Protein Alignment ABCA12 and CG1801

DIOPT Version :10

• Sequence 1: XP_011509253.1
• Gene: ABCA12 / 26154
• HGNCID: 14637
• Length: 2598
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_728408.3
• Gene: CG1801 / 33104
• FlyBaseID: FBgn0031171
• Length: 1655
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1852
• Identity: 387/1852 - (20%)
• Similarity: 713/1852 - (38%)
• Gaps: 429/1852 - (23%)

Human   862 MLQNTLRNPFVQVFVKFSVGLDAVELLKQIDELDILRLKLENNIDIIDQLNTLSSLTVNISSCVL 926
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  Fly    48 LLYTTTENENEQSIV--SHKLQDINILTRM--ADSKREKTKYILAFTPETTFTSEVTKNV----- 103

Human   927 YDRIQAAKTID-------EMEREAKRLYKSNELFGSVIFKLPSNRSWHRGYDSGNVFLPPVIKYT 984
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  Fly   104 ------AKTLELSSTVGYESESEMQNQFDERTTLAGIVF--------NDLRDDGT----PL---T 147

Human   985 IRMSLKTAQTTRSL-----RTKIWA--------PGPHNSPSHNQ--IYGR-AFIYLQDSI----- 1028
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  Fly   148 LSISIRFPSEFRTIAPFLTEDRLWITRCSGRINPGRDRAKHDKQQDIYIREGFLQLQHQIFVEWY 212

Human  1029 ---ERAIIELQTGRNSQEIAVQVQAIPYPCFMKD-----NFLTSVSYSLPIVLMVAWVVFIAAFV 1085
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  Fly   213 HQLRKDIVSTYPEPNVEVYNILLKAADEPCSVMSVAQLPTFLYNFIYLLPFLNIIR---NVAAQV 274

Human  1086 KKLVYEKDLRLHEYMKMMGVNSCSHF-----FAW----LIESVGFLLVTIVILIIILKFGNILPK 1141
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  Fly   275 -----EDGVMVHQW----------HYGYSFGMQWGIKFLVLFLRMCILGVIYTIMLLAFWGFGGR 324

Human  1142 T-----NGFILFLYF-SDYSFSVIAMSYLISVFFNNTNIAALIGSLIYIIAFFPFIVLVTVENEL 1200
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  Fly   325 EGEFSGTGTIAFVCFITLYTVEIIITGMVVAKLFANPTNAVLFALMLWLFMYAAFCIILERYWDI 389

Human  1201 SYVLKVFMSLLSPTAFSYASQYIARYEEQGIGLQWENMYTSPVQDDTTSFGWLCCLILADSFIYF 1265
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  Fly   390 -HKYYVFFILV---AFCNCQMHFS------MSL-FRNCIEKPEMVNTIDFVLIFTSAISSALIYF 443

Human  1266 LIAWYVRNVFPGTYGMAAPWYFPILPSYWKERFGCAEVKPEKSNGLMFTNIMMQNTNPS------ 1324
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  Fly   444 LILLAIQWRMPGT--------------FLSRRI--VNNRPRKQQE-SDTTIMYLGRAPSFQNFEF 491

Human  1325 ASKTSPEYMFSSNIEPEPKDLTVGVALHGVTKIYGSKVAVDNLNLNFYEGHITSLLGPNGAGKTT 1389
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  Fly   492 GDVGSVELMRLRHVSTSHRD--------------SERKILKNISMRIYRGEVFVILGHIGSGKLT 542

Human  1390 TISMLTGLFGASAGTIFVYGK------------DIKTDLHTVRKNMGVCMQHDVLFSYLTTKEHL 1442
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  Fly   543 LLRILAGLKFPLRGNVYIMGNPFEPNGEARRLVDFRFDEHGLNK-------------HLTVEQTI 594

Human  1443 LLYGSIKV-PHWTKKQLHEEVKR----TLKDTGLYSHRHKRVGTLSGGMKRKLSISIALIGGSRV 1502
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  Fly   595 DYHVRLKLSPSESDRY---EIERRKWLAILDQHVES-RGVRIGKLSSGSMKLVALCCCLAGDTPI 655

Human  1503 VILDEPSTGVDPCSRRSIWDVISKNKTARTIILSTHHLDEAEVLSDRIAFLEQGGLRCCGSPFYL 1567
            :||:||:|.:.....:..|.::...|..|..|::|:::.|||.::|||..|..|.|...|:||:|
  Fly   656 IILEEPTTQLTGREAQIFWSIVHAEKENRAFIIATYNVGEAEHVADRIGILSMGVLEASGTPFFL 720

Human  1568 KEAFGDGYHLTLTKKKSPNLNANAVCDTMAVTAMIQSHLPEAYLKEDIGGELVYVLP----PFST 1628
            :..|.....|.:.||  |::....:.|  .:...:|:..||    .:||..|.|.||    |...
  Fly   721 RSKFSSSVDLVIIKK--PHVPDQPITD--YINQFMQNIEPE----NEIGDSLTYRLPVIYRPRLQ 777

Human  1629 KVSGAYLSLLRALDNGMGDLNIGCYGISDTTVEEVFLNLTKESQKNSAMSLEHLTQKKIGNSNAN 1693
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  Fly   778 KLL-IHLEIDRKM---LGIENVRVVG---AELSDIYMTLVTSFR---------LQQQMI------ 820

Human  1694 GISTPDDLSVSSSNFTDRDDKILTRGERLDGFGLLLKKIMAILIKRFHHTRRNWKGLIAQVILPI 1758
                ||  ...:..:.....|.||:           :::.|:..|:..||..|        :.||
  Fly   821 ----PD--VTQTFKYQVVSQKQLTK-----------QRMRAMFYKKMIHTAPN--------VWPI 860

Human  1759 VFVTTAMGLGTLRNSSNSYPEIQISPSLYGTSEQTAFYANYHPSTEALVSAMWDFPGIDNMCLNT 1823
            :.:.|            |:..|.|.                     |.:|.:.|.|   ....|:
  Fly   861 IMIFT------------SFVLIAII---------------------ARLSVLLDMP---KERQNS 889

Human  1824 SDLQCLNKDSLEKWNTSGEPITNFGVCSCSENVQECPKFN--YSPPHRRTYSSQVIYNLTGQRVE 1886
            ..:.....:.:.|:      :.|...|...: ::...|.|  .|....||:.........|....
  Fly   890 IHIGFREPEDVVKY------LPNLKDCGYID-IRSAVKVNKKKSVGVSRTFDDDSFVCEKGSYRN 947

Human  1887 NYLISTANEFVQKRYGGWSFGLPLTKDLRFDITGVPANRTLAKVWYDPEGYHSLPAYLNSLNNFL 1951
            |         ::|:....||| .:..|....:.|          :...:.:||.|..||.|.|.:
  Fly   948 N---------LRKKNELRSFG-AVESDGDEHLNG----------YISQDMFHSAPMMLNLLQNVI 992

Human  1952 LRVNM-SKYDAARHGIIMYSHPYPGVQDQEQATISSLIDIL------VALSILMG--YSVTTASF 2007
            ||::. .:.|..   :::.:||.|       ..:|..|::|      :.:.:::|  ..:|.:.|
  Fly   993 LRLSYPMQTDLV---VLVENHPLP-------TQLSQKINVLDNKIAHIHVPLVVGCIIPLTVSVF 1047

Human  2008 VTYVVREHQTKAKQLQHISGIGVