DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NBEA and nbea

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001371941.1 Gene:NBEA / 26960 HGNCID:7648 Length:2967 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012813375.1 Gene:nbea / 100490814 XenbaseID:XB-GENE-951576 Length:2918 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:3000 Identity:2677/3000 - (89%)
Similarity:2772/3000 - (92%) Gaps:115/3000 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASEKPGPGPGLEPQPVGLIAVGAAGGGGGGSGGGGTGGSGMGELRGASGSGSVMLPAGMINPSV 65
            ||:|||            |:.||.......|             :..|.||||::||.|:|||||
 Frog     1 MATEKP------------LVGVGCPDRDAPG-------------VSSAGGSGSMVLPGGVINPSV 40

Human    66 PIRNIRMKFAVLIGLIQVGEVSNRDIVETVLNL-------------------------LVGGEFD 105
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||                         |||||||
 Frog    41 PIRNMRMKFAVLIGLIQVGEVSNRDIVETVLNLVGGAPILWKAERRQLSECNTSTQNKLVGGEFD 105

Human   106 LEMNFIIQDAESITCMTELLEHCDVTCQAEIWSMFTAILRKSVRNLQTSTEVGLIEQVLLKMSAV 170
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|
 Frog   106 LEMNFIIQDAESITCMSELLEHCDVTCQAEIWSMFTAILRKSVRNLQTSTEVGLIEQVLLKMPSV 170

Human   171 DDMIADLLVDMLGVLASYSITVKELKLLFSMLRGESGIWPRHAVKLLSVLNQMPQRHGPDTFFNF 235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   171 DDMIADLLVDMLGVLASYSITVKELKLLFSMLRGENGIWPRHAVKLLSVLNQMPQRHGPDTFFNF 235

Human   236 PGCSAAAIALPPIAKWPYQNGFTLNTWFRMDPLNNINVDKDKPYLYCFRTSKGVGYSAHFVGNCL 300
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   236 PGRSAAAIALPPIAKWPYQNGFTLNTWFRMDPLNNINVDKDKPYLYCFRTSKGVGYSAHFVGNCL 300

Human   301 IVTSLKSKGKGFQHCVKYDFQPRKWYMISIVHIYNRWRNSEIRCYVNGQLVSYGDMAWHVNTNDS 365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   301 IVTSLKSKGKGFQHCVKYDFQPRKWYMISIVHIYNRWRNSEIRCYVNGQLVSYGDMAWHVNTNDS 365

Human   366 YDKCFLGSSETADANRVFCGQLGAVYVFSEALNPAQIFAIHQLGPGYKSTFKFKSESDIHLAEHH 430
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   366 YDKCFLGSSETADANRVFCGQLGAVYVFIEALNPAQIFAIHQLGPGYKSTFKFKSESDIHLAEHH 430

Human   431 KQVLYDGKLASSIAFTYNAKATDAQLCLESSPKENASIFVHSPHALMLQDVKAIVTHSIHSAIHS 495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   431 KQVLYDGKLASSIAFTYNAKATDAQLCLESSPKENASIFVHSPHALMLQDVKAIVTHSIHSAIHS 495

Human   496 IGGIQVLFPLFAQLDNRQLNDSQVETTVCATLLAFLVELLKSSVAMQEQMLGGKGFLVIGYLLEK 560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   496 IGGIQVLFPLFAQLDNRQLNDSQVETTVCATLLAFLVELLKSSVAMQEQMLGGKGFLVIGYLLEK 560

Human   561 SSRVHITRAVLEQFLSFAKYLDGLSHGAPLLKQLCDHILFNPAIWIHTPAKVQLSLYTYLSAEFI 625
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   561 SSRIHITRAVLEQFLSFAKYLDGLSHGAPLLKQLCDHILFNPAIWIHTPAKVQLSLYTYLSAEFI 625

Human   626 GTATIYTTIRRVGTVLQLMHTLKYYYWVINPADSSGITPKGLDGPRPSQKEIISLRAFMLLFLKQ 690
            ||||||||||||||||||||||||||||:||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||
 Frog   626 GTATIYTTIRRVGTVLQLMHTLKYYYWVVNPTDSSGINPKGLDGSRPSQKEIISLRAFMLLFLKQ 690

Human   691 LILKDRGVKEDELQSILNYLLTMHEDENIHDVLQLLVALMSEHPASMIPAFDQRNGIRVIYKLLA 755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   691 LILKDRGVKEDELQSILNYLLTMHEDENIHDVLQLLVALMSEHPASMIPAFDQRNGIRVIYKLLA 755

Human   756 SKSESIWVQALKVLGYFLKHLGHKRKVEIMHTHSLFTLLGERLMLHTNTVTVTTYNTLYEILTEQ 820
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
 Frog   756 SKSESIRVQALKVLGYFLKHLGHKRKVEIMHTHSLFTLLGERLMLHTNTLTVTTYNTLYEILTEQ 820

Human   821 VCTQVVHKPHPEPDSTVKIQNPMILKVVATLLKNSTPSAELMEVRRLFLSDMIKLFSNSRENRRC 885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
 Frog   821 VCTQVVHKPHPEPDSTVKIQNPMILKVVATLLKNSTPSSELMEVRRLFLSDMIKLFSNSRENRRC 885

Human   886 LLQCSVWQDWMFSLGYINPKNSEEQKITEMVYNIFRILLYHAIKYEWGGWRVWVDTLSIAHSKVT 950
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   886 LLQCSVWQDWMFSLGYINPKSSEEQKITEMVYNIFRILLYHAIKYEWGGWRVWVDTLSIAHSKVT 950

Human   951 YEAHKEYLAKMYEEYQRQEEENIKKGKKGNVSTISGLSSQTTGAKGGMEIREIEDLSQSQSPESE 1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||....|||:|:|||||||||||||||
 Frog   951 YEAHKEYLAKMYEEYQRQEEENIKKGKKGNVSTISGLSSQAAAVKGGLELREIEDLSQSQSPESE 1015

Human  1016 TDYPVSTDTRDLLMSTKVSDDILGNSDRPGSGVHVEVHDLLVDIKAEKVEATEVKLDDMDLSPET 1080
            |||||:.||||||::||:|||.|..||||..||.||||||||||||||||||||||||:||||||
 Frog  1016 TDYPVNADTRDLLIATKISDDSLATSDRPSGGVRVEVHDLLVDIKAEKVEATEVKLDDLDLSPET 1080

Human  1081 LVGGENGALVEVESLLDNVYSAAVEKLQNNVHGSVGIIKKNEEKDNGPLITLADEKEDLPNSSTS 1145
            |||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||:.|||| |||||||||||....::||
 Frog  1081 LVGRENGALVEVESLLDNVYSAAVEKLQNNVHDSVGIIKETEEKD-GPLITLADEKEQTTPNNTS 1144

Human  1146 FLFDKIPKQEEKLLPEL-SSNHI-IPNIQDTQVHLGVSDDLGLLAHMTGSVDLTCTSSIIEEKEF 1208
            |||||:...::|||||| ||||| :.|:||..|||||:|||||||||||||||||...:|.:|:|
 Frog  1145 FLFDKMTNSDDKLLPELSSSNHITLANVQDAHVHLGVNDDLGLLAHMTGSVDLTCAPGVIGDKDF 1209

Human  1209 KIHTTSDGMSSISERDLASSTKGLEYAEMTATTLETESSSSKIVPNIDAGSIISDTERSDDGKES 1273
            |||||:|.:|||::|:||||:|||:|.:|||||||.|::|..|| |:||||.:|||||||||:|.
 Frog  1210 KIHTTADSLSSITDRELASSSKGLDYHQMTATTLEPETASKSIV-NMDAGSTVSDTERSDDGREL 1273

