DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NBEA and Nbea

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001371941.1 Gene:NBEA / 26960 HGNCID:7648 Length:2967 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038959903.1 Gene:Nbea / 361948 RGDID:1562629 Length:2956 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2969 Identity:2893/2969 - (97%)
Similarity:2928/2969 - (98%) Gaps:15/2969 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASEKPGPGPGLEPQPVGLIAVGAAGGGGGGSGGGGTGGSGMGELRGA--SGSGSVMLPAGMINP 63
            |||:|  ||||||||||.|:||||        ||.|:||..|||.|||  ||||||:||||||||
  Rat     1 MASDK--PGPGLEPQPVALLAVGA--------GGSGSGGGAMGEPRGAAGSGSGSVVLPAGMINP 55

Human    64 SVPIRNIRMKFAVLIGLIQVGEVSNRDIVETVLNLLVGGEFDLEMNFIIQDAESITCMTELLEHC 128
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    56 SVPIRNIRMKFAVLIGLIQVGEVSNRDIVETVLNLLVGGEFDLEMNFIIQDAESITCMTELLEHC 120

Human   129 DVTCQAEIWSMFTAILRKSVRNLQTSTEVGLIEQVLLKMSAVDDMIADLLVDMLGVLASYSITVK 193
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   121 DVTCQAEIWSMFTAILRKSVRNLQTSTEVGLIEQVLLKMSAVDDMIADLLVDMLGVLASYSITVK 185

Human   194 ELKLLFSMLRGESGIWPRHAVKLLSVLNQMPQRHGPDTFFNFPGCSAAAIALPPIAKWPYQNGFT 258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   186 ELKLLFSMLRGESGIWPRHAVKLLSVLNQMPQRHGPDTFFNFPGCSAAAIALPPIAKWPYQNGFT 250

Human   259 LNTWFRMDPLNNINVDKDKPYLYCFRTSKGVGYSAHFVGNCLIVTSLKSKGKGFQHCVKYDFQPR 323
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   251 LNTWFRMDPLNNINVDKDKPYLYCFRTSKGVGYSAHFVGNCLIVTSLKSKGKGFQHCVKYDFQPR 315

Human   324 KWYMISIVHIYNRWRNSEIRCYVNGQLVSYGDMAWHVNTNDSYDKCFLGSSETADANRVFCGQLG 388
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   316 KWYMISIVHIYNRWRNSEIRCYVNGQLVSYGDMAWHVNTNDSYDKCFLGSSETADANRVFCGQLG 380

Human   389 AVYVFSEALNPAQIFAIHQLGPGYKSTFKFKSESDIHLAEHHKQVLYDGKLASSIAFTYNAKATD 453
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
  Rat   381 AVYVFSEALNPAQIFAVHQLGPGYKSTFKFKSESDIHLAEHHKQVLYDGKLASSIAFSYNAKATD 445

Human   454 AQLCLESSPKENASIFVHSPHALMLQDVKAIVTHSIHSAIHSIGGIQVLFPLFAQLDNRQLNDSQ 518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   446 AQLCLESSPKENASIFVHSPHALMLQDVKAIVTHSIHSAIHSIGGIQVLFPLFAQLDNRQLNDSQ 510

Human   519 VETTVCATLLAFLVELLKSSVAMQEQMLGGKGFLVIGYLLEKSSRVHITRAVLEQFLSFAKYLDG 583
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   511 VETTVCATLLAFLVELLKSSVAMQEQMLGGKGFLVIGYLLEKSSRVHITRAVLEQFLSFAKYLDG 575

Human   584 LSHGAPLLKQLCDHILFNPAIWIHTPAKVQLSLYTYLSAEFIGTATIYTTIRRVGTVLQLMHTLK 648
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   576 LSHGAPLLKQLCDHILFNPAIWIHTPAKVQLSLYTYLSAEFIGTATIYTTIRRVGTVLQLMHTLK 640

Human   649 YYYWVINPADSSGITPKGLDGPRPSQKEIISLRAFMLLFLKQLILKDRGVKEDELQSILNYLLTM 713
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   641 YYYWVINPADSSGITPKGLDGPRPSQKEIISLRAFMLLFLKQLILKDRGVKEDELQSILNYLLTM 705

Human   714 HEDENIHDVLQLLVALMSEHPASMIPAFDQRNGIRVIYKLLASKSESIWVQALKVLGYFLKHLGH 778
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   706 HEDENIHDVLQLLVALMSEHPASMIPAFDQRNGIRVIYKLLASKSESIWVQALKVLGYFLKHLGH 770

