DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NBEA and Nbea

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001371941.1 Gene:NBEA / 26960 HGNCID:7648 Length:2967 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_036019004.1 Gene:Nbea / 26422 MGIID:1347075 Length:2968 Species:Mus musculus


Alignment Length:2978 Identity:2889/2978 - (97%)
Similarity:2929/2978 - (98%) Gaps:21/2978 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASEKPGPGPGLEPQPVGLIAVGAAGGGGGGSGGGGTGGSGMGELRGASGSGSVMLPAGMINPSV 65
            |||:|  ||||||||||.|:||||    |||:||||    .|||.|||:|||.|:||||||||||
Mouse     1 MASDK--PGPGLEPQPVALLAVGA----GGGAGGGG----AMGEPRGAAGSGPVVLPAGMINPSV 55

Human    66 PIRNIRMKFAVLIGLIQVGEVSNRDIVETVLNLLVGGEFDLEMNFIIQDAESITCMTELLEHCDV 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    56 PIRNIRMKFAVLIGLIQVGEVSNRDIVETVLNLLVGGEFDLEMNFIIQDAESITCMTELLEHCDV 120

Human   131 TCQAEIWSMFTAILRKSVRNLQTSTEVGLIEQVLLKMSAVDDMIADLLVDMLGVLASYSITVKEL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   121 TCQAEIWSMFTAILRKSVRNLQTSTEVGLIEQVLLKMSAVDDMIADLLVDMLGVLASYSITVKEL 185

Human   196 KLLFSMLRGESGIWPRHAVKLLSVLNQMPQRHGPDTFFNFPGCSAAAIALPPIAKWPYQNGFTLN 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   186 KLLFSMLRGESGIWPRHAVKLLSVLNQMPQRHGPDTFFNFPGCSAAAIALPPIAKWPYQNGFTLN 250

Human   261 TWFRMDPLNNINVDKDKPYLYCFRTSKGVGYSAHFVGNCLIVTSLKSKGKGFQHCVKYDFQPRKW 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   251 TWFRMDPLNNINVDKDKPYLYCFRTSKGVGYSAHFVGNCLIVTSLKSKGKGFQHCVKYDFQPRKW 315

Human   326 YMISIVHIYNRWRNSEIRCYVNGQLVSYGDMAWHVNTNDSYDKCFLGSSETADANRVFCGQLGAV 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   316 YMISIVHIYNRWRNSEIRCYVNGQLVSYGDMAWHVNTNDSYDKCFLGSSETADANRVFCGQLGAV 380

Human   391 YVFSEALNPAQIFAIHQLGPGYKSTFKFKSESDIHLAEHHKQVLYDGKLASSIAFTYNAKATDAQ 455
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
Mouse   381 YVFSEALNPAQIFAVHQLGPGYKSTFKFKSESDIHLAEHHKQVLYDGKLASSIAFSYNAKATDAQ 445

Human   456 LCLESSPKENASIFVHSPHALMLQDVKAIVTHSIHSAIHSIGGIQVLFPLFAQLDNRQLNDSQVE 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   446 LCLESSPKENASIFVHSPHALMLQDVKAIVTHSIHSAIHSIGGIQVLFPLFAQLDNRQLNDSQVE 510

Human   521 TTVCATLLAFLVELLKSSVAMQEQMLGGKGFLVIGYLLEKSSRVHITRAVLEQFLSFAKYLDGLS 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   511 TTVCATLLAFLVELLKSSVAMQEQMLGGKGFLVIGYLLEKSSRVHITRAVLEQFLSFAKYLDGLS 575

Human   586 HGAPLLKQLCDHILFNPAIWIHTPAKVQLSLYTYLSAEFIGTATIYTTIRRVGTVLQLMHTLKYY 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   576 HGAPLLKQLCDHILFNPAIWIHTPAKVQLSLYTYLSAEFIGTATIYTTIRRVGTVLQLMHTLKYY 640

Human   651 YWVINPADSSGITPKGLDGPRPSQKEIISLRAFMLLFLKQLILKDRGVKEDELQSILNYLLTMHE 715
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   641 YWVINPADSSGIAPKGLDGPRPSQKEIISLRAFMLLFLKQLILKDRGVKEDELQSILNYLLTMHE 705

Human   716 DENIHDVLQLLVALMSEHPASMIPAFDQRNGIRVIYKLLASKSESIWVQALKVLGYFLKHLGHKR 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   706 DENIHDVLQLLVALMSEHPASMIPAFDQRNGIRVIYKLLASKSESIWVQALKVLGYFLKHLGHKR 770

