DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment INTS1 and ints1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011513562.1 Gene:INTS1 / 26173 HGNCID:24555 Length:2200 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002942086.3 Gene:ints1 / 100380131 XenbaseID:XB-GENE-5888682 Length:2186 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:2200 Identity:1763/2200 - (80%)
Similarity:1973/2200 - (89%) Gaps:14/2200 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MNRAKPTTVRRPSAAAKPSGHPPPGDFIALGSKGQANESKTASTLLKPAPSGLPSERKRDAAAAL 65
            |||.|...|||||||||.|||||||||||||||||..:||.:|.|||||.|||.|||||:|...|
 Frog     1 MNRPKTAAVRRPSAAAKSSGHPPPGDFIALGSKGQNTDSKASSNLLKPAASGLSSERKREATTTL 65

Human    66 SSASALTGLTKRPKLSSTPPLSALGRLAEAAVAEKRAISPSIKEPSVVPIEVLPTVLLDEIEAAE 130
            :|.||||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||.|..|||:|:|:|
 Frog    66 ASTSALTGLTKRPKLSSTPPLSALGKLADAAVAEKRAISPSIKEPSVVPIEVPPASLLDDIDASE 130

Human   131 LEGNDDRIEGVLCGAVKQLKVTRAKPDSTLYLSLMYLAKIKPNIFATEGVIEALCSLLRRDASIN 195
            .:||||||||||||||||||:.|||||.|||||||||||:||||||||||||||||||||||:||
 Frog   131 SDGNDDRIEGVLCGAVKQLKMNRAKPDPTLYLSLMYLAKMKPNIFATEGVIEALCSLLRRDATIN 195

Human   196 FKAKGNSLVSVLACNLLMAAYEEDENWPEIFVKVYIEDSLGERIWVDSPHCKTFVDNIQTAFNTR 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|:
 Frog   196 FKAKGNSLVSVLACNLLMAAYEEDENWPEIFVKVYIEDSLGERIWVDSQHCKTFVDNIQTAFCTK 260

Human   261 MPPRSVLLQGEAGRVAGDLGAGSSPHPSLTEEEDSQTELLIAEEKLSPEQEGQLMPRYEELAESV 325
            |||:|::|..|.||.||||.||:|||||:.:|||||:||||||||||||.|||:||||:||||||
 Frog   261 MPPKSMVLHSETGRTAGDLSAGNSPHPSMPDEEDSQSELLIAEEKLSPEDEGQVMPRYDELAESV 325

Human   326 EEYVLDMLRDQLNRRQPIDNVSRNLLRLLTSTCGYKEVRLLAVQKLEMWLQNPKLTRPAQDLLMS 390
            |||.|||||||||||||:||||||||||||:||||||||::|||:|||||||||||||||:||||
 Frog   326 EEYALDMLRDQLNRRQPMDNVSRNLLRLLTATCGYKEVRMMAVQRLEMWLQNPKLTRPAQELLMS 390

Human   391 VCMNCNTHGSEDMDVISHLIKIRLKPKVLLNHFMLCIRELLSAHKDNLGTTIKLVIFNELSSARN 455
            |||||||||.|||:|||:||||||||||||||:||.:||||:||:|||||.:|.|||||||:|||
 Frog   391 VCMNCNTHGPEDMEVISNLIKIRLKPKVLLNHYMLSVRELLNAHRDNLGTLVKFVIFNELSNARN 455

Human   456 PNNMQVLYTALQHSSELAPKFLAMVFQDLLTNKDDYLRASRALLREIIKQTKHEINFQAFCLGLM 520
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   456 PNNMQVLYTVLQHSSELAPKFLAMVFQDLLTNKDDYLRASRALLREIIKQTKHEINFQAFCLGLM 520

Human   521 QERKEPQYLEMEFKERFVVHITDVLAVSMMLGITAQVKEAGIAWDKGEKRNLEVLRSFQNQIAAI 585
            |||||.||.:||||||||:||||:|||||||||||||||||:|||||||:|||||||||||||||
 Frog   521 QERKEAQYTDMEFKERFVIHITDLLAVSMMLGITAQVKEAGVAWDKGEKKNLEVLRSFQNQIAAI 585

Human   586 QRDAVWWLHTVVPSISKLAPKDYVHCLHKVLFTEQPETYYKWDNWPPESDRNFFLRLCSEVPILE 650
            |||||||||||||:|.||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
 Frog   586 QRDAVWWLHTVVPTICKLSPKDYVHCLHKVLFTEQPETYYKWDNWPPESDRNFFLRLCSEVPLLE 650

Human   651 DTLMRILVIGLSRELPLGPADAMELADHLVKRAAAVQADDVEVLKVGRTQLIDAVLNLCTYHHPE 715
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||:|||::.|.||:|||||||||||||
 Frog   651 DTLMRILVIGLSRDLPLGPADAMELADHLVKRAAAVQADDLEVLRIERIQLLDAVLNLCTYHHPE 715

