DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG33298 and Atp8b4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_995666.1 Gene:CG33298 / 2768929 FlyBaseID:FBgn0032120 Length:1517 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001417363.1 Gene:Atp8b4 / 311396 RGDID:1306712 Length:1194 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1356 Identity:412/1356 - (30%)
Similarity:653/1356 - (48%) Gaps:305/1356 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   239 KTPKRDH-PNGQFVGNKIRTTKYTLLSFIPKNLLEQFHRVANLYFIFIVLLNWVPEISAFGKEVA 302
            |...||: ...|:..|:|.|:||.:|:|:|.||.|||.||||.||:|:::|..:||||:......
  Rat    17 KANDRDYNEKFQYADNRIHTSKYNILTFLPINLFEQFQRVANAYFLFLLILQLIPEISSLTWFTT 81

  Fly   303 MIPVLFVLGVTAVKDLFEDRRRRASDKRINNTTCRVYDGETERYKKVKWQELRVGDIVHLSNNET 367
            ::|::.|:.:|||||..:|..|..||.::||....|.  ...:.:..||..::||||:.|.||:.
  Rat    82 IVPLVLVISMTAVKDATDDFFRHKSDNQVNNRQSEVL--INSKLQNEKWMNVKVGDIIKLENNQF 144

  Fly   368 VPADILLLRTSDPQGVCYIDTCDLDGETNLKRREVVRGFEEM-QSIFVPSKFVSRVEADAPTTKL 431
            |.||:|||.:|:|.|:||::|.:||||||||.|:.:....|: ..|...:||...|..:||..||
  Rat   145 VAADLLLLSSSEPHGLCYVETAELDGETNLKVRQALPVTSELGADISSLAKFDGIVICEAPNNKL 209

  Fly   432 YRFHGALIHPTGERVPISTECLLLRESRLKNTDYIEGIVVYAGHETKSMLNNSGPRYKRSQVEQQ 496
            .||.|.|.....:.. :|.:.::||...|:||.:..|:|::||.:||.|.|:...::||:.:::.
  Rat   210 DRFSGVLSWKDSKHT-LSNQKIILRGCVLRNTSWCFGMVLFAGPDTKLMQNSGKTKFKRTSIDRL 273

  Fly   497 MNIDVIWCVIILLILCVVGAIGCRMWLSSFTHFPVPYLPPNKLTANMESMW-------------I 548
            ||..|:|....|:.|.::.|:|..:|.|..         .|:...::  .|             .
  Rat   274 MNTLVLWIFGFLVCLGIILAVGNSIWESEV---------GNQFRTSL--FWREGEKSSLFSGFLT 327

  Fly   549 FWTYIVILQVMIPLSLYVTIELCKILQVFHIHNNVDLFDAETNKQTECRAMNITEELGQIQHIFT 613
            ||:|::||..::|:||||::|:.::...:.|:.:..::.|......|.|...:.||||||::||:
  Rat   328 FWSYVIILNTLVPISLYVSVEVIRLGHSYFINWDRKMYYAAKAMPAEARTTTLNEELGQIEYIFS 392

  Fly   614 DKTGTLTENKMIFRRCVVNGSDYNHPPSELEKIYSKPGAPAPPLIPNDNLN--------SDMAQL 670
            |||||||:|.|.|::|.:||           ::|:  |.....|.....:.        |..::.
  Rat   393 DKTGTLTQNIMTFKKCSING-----------RVYA--GEVLDDLDQKKEITKKKEAVDFSGKSKS 444

  Fly   671 TQGTYLTPHA---------QRIQEFLVVLAICNTVIVGAAPHRDMMNASGIIEVQQIGNSPANLK 726
            .:..:...|:         .::.|||.:||:|:||:                             
  Rat   445 ERTLHFFDHSLMESIELGDPKVHEFLRLLALCHTVM----------------------------- 480

  Fly   727 HGKQRQKLLASSTSTTTTTTIINGPTTQPQVVSIPADRYIRLAESRSVTPSPPPNLLFALPAQSH 791
                                                                             
  Rat   481 ----------------------------------------------------------------- 480

  Fly   792 QPTLSPISSSAESSPNSESESPSPPMKNKSLSNSISPTGRAKAVINSKITSIATFLNAKTQGKRM 856
                            ||.:|.                                           
  Rat   481 ----------------SEEDSA------------------------------------------- 486

  Fly   857 KLPSSKTGTIYRTADGRPLYEAESPDELALVNAAYSYDCCLLNRSPNQILVSMPMAGATREYEIL 921
                           |:.:|:.:||||.|||.||.::.....:|:|..|.:.  ..|....|::|
  Rat   487 ---------------GQLVYQVQSPDEGALVTAARNFGFIFKSRTPETITIE--ELGTPVTYQLL 534

