DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment INTS1 and Ints1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011513562.1 Gene:INTS1 / 26173 HGNCID:24555 Length:2200 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063127802.1 Gene:Ints1 / 288514 RGDID:1308908 Length:2225 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2209 Identity:1983/2209 - (89%)
Similarity:2084/2209 - (94%) Gaps:20/2209 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MNRAKPTTVRRPSAAAKPSGHPPPGDFIALGSKGQANESKTASTLLKPAPSGLPSERKRDAAAAL 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|
  Rat    28 MNRAKPTTVRRPSAAAKPSGHPPPGDFIALGSKGQANESKTASTLLKPAPSGLPSERKRDASASL 92

Human    66 SSASALTGLTKRPKLSSTPPLSALGRLAEAAVAEKRAISPSIKEPSVVPIEVLPTVLLDEIEAAE 130
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    93 SGASGLTGLTKRPKLSSTPPLSALGRLAEAAVAEKRAISPSIKEPSVVPIEVLPTVLLDEIEAAE 157

Human   131 LEGNDDRIEGVLCGAVKQLKVTRAKPDSTLYLSLMYLAKIKPNIFATEGVIEALCSLLRRDASIN 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat   158 LEGNDDRIEGVLCGAVKQLKVTRAKPDSTLYLSLMYLAKIKPNIFATEGVIEALCSLLRRDASVN 222

Human   196 FKAKGNSLVSVLACNLLMAAYEEDENWPEIFVKVYIEDSLGERIWVDSPHCKTFVDNIQTAFNTR 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:
  Rat   223 FKAKGNSLVSVLACNLLMAAYEEDENWPEIFVKVYIEDSLGERIWVDSPHCRTFVDNIQTAFNTK 287

Human   261 MPPRSVLLQGEAGRVAGDLGAGSSPHPSLTEEEDSQTELLIAEEKLSPEQEGQLM--PRYEELAE 323
            |||:|||||||..|..|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||:||.|
  Rat   288 MPPKSVLLQGEGARSGGELGAGSSPHPSLTEEEDSQTELLIAEEKLSPEQEGQLMPRPRYDELTE 352

Human   324 SVEEYVLDMLRDQLNRRQPIDNVSRNLLRLLTSTCGYKEVRLLAVQKLEMWLQNPKLTRPAQDLL 388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat   353 SVEEYVLDMLRDQLNRRQPIDNVSRNLLRLLTATCGYKEVRLLAVQRLEMWLQNPKLTRPAQDLL 417

Human   389 MSVCMNCNTHGSEDMDVISHLIKIRLKPKVLLNHFMLCIRELLSAHKDNLGTTIKLVIFNELSSA 453
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||||||.|||||||:|
  Rat   418 MSVCMNCNSHGSEDMDVISHLIKIRLKPKVLLNHYMLCIRELLNAHKDNLGTTIKFVIFNELSNA 482

Human   454 RNPNNMQVLYTALQHSSELAPKFLAMVFQDLLTNKDDYLRASRALLREIIKQTKHEINFQAFCLG 518
            |||||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   483 RNPNNMQILYTVLQHSSELAPKFLAMVFQDLLTNKDDYLRASRALLREIIKQTKHEINFQAFCLG 547

Human   519 LMQERKEPQYLEMEFKERFVVHITDVLAVSMMLGITAQVKEAGIAWDKGEKRNLEVLRSFQNQIA 583
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||:||||||
  Rat   548 LMQERKEPQYLEMEFKERFVVHITDVLAVSMMLGITAQVKEAGVAWDKGEKRNLEVLRTFQNQIA 612

Human   584 AIQRDAVWWLHTVVPSISKLAPKDYVHCLHKVLFTEQPETYYKWDNWPPESDRNFFLRLCSEVPI 648
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   613 AIQRDAVWWLHTVVPSISKLAPKDYVHCLHKVLFTEQPETYYKWDNWPPESDRNFFLRLCSEVPI 677

Human   649 LEDTLMRILVIGLSRELPLGPADAMELADHLVKRAAAVQADDVEVLKVGRTQLIDAVLNLCTYHH 713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
  Rat   678 LEDTLMRILVIGLSRELPLGPADAMELADHLVKRAAAVQADDVEVLKVERIQLIDAVLNLCTYHH 742

Human   714 PENIQLPPGYQPPNLAISTLYWKAWPLLLVVAAFNPENIGLAAWEEYPTLKMLMEMVMTNNYSYP 778
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   743 PENIQLPPGYQPPNLAISTLYWKAWPLLLVVAAFNPENIGLAAWEEYPTLKMLMEMVMTNNYSYP 807