Human   716 NIQLPPGYQPPNLAISTLYWKAWPLLLVVAAFNPENIGLAAWEEYPTLKMLMEMVMTNNYSYPPC 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:|||
 Frog   716 NIQLPPGYQPPNLAISTLYWKAWPLLLVVAAFNPENLGLAAWEEYPTLKMLMEMVMTNNYSFPPC 780

Human   781 TLTDEETRTEMLNRELQTAQREKQEILAFEGHLAAASTKQTITESSSLLLSQLTSLDPQGPPRRP 845
            |:|:||||||::|||||.:|||||||||||.||||||||||||||:|||||||||||||||||||
 Frog   781 TVTEEETRTEIINRELQISQREKQEILAFESHLAAASTKQTITESNSLLLSQLTSLDPQGPPRRP 845

Human   846 PPHILDQVKSLNQSLRLGHLLCRSRNPDFLLHIIQRQASSQSMPWLADLVQSSEGSLDVLPVQCL 910
            |||.::|||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   846 PPHAIEQVKSLNQSLRLGHLLCRSRNPDFLLNIIQRQASSQSMPWLADLVQSSEGSLDVLPVQCL 910

Human   911 CEFLLHDAVDDAASGEEDDEGESKEQKAKKRQRQQKQRQLLGRLQDLLLGPKADEQTTCEVLDYF 975
            ||||||||.|::.:||:::|.|||||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   911 CEFLLHDAADESGTGEDEEENESKEQRAKKQQRQQKQRQLLGRLQDLLLGPKADEQTTCEVLDYF 975

Human   976 LRRLGSSQVASRVLAMKGLSLVLSEGSLRDGEEKEPPMEEDVGDTDVLQGYQWLLRDLPRLPLFD 1040
            ||||.|.|||||||||||||:||||..|||.::|:..|:||.||::::|||||||||||.||||:
 Frog   976 LRRLSSPQVASRVLAMKGLSMVLSEKGLRDTDDKDQSMDEDSGDSELMQGYQWLLRDLPNLPLFE 1040

Human  1041 SVRSTTALALQQAIHMETDPQTISAYLIYLSQHTPVEEQAQHSDLALDVARLVVERSTIMSHLFS 1105
            ||:.|||:|||||||||||.|||||||:|||:|.|:|:||||:|||||||||:||||||||||||
 Frog  1041 SVKGTTAVALQQAIHMETDLQTISAYLVYLSEHAPIEDQAQHNDLALDVARLIVERSTIMSHLFS 1105

Human  1106 KLSPSAASDAVLSALLSIFSRYVRRMRQSKEGEEVYSWSESQDQVFLRWSSGETATMHILVVHAM 1170
            |||..:.|.|||:|||||||.:|||||:||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1106 KLSYCSESSAVLAALLSIFSCFVRRMRKSKEGDEVYSWSESQDQVFLRWSSGETATMHILVVHAM 1170

Human  1171 VILLTLGPPRADDSEFQALLDIWFPEEKPLPTAFLVDTSEEALLLPDWLKLRMIRSEVLRLVDAA 1235
            ||||||||||. :|:|.|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
 Frog  1171 VILLTLGPPRG-ESDFFALLDIWFPEKKPLPTAFLVDTSEEALLLPDWLKLRMIRSEVPRLVDAA 1234

Human  1236 LQDLEPQQLLLFVQSFGIPVSSMSKLLQFLDQAVAHDPQTLEQNIMDKNYMAHLVEVQHERGASG 1300
            |.||||||||||||||||||||||||||:|||||:.:||.|||||||||||||||||||||||:|
 Frog  1235 LHDLEPQQLLLFVQSFGIPVSSMSKLLQYLDQAVSQEPQALEQNIMDKNYMAHLVEVQHERGATG 1299

Human  1301 GQTFHSLLTASLPPRRDSTEAPKPKSSPEQPIGQGRIRVGTQLRVLGPEDDLAGMFLQIFPLSPD 1365
            |||||||||||:||||||||..|.|:|.|.|.||.|.|..||:.||||||||||||||:|||:||
 Frog  1300 GQTFHSLLTASIPPRRDSTELIKRKASTETPQGQVRARAVTQIPVLGPEDDLAGMFLQLFPLNPD 1364

Human  1366 PRWQSSSPRPVALALQQALGQELARVVQGSPEVPGITVRVLQALATLLSSPHGGALVMSMHRSHF 1430
            ||||:.:|||::|||||||||||||:.||:.::.||.||:|||:..||:|||.||||::|||:||
 Frog  1365 PRWQNFNPRPISLALQQALGQELARIRQGNTQLTGIAVRLLQAVGALLNSPHSGALVLAMHRNHF 1429

Human  1431 LACPLLRQLCQYQRCVPQDTGFSSLFLKVLLQMLQWLDSPGVEGGPLRAQLRMLASQASAGRRLS 1495
            :||||:|.|.||||.|||||.|||||.|||:||||||||||||.|||||||:..|:..|:..|:|
 Frog  1430 IACPLMRLLYQYQRSVPQDTAFSSLFFKVLMQMLQWLDSPGVEEGPLRAQLKSFAALYSSKHRIS 1494