  Fly   922 KVLPFDSSRKCMSIVVRQIGSQEIVLYTKGADSSIMPVLVPCSHNSPEGILREQTQQLLDRYARE 986
            ..|.|::.||.||::||....| |.||:||||:.:...|    |.|.|.:| ..|...|..:|.|
  Rat   535 AFLDFNNIRKRMSVIVRNPEGQ-IKLYSKGADTILFEKL----HPSNEDLL-SLTSDHLSEFAGE 593

  Fly   987 GLRILVMAKRTLNSADYTDWWARHQEIEMSLENRERRLRDSFAKLESNLTLLGATGIEDRLQDGV 1051
            |||.|.:|.|.|:...:..|....::...::..|:.|:...:.::|.:|.|||||.:||:||:||
  Rat   594 GLRTLAIAYRELDDKYFKMWQKMLEDANSAIAERDERISGLYEEIERDLMLLGATAVEDKLQEGV 658

  Fly  1052 PETIASLLSAGISVWVLTGDKPETAINIAYSAKLFTQQME---------LIRLTARSRDAAETAI 1107
            .|||.||..|.|.:|:|||||.||||||.|:..:.|..|:         .:.:....|.|.|..:
  Rat   659 IETITSLSLANIKIWILTGDKQETAINIGYACNVLTDAMDAVFVITGNTAVEVREELRKAKENLL 723

  Fly  1108 -------NFYLTDMENDKTTSTLGYGQSLRKKQRALVVDGKTLTFILDPKSKLILPFLRLSKRCA 1165
                   |.:.......:.....|.|::: ..:.|||::|.:|...|:  |.:....|.|:..|.
  Rat   724 GQNTSFSNGHAVYENKQRLELDSGAGETV-TGEYALVINGHSLAHALE--SDVEKDLLELACVCK 785

  Fly  1166 SVLCCRSTPLQKAYLVKVVKEELNLRTLAIGDGANDVSMIQMADVGVGISGQEGMQAVMAADFTL 1230
            :|:|||.||||||.:|::||:..|..||||||||||||||:.|.:|:|||||||:|||:|:|:.|
  Rat   786 TVVCCRVTPLQKAQVVELVKKHRNAVTLAIGDGANDVSMIKSAHIGIGISGQEGLQAVLASDYAL 850

  Fly  1231 PRFRYLERLLLAHGYWCYDRLSRMILYFFYKNAAFVFLIFWYQLYCGFSGQVMMDQMYLMLYNLI 1295
            .:||||:||||.||.|.|.|:.:.:.||||||.||..:.||:..|||||.|.:.||.::.|:|::
  Rat   851 AQFRYLQRLLLVHGRWSYYRMCKFLCYFFYKNFAFTLVHFWFAFYCGFSAQTVYDQWFITLFNIV 915

  Fly  1296 FTSLPPLAIGVYDKRVAEDLLLKNPYLYKNGRLGVAYRPHDFWLILLDALYQSLVIFFVALCAY- 1359
            :||||.||:||:|:.|:|...:..|.||:.|:|.:.:....|::.:...:|.||::||:...|: 
  Rat   916 YTSLPVLAMGVFDQDVSEQNSMDCPQLYEPGQLNLLFNKRRFFICVAHGIYTSLILFFIPYGAFY 980

  Fly  1360 ---AESDVGIWE---FGTTITASCLFANLVHCAIEIRSWTVLHVLSIVLSLGSFY--LFAIVYDS 1416
               ||....|.:   |..|:..|.:....|..|::...|||::.:.|..|:.:::  |.|:..|.
  Rat   981 NVAAEDGQHIADYQSFAVTVATSLVIVVSVQIALDTSYWTVVNHVFIWGSVATYFSILLAMHSDG 1045

  Fly  1417 VCMNCFGV-----------RSSYWVIFVCFASAVHWLVIMLSTVVAVLPRLLLTTVRISLCPDDS 1470
            |    ||:           |.|....||       |||::|:.|.:|:|.::...:::.|.|..|
  Rat  1046 V----FGIFPRQFPFVGNARRSLSQKFV-------WLVVLLTAVTSVMPVVVFRFLKMHLYPSLS 1099

  Fly  1471 TKV-----------ILQSKRERSRGEALLVTWSRSTSASSIYRITDYGSKNQIITT 1515
            .::           .|:|:|.::|         ||:|..|.|.........::||:
  Rat  1100 DQIRRWQKAQRKERPLRSRRPQTR---------RSSSRRSGYAFAHQEGYGELITS 1146

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG33298NP_995666.1 P-type_ATPase_APLT_Dnf-like 252..1355 CDD:319770 363/1149 (32%)
Atp8b4NP_001417363.1 None

Return to query results.
Submit another query.