Protein Alignment PCDH17 and Pcdh17

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001035519.1
• Gene: PCDH17 / 27253
• HGNCID: 14267
• Length: 1159
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_006518968.1
• Gene: Pcdh17 / 219228
• MGIID: 2684924
• Length: 1185
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1188
• Identity: 1138/1188 - (95%)
• Similarity: 1144/1188 - (96%)
• Gaps: 32/1188 - (2%)

Human     1 MYLSICCCFLLWAPALTLKNLNYSVPEEQGAGTVIGNIGRDARLQPGLPPAERG-GGGRSKSGSY 64
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||| |.||||||||
Mouse     1 MYLSICCCFLLWAPALTLKNLNYSVPEEQGAGTVIGNIGKDARLQPGLPPAERGSGSGRSKSGSY 65

Human    65 RVLENSAPHLLDVDADSGLLYTKQRIDRESLCRHNAKCQLSLEVFANDKEICMIKVEIQDINDNA 129
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 RVLENSAPHLLDVDADSGLLYTKQRIDRESLCRHNAKCQLSLEVFANDKEICMIKVEIQDINDNA 130

Human   130 PSFSSDQIEMDISENAAPGTRFPLTSAHDPDAGENGLRTYLLTRDDHGLFGLDVKSRGDGTKFPE 194
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Mouse   131 PSFPSDQIEMDISENAAPGTRFPLTSAHDPDAGENGLRTYLLTRDDHGLFALDVKSRGDGTKFPE 195

Human   195 LVIQKALDREQQNHHTLVLTALDGGEPPRSATVQINVKVIDSNDNSPVFEAPSYLVELPENAPLG 259
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 LVIQKALDRELQNHHTLVLTALDGGEPPRSATVQINVKVIDSNDNSPVFEAPSYLVELPENAPLG 260

Human   260 TVVIDLNATDADEGPNGEVLYSFSSYVPDRVRELFSIDPKTGLIRVKGNLDYEENGMLEIDVQAR 324
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 TVVIDLNATDADEGPNGEVLYSFSSYVPDRVRELFSIDPKTGLIRVKGNLDYEENGMLEIDVQAR 325

Human   325 DLGPNPIPAHCKVTVKLIDRNDNAPSIGFVSVRQGALSEAAPPGTVIALVRVTDRDSGKNGQLQC 389
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 DLGPNPIPAHCKVTVKLIDRNDNAPSIGFVSVRQGALSEAAPPGTVIALVRVTDRDSGKNGQLQC 390

Human   390 RVLGGGGTGGGGGLGGPGGSVPFKLEENYDNFYTVVTDRPLDRETQDEYNVTIVARDGGSPPLNS 454
            ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 RVLGGGGT--GGGLGGP-GSVPFKLEENYDNFYTVVTDRPLDRETQDEYNVTIVARDGGSPPLNS 452

Human   455 TKSFAIKILDENDNPPRFTKGLYVLQVHENNIPGEYLGSVLAQDPDLGQNGTVSYSILPSHIGDV 519
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   453 TKSFAVKILDENDNPPRFTKGLYVLQVHENNIPGEYLGSVLAQDPDLGQNGTVSYSILPSHIGDV 517

Human   520 SIYTYVSVNPTNGAIYALRSFNFEQTKAFEFKVLAKDSGAPAHLESNATVRVTVLDVNDNAPVIV 584
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   518 SIYTYVSVNPTNGAIYALRSFNYEQTKAFEFKVLAKDSGAPAHLESNATVRVTVLDVNDNAPVIV 582

Human   585 LPTLQNDTAELQVPRNAGLGYLVSTVRALDSDFGESGRLTYEIVDGNDDHLFEIDPSSGEIRTLH 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   583 LPTLQNDTAELQVPRNAGLGYLVSTVRALDSDFGESGRLTYEIVDGNDDHLFEIDPSSGEIRTLH 647