Human   781 KVEIMHTHSLFTLLGERLMLHTNTVTVTTYNTLYEILTEQVCTQVVHKPHPEPDSTVKIQNPMIL 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   771 KVEIMHTHSLFTLLGERLMLHTNTVTVTTYNTLYEILTEQVCTQVVHKPHPEPDSTVKIQNPMIL 835

Human   846 KVVATLLKNSTPSAELMEVRRLFLSDMIKLFSNSRENRRCLLQCSVWQDWMFSLGYINPKNSEEQ 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
Mouse   836 KVVATLLKNSTPSAELMEVRRLFLSDMIKLFSNSRENRRCLLQCSVWQDWMFSLGYINPKSSEEQ 900

Human   911 KITEMVYNIFRILLYHAIKYEWGGWRVWVDTLSIAHSKVTYEAHKEYLAKMYEEYQRQEEENIKK 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   901 KITEMVYNIFRILLYHAIKYEWGGWRVWVDTLSIAHSKVTYEAHKEYLAKMYEEYQRQEEENIKK 965

Human   976 GKKGNVSTISGLSSQTTGAKGGMEIREIEDLSQSQSPESETDYPVSTDTRDLLMSTKVSDDILGN 1040
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
Mouse   966 GKKGNVSTISGLSSQTAGAKGGMEIREIEDLSQSQSPESETDYPVSTDTRDLLMSTKVSDDILGS 1030

Human  1041 SDRPGSGVHVEVHDLLVDIKAEKVEATEVKLDDMDLSPETLVGGENGALVEVESLLDNVYSAAVE 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1031 SDRPGSGVHVEVHDLLVDIKAEKVEATEVKLDDMDLSPETLVGGENGALVEVESLLDNVYSAAVE 1095

Human  1106 KLQNNVHGSVGIIKKNEEKDNGPLITLADEKEDLPNSSTSFLFDKIPKQEEKLLPELSSNHIIPN 1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||:|||||||||||||||||
Mouse  1096 KLQNNVHGSVGIIKKNEEKDNGPLITLADEKEELPNSSTPFLFDKIPRQEEKLLPELSSNHIIPN 1160

Human  1171 IQDTQVHLGVSDDLGLLAHMTGSVDLTCTSSIIEEKEFKIHTTSDGMSSISERDLASSTKGLEYA 1235
            |||||||||||||||||||||.||:|||||||:|||:|:|||||||:||:|||:||||||||:||
Mouse  1161 IQDTQVHLGVSDDLGLLAHMTASVELTCTSSIMEEKDFRIHTTSDGVSSVSERELASSTKGLDYA 1225

Human  1236 EMTATTLETESSSSKIVPNIDAGSIISDTERSDDGKESGKEIRKIQTTTTTQAVQGRSITQQDRD 1300
            ||||||||||||:||.|||:||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||
Mouse  1226 EMTATTLETESSNSKAVPNVDAGSIISDTERSDDGKESGKEIRKIQTTATTQAVQGRSSTQQDRD 1290

Human  1301 LRVDLGFRGMPMTEEQRRQFSPGPRTTMFRIPEFKWSPMHQRLLTDLLFALETDVHVWRSHSTKS 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1291 LRVDLGFRGMPMTEEQRRQFSPGPRTTMFRIPEFKWSPMHQRLLTDLLFALETDVHVWRSHSTKS 1355

Human  1366 VMDFVNSNENIIFVHNTIHLISQMVDNIIIACGGILPLLSAATSPTGSKTELENIEVTQGMSAET 1430
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1356 VMDFVNSNENIIFVHNTIHLISQMVDNIIIACGGILPLLSAATSPTGSKTELENIEVTQGMSAET 1420

Human  1431 AVTFLSRLMAMVDVLVFASSLNFSEIEAEKNMSSGGLMRQCLRLVCCVAVRNCLECRQRQRDRGN 1495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
Mouse  1421 AVTFLSRLMAMVDVLVFASSLNFSEIEAEKNMSSGGLMRQCLRLVCCVAVRNCLECRQRQRDRGS 1485

Human  1496 KSSHGSSKPQEVPQSVTATAASKTPLENVPGNLSPIKDPDRLLQDVDINRLRAVVFRDVDDSKQA 1560
            |||||||||||.|.||||.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1486 KSSHGSSKPQEAPHSVTAASASKTPLENVPGNLSPIKDPDRLLQDVDINRLRAVVFRDVDDSKQA 1550

Human  1561 QFLALAVVYFISVLMVSKYRDILEPQRETTRTGSQPGRNIRQEINSPTSTVVVIPSIPHPSLNHG 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1551 QFLALAVVYFISVLMVSKYRDILEPQRETARTGSQPGRNIRQEINSPTSTVVVIPSIPHPSLNHG 1615

