNGHELIMECPANLYWDYHKFVCSGDSGVCYND 1678
            |..|..    |:.|.....:..|....|....|:                  ||.||        
Zfish  1807 PPATGK----LTESGSLSVVSSPLTTGKLTESSS------------------FVLSG-------- 1841

  Fly  1679 TENSNPEEKVCGPG 1692
               |.|.||:...|
Zfish  1842 ---SLPAEKLTESG 1852

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc68ENP_996064.1 ChtBD2 <1761..1791 CDD:214696
ChtBD2 1626..1668 CDD:214696 5/41 (12%)
ChtBD2 1688..1734 CDD:214696 1/5 (20%)
si:ch73-160p18.3XP_021325765.1 Atrophin-1 <1166..1632 CDD:331285 111/475 (23%)
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
ZFIN 00.000 Not matched by this tool.
10.910

Return to query results.
Submit another query.