DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment INTS1 and ints1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011513562.1 Gene:INTS1 / 26173 HGNCID:24555 Length:2200 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_003198200.3 Gene:ints1 / 562131 ZFINID:ZDB-GENE-030131-6523 Length:2192 Species:Danio rerio


Alignment Length:2209 Identity:1624/2209 - (73%)
Similarity:1882/2209 - (85%) Gaps:30/2209 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MNRAKPTTVRRPSAAAKPSGHPPPGDFIALGSKGQANESKTASTLLKPAPSGLPSERKRDAAAAL 65
            |||.|||::|||| ..|||||||||||||||||.|::|.|....|||||.:|||.:|||:|:::|
Zfish     1 MNRPKPTSIRRPS-NTKPSGHPPPGDFIALGSKSQSSEPKANPALLKPASTGLPPDRKREASSSL 64

Human    66 SSASALTGLTKRPKLSSTPPLSALGRLAEAAVAEKRAISPSIKEPSVVPIEVLPTVLLDEIEAAE 130
            .|:|.|:.|:||||..:||| |||.||||.|..:||:||||||||||:||||.|.||||||||||
Zfish    65 PSSSGLSSLSKRPKHPNTPP-SALSRLAEVAAVDKRSISPSIKEPSVIPIEVSPAVLLDEIEAAE 128

Human   131 LEGNDDRIEGVLCGAVKQLKVTRAKPDSTLYLSLMYLAKIKPNIFATEGVIEALCSLLRRDASIN 195
            .|||||||||||||||||||:.|||||.|||||||:|||||||:|||||||||||||||||||||
Zfish   129 AEGNDDRIEGVLCGAVKQLKMNRAKPDMTLYLSLMFLAKIKPNVFATEGVIEALCSLLRRDASIN 193

Human   196 FKAKGNSLVSVLACNLLMAAYEEDENWPEIFVKVYIEDSLGERIWVDSPHCKTFVDNIQTAFNTR 260
            ||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|:
Zfish   194 FKAKGNNLVSVLACNLLMAAYEEDENWPEIFVKVYIEDSLGERIWVDSSHCKTFVDNIQTAFTTK 258

Human   261 MPPRSVLLQGEAGRVAGDLGAGSSPHPSLTEEEDSQTELLIAEEKLSPEQEGQLMPRYEELAESV 325
            |||:|:|||.|.||..|||.||:|||||..:|::.||||||||||||||.:||:|||||||||||
Zfish   259 MPPKSMLLQTETGRSGGDLSAGNSPHPSTPDEDEGQTELLIAEEKLSPEDDGQVMPRYEELAESV 323

Human   326 EEYVLDMLRDQLNRRQPIDNVSRNLLRLLTSTCGYKEVRLLAVQKLEMWLQNPKLTRPAQDLLMS 390
            ||||||:||||||||||:||||||||||||:|||||||||:|||:||||||||||||||||||||
Zfish   324 EEYVLDVLRDQLNRRQPMDNVSRNLLRLLTATCGYKEVRLMAVQRLEMWLQNPKLTRPAQDLLMS 388

Human   391 VCMNCNTHGSEDMDVISHLIKIRLKPKVLLNHFMLCIRELLSAHKDNLGTTIKLVIFNELSSARN 455
            :|||||||||:||:|||:||||||||||||||:|||:||||:||:|||||.:|.|||||||:|||
Zfish   389 LCMNCNTHGSDDMEVISNLIKIRLKPKVLLNHYMLCVRELLNAHRDNLGTMVKFVIFNELSNARN 453

Human   456 PNNMQVLYTALQHSSELAPKFLAMVFQDLLTNKDDYLRASRALLREIIKQTKHEINFQAFCLGLM 520
            |||||||:|.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
Zfish   454 PNNMQVLHTVLQHSPEQAPKFLAMVFQDLLTNKDDYLRASRALLREIIKQTKHEINFQSFCLGLM 518