Human  1496 DVRGGLLRLAEALAFRQDLEVVSSTVRAVIATLRSGEQCSVEPDLISKVLQGLIEVRSPHLEELL 1560
            |||.|.|.|||||||.::.:|::||:|.:|.||:||::|:|||:|||||||||||.:||:|||.|
 Frog  1495 DVRSGFLHLAEALAFCREPDVINSTIRTIITTLKSGDKCNVEPELISKVLQGLIEAKSPYLEEFL 1559

Human  1561 TAFFSATADAASPFPACKPVVVVSSLLLQEEEPLAGGKPGADGGSLEAVRLGPSSGLLVDWLEML 1625
            |...|.|.:..|.|.|..||.:||||||||.:. :..|.|.:..|.|..|..||||||:||||:|
 Frog  1560 TVLLSVTIETTSRFTATGPVALVSSLLLQERQE-SSIKKGNESCSSETARSYPSSGLLIDWLELL 1623

Human  1626 DPEVVSSCPDLQLRLLFSRRKGKGQAQVPSFRPYLLTLFTHQSSWPTLHQCIRVLLGKSREQRFD 1690
            ||||:||.||||.|||||..||....|.||||||||.|.||||:|.||||||.:||.|.||||||
 Frog  1624 DPEVISSFPDLQQRLLFSWNKGSSALQPPSFRPYLLALLTHQSNWTTLHQCIAILLSKQREQRFD 1688

Human  1691 PSASLDFLWACIHVPRIWQGRDQRTPQKRREELVLRVQGPELISLVELILAEAETRSQDGDTAAC 1755
            |||||||||||||:||||||||||||||||:|.|||::..||:.||:||::|||||.|..:..||
 Frog  1689 PSASLDFLWACIHIPRIWQGRDQRTPQKRRDEYVLRLKQSELLCLVDLIISEAETRGQGSEEIAC 1753

Human  1756 SLIQARLPLLLSCCCGDDESVRKVTEHLSGCIQQWGDSVLGRRCRDLLLQLYLQRPELRVPVPEV 1820
            .|||:|||||::.|.||.|:::||.|||..||:|||:|.||:.|||.|||||||.|||.:|||::
 Frog  1754 PLIQSRLPLLINSCQGDQENIKKVMEHLISCIKQWGNSSLGKHCRDFLLQLYLQLPELILPVPDI 1818

Human  1821 LLHSEGAASSSVCKLDGLIHRFITLLADTSDSRALENRGADASMACRKLAVAHPLLLLRHLPMIA 1885
            ||.||||..||.||:|.||||||||||||||.:  |:|.:||:||||||||||||||||||||||
 Frog  1819 LLTSEGATDSSTCKMDALIHRFITLLADTSDCK--ESRMSDANMACRKLAVAHPLLLLRHLPMIA 1881

Human  1886 ALLHGRTHLNFQEFRQQNHLSCFLHVLGLLELLQPHVFRSEHQGALWDCLLSFIRLLLNYRKSSR 1950
            ||||||.||||.||||||||:.|.||||:||||||.||.||.|.||||||:|||::|.||||.||
 Frog  1882 ALLHGRAHLNFHEFRQQNHLTFFTHVLGILELLQPQVFHSERQEALWDCLVSFIKVLQNYRKYSR 1946

Human  1951 HLAAFINKFVQFIHKYITYNAPAAISFLQKHADPLHDLSFDNSDLVMLKSLLAGLSLPSRDDRTD 2015
            .|||||:|||||||||||.:|.||:|||||::||||.||.:||||.||||||||||||||....:
 Frog  1947 QLAAFISKFVQFIHKYITCDAQAAVSFLQKNSDPLHGLSSENSDLSMLKSLLAGLSLPSRGGAQE 2011

Human  2016 RGLDEEGEEESSAGSLPLVSVSLFTPLTAAEMAPYMKRLSRGQTVEGESGPASPTPDLLEVLSDI 2080
            :..:||.:|||:.||||.||||:||||||||||||:||:||.::||          |:|:.||||
 Frog  2012 KTSEEEKDEESTTGSLPFVSVSMFTPLTAAEMAPYLKRISRSKSVE----------DILQALSDI 2066

Human  2081 DEMSRRRPEILSFFSTNLQRLMSSAEECCRNLAFSLALRSMQNSPSIAAAFLPTFMYCLGSQDFE 2145
            ||||:|||||||||:::.||||||.||.|||||||||||::|.:|||||.|||||||||||:|||
 Frog  2067 DEMSKRRPEILSFFASDFQRLMSSTEESCRNLAFSLALRTVQCNPSIAADFLPTFMYCLGSRDFE 2131

Human  2146 VVQTALRNLPEYALLCQEHAAVLLHRAFLVGMYGQMDPSAQISEALRILHMEAVM 2200
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||||::|||||::
 Frog  2132 VVQTALRNLPEYTLLCQEHAAVLLHRAFLVGMYGQMDTSPQISEALKVLHMEAMV 2186

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
INTS1XP_011513562.1 DUF3677 350..430 CDD:463578 68/79 (86%)
ints1XP_002942086.3 DUF3677 350..430 CDD:463578 68/79 (86%)

Return to query results.
Submit another query.