Protein Alignment ABCA12 and CG6052

DIOPT Version :10

• Sequence 1: XP_011509253.1
• Gene: ABCA12 / 26154
• HGNCID: 14637
• Length: 2598
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_649002.3
• Gene: CG6052 / 39971
• FlyBaseID: FBgn0036747
• Length: 1725
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1776
• Identity: 506/1776 - (28%)
• Similarity: 838/1776 - (47%)
• Gaps: 292/1776 - (16%)

Human   912 NTLSSLTVNISSCVLYDRIQAAKTIDEMEREAKRLYKSNELFGSVIFKLPSNRSWHRGYDSGNVF 976
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  Fly   112 NPINSAIVGATAIRL--RLLGTRAYDTALHMEQDMVLHNFLAG-VQFEDNENVNTN---DAG--- 167

Human   977 LPPVIKYTIRM--SLKTAQ-----TTRSLRTKIWAPGPHNSPSHNQI---------YGR-AFIYL 1024
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  Fly   168 YPLNLNYSLRFPSELRTMQGPIIDTWRTSRLFL---SYDTSGSRNRLDNDGGVPVGYIREGFLPI 229

Human  1025 QDSIERAIIELQTGRNSQEI-AVQVQAIPYPCFMKDNFLTSVSYSLPIVLMVAWVVFIAAFVKKL 1088
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  Fly   230 QHALTMSWLALASGVTDTGIPAIHLQRFPYRAYTYDQLLSGLRQLLPFVILLSFIYPASTVTKYV 294

Human  1089 VYEKDLRLHEYMKMMGVNSCSHFFAWLIES------VGFLLVTIVIL-----IIILKFGNILPKT 1142
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  Fly   295 TSEKELQLKEIMKLIGVHNWLHWVAWFVKSYIMLMLVVFLIMSLIMVKFYASVAVLTFSSWVP-- 357

Human  1143 NGFILFLYFSDYSFSVIAMSYLISVFFNNTNIAALIGSLIYIIAFFPFIVLVTVENELSYVLKVF 1207
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  Fly   358 --VLLFLH--TYVVTSVCLCFMLAVLFSKASTASAVAAIFWFLTYIPYSFGYYYYERLSLMSKLL 418

Human  1208 MSLL-SPTAFSYASQYIARYEEQGIGLQWENMYTSPVQDDTTSFGWLCCLILADSFIYFLIAWYV 1271
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  Fly   419 ISLIFSNSALGFGIHVIVMWEGTGEGITWRNMFHPVSTDDSLTLFYIIMTMSFGSIMFISICLYV 483

Human  1272 RNVFPGTYGMAAPWYFPILPSYWKERFGCAEVKPEKSNGLMFTNIMMQNTNPSASKTSPEYMFSS 1336
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  Fly   484 EQVFPGEYGVPRRWNFMCHKNYWRQYVPSLNIVPS------FQTILHGSAKAKSCRRARE----- 537

Human  1337 NIEPEPKDLTVGVALHGVTKIYGSKVAVDNLNLNFYEGHITSLLGPNGAGKTTTISMLTGLFGAS 1401
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  Fly   538 ----------VGIQLFNLQKNYGKLKAVKGISLKMHRNEITVLLGHNGAGKTTTINMITGIVKPT 592

Human  1402 AGTIFVYGKDIKTDLHTVRKNMGVCMQHDVLFSYLTTKEHLLLYGSIKVPHWTKKQLHEEVKRTL 1466
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  Fly   593 SGTAIVNGYDIRTHLAKARESLGICPQNNILFKEMSVRDHIIFFSKLKGIRGT-KAVENEVGKYM 656

Human  1467 KDTGLYSHRHKRVGTLSGGMKRKLSISIALIGGSRVVILDEPSTGVDPCSRRSIWDVISKNKTAR 1531
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  Fly   657 TMLKLQDKSYVAAKNLSGGMKRKLSLCCALCGNAKVVLCDEPSSGIDAAGRRSLWDLLQSEKDGR 721

Human  1532 TIILSTHHLDEAEVLSDRIAFLEQGGLRCCGSPFYLKEAFGDGYHLTLTKKKSPNLNANAVCDTM 1596
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  Fly   722 TILLTTHYMDEADVLGDRIAILSEGKLQCQGTSFYLKKRFGTGYLLVCIMQSG--------CDVG 778

Human  1597 AVTAMIQSHLPEAYLKEDIGGELVYVLPPFSTKVSGAYLSLLRALDNGMGDLNIGCYGISDTTVE 1661
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  Fly   779 AVTQLIRKYVPPIKPERVLGTELTYRLP---TEYSKKFAELLQDLDEKCAQLQLVGYGLSGATLE 840

Human  1662 EVFLNLTKESQKNSAMSLEHLTQKKIGNSNANGISTPDDLSVSSSNFTDRDDKILTRGERLDGFG 1726
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  Fly   841 DVFMAVN--------------TDKRV-QGGAEG--PPVDGSIDFKELV-FDSK--TREKR----- 880

Human  1727 LLLKKI----MAILIKRFHHTRRNWKGLIAQVILPIVFVTTAMGLGTLRNSSNS--YPEIQISPS 1785
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  Fly   881 -RIRRCFMFWQALFLKKFYTTTRNYWLLGIQLVLPI----AVMAL-TILNSRGGRIYYELPAMP- 938

Human  1786 LYGTSEQTAFYANYHPSTEALVSAMWDFPGIDNMCLNTSDLQCLNKDSLEKWNTSGEPITNFGVC 1850
                     ...|.:.|...::.        ||....||.|    .|:..|
  Fly   939 ---------ISINQYSSAYVVLE--------DNTTDKTSSL----ADAYSK-------------- 968

