DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment LATS2 and Lats2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_054230417.1 Gene:LATS2 / 26524 HGNCID:6515 Length:1090 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001100737.1 Gene:Lats2 / 305922 RGDID:1305906 Length:1042 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1095 Identity:904/1095 - (82%)
Similarity:943/1095 - (86%) Gaps:58/1095 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRPKTFPATTYSGNSRQRLQEIREGLKQPSKSSVQGLPAGPNSDT-SLDAKVLGSKDATRQQQQM 64
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||..|||||| ||||||||:|||:| ||||
  Rat     1 MRPKTFPATTYSGNSRQRLQEIREGLKQPAKSSTQGLLVGPNSDTSSLDAKVLGNKDASR-QQQM 64

Human    65 RATPKFGPYQKALREIRYSLLPFANESGTSAAAEVNRQMLQELVNAGCDQEMAGRALKQTGSRSI 129
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    65 RATPKFGPYQKALREIRYSLLPFANESGTSAAAEVNRQMLQELVNAGCDQEMAGRALKQTGSRSI 129

Human   130 EAALEYISKMGYLDPRNEQIVRVIKQTSPGKGLMPTPVTRRPSFEGTGDSFASYHQLSGTPYEGP 194
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|||||||||||::|.|:|||.|..||||
  Rat   130 EAALEYISKMGYLDPRNEQIVRVIKQTSPGKGLVPTAVTRRPSFEGTGEAFPSHHQLGGANYEGP 194

Human   195 SFGADGPTALEEMPRPYVDYLFPGVGPHGPGHQHQHPPKGYGASVEAAGAHFPLQGAHYGRPHLL 259
            :       |||||||.|:|:||||...|| ...||||||||..:|: ||.|||  ||||||.|||
  Rat   195 A-------ALEEMPRQYLDFLFPGASVHG-APAHQHPPKGYSTAVD-AGTHFP--GAHYGRAHLL 248

Human   260 VPGEPLGYGVQRSPSFQSKTPPETGGYASLPTKGQGGPPGAGLAFPPPAAGLYVPHPHHKQAG-- 322
              .|..||||||||||||||||:|  |:|| .|.||||| |.|.| |..||||.. .|||.|.  
  Rat   249 --SEQPGYGVQRSPSFQSKTPPDT--YSSL-AKAQGGPP-ASLTF-PAHAGLYTT-SHHKPAAAV 305

Human   323 PVAHQLHVLGSRSQVFASDSPPQSLLTPSRNSLNVDLYELSSTSVQQWPAATLARRDSLQKPGLE 387
            |.||.|||||:|...|..||..|::|.|||||||.|||||.|.  ..||||.|||||||||..||
  Rat   306 PGAHPLHVLGTRGPTFTGDSSTQAVLAPSRNSLNNDLYELGSP--VPWPAAPLARRDSLQKQSLE 368

Human   388 APPRAHVAFRPDCPVPSRTNSFNSHQPRPGPPGKAEPSLPAPNTVTAVTAAHILHPVKSVRVLRP 452
            | .|.|||||..   |||||||:|.||        ||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   369 A-SRPHVAFRAG---PSRTNSFSSPQP--------EPSLPAPNTVTAVTAAHILHPVKSVRVLRP 421

Human   453 EPQTAVGPSHPAWVPAPAPAPAPAPAPAPAAEGLDAKEEHALALGGAGAFPLDVEYGGPDRRCPP 517
            |||||||||||||||||.       ||| |||||::||      |.||..|||:::||.:|||||
  Rat   422 EPQTAVGPSHPAWVPAPT-------APA-AAEGLESKE------GSAGPPPLDMDFGGSERRCPP 472

Human   518 PPYPKHLLLRSKSEQYD--LDSLCAGMEQSLRAGPNEPEGGDKSRKSAKGDKGGKDKKQIQTSPV 580
            |||||||||.||||||.  ||.||.|:|||||.| .|.:..||..|.|||||.|:||||||||||
  Rat   473 PPYPKHLLLPSKSEQYSAGLDRLCTGVEQSLRGG-TEQDRNDKGHKGAKGDKAGRDKKQIQTSPV 536

Human   581 PVRKNSRDEEKRESRIKSYSPYAFKFFMEQHVENVIKTYQQKVNRRLQLEQEMAKAGLCEAEQEQ 645
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||.||||
  Rat   537 PVRKNSRDEEKRESRIKSYSPYAFKFFMEQHVENVIKTYQQKVSRRLQLEQEMAKAGLCETEQEQ 601

Human   646 MRKILYQKESNYNRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLACKVDTHALYAMKTLRKKDVLNRN 710
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   602 MRKILYQKESNYNRLKRAKMDKSMFVKIKTLGIGAFGEVCLACKVDTHALYAMKTLRKKDVLNRN 666

Human   711 QVAHVKAERDILAEADNEWVVKLYYSFQDKDSLYFVMDYIPGGDMMSLLIRMEVFPEHLARFYIA 775
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   667 QVAHVKAERDILAEADNEWVVKLYYSFQDKDSLYFVMDYIPGGDMMSLLIRMEVFPEHLARFYIA 731

Human   776 ELTLAIESVHKMGFIHRDIKPDNILIDLDGHIKLTDFGLCTGFRWTHNSKYYQKGSHVRQDSMEP 840
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|||||||
  Rat   732 ELTLAIESVHKMGFIHRDIKPDNILIDLDGHIKLTDFGLCTGFRWTHNSKYYQKGNHIRQDSMEP 796

Human   841 SDLWDDVSNCRCGDRLKTLEQRARKQHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRKGYTQLCDWWSVGVIL 905
            .||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   797 GDLWDDVSNCRCGDRLKTLEQRAQKQHQRCLAHSLVGTPNYIAPEVLLRKGYTQLCDWWSVGVIL 861

Human   906 FEMLVGQPPFLAPTPTETQLKVINWENTLHIPAQVKLSPEARDLITKLCCSADHRLGRNGADDLK 970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||:||.||||:||||||
  Rat   862 FEMLVGQPPFLAPTPTETQLKVINWENTLHIPTQVKLSAEARDLITKLCCAADCRLGRDGADDLK 926

Human   971 AHPFFSAIDFSSDIRKQPAPYVPTISHPMDTSNFDPVDEESPWNDASEGSTKAWDTLTSPNNKHP 1035
            ||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||::||..|.||||||.|||:|||
  Rat   927 AHPFFSTIDFSRDIRKQPAPYVPTISHPMDTSNFDPVDEESPWHEASGESAKAWDTLASPNSKHP 991

Human  1036 EHAFYEFTFRRFFDDNGYPFRCPKPSGAEASQAESSDLESSDLVDQTEGCQPVYV 1090
            ||||||||||||||||||||||||||    ..|||:|...::|....||||||||
  Rat   992 EHAFYEFTFRRFFDDNGYPFRCPKPS----EPAESADPGDAELGGAVEGCQPVYV 1042

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
LATS2XP_054230417.1 UBA_LATS2 101..141 CDD:270581 39/39 (100%)
PHA03247 <143..521 CDD:223021 251/379 (66%)
MobB_LATS2 587..669 CDD:439272 79/81 (98%)
STKc_LATS2 668..1048 CDD:173715 361/379 (95%)
Lats2NP_001100737.1 UBA_LATS2 101..141 CDD:270581 39/39 (100%)
PHA03247 <143..490 CDD:223021 264/393 (67%)
MobB_LATS2 543..625 CDD:439272 79/81 (98%)
Protein Kinases, catalytic domain 624..1004 CDD:473864 361/379 (95%)

Return to query results.
Submit another query.