DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GBE1 and Gbe1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000149.4 Gene:GBE1 / 2632 HGNCID:4180 Length:702 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001093972.1 Gene:Gbe1 / 288333 RGDID:1309968 Length:702 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:702 Identity:639/702 - (91%)
Similarity:672/702 - (95%) Gaps:0/702 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAAPMTPAARPEDYEAALNAALADVPELARLLEIDPYLKPYAVDFQRRYKQFSQILKNIGENEGG 65
            ||||..|||..:..||.|.|||||||||.|||||||||||||.|||||||:|:|:|.:|||||||
  Rat     1 MAAPAAPAAEEKGSEAQLKAALADVPELGRLLEIDPYLKPYAADFQRRYKKFNQVLHDIGENEGG 65

Human    66 IDKFSRGYESFGVHRCADGGLYCKEWAPGAEGVFLTGDFNGWNPFSYPYKKLDYGKWELYIPPKQ 130
            ||||||||||||:|||:|||:||||||||||||||||:|:||||||:|||||:||||||||||||
  Rat    66 IDKFSRGYESFGIHRCSDGGIYCKEWAPGAEGVFLTGEFSGWNPFSHPYKKLEYGKWELYIPPKQ 130

Human   131 NKSVLVPHGSKLKVVITSKSGEILYRISPWAKYVVREGDNVNYDWIHWDPEHSYEFKHSRPKKPR 195
            |||..:|||||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||||:.|:|:||||||||
  Rat   131 NKSPPIPHGSKLKVVITSKSGEILYRISPWAKYVVRENNNVNYDWIHWDPENPYKFRHSRPKKPR 195

Human   196 SLRIYESHVGISSHEGKVASYKHFTCNVLPRIKGLGYNCIQLMAIMEHAYYASFGYQITSFFAAS 260
            |||||||||||||||||:|||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||:|||||||
  Rat   196 SLRIYESHVGISSHEGKIASYKHFTSNVLPRIKDLGYNCIQLMAIMEHAYYASFGYQVTSFFAAS 260

Human   261 SRYGTPEELQELVDTAHSMGIIVLLDVVHSHASKNSADGLNMFDGTDSCYFHSGPRGTHDLWDSR 325
            |||||||||:|||||||.|||:||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 SRYGTPEELKELVDTAHLMGIVVLLDVVHSHASKNSEDGLNMFDGTDSCYFHSGPRGTHDLWDSR 325

Human   326 LFAYSSWEILRFLLSNIRWWLEEYRFDGFRFDGVTSMLYHHHGVGQGFSGDYSEYFGLQVDEDAL 390
            ||.|||||:|||||||||||||||.||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
  Rat   326 LFIYSSWEVLRFLLSNIRWWLEEYCFDGFRFDGVTSMLYHHHGMGQGFSGDYSEYFGLQVDEDAL 390

Human   391 TYLMLANHLVHTLCPDSITIAEDVSGMPALCSPISQGGGGFDYRLAMAIPDKWIQLLKEFKDEDW 455
            .||||||||.||:.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 VYLMLANHLTHTMYPDSITIAEDVSGMPALCSPTSQGGGGFDYRLAMAIPDKWIQLLKEFKDEDW 455

Human   456 NMGDIVYTLTNRRYLEKCIAYAESHDQALVGDKSLAFWLMDAEMYTNMSVLTPFTPVIDRGIQLH 520
            |||:|||||||||:||||:||||||||||||||:|||||||||||||||||.|||||||||||||
  Rat   456 NMGNIVYTLTNRRHLEKCVAYAESHDQALVGDKTLAFWLMDAEMYTNMSVLAPFTPVIDRGIQLH 520

Human   521 KMIRLITHGLGGEGYLNFMGNEFGHPEWLDFPRKGNNESYHYARRQFHLTDDDLLRYKFLNNFDR 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat   521 KMIRLITHGLGGEGYLNFMGNEFGHPEWLDFPRKGNNESYHYARRQFNLTDDDLLRYKFLNNFDR 585

Human   586 DMNRLEERYGWLAAPQAYVSEKHEGNKIIAFERAGLLFIFNFHPSKSYTDYRVGTALPGKFKIVL 650
            |||||||..|||:||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   586 DMNRLEETCGWLSAPQAYVSEKHEGNKTITFERAGLLFIFNFHPSKSYTDYRVGTAMPGKFKIVL 650

Human   651 DSDAAEYGGHQRLDHSTDFFSEAFEHNGRPYSLLVYIPSRVALILQNVDLPN 702
            ||||||||||||||||||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 DSDAAEYGGHQRLDHSTDYFAEAFEHNGRPYSLLVYIPSRVALILQNVDLPN 702

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GBE1NP_000149.4 PLN02447 2..699 CDD:215246 633/696 (91%)
Gbe1NP_001093972.1 PLN02447 15..699 CDD:215246 627/683 (92%)

Return to query results.
Submit another query.