DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CNNM4 and Cnnm4

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_005263971.1 Gene:CNNM4 / 26504 HGNCID:105 Length:796 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017451999.1 Gene:Cnnm4 / 363216 RGDID:1305571 Length:793 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:796 Identity:708/796 - (88%)
Similarity:736/796 - (92%) Gaps:3/796 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAPVGGGGRPVGGPARGRLLLAAPVLLVLLWALGARGQGSPQQGTIVGMRLASCNKSCGTNPDGI 65
            |||.|||||..|.||||||||||  ||:|||...|.||.||||..|:||||||||||||.|||||
  Rat     1 MAPGGGGGRRDGWPARGRLLLAA--LLLLLWTRAASGQSSPQQSVILGMRLASCNKSCGMNPDGI 63

Human    66 IFVSEGSTVNLRLYGYSLGNISSNLISFTEVDDAETLHKSTSCLELTKDLVVQQLVNVSRGNTSG 130
            |||||||||||||||:.||.||||||||||||||||:|.||:|||||||||||:|||||||||||
  Rat    64 IFVSEGSTVNLRLYGHRLGEISSNLISFTEVDDAETVHNSTNCLELTKDLVVQRLVNVSRGNTSG 128

Human   131 VLVVLTKFLRRSESMKLYALCTRAQPDGPWLKWTDKDSLLFMVEEPGRFLPLWLHILLITVLLVL 195
            :|||:||||||||:|||||||||.:.|||||||||||||||||||.||||||||||||:.|||||
  Rat   129 MLVVITKFLRRSENMKLYALCTRTRADGPWLKWTDKDSLLFMVEEHGRFLPLWLHILLVLVLLVL 193

Human   196 SGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSLTIL 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   194 SGIFSGLNLGLMALDPMELRIVQNCGTEKERRYARKIEPIRRKGNYLLCSLLLGNVLVNTSLTIL 258

Human   261 LDNLIGSGLMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGANTILLTKFFMLLTFPLSFPISKLLD 325
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||
  Rat   259 LDNLIGSGIMAVASSTIGIVIFGEILPQALCSRHGLAVGANTIVLTKIFMLLTFPLSFPISKLLD 323

Human   326 FFLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLQDCFMIRSDA 390
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   324 FVLGQEIRTVYNREKLMEMLKVTEPYNDLVKEELNMIQGALELRTKTVEDIMTQLHDCFMIRSDA 388

Human   391 ILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHD 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   389 ILDFNTMSEIMESGYTRIPVFEDEQSNIVDILYVKDLAFVDPDDCTPLKTITRFYNHPVHFVFHD 453

Human   456 TKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDMYTDNRS 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||:
  Rat   454 TKLDAMLEEFKKGKSHLAIVQKVNNEGEGDPFYEVLGLVTLEDVIEEIIKSEILDESDTYTDNRT 518

Human   521 RKRVSEKNKRDFSAFKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVSQFSPSLISEKILLRLLKYPDVI 585
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||:|||||||||||||||
  Rat   519 RKRVSMKNKRDFSAFKDADNELKVKISPQLLLAAHRFLATEVPQFSPSLMSEKILLRLLKYPDVI 583

Human   586 QELKFDEHNKYYARHYLYTRNKPADYFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALTSVPSV 650
            |||:||||||:..||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||:..|..
  Rat   584 QELRFDEHNKHCTRHYLYTRNKPADCFILILQGKVEVEAGKENMKFETGAFSYYGTMALSLAPPA 648

Human   651 PSVQVGCPPGKRNSLLCWLTDRSPAHPTPLSRSASLSYPDRTDVSTAATLAGSSNQFGSSVLGQY 715
            |.||.||..||.||||..|.|||||||||||||||||||||....|.::||| ||||||.:||||
  Rat   649 PPVQAGCSTGKLNSLLSRLADRSPAHPTPLSRSASLSYPDRNTDMTPSSLAG-SNQFGSCILGQY 712

Human   716 ISDFSVRALVDLQYIKITRQQYQNGLLASRMENSPQFPIDGCTTHMENLAEKSELPVVDETTTLL 780
            :||||||||.||||||:||||||||||||||:||||..:|||.|..|||:|:.||||||||||||
  Rat   713 VSDFSVRALTDLQYIKVTRQQYQNGLLASRMDNSPQLTLDGCATCTENLSERPELPVVDETTTLL 777

Human   781 NERNSLLHKASHENAI 796
            ||||.|||:||.|..|
  Rat   778 NERNLLLHRASQEGTI 793

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CNNM4XP_005263971.1 DUF21 196..358 CDD:279876 157/161 (98%)
CBS 373..500 CDD:223591 125/126 (99%)
CBS_pair_CorC_HlyC_assoc 382..502 CDD:239963 119/119 (100%)
Cnnm4XP_017451999.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83683570
Domainoid 1 1.000 452 1.000 Domainoid score I8932
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG1253
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H75662
Inparanoid 1 1.050 1363 1.000 Inparanoid score I3291
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG44109
OrthoDB 1 1.010 - - D1446644at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000343
OrthoInspector 1 1.000 - - oto129235
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100176
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR12064
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X235
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.