Human   521 QERKEPQYLEMEFKERFVVHITDVLAVSMMLGITAQVKEAGIAWDKGEKRNLEVLRSFQNQIAAI 585
            |||||..|::||||||||:.:||:|.|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
Zfish   519 QERKEATYVDMEFKERFVIQVTDLLTVSMMLGITAQVKEAGIAWDKGEKKNLEVLRSFQNQIAAI 583

Human   586 QRDAVWWLHTVVPSISKLAPKDYVHCLHKVLFTEQPETYYKWDNWPPESDRNFFLRLCSEVPILE 650
            |||||||||:|||:|||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Zfish   584 QRDAVWWLHSVVPTISKVGPKDYVHCLHKVLFTEQPETYYKWDNWPPESDRNFFLRLCSEVPLLE 648

Human   651 DTLMRILVIGLSRELPLGPADAMELADHLVKRAAAVQADDVEVLKVGRTQLIDAVLNLCTYHHPE 715
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||.||:||:|||:|.|.||||||||||||||||
Zfish   649 DTLMRILVIGLSRDLPLGPADAMELADHLVKRAAGVQSDDLEVLRVERIQLIDAVLNLCTYHHPE 713

Human   716 NIQLPPGYQPPNLAISTLYWKAWPLLLVVAAFNPENIGLAAWEEYPTLKMLMEMVMTNNYSYPPC 780
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||:.||||||:.|||||||||||||||||||||
Zfish   714 NIQLPAGYQPPNLAISTLYWKAWLLLLVVAAFNPQKIGLAAWDGYPTLKMLMEMVMTNNYSYPPC 778

Human   781 TLTDEETRTEMLNRELQTAQREKQEILAFEGHLAAASTKQTITESSSLLLSQLTSLDPQGPPRRP 845
            |:.||||:|||:|||||.:|:|:|||||||.|||||||||||||::||||||||||||:||||||
Zfish   779 TVADEETKTEMINRELQISQKERQEILAFESHLAAASTKQTITENNSLLLSQLTSLDPKGPPRRP 843

Human   846 PPHILDQVKSLNQSLRLGHLLCRSRNPDFLLHIIQRQASSQSMPWLADLVQSSEGSLDVLPVQCL 910
            ||.:|||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   844 PPLVLDQVKSLNQSLRLGHLLCRSRSPDFLLNIIQRQASSQSMPWLADLVQSSEGSLDVLPVQCL 908

Human   911 CEFLLHDAVDDAASGEEDDEGESKEQKAKKRQRQQKQRQLLGRLQDLLLGPKADEQTTCEVLDYF 975
            ||||||||.|||:|.::::|||||||:|||||||||||||||||||||||.|||:||||||||||
Zfish   909 CEFLLHDAADDASSADDEEEGESKEQRAKKRQRQQKQRQLLGRLQDLLLGSKADKQTTCEVLDYF 973

Human   976 LRRLGSSQVASRVLAMKGLSLVLSEGSLRDGEEKEPPMEEDVGDTDVLQGYQWLLRDLPRLPLFD 1040
            ||||.||||||||||:|||||||:||.|:|||:::..||||..|.::|..|||||:|||:|||||
Zfish   974 LRRLSSSQVASRVLAIKGLSLVLTEGGLKDGEDRDHLMEEDSRDAELLPSYQWLLQDLPKLPLFD 1038

Human  1041 SVRSTTALALQQAIHMETDPQTISAYLIYLSQHTPVEEQAQHSDLALDVARLVVERSTIMSHLFS 1105
            |||..||.|||||||:|||||||||||||||||.|:|||:.|:|||||||||:|||||||:.|||
Zfish  1039 SVRGLTASALQQAIHVETDPQTISAYLIYLSQHAPIEEQSLHNDLALDVARLIVERSTIMNCLFS 1103

