DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GARS1 and Gars1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_002038.2 Gene:GARS1 / 2617 HGNCID:4162 Length:739 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001258068.1 Gene:Gars1 / 297113 RGDID:1307856 Length:728 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:739 Identity:676/739 - (91%)
Similarity:705/739 - (95%) Gaps:11/739 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPSPRPVLLRGARAALLLLLPPRLLARPSLLLRRSLSAASCPPISLPAAASRSSMDGAGAEEVLA 65
            ||...|.|||..||| |||..||::|.|:  .:|.|||.:.|      |||.||||  .|||:||
  Rat     1 MPCLLPTLLRATRAA-LLLQSPRVVAAPA--SQRLLSAPAQP------AASPSSMD--SAEELLA 54

Human    66 PLRLAVRQQGDLVRKLKEDKAPQVDVDKAVAELKARKRVLEAKELALQPKDDIVDRAKMEDTLKR 130
            |||||||||||.|||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    55 PLRLAVRQQGDFVRKLKEDKAPQVDVDRAVAELKARKRVLEAKELALQPKDDIVDRAKMEDTLKR 119

Human   131 RFFYDQAFAIYGGVSGLYDFGPVGCALKNNIIQTWRQHFIQEEQILEIDCTMLTPEPVLKTSGHV 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   120 RFFYDQAFAIYGGVSGLYDFGPVGCALKNNIIQTWRQHFIQEEQILEIDCTMLTPEPVLKTSGHV 184

Human   196 DKFADFMVKDVKNGECFRADHLLKAHLQKLMSDKKCSVEKKSEMESVLAQLDNYGQQELADLFVN 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   185 DKFADFMVKDVKNGECFRADHLLKAHLQKLMSDKKCSAEKKSEMESVLAQLDNYGQQELADLFVN 249

Human   261 YNVKSPITGNDLSPPVSFNLMFKTFIGPGGNMPGYLRPETAQGIFLNFKRLLEFNQGKLPFAAAQ 325
            ||||||.|||||||||.|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   250 YNVKSPTTGNDLSPPVPFNLMFQTFIGPGGNMPGYLRPETAQGIFLNFKRLLEFNQGKLPFAAAQ 314

Human   326 IGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFVDPSEKDHPKFQNVADLHLYLYSAKAQVSGQSARKM 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.:||||:||||||||||:|||||||
  Rat   315 IGNSFRNEISPRSGLIRVREFTMAEIEHFVDPTEKDHPKFPSVADLYLYLYSAKAQVTGQSARKM 379

Human   391 RLGDAVEQGVINNTVLGYFIGRIYLYLTKVGISPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGW 455
            |||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   380 RLGDAVEQGVINNSVLGYFIGRIYLYLTKVGISPDKLRFRQHMENEMAHYACDCWDAESKTSYGW 444

Human   456 IEIVGCADRSCYDLSCHARATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPSKGAIGKAYKKDAKLVMEYLA 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||||||||||:|||.
  Rat   445 IEIVGCADRSCYDLSCHARATKVPLVAEKPLKEPKTVNVVQFEPNKGAVGKAYKKDAKLVLEYLG 509

Human   521 ICDECYITEMEMLLNEKGEFTIETEGKTFQLTKDMINVKRFQKTLYVEEVVPNVIEPSFGLGRIM 585
            .||||||||||:||:||||||||||||||||||||::||||||||:||||||:||||||||||||
  Rat   510 ACDECYITEMELLLSEKGEFTIETEGKTFQLTKDMVSVKRFQKTLHVEEVVPSVIEPSFGLGRIM 574

Human   586 YTVFEHTFHVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRHGVSHKVDDS 650
            ||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat   575 YTILEHTFHVREGDEQRTFFSFPAVVAPFKCSVLPLSQNQEFMPFVKELSEALTRNGVSHKVDDS 639

Human   651 SGSIGRRYARTDEIGVAFGVTIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEISELPSIVQDLANGNIT 715
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|:||||||||
  Rat   640 SGSIGRRYARTDEIGVAFGITIDFDTVNKTPHTATLRDRDSMRQIRAEVSELPSVVRDLANGNIT 704

Human   716 WADVEARYPLFEGQETGKKETIEE 739
            |||||||||||||||||||||:||
  Rat   705 WADVEARYPLFEGQETGKKETVEE 728

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GARS1NP_002038.2 PLN02734 61..724 CDD:178335 631/662 (95%)
Gars1NP_001258068.1 PLN02734 45..713 CDD:178335 635/669 (95%)

Return to query results.
Submit another query.