Human  1274 GKEIRKIQTT-TTTQAVQGRSITQQDRDLRVDLGFRGMPMTEEQRRQFSPGPRTTMFRIPEFKWS 1337
            ||||:||||| |||||||||.:.|.:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1274 GKEIKKIQTTATTTQAVQGRPLNQHERDLRVDLGFRGMPMTEEQRRQFSPGPRTTMFRIPEFKWS 1338

Human  1338 PMHQRLLTDLLFALETDVHVWRSHSTKSVMDFVNSNENIIFVHNTIHLISQMVDNIIIACGGILP 1402
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1339 PMHQRLLTDLLFALETDVHVWRSHSTKSVMDFVNSNENIIFVHNTIHLISQMVDNIIIACGGILP 1403

Human  1403 LLSAATSPTGSK-----TELENIEVTQGMSAETAVTFLSRLMAMVDVLVFASSLNFSEIEAEKNM 1462
            ||||||||||||     |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1404 LLSAATSPTGSKVSITDTELENIEVTQGMSSETAVTFLSRLMAMVDVLVFASSLNFSEIEAEKNM 1468

Human  1463 SSGGLMRQCLRLVCCVAVRNCLECRQRQRDRGNKSSHGSSKPQEVPQSVTATAASKTPLENVPGN 1527
            |||||||||||||||||||||||||||||:||:|.|.||||.|:..|.||:||::|||:::||||
 Frog  1469 SSGGLMRQCLRLVCCVAVRNCLECRQRQRERGSKPSLGSSKVQDSLQGVTSTASTKTPVDSVPGN 1533

Human  1528 LSPIKDPDRLLQDVDINRLRAVVFRDVDDSKQAQFLALAVVYFISVLMVSKYRDILEPQRETTRT 1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:
 Frog  1534 LSPIKDPDRLLQDVDINRLRAVVFRDVDDSKQAQFLALAVVYFISVLMVSKYRDILEPQRETARS 1598

Human  1593 GSQPGRNIRQEINSPTSTVVVIPSIPHPSLNHGFLAKLIPEQSFGHSFYKETPAAFPDTIKEKET 1657
            .||..|||||||||||||                                :|||.||| :|||||
 Frog  1599 ASQAARNIRQEINSPTST--------------------------------DTPALFPD-LKEKET 1630

Human  1658 PTPGEDIQVESSIPHTDSGIGEEQVASILNGAELETSTGPDAMSELLSTLSSEVKKSQESLTENP 1722
            |||.|::.:||||||||||||||.::|||||.:|:....||.|.||:|||||:||||||||||:|
 Frog  1631 PTPTEELHLESSIPHTDSGIGEEHISSILNGTDLDACMSPDVMGELISTLSSDVKKSQESLTESP 1695

Human  1723 SETLKPATSISSISQTKGINVKEILKSLVAAPVEIAECGPEPIPYPDPALKRETQAILPMQFHSF 1787
            ||.||||.|||||||:||||||||||||||||.||||.||:|:||||||||||.|||||||||||
 Frog  1696 SELLKPAQSISSISQSKGINVKEILKSLVAAPFEIAETGPDPVPYPDPALKREAQAILPMQFHSF 1760

Human  1788 DRSVVVPVKKPPPGSLAVTTVGATTAGSGLPTGSTSNIFAATGATPKSMINTTGAVDSGSSSSSS 1852
            ||||||||||||||||||.|||| .:|.|:...:|.||||||||||||||||||||||.||||||
 Frog  1761 DRSVVVPVKKPPPGSLAVNTVGA-ASGGGVTPSTTPNIFAATGATPKSMINTTGAVDSASSSSSS 1824

Human  1853 SSSFVNGATSKNLPAVQTVAPMPEDSAENMSITAKLERALEKVAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGS 1917
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1825 SSSFVNGATSKNLPAVQTVAPMPEDSAENMSITAKLERALEKVAPLLREIFVDFAPFLSRTLLGS 1889