Human   779 KRKVEIMHTHSLFTLLGERLMLHTNTVTVTTYNTLYEILTEQVCTQVVHKPHPEPDSTVKIQNPM 843
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   771 KRKVEIMHTHSLFTLLGERLMLHTNTVTVTTYNTLYEILTEQVCTQVVHKPHPEPDSTVKIQNPM 835

Human   844 ILKVVATLLKNSTPSAELMEVRRLFLSDMIKLFSNSRENRRCLLQCSVWQDWMFSLGYINPKNSE 908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
  Rat   836 ILKVVATLLKNSTPSAELMEVRRLFLSDMIKLFSNSRENRRCLLQCSVWQDWMFSLGYINPKSSE 900

Human   909 EQKITEMVYNIFRILLYHAIKYEWGGWRVWVDTLSIAHSKVTYEAHKEYLAKMYEEYQRQEEENI 973
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   901 EQKITEMVYNIFRILLYHAIKYEWGGWRVWVDTLSIAHSKVTYEAHKEYLAKMYEEYQRQEEENI 965

Human   974 KKGKKGNVSTISGLSSQTTGAKGGMEIREIEDLSQSQSPESETDYPVSTDTRDLLMSTKVSDDIL 1038
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   966 KKGKKGNVSTISGLSSQTAGAKGGMEIREIEDLSQSQSPESETDYPVSTDTRDLLMSTKVSDDIL 1030

Human  1039 GNSDRPGSGVHVEVHDLLVDIKAEKVEATEVKLDDMDLSPETLVGGENGALVEVESLLDNVYSAA 1103
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1031 GGSDRPGSGVHVEVHDLLVDIKAEKVEATEVKLDDMDLSPETLVGGENGALVEVESLLDNVYSAA 1095

Human  1104 VEKLQNNVHGSVGIIKKNEEKDNGPLITLADEKEDLPNSSTSFLFDKIPKQEEKLLPELSSNHII 1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  1096 VEKLQNNVHGSVGIIKKNEEKDNGPLITLADEKEELPNSSTSFLFDKLPKQEEKLLPELSSNHII 1160

Human  1169 PNIQDTQVHLGVSDDLGLLAHMTGSVDLTCTSSIIEEKEFKIHTTSDGMSSISERDLASSTKGLE 1233
            ||||||||||||:||||||||||.||:|||||||:|||:|:|||||||:||:|||:||||||||:
  Rat  1161 PNIQDTQVHLGVTDDLGLLAHMTASVELTCTSSIMEEKDFRIHTTSDGVSSVSERELASSTKGLD 1225

Human  1234 YAEMTATTLETESSSSKIVPNIDAGSIISDTERSDDGKESGKEIRKIQTTTTTQAVQGRSITQQD 1298
            ||||||||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||
  Rat  1226 YAEMTATTLETESSNSKTVPNIDAGSIISDTERSDDGKESGKEIRKIQTTATTQAVQGRSSTQQD 1290

Human  1299 RDLRVDLGFRGMPMTEEQRRQFSPGPRTTMFRIPEFKWSPMHQRLLTDLLFALETDVHVWRSHST 1363
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1291 RDLRVDLGFRGMPMTEEQRRQFSPGPRTTMFRIPEFKWSPMHQRLLTDLLFALETDVHVWRSHST 1355

Human  1364 KSVMDFVNSNENIIFVHNTIHLISQMVDNIIIACGGILPLLSAATSPTGSKTELENIEVTQGMSA 1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||
  Rat  1356 KSVMDFVNSNENIIFVHNTIHLISQMVDNIIIACGGILPLLSAATSPT---TELENIEVTQGMSA 1417

Human  1429 ETAVTFLSRLMAMVDVLVFASSLNFSEIEAEKNMSSGGLMRQCLRLVCCVAVRNCLECRQRQRDR 1493
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1418 ETAVTFLSRLMAMVDVLVFASSLNFSEIEAEKNMSSGGLMRQCLRLVCCVAVRNCLECRQRQRDR 1482

Human  1494 GNKSSHGSSKPQEVPQSVTATAASKTPLENVPGNLSPIKDPDRLLQDVDINRLRAVVFRDVDDSK 1558
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1483 GNKSSHGSSKPQEAPQSVTATAASKTPLENVPGNLSPIKDPDRLLQDVDINRLRAVVFRDVDDSK 1547

Human  1559 QAQFLALAVVYFISVLMVSKYRDILEPQRETTRTGSQPGRNIRQEINSPTSTVVVIPSIPHPSLN 1623
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1548 QAQFLALAVVYFISVLMVSKYRDILEPQRETARTGSQPGRNIRQEINSPTSTVVVIPSIPHPSLN 1612