Human  1106 KLSPSAASDAVLSALLSIFSRYVRRMRQSKEGEEVYSWSESQDQVFLRWSSGETATMHILVVHAM 1170
            |.|....||||||||:||||.|:||||::||||::||||||||||||||::||||||||||||||
Zfish  1104 KHSCRPESDAVLSALISIFSNYIRRMRKTKEGEDLYSWSESQDQVFLRWTTGETATMHILVVHAM 1168

Human  1171 VILLTLGPPRADDSEFQALLDIWFPEEKPLPTAFLVDTSEEALLLPDWLKLRMIRSEVLRLVDAA 1235
            |||||||||:. :|||..|||||||::|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Zfish  1169 VILLTLGPPKG-ESEFYILLDIWFPDKKPLPTAFLVDTSEEALLLPDWLKLRMIRSEVSRLVDAA 1232

Human  1236 LQDLEPQQLLLFVQSFGIPVSSMSKLLQFLDQAVAHDPQTLEQNIMDKNYMAHLVEVQHERGASG 1300
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||||:|
Zfish  1233 LQDLEPQQLLLFVQSFGIPVSSMSKLLQYLDQAVSHDPQTLEQNIMDKNYMAHLVEVQHERGATG 1297

Human  1301 GQTFHSLLTASLPPRRDSTEAPKPKSSPEQPIGQGRIRVGTQLRVLGPEDDLAGMFLQIFPLSPD 1365
            |.|||:||:||||.||||:|..:.|.:.|.|.|..::|..:|:.|:||||||||:.||:|||..|
Zfish  1298 GHTFHTLLSASLPQRRDSSEVSRAKVTVETPHGSVKMRAVSQVPVIGPEDDLAGVLLQLFPLKVD 1362

Human  1366 PRWQSSSPRPVALALQQALGQELARVVQGSPEVPGITVRVLQALATLLSSPHGGALVMSMHRSHF 1430
            |.|.....||::|||||.|.||:.|..||..:..|...|:|||||.||:|.|.|||||:||.||.
Zfish  1363 PHWPPPPVRPLSLALQQTLAQEVLRARQGHIQPGGAAGRLLQALAALLNSGHAGALVMAMHHSHT 1427

Human  1431 LACPLLRQLCQYQRCVPQDTGFSSLFLKVLLQMLQWLDSPGVEGGPLRAQLRMLASQASAGRRLS 1495
            ::|||||||..|||.|.||.||||||...::|||.||::..|:.|||.:.|:.||:|.|...|::
Zfish  1428 ISCPLLRQLHLYQRSVSQDVGFSSLFFNAVVQMLTWLENSAVDTGPLHSLLKSLAAQYSHKHRIT 1492

Human  1496 DVRGGLLRLAEALAFRQDLEVVSSTVRAVIATLRSGEQCSVEPDLISKVLQGLIEVRSPHLEELL 1560
            |||.|.|.||||||:|:|.||   .||.:||:||:||:|:.||:||.||||||:||:||:|||||
Zfish  1493 DVRTGFLHLAEALAYRRDSEV---AVRGIIASLRAGEKCNAEPELIRKVLQGLMEVKSPYLEELL 1554

Human  1561 TAFFSATADAASPFPACKPVVVVSSLLLQEEEPLAGGKPGADGGSLEAVRLGPSSGLLVDWLEML 1625
            :...|...:..||.....||.:|.||||||.|. .|.|...|....|:.:.|..|||||||||:|
Zfish  1555 SLLMSIGTETGSPGSTAGPVAMVISLLLQETEE-RGVKVELDSKITESKKPGSCSGLLVDWLELL 1618

Human  1626 DPEVVSSCPDLQLRLLFSRRKGK--GQAQVPSFRPYLLTLFTHQSSWPTLHQCIRVLLGKSREQR 1688
            ||||.|.|.|||.:|||::.|.|  |.:..||:|||||.|.||||:|.||||||..||.|.||||
Zfish  1619 DPEVTSVCSDLQQKLLFAQNKAKSSGVSVAPSYRPYLLALLTHQSNWSTLHQCISSLLNKHREQR 1683