Human  1918 HGQELLIEGLVCMKSSTSVVELVMLLCSQEWQNSIQKNAGLAFIELINEGRLLCHAMKDHIVRVA 1982
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1890 HGQELLIEGLVCMKSSTSVVELVMLLCSQEWQNSIQKNAGLAFIELINEGRLLCHAMKDHIVRVA 1954

Human  1983 NEAEFILNRQRAEDVHKHAEFESQCAQYAADRREEEKMCDHLISAAKHRDHVTANQLKQKILNIL 2047
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
 Frog  1955 NEAEFILNRQRAEDVHKHAEFESQCAQYAADRREEEKMCDHLISAAKHRDHVTANQLKQKIVNIL 2019

Human  2048 TNKHGAWGAVSHSQLHDFWRLDYWEDDLRRRRRFVRNAFGSTHAEALLKAAIEYGTEEDVVKSKK 2112
            |||||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||:||.||:||||||||||:||||
 Frog  2020 TNKHGAWGAISQSQLHDFWRLDYWEDDLRRRRRFVRNAFGSTHSEARLKSAIEYGTEEDVMKSKK 2084

Human  2113 TFRSQAIVNQNAETELMLEGDDDAVSLLQEKEIDNLAGPVVLSTPAQLIAPVVVAKGTLSITTTE 2177
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
 Frog  2085 TFRSQAAVNQNAETELMLEGDDDAVSLLQEKEIDNLAGPVVLSTPAQLIAPVIVAKGTLSITTTE 2149

Human  2178 IYFEVDEDDSAFKKIDTKVLAYTEGLHGKWMFSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTSVMFNFP 2242
            |||||||:|..|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2150 IYFEVDEEDPTFKKIDPKVLGYTEGLHGKWMFSEIRAVFSRRYLLQNTALEVFMANRTSVMFNFP 2214

Human  2243 DQATVKKVVYSLPRVGVGTSYGLPQARRISLATPRQLYKSSNMTQRWQRREISNFEYLMFLNTIA 2307
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2215 DQATVKKVVYSLPRVGVGTSYGLPQARRISLATPRQLFKSSNMTQRWQRREISNFEYLMFLNTIA 2279

Human  2308 GRTYNDLNQYPVFPWVLTNYESEELDLTLPGNFRDLSKPIGALNPKRAVFYAERYETWEDDQSPP 2372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
 Frog  2280 GRTYNDLNQYPVFPWVLTNYESEELDLTLPGNFRDLSKPIGALNPKRAVFYAERYETWEDDQTPP 2344

Human  2373 YHYNTHYSTATSTLSWLVRIEPFTTFFLNANDGKFDHPDRTFSSVARSWRTSQRDTSDVKELIPE 2437
            |||||||||:..||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||||||||
 Frog  2345 YHYNTHYSTSLFTLCWLVRIEPFTTFFLNANDSKFDHSDRTFSSVARSWRNSQRDTSDVKELIPE 2409

Human  2438 FYYLPEMFVNSNGYNLGVREDEVVVNDVDLPPWAKKPEDFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIF 2502
            |||||||||||||||.|||:|.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2410 FYYLPEMFVNSNGYNFGVRDDSVVVNDVDLPPWAKNPEDFVRINRMALESEFVSCQLHQWIDLIF 2474

Human  2503 GYKQRGPEAVRALNVFHYLTYEGSVNLDSITDPVLREIPEAYFIRDPHTFLLTKDFIKAMEAQIQ 2567
            ||||||||||||||||||.||||||||||:|||||||                     ||||||.
 Frog  2475 GYKQRGPEAVRALNVFHYHTYEGSVNLDSVTDPVLRE---------------------AMEAQIH 2518

Human  2568 NFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMHLCFLPQSPLMFKDQMQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTLPHLT 2632
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2519 NFGQTPSQLLIEPHPPRSSAMHLCFLPQSPLMFKDQMQQDVIMVLKFPSNSPVTHVAANTLPHLT 2583

Human  2633 IPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTVGLRGAPGYSLDQAHHLPIEMDPLIANNSGVNKRQITDLVDQSI 2697
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
 Frog  2584 IPAVVTVTCSRLFAVNRWHNTVGLRGAPGYSLDQAHHLPIEMDSLIANNSGVNKRQITDLVDQSI 2648

Human  2698 QINAHCFVVTADNRYILICGFWDKSFRVYSTETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVS 2762
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2649 QINAHCFVVTADNRYILVCGFWDKSFRVYSTETGKLTQIVFGHWDVVTCLARSESYIGGDCYIVS 2713

Human  2763 GSRDATLLLWYWSGRHHIIGDNPNSSDYPAPRAVLTGHDHEVVCVSVCAELGLVISGAKEGPCLV 2827
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2714 GSRDATLLLWYWSGRHHIIGDNPNNSDYPAPRAVLTGHDHEVVCVSVCAELGLVISGAKEGPCLV 2778

Human  2828 HTITGDLLRALEGPENCLFPRLISVSSEGHCIIYYERGRFSNFSINGKLLAQMEINDSTRAILLS 2892
            ||||||||||||||:.||:|||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||
 Frog  2779 HTITGDLLRALEGPDLCLYPRLISVSSEGHCIIYYERGRFCNFSINGKLLGQMEINDSTRAILLS 2843

Human  2893 SDGQNLVTGGDNGVVEVWQACDFKQLYIYPGCDAGIRAMDLSHDQRTLITGMASGSIVAFNIDFN 2957
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2844 SDGQNLVTGGDNGVVEVWQACDFKQLYIYPGCDAGIRAMDLSHDQRTLITGMASGSIVAFNIDFN 2908

Human  2958 RWHYEHQNRY 2967
            ||||||||||
 Frog  2909 RWHYEHQNRY 2918

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NBEANP_001371941.1 Laminin_G_3 255..402 CDD:463865 145/146 (99%)
DUF4704 467..947 CDD:464870 470/479 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 971..995 20/23 (87%)
WD 1. /evidence=ECO:0000305 1326..1368 41/41 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1490..1531 25/40 (63%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1651..1675 16/23 (70%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1711..1731 17/19 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1841..1860 17/18 (94%)
DUF1088 1966..2132 CDD:461925 157/165 (95%)
PH_BEACH 2158..2255 CDD:434260 90/96 (94%)
Beach 2287..2584 CDD:460459 260/296 (88%)
NBCH_WD40 2684..2956 CDD:466575 264/271 (97%)
WD 2. /evidence=ECO:0000305 2739..2782 42/42 (100%)
WD40 repeat 2745..2799 CDD:293791 52/53 (98%)
WD 3. /evidence=ECO:0000305 2799..2839 39/39 (100%)
WD40 repeat 2804..2839 CDD:293791 34/34 (100%)
WD40 repeat 2844..2873 CDD:293791 26/28 (93%)
WD 4. /evidence=ECO:0000305 2881..2920 38/38 (100%)
WD40 repeat 2882..2920 CDD:293791 37/37 (100%)
WD 5. /evidence=ECO:0000305 2923..2962 38/38 (100%)
WD40 repeat 2928..2954 CDD:293791 25/25 (100%)
nbeaXP_012813375.1 Laminin_G_3 255..402 CDD:463865 145/146 (99%)
DUF4704 467..947 CDD:464870 470/479 (98%)
DUF1088 1938..2104 CDD:461925 157/165 (95%)
PH_BEACH 2130..2227 CDD:434260 90/96 (94%)
Beach 2258..2535 CDD:214982 261/297 (88%)
NBCH_WD40 2635..2907 CDD:466575 264/271 (97%)
WD40 repeat 2696..2750 CDD:293791 52/53 (98%)
WD40 repeat 2755..2790 CDD:293791 34/34 (100%)
WD40 repeat 2793..2824 CDD:293791 26/30 (87%)
WD40 repeat 2833..2871 CDD:293791 37/37 (100%)
WD40 repeat 2879..2905 CDD:293791 25/25 (100%)

Return to query results.
Submit another query.