Human   779 PCTLTDEETRTEMLNRELQTAQREKQEILAFEGHLAAASTKQTITESSSLLLSQLTSLDPQGPPR 843
            |||||||||||||:|||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   808 PCTLTDEETRTEMINRELQISQREKQEILAFEGHLAAASTKQTITESSSLLLSQLTSLDPQGPPR 872

Human   844 RPPPHILDQVKSLNQSLRLGHLLCRSRNPDFLLHIIQRQASSQSMPWLADLVQSSEGSLDVLPVQ 908
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   873 RPPPHILDQVKALNQSLRLGHLLCRSRNPDFLLHIIQRQASSQSMPWLADLVQSSEGSLDVLPVQ 937

Human   909 CLCEFLLHDAVDDAASGEEDDEGESKEQKAKKRQRQQKQRQLLGRLQDLLLGPKADEQTTCEVLD 973
            ||||||||||.|..|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   938 CLCEFLLHDAADATASGEEDDEGESREQKAKKRQRQQKQRQLLGRLQDLLLGPKADEQTTCEVLD 1002

Human   974 YFLRRLGSSQVASRVLAMKGLSLVLSEGSLRDGEEKEPPMEEDVGDTDVLQGYQWLLRDLPRLPL 1038
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||:.|.||||||||||||||||
  Rat  1003 YFLRRLGSSQVASRVLAMKGLSLVLSEGGLRDKEEKEPPMEEDVGEADALQGYQWLLRDLPRLPL 1067

Human  1039 FDSVRSTTALALQQAIHMETDPQTISAYLIYLSQHTPVEEQAQHSDLALDVARLVVERSTIMSHL 1103
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||:||
  Rat  1068 FDSVRTTTALALQQAIHMETDPQTISAYLIYLSQHTPVEEQGPHSDLALDVARLVVERSTIMAHL 1132

Human  1104 FSKLSPSAASDAVLSALLSIFSRYVRRMRQSKEGEEVYSWSESQDQVFLRWSSGETATMHILVVH 1168
            |||.|.|.|||||||||||:|||||||||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat  1133 FSKPSCSTASDAVLSALLSVFSRYVRRMRKSKEGEEVYSWSESQDQVFLRWTSGETATMHILVVH 1197

Human  1169 AMVILLTLGPPRADDSEFQALLDIWFPEEKPLPTAFLVDTSEEALLLPDWLKLRMIRSEVLRLVD 1233
            ||||||||||||:.||||..||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
  Rat  1198 AMVILLTLGPPRSGDSEFSELLDIWFPEKKPLPTAFLVDTSEEALLLPDWLKLRMIRSEVPRLVD 1262

Human  1234 AALQDLEPQQLLLFVQSFGIPVSSMSKLLQFLDQAVAHDPQTLEQNIMDKNYMAHLVEVQHERGA 1298
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1263 AALQDLEPQQLLLFVQSFGIPVSSMSKLLQYLDQAVAQDPQTLEQNIMDKNYMAHLVEVQHERGA 1327

Human  1299 SGGQTFHSLLTASLPPRRDSTEAPKPKSSPEQPIGQGRIRVGTQLRVLGPEDDLAGMFLQIFPLS 1363
            ||||||||||||||||||||||||||:||||.|.||||.|.|||:.||||||||||:||||||||
  Rat  1328 SGGQTFHSLLTASLPPRRDSTEAPKPESSPEPPPGQGRTRAGTQVPVLGPEDDLAGIFLQIFPLS 1392

Human  1364 PDPRWQSSSPRPVALALQQALGQELARVVQGSPEVPGITVRVLQALATLLSSPHGGALVMSMHRS 1428
            ||||||||||||:|||||||||||||||.||:|||||||||:|||:||||||||||.|.::||.|
  Rat  1393 PDPRWQSSSPRPLALALQQALGQELARVRQGNPEVPGITVRLLQAMATLLSSPHGGTLALAMHHS 1457

Human  1429 HFLACPLLRQLCQYQRCVPQDTGFSSLFLKVLLQMLQWLDSPGVEGGPLRAQLRMLASQASAGRR 1493
            |||:|||:||||||||.|||||||||||||||:|:|||||||.||.|||:|||::.|::.||.||
  Rat  1458 HFLSCPLMRQLCQYQRAVPQDTGFSSLFLKVLMQILQWLDSPAVEDGPLQAQLKLFATRYSARRR 1522

Human  1494 LSDVRGGLLRLAEALAFRQDLEVVSSTVRAVIATLRSGEQCSVEPDLISKVLQGLIEVRSPHLEE 1558
            :||||.|||.|||||:|.:||||.:||.|||||||||||:|:|||:||||||:|||||||||.||
  Rat  1523 ISDVRSGLLHLAEALSFHRDLEVANSTARAVIATLRSGEKCTVEPELISKVLRGLIEVRSPHFEE 1587

