DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment FOXP1 and Foxp1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001231739.1 Gene:FOXP1 / 27086 HGNCID:3823 Length:693 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_030110934.1 Gene:Foxp1 / 108655 MGIID:1914004 Length:723 Species:Mus musculus


Alignment Length:723 Identity:671/723 - (92%)
Similarity:681/723 - (94%) Gaps:30/723 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MMQESGTETKSNGSAIQNGSGGSNHLLECGGLREGRSNGETPAVDIGAADLAHAQQQQQQALQVA 65
            ||||||:|||||||||||||.|.|||||||.||:.|||||.||||:|||||||.|||||||||||
Mouse     1 MMQESGSETKSNGSAIQNGSSGGNHLLECGALRDTRSNGEAPAVDLGAADLAHVQQQQQQALQVA 65

Human    66 RQLLL------------------------------QQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVA 100
            |||||                              ||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 RQLLLQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQVSGLKSPKRNDKQPALQVPVSVA 130

Human   101 MMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAG 165
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 MMTPQVITPQQMQQILQQQVLSPQQLQVLLQQQQALMLQQQQLQEFYKKQQEQLQLQLLQQQHAG 195

Human   166 KQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPLAQGMIPTELQQ 230
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 KQPKEQQQVATQQLAFQQQLLQMQQLQQQHLLSLQRQGLLTIQPGQPALPLQPLAQGMIPTELQQ 260

Human   231 LWKEVTSAHTAEETTGNNHSSLDLTTTCVSSSAPSKTSLIMNPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEE 295
            |||||||||||||||.:||||||||:||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 LWKEVTSAHTAEETTSSNHSSLDLTSTCVSSSAPSKSSLIMNPHASTNGQLSVHTPKRESLSHEE 325

Human   296 HPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCEDFQSFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKE 360
            ||||||||||||||||||||||:||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 HPHSHPLYGHGVCKWPGCEAVCDDFPAFLKHLNSEHALDDRSTAQCRVQMQVVQQLELQLAKDKE 390

Human   361 RLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLSKSASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVIT 425
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 RLQAMMTHLHVKSTEPKAAPQPLNLVSSVTLSKSASEASPQSLPHTPTTPTAPLTPVTQGPSVIT 455

Human   426 TTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNE 490
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   456 TTSMHTVGPIRRRYSDKYNVPISSADIAQNQEFYKNAEVRPPFTYASLIRQAILESPEKQLTLNE 520

Human   491 IYNWFTRMFAYFRRNAATWKGAIRTNLSLHKCFIRVEDEFGSFWTVDDEEFKRGRHIQRGRPRKY 555
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Mouse   521 IYNWFTRMFAYFRRNAATWKGAIRTNLSLHKCFIRVEDEFGSFWTVDDEEFIRGRHIQRGRPRKY 585

Human   556 CPDENFDELVAHNPSLIKNMQSSHAYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGNLASAIRE 620
            ||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
Mouse   586 CPGENSDELGAHNPSLIKNMQSSHAYCTPLNAALQASMAENSIPLYTTASMGNPTLGSLASAIRE 650

Human   621 ELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPVHVKEEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSPDFDHDRDYED 685
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   651 ELNGAMEHTNSNESDSSPGRSPMQAVHPIHVKEEPLDPEEAEGPLSLVTTANHSPDFDHDRDYED 715

Human   686 EPVNEDME 693
            ||||||||
Mouse   716 EPVNEDME 723

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FOXP1NP_001231739.1 FOXP-CC 302..369 CDD:465036 63/66 (95%)
FH_FOX 464..545 CDD:469596 79/80 (99%)
Foxp1XP_030110934.1 FOXP-CC 332..399 CDD:465036 63/66 (95%)
FH_FOX 494..575 CDD:469596 79/80 (99%)

Return to query results.
Submit another query.