Human  1851 SCSENVQECPKFNYSPPHRRTYSSQVIYNLTGQ-RVENYLIS-TANEFVQKRYGGWSFGLPLTKD 1913
                             |...|:.:.....||. :.|:|::| ..|.  .:|.           |
  Fly   969 -----------------HLEHYARRCTLLRTGDLKFEDYILSHDVNH--SRRI-----------D 1003

Human  1914 LRFDITGVPANRTLAKVWYDPEGYHSLPAYLNSLNNFLLRVNMSKYDAARHGIIMYSHPYPGVQD 1978
            ..| :.|:..:.....||.:.:..|:.|..||.|:| .|.:.:...||:.:   :.:.|.|...|
  Fly  1004 FHF-LAGLTVSENNFIVWLNNKPLHTAPLTLNLLHN-ALAIKLLGQDASTY---VTNEPLPYSDD 1063

Human  1979 QEQATISS----LIDILVALSILMGYSVTTASFVTYVVREHQTKAKQLQHISGIGVTCYWVTNFI 2039
            .....::.    ..:|.:.||:.|.:  .||.:...::||.:|:||.||.:||:.|..||.::.:
  Fly  1064 TRTLRLNKGQVLGAEISINLSLTMCF--ITAFYAIPIIRERETRAKLLQFLSGVDVCAYWTSHIV 1126

Human  2040 YDMVFYLVPVAFSIGIIAIFKLPAFYSENNLGAVSLLLLLFGYATFSWMYLLAGLFHETGMAFIT 2104
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  Fly  1127 WDYLVFVLSALSSILTIAAFKEIGYITPLDLSRYFYMLLIFGFPGIMLSYAASGCFSDAATGFTR 1191

Human  2105 YVCVNLFFGINSIVSLSVVYFLSKEKPNDPTLELISETLKRIFLIFPQFC---------FGY--- 2157
            ...:|...|....:....:.|.:.:      |:.::|.|...|.:.|.:.         .||
  Fly  1192 ISIINTLMGTGLFLMFMTLNFEAFQ------LKDVAEKLAWYFRLSPHYSLASSTHSIHIGYNIR 1250

Human  2158 ------GLIELSQQ---QSV---LDFLKAYGVEYPNETFE---MNKLGA-MFVALVSQGTMFFSL 2206
                  |:.:|.:|   ::|   .|....||...|....|   |..||: :|:.:|.......:|
  Fly  1251 RGCSIGGIRKLPKQLRCRNVPICCDIPGYYGWRKPGVLVEITYMIMLGSTLFLLIVMHDAKVCNL 1315

Human  2207 RLLINESLIKKLRLFFRKFNSSHVRETIDEDEDVRAERL---RVESGAAEFDLVQLYCLTKTYQL 2268
                   :.:||...|.|........:|:.|..|..:|:   .:.||..:..|: :|.::|.|
  Fly  1316 -------IAEKLGNCFSKRKRVEGGTSIENDSVVAEQRVVREMINSGRKDVPLL-VYKISKRY-- 1370

Human  2269 IHKKIIAVNNISIGIPAGECFGLLGVNGAGKTTIFKMLTGDIIPSSGNILIRNKTGSLGHVDSHS 2333
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  Fly  1371 --RSKLAVKAISFHVPHAECFGLLGINGAGKTSTFKMLAGDEKITSGEAYIDGT-----NISTHK 1428

Human  2334 --SLVGYCPQEDALDDLVTVEEHLYFYARVHGIPEKDIKETVHKLLRRLHLMPFKDRATSMCSYG 2396
              ..:|||||.|||.:.:|..|.|..|..:.|:..:.:......|..........|:.|...|.|
  Fly  1429 VYRKIGYCPQFDALFEDLTGRETLNIYCLLRGVQRRHVTPICWGLAISFGFAKHMDKQTKHYSGG 1493

Human  2397 TKRKLSTALALIGKPSILLLDEPSSGMDPKSKRHLWKIISEEVQNKCSVILTSHSMEECEALCTR 2461
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  Fly  1494 NRRKLSTAISVLGNPSVLYLDEPTSGMDPAARRQLWQIIGLIRTAGKSIVLTSHSMDECEALCSR 1558

Human  2462 LAIMVNGKFQCIGSLQHIKSRFGRGFTVKVHLKNNKVTM-----------------ETLTKFMQL 2509
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  Fly  1559 LAIMVDGEFKCLGSVQSLKNQFSKGLILKVKVKHKKKTFQRVVEDSSSSNDKKSISETDLKFLQM 1623

Human  2510 ---------------------HFPKTYLKDQHLSMLEYHVPVTAGGVANIFDLLETNKTALNITN 2553
                                 ..|...||:::..::.|::| .:..::.||.|||||...|||.:
  Fly  1624 ASVMESSQADRILKVNRFISKEIPDAELKEEYNGLITYYIP-HSKTLSKIFQLLETNSHKLNIED 1687

Human  2554 FLVSQTTLEEVFINFAKDQKS 2574
            :|:.||.|||:|::||..:.|
  Fly  1688 YLIMQTRLEEIFLDFASKRDS 1708

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ABCA12	XP_011509253.1	rim_protein	7..>86	CDD:130324
		rim_protein	752..2579	CDD:130324	506/1776 (28%)
CG6052	NP_649002.3	rim_protein	21..>54	CDD:130324
		rim_protein	<149..1709	CDD:130324	499/1737 (29%)