Human  1559 LLTAFFSATADAASPFPACKPVVVVSSLLLQE-EEPLAGGKPGADGGSLEAVRLGPSSGLLVDWL 1622
            ||||.|||||:.. |.||..|:|||||||||| :|||......|:|.|.||:||||:||||||||
  Rat  1588 LLTALFSATAETC-PSPASGPIVVVSSLLLQERDEPLGPSTQDAEGASTEAMRLGPASGLLVDWL 1651

Human  1623 EMLDPEVVSSCPDLQLRLLFSRRKGKG--QAQVPSFRPYLLTLFTHQSSWPTLHQCIRVLLGKSR 1685
            |.||||||.||||||.:||||||||||  .|||.|||||||.|.|||:||.|||:|.||||.|||
  Rat  1652 ETLDPEVVCSCPDLQWKLLFSRRKGKGHISAQVLSFRPYLLALLTHQASWSTLHRCTRVLLSKSR 1716

Human  1686 EQRFDPSASLDFLWACIHVPRIWQGRDQRTPQKRREELVLRVQGPELISLVELILAEAETRSQDG 1750
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||:|||||||:|||||||||
  Rat  1717 EQRLDPSASLDFLWACIHVPRIWQGRDQRTPQKRREELVLHVQGPELLSLVELILSEAETRSQDG 1781

Human  1751 DTAACSLIQARLPLLLSCCCGDDESVRKVTEHLSGCIQQWGDSVLGRRCRDLLLQLYLQRPELRV 1815
            |:||.:|||.|||||||||..:|||:.||||||:.|||||||||||:|||||||||||||||:||
  Rat  1782 DSAARTLIQTRLPLLLSCCRSNDESIGKVTEHLTSCIQQWGDSVLGQRCRDLLLQLYLQRPEVRV 1846

Human  1816 PVPEVLLHSEGAASSSVCKLDGLIHRFITLLADTSDSRALENRGADASMACRKLAVAHPLLLLRH 1880
            |||||||.||||.|||:|||||||||||||||||||||:.|:|.|||:|||||||||||:|||||
  Rat  1847 PVPEVLLQSEGATSSSICKLDGLIHRFITLLADTSDSRSSESRVADANMACRKLAVAHPILLLRH 1911

Human  1881 LPMIAALLHGRTHLNFQEFRQQNHLSCFLHVLGLLELLQPHVFRSEHQGALWDCLLSFIRLLLNY 1945
            |||||||||||||||||||||||||:.:|||||:||||||.||:|||||||||||.|||||||||
  Rat  1912 LPMIAALLHGRTHLNFQEFRQQNHLAFYLHVLGILELLQPRVFQSEHQGALWDCLRSFIRLLLNY 1976

Human  1946 RKSSRHLAAFINKFVQFIHKYITYNAPAAISFLQKHADPLHDLSFDNSDLVMLKSLLAGLSLPSR 2010
            |||||.||.||:|||||||||:..:||||::||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1977 RKSSRQLAPFISKFVQFIHKYVACSAPAAVAFLQKHAEPLHDLSFDNSDLVMLKSLLAGLSLPSR 2041

Human  2011 DDRTDRGLDEEGE----EESSAGSLPLVSVSLFTPLTAAEMAPYMKRLSRGQTVEGESGPASPTP 2071
            |.|.|:|||||||    :|.||||||||||||.||||.|::||:||||||||.||          
  Rat  2042 DGRADQGLDEEGEGKRADERSAGSLPLVSVSLSTPLTVADVAPHMKRLSRGQAVE---------- 2096

Human  2072 DLLEVLSDIDEMSRRRPEILSFFSTNLQRLMSSAEECCRNLAFSLALRSMQNSPSIAAAFLPTFM 2136
            |:||.|||||||||||||:|.|||||||||||||||.||||||||||||:||:|||||.||||||
  Rat  2097 DVLETLSDIDEMSRRRPEVLGFFSTNLQRLMSSAEESCRNLAFSLALRSIQNNPSIAADFLPTFM 2161

Human  2137 YCLGSQDFEVVQTALRNLPEYALLCQEHAAVLLHRAFLVGMYGQMDPSAQISEALRILHMEAVM 2200
            |||||:|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||:|.||||||||:||||||||
  Rat  2162 YCLGSRDFEVVQTALRNLPEYTLLCQEHAAVLLHRAFLVGMYGQIDTSAQISEALKILHMEAVM 2225

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
INTS1XP_011513562.1 DUF3677 350..430 CDD:463578 75/79 (95%)
Ints1XP_063127802.1 None

Return to query results.
Submit another query.