Human   650 PFWEDVTPVVELVVKVTDHGKPTLSAVAKLIIRSVSGSLPEGVPRVNGEQHHWDMSLPLIVTLST 714
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   648 PFWEDVTPVVELVVKVTDHGKPTLSAVAKLIIRSVSGSLPEGVPRVNGEQHHWDMSLPLIVTLST 712

Human   715 ISIILLAAMITIAVKCKRENKEIRTYNCRIAEYSHPQLGGGKGKKKKINKNDIMLVQSEVEERNA 779
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   713 ISIILLAAMITIAVKCKRENKEIRTYNCRIAEYSHPQLGGGKGKKKKINKNDIMLVQSEVEERNA 777

Human   780 MNVMNVVSSPSLATSPMYFDYQTRLPLSSPRSEVMYLKPASNNLTVPQGHAGCHTSFTGQGTNAS 844
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   778 MNVMNVVSSPSLATSPMYFDYQTRLPLSSPRSEVMYLKPASNNLTVPQGHAGCHTSFTGQGTNSS 842

Human   845 ETPATRMSIIQTDNFPAEPNYMGSRQQFVQSSSTFKDPERASLRDSGHGDSDQADSDQDTNKGSC 909
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   843 ETPATRMSIIQTDNFPAEPNYMGSRQQFVQSSSTFKDPERASLRDSGHGDSDQADSDQDTNKGSC 907

Human   910 CDMSVREALKMKTTSTKSQPLEQ----------------------------EPEECVNCTDECRV 946
            |||||||||||||||||||||||                            |||||:||||||||
Mouse   908 CDMSVREALKMKTTSTKSQPLEQAFPTLLSFAILTLHTITTRLQSVDPLPPEPEECINCTDECRV 972

Human   947 LGHSDRCWMPQFPAANQAENADYRTNLFVPTVEANVETETYETVNPTGKKTFCTFGKDKREHTIL 1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   973 LGHSDRCWMPQFPAANQAENADYRTNLFVPTVEANVETETYETVNPTGKKTFCTFGKDKREHTIL 1037

Human  1012 IANVKPYLKAKRALSPLLQEVPSASSSPTKACIEPCTSTKGSLDGCEAKPGALAEASSQYLPTDS 1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||
Mouse  1038 IANVKPYLKAKRALSPLLQEVPSASSSPTKACIEPCASTKGSLDGCEAKPGPLAEASSSYLPTDS 1102

Human  1077 QYLSPSKQPRDPPFMASDQMARVFADVHSRASRDSSEMGAVLEQLDHPNRDLGRESVDAEEVVRE 1141
            ||.|||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||:.||||||||||||||||||
Mouse  1103 QYPSPSKQPRDPSFMASDQMARVFADVHSRARRASSEMGAVLEQLEQPNRDLGRESVDAEEVVRE 1167

Human  1142 IDKLLQDCRGNDPVAVRK 1159
            ||||||||||||||||||
Mouse  1168 IDKLLQDCRGNDPVAVRK 1185

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
PCDH17	NP_001035519.1	Cadherin_2	21..112	CDD:462413	88/91 (97%)
		Cadherin_repeat	141..239	CDD:206637	95/97 (98%)
		Cell attachment site. /evidence=ECO:0000255	186..188		1/1 (100%)
		Cadherin_repeat	247..347	CDD:206637	99/99 (100%)
		Cadherin_repeat	361..468	CDD:206637	102/106 (96%)
		Cadherin_repeat	477..579	CDD:206637	100/101 (99%)
		Cadherin_repeat	594..682	CDD:206637	87/87 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	858..909		50/50 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1108..1132		19/23 (83%)
Pcdh17	XP_006518968.1	Cadherin_2	21..113	CDD:462413	88/91 (97%)
		Cadherin_repeat	142..240	CDD:206637	95/97 (98%)
		Cadherin_repeat	248..348	CDD:206637	99/99 (100%)
		Cadherin_repeat	362..466	CDD:206637	102/106 (96%)
		Cadherin_repeat	475..577	CDD:206637	100/101 (99%)
		Cadherin_repeat	592..680	CDD:206637	87/87 (100%)