Human  1624 HGFLAKLIPEQSFGHSFYKETPAAFPDTIKEKETPTPGEDIQVESSIPHTDSGIGEEQVASILNG 1688
            ||.||||:|||||.|||||||||.||||||||||||||||||:|||:||||||:|||||||||:|
  Rat  1613 HGLLAKLMPEQSFAHSFYKETPATFPDTIKEKETPTPGEDIQLESSVPHTDSGMGEEQVASILDG 1677

Human  1689 AELETSTGPDAMSELLSTLSSEVKKSQESLTENPSETLKPATSISSISQTKGINVKEILKSLVAA 1753
            |||||:.|||||||||||||||||||||||||:|||.||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat  1678 AELETAAGPDAMSELLSTLSSEVKKSQESLTEHPSEMLKPAPSISSISQTKGINVKEILKSLVAA 1742

Human  1754 PVEIAECGPEPIPYPDPALKRETQAILPMQFHSFDRSVVVPVKKPPPGSLAVTTVGATTAGSGLP 1818
            ||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat  1743 PVEIAECGPEPIPYPDPALKREAHAILPMQFHSFDRSVVVPVKKPPPGSLAVTTVGATAAGSGLP 1807

Human  1819 TGSTSNIFAATGATPKSMINTTGAVDSGSSSSSSSSSFVNGATSKNLPAVQTVAPMPEDSAENMS 1883
            |||||:||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1808 TGSTSSIFAAPGATPKSMINTTGAVDSGSSSSSSSSSFVNGATSKNLPAVQTVAPMPEDSAENMS 1872

Human  1884 ITAKLERALEKVAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGSHGQELLIEGLVCMKSSTSVVELVMLLCSQEW 1948
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1873 ITAKLERALEKVAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGSHGQELLIEGLVCMKSSTSVVELVMLLCSQEW 1937

Human  1949 QNSIQKNAGLAFIELINEGRLLCHAMKDHIVRVANEAEFILNRQRAEDVHKHAEFESQCAQYAAD 2013
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1938 QNSIQKNAGLAFIELINEGRLLCHAMKDHIVRVANEAEFILNRQRAEDVHKHAEFESQCAQYAAD 2002

Human  2014 RREEEKMCDHLISAAKHRDHVTANQLKQKILNILTNKHGAWGAVSHSQLHDFWRLDYWEDDLRRR 2078
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2003 RREEEKMCDHLISAAKHRDHVTANQLKQKILNILTNKHGAWGAVSHSQLHDFWRLDYWEDDLRRR 2067

Human  2079 RRFVRNAFGSTHAEALLKAAIEYGTEEDVVKSKKTFRSQAIVNQNAETELMLEGDDDAVSLLQEK 2143
            ||||||||||||||||||:|:|||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat  2068 RRFVRNAFGSTHAEALLKSAVEYGTEEDVVKSKKAFRSQAIVNQNSETELMLEGDDDAVSLLQEK 2132

Human  2144 EIDNLAGPVVLSTPAQLIAPVVVAKGTLSITTTEIYFEVDEDDSAFKKIDTKVLAYTEGLHGKWM 2208
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat  2133 EIDNLAGPVVLSTPAQLIAPVVVAKGTLSITTTEIYFEVDEDDAAFKKIDTKVLAYTEGLHGKWM 2197

Human  2209 FSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTSVMFNFPDQATVKKVVYSLPRVGVGTSYGLPQARRISL 2273
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2198 FSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTSVMFNFPDQATVKKVVYSLPRVGVGTSYGLPQARRISL 2262

Human  2274 ATPRQLYKSSNMTQRWQRREISNFEYLMFLNTIAGRTYNDLNQYPVFPWVLTNYESEELDLTLPG 2338
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2263 ATPRQLYKSSNMTQRWQRREISNFEYLMFLNTIAGRTYNDLNQYPVFPWVLTNYESEELDLTLPG 2327

Human  2339 NFRDLSKPIGALNPKRAVFYAERYETWEDDQSPPYHYNTHYSTATSTLSWLVRIEPFTTFFLNAN 2403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat  2328 NFRDLSKPIGALNPKRAVFYAERYETWEDDQSPPYHYNTHYSTATSALSWLVRIEPFTTFFLNAN 2392

Human  2404 DGKFDHPDRTFSSVARSWRTSQRDTSDVKELIPEFYYLPEMFVNSNGYNLGVREDEVVVNDVDLP 2468
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||
  Rat  2393 DGKFDHPDRTFSSIARSWRTSQRDTSDVKELIPEFYYLPEMFVNSNGYHLGVREDEVLVNDVDLP 2457

Human  2469 PWAKKPEDFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQRGPEAVRALNVFHYLTYEGSVNLDSIT 2533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat  2458 PWAKKPEDFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQRGPEAVRALNVFHYLTYEGSVNLDSIS 2522

Human  2534 DPVLREIPEAYFIRDPHTFLLTKDFIKAMEAQIQNFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMHLCFLPQSPL 2598
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2523 DPVLREIPEAYFIRDPHTFLLTKDSIKAMEAQIQNFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMHLCFLPQSPL 2587

Human  2599 MFKDQMQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTLPHLTIPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTVGLRGAPGYS 2663
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2588 MFKDQMQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTLPHLTIPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTVGLRGAPGYS 2652

Human  2664 LDQAHHLPIEMDPLIANNSGVNKRQITDLVDQSIQINAHCFVVTADNRYILICGFWDKSFRVYST 2728
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2653 LDQAHHLPIEMDPLIANNSGVNKRQITDLVDQSIQINAHCFVVTADNRYILICGFWDKSFRVYST 2717

Human  2729 ETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVSGSRDATLLLWYWSGRHHIIGDNPNSSDYPAP 2793
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2718 ETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVSGSRDATLLLWYWSGRHHIIGDNPNSSDYPAP 2782

Human  2794 RAVLTGHDHEVVCVSVCAELGLVISGAKEGPCLVHTITGDLLRALEGPENCLFPRLISVSSEGHC 2858
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2783 RAVLTGHDHEVVCVSVCAELGLVISGAKEGPCLVHTITGDLLRALEGPENCLFPRLISVSSEGHC 2847

Human  2859 IIYYERGRFSNFSINGKLLAQMEINDSTRAILLSSDGQNLVTGGDNGVVEVWQACDFKQLYIYPG 2923
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2848 IIYYERGRFSNFSINGKLLAQMEINDSTRAILLSSDGQNLVTGGDNGVVEVWQACDFKQLYIYPG 2912

Human  2924 CDAGIRAMDLSHDQRTLITGMASGSIVAFNIDFNRWHYEHQNRY 2967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2913 CDAGIRAMDLSHDQRTLITGMASGSIVAFNIDFNRWHYEHQNRY 2956

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NBEANP_001371941.1 Laminin_G_3 255..402 CDD:463865 146/146 (100%)
DUF4704 467..947 CDD:464870 478/479 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 971..995 22/23 (96%)
WD 1. /evidence=ECO:0000305 1326..1368 41/41 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1490..1531 39/40 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1651..1675 21/23 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1711..1731 17/19 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1841..1860 18/18 (100%)
DUF1088 1966..2132 CDD:461925 161/165 (98%)
PH_BEACH 2158..2255 CDD:434260 95/96 (99%)
Beach 2287..2584 CDD:460459 290/296 (98%)
NBCH_WD40 2684..2956 CDD:466575 271/271 (100%)
WD 2. /evidence=ECO:0000305 2739..2782 42/42 (100%)
WD40 repeat 2745..2799 CDD:293791 53/53 (100%)
WD 3. /evidence=ECO:0000305 2799..2839 39/39 (100%)
WD40 repeat 2804..2839 CDD:293791 34/34 (100%)
WD40 repeat 2844..2873 CDD:293791 28/28 (100%)
WD 4. /evidence=ECO:0000305 2881..2920 38/38 (100%)
WD40 repeat 2882..2920 CDD:293791 37/37 (100%)
WD 5. /evidence=ECO:0000305 2923..2962 38/38 (100%)
WD40 repeat 2928..2954 CDD:293791 25/25 (100%)
NbeaXP_038959903.1 Laminin_G_3 247..394 CDD:463865 146/146 (100%)
DUF4704 459..939 CDD:464870 478/479 (100%)
DUF1088 1955..2121 CDD:461925 161/165 (98%)
PH_BEACH 2147..2244 CDD:434260 95/96 (99%)
Beach 2276..2573 CDD:460459 290/296 (98%)
NBCH_WD40 2673..2945 CDD:466575 271/271 (100%)
WD40 repeat 2734..2788 CDD:293791 53/53 (100%)
WD40 repeat 2793..2828 CDD:293791 34/34 (100%)
WD40 repeat 2833..2862 CDD:293791 28/28 (100%)
WD40 repeat 2871..2909 CDD:293791 37/37 (100%)
WD40 repeat 2917..2943 CDD:293791 25/25 (100%)

Return to query results.
Submit another query.