Human  1689 FDPSASLDFLWACIHVPRIWQGRDQRTPQKRREELVLRVQGPELISLVELILAEAETRSQDG--- 1750
            .||:::|||||||.|:|||||||||:|||||.|:.||::...||||||:|||:|:|...:|.   
Zfish  1684 LDPTSALDFLWACSHIPRIWQGRDQKTPQKRTEQFVLKLSSEELISLVDLILSESELSCRDSGSS 1748

Human  1751 ----DTAACSLIQARLPLLLSCCCGDDESVRKVTEHLSGCIQQWGDSVLGRRCRDLLLQLYLQRP 1811
                |..:|||:|:|||||.||...|.::|::|:|:|..|:::||||::.::|:.||||:||..|
Zfish  1749 KSALDPVSCSLLQSRLPLLHSCLHSDLDNVKRVSEYLISCVKKWGDSIMSKKCQTLLLQIYLHFP 1813

Human  1812 EL--RVPVPEVLLHSEGAASSSVCKLDGLIHRFITLLADTSDSRALENRGADASMACRKLAVAHP 1874
            |:  .:.:||..|..||||..|.||||.|:||.|||||||.||::.|||.:||::|||||||:||
Zfish  1814 EVIQHIRLPEATLSGEGAADGSTCKLDVLVHRLITLLADTGDSKSAENRVSDANLACRKLAVSHP 1878

Human  1875 LLLLRHLPMIAALLHGRTHLNFQEFRQQNHLSCFLHVLGLLELLQPHVFRSEHQGALWDCLLSFI 1939
            :||||||||||||||||.|||.||.||||||..|..||.:||||||.||.|:||.||.|||||||
Zfish  1879 VLLLRHLPMIAALLHGRIHLNLQEIRQQNHLGFFTDVLAVLELLQPLVFNSDHQRALQDCLLSFI 1943

Human  1940 RLLLNYRKSSRHLAAFINKFVQFIHKYITYNAPAAISFLQKHADPLHDLSFDNSDLVMLKSLLAG 2004
            ::|.|:|:|||  ...||||||||.||||::|.:|:.|||||:|.|..||.:|.|||.|||||||
Zfish  1944 KVLQNFRRSSR--LPIINKFVQFIQKYITHDAASAVPFLQKHSDVLQGLSTENPDLVQLKSLLAG 2006

Human  2005 LSLPSRDDRTDRGLDEEGEEESSAGSLPLVSVSLFTPLTAAEMAPYMKRLSRGQTVEGESGPASP 2069
            |:||.:...::...::...||||:||||||::|....||||:|...:|::|||:.:|        
Zfish  2007 LTLPVKCGSSESSAEDGDVEESSSGSLPLVNISASMSLTAADMTKCLKKISRGEAIE-------- 2063

Human  2070 TPDLLEVLSDIDEMSRRRPEILSFFSTNLQRLMSSAEECCRNLAFSLALRSMQNSPSIAAAFLPT 2134
              |:.|.|:::||.|:|.|||:.:|..:|||||||.||.|||:|||||||.:|||||:||.||||
Zfish  2064 --DVFEGLTEVDEKSKRNPEIIQYFVNDLQRLMSSPEEVCRNMAFSLALRCIQNSPSMAAEFLPT 2126

Human  2135 FMYCLGSQDFEVVQTALRNLPEYALLCQEHAAVLLHRAFLVGMYGQMDPSAQISEALRILHMEA 2198
            |||||||..|:|||||||:||||.|||||||.:|||:|||||:|||:|.|:.|:|::::|.|||
Zfish  2127 FMYCLGSGSFDVVQTALRSLPEYVLLCQEHADILLHKAFLVGIYGQIDTSSMIAESMKVLRMEA 2190

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
INTS1XP_011513562.1 DUF3677 350..430 CDD:463578 70/79 (89%)
ints1XP_003198200.3 None

Return to query results.
Submit another query.