Human  1626 FLAKLIPEQSFGHSFYKETPAAFPDTIKEKETPTPGEDIQVESSIPHTDSGIGEEQVASILNGAE 1690
            .||||:|||||.|||||||||.||||:|||||||||||||:|||:||||||:|||||||||:|||
Mouse  1616 LLAKLMPEQSFAHSFYKETPATFPDTVKEKETPTPGEDIQLESSVPHTDSGMGEEQVASILDGAE 1680

Human  1691 LETSTGPDAMSELLSTLSSEVKKSQESLTENPSETLKPATSISSISQTKGINVKEILKSLVAAPV 1755
            ||.:.|||||||||||||||||||||||||:|||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Mouse  1681 LEPAAGPDAMSELLSTLSSEVKKSQESLTEHPSEMLKPAPSISSISQTKGINVKEILKSLVAAPV 1745

Human  1756 EIAECGPEPIPYPDPALKRETQAILPMQFHSFDRSVVVPVKKPPPGSLAVTTVGATTAGSGLPTG 1820
            ||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Mouse  1746 EIAECGPEPIPYPDPALKREAHAILPMQFHSFDRSVVVPVKKPPPGSLAVTTVGATAAGSGLPTG 1810

Human  1821 STSNIFAATGATPKSMINTTGAVDSGSSSSSSSSSFVNGATSKNLPAVQTVAPMPEDSAENMSIT 1885
            |||:||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1811 STSSIFAAPGATPKSMINTTGAVDSGSSSSSSSSSFVNGATSKNLPAVQTVAPMPEDSAENMSIT 1875

Human  1886 AKLERALEKVAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGSHGQELLIEGLVCMKSSTSVVELVMLLCSQEWQN 1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1876 AKLERALEKVAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGSHGQELLIEGLVCMKSSTSVVELVMLLCSQEWQN 1940

Human  1951 SIQKNAGLAFIELINEGRLLCHAMKDHIVRVANEAEFILNRQRAEDVHKHAEFESQCAQYAADRR 2015
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1941 SIQKNAGLAFIELINEGRLLCHAMKDHIVRVANEAEFILNRQRAEDVHKHAEFESQCAQYAADRR 2005

Human  2016 EEEKMCDHLISAAKHRDHVTANQLKQKILNILTNKHGAWGAVSHSQLHDFWRLDYWEDDLRRRRR 2080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2006 EEEKMCDHLISAAKHRDHVTANQLKQKILNILTNKHGAWGAVSHSQLHDFWRLDYWEDDLRRRRR 2070

Human  2081 FVRNAFGSTHAEALLKAAIEYGTEEDVVKSKKTFRSQAIVNQNAETELMLEGDDDAVSLLQEKEI 2145
            ||||||||||||||||:|:|||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||||||
Mouse  2071 FVRNAFGSTHAEALLKSAVEYGTEEDVVKSKKAFRSQAIVNQNSETELMLEGDDDAVSLLQEKEI 2135

Human  2146 DNLA-----------GPVVLSTPAQLIAPVVVAKGTLSITTTEIYFEVDEDDSAFKKIDTKVLAY 2199
            ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
Mouse  2136 DNLAVSFLPKLFISRGPVVLSTPAQLIAPVVVAKGTLSITTTEIYFEVDEDDAAFKKIDTKVLAY 2200

Human  2200 TEGLHGKWMFSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTSVMFNFPDQATVKKVVYSLPRVGVGTSYG 2264
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2201 TEGLHGKWMFSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTSVMFNFPDQATVKKVVYSLPRVGVGTSYG 2265

Human  2265 LPQARRISLATPRQLYKSSNMTQRWQRREISNFEYLMFLNTIAGRTYNDLNQYPVFPWVLTNYES 2329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2266 LPQARRISLATPRQLYKSSNMTQRWQRREISNFEYLMFLNTIAGRTYNDLNQYPVFPWVLTNYES 2330

Human  2330 EELDLTLPGNFRDLSKPIGALNPKRAVFYAERYETWEDDQSPPYHYNTHYSTATSTLSWLVRIEP 2394
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||.|||||||||
Mouse  2331 EELDLTLPGNFRDLSKPIGALNPKRAVFYAERYETWEEDQSPPFHYNTHYSTATSALSWLVRIEP 2395

Human  2395 FTTFFLNANDGKFDHPDRTFSSVARSWRTSQRDTSDVKELIPEFYYLPEMFVNSNGYNLGVREDE 2459
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
Mouse  2396 FTTFFLNANDGKFDHPDRTFSSIARSWRTSQRDTSDVKELIPEFYYLPEMFVNSNGYHLGVREDE 2460

Human  2460 VVVNDVDLPPWAKKPEDFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQRGPEAVRALNVFHYLTYE 2524
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2461 VVVNDVDLPPWAKKPEDFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIFGYKQRGPEAVRALNVFHYLTYE 2525

Human  2525 GSVNLDSITDPVLREIPEAYFIRDPHTFLLTKDFIKAMEAQIQNFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMH 2589
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2526 GSVNLDSITDPVLREIPEAYFIRDPHTFLLTKDFIKAMEAQIQNFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMH 2590

Human  2590 LCFLPQSPLMFKDQMQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTLPHLTIPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTV 2654
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2591 LCFLPQSPLMFKDQMQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTLPHLTIPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTV 2655

Human  2655 GLRGAPGYSLDQAHHLPIEMDPLIANNSGVNKRQITDLVDQSIQINAHCFVVTADNRYILICGFW 2719
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2656 GLRGAPGYSLDQAHHLPIEMDPLIANNSGVNKRQITDLVDQSIQINAHCFVVTADNRYILICGFW 2720

Human  2720 DKSFRVYSTETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVSGSRDATLLLWYWSGRHHIIGDN 2784
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2721 DKSFRVYSTETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVSGSRDATLLLWYWSGRHHIIGDN 2785

Human  2785 PNSSDYPAPRAVLTGHDHEVVCVSVCAELGLVISGAKEGPCLVHTITGDLLRALEGPENCLFPRL 2849
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2786 PNSSDYPAPRAVLTGHDHEVVCVSVCAELGLVISGAKEGPCLVHTITGDLLRALEGPENCLFPRL 2850

Human  2850 ISVSSEGHCIIYYERGRFSNFSINGKLLAQMEINDSTRAILLSSDGQNLVTGGDNGVVEVWQACD 2914
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2851 ISVSSEGHCIIYYERGRFSNFSINGKLLAQMEINDSTRAILLSSDGQNLVTGGDNGVVEVWQACD 2915

Human  2915 FKQLYIYPGCDAGIRAMDLSHDQRTLITGMASGSIVAFNIDFNRWHYEHQNRY 2967
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2916 FKQLYIYPGCDAGIRAMDLSHDQRTLITGMASGSIVAFNIDFNRWHYEHQNRY 2968

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NBEANP_001371941.1 Laminin_G_3 255..402 CDD:463865 146/146 (100%)
DUF4704 467..947 CDD:464870 477/479 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 971..995 22/23 (96%)
WD 1. /evidence=ECO:0000305 1326..1368 41/41 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1490..1531 35/40 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1651..1675 20/23 (87%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1711..1731 17/19 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1841..1860 18/18 (100%)
DUF1088 1966..2132 CDD:461925 161/165 (98%)
PH_BEACH 2158..2255 CDD:434260 95/96 (99%)
Beach 2287..2584 CDD:460459 291/296 (98%)
NBCH_WD40 2684..2956 CDD:466575 271/271 (100%)
WD 2. /evidence=ECO:0000305 2739..2782 42/42 (100%)
WD40 repeat 2745..2799 CDD:293791 53/53 (100%)
WD 3. /evidence=ECO:0000305 2799..2839 39/39 (100%)
WD40 repeat 2804..2839 CDD:293791 34/34 (100%)
WD40 repeat 2844..2873 CDD:293791 28/28 (100%)
WD 4. /evidence=ECO:0000305 2881..2920 38/38 (100%)
WD40 repeat 2882..2920 CDD:293791 37/37 (100%)
WD 5. /evidence=ECO:0000305 2923..2962 38/38 (100%)
WD40 repeat 2928..2954 CDD:293791 25/25 (100%)
NbeaXP_036019004.1 Laminin_G_3 245..392 CDD:463865 146/146 (100%)
DUF4704 457..937 CDD:464870 477/479 (100%)
DUF1088 1956..2122 CDD:461925 161/165 (98%)
PH_BEACH 2159..2256 CDD:434260 95/96 (99%)
Beach 2288..2585 CDD:460459 291/296 (98%)
NBCH_WD40 2685..2957 CDD:466575 271/271 (100%)
WD40 repeat 2746..2800 CDD:293791 53/53 (100%)
WD40 repeat 2805..2840 CDD:293791 34/34 (100%)
WD40 repeat 2845..2874 CDD:293791 28/28 (100%)
WD40 repeat 2883..2921 CDD:293791 37/37 (100%)
WD40 repeat 2929..2955 CDD:293791 25/25 (100%)

Return to query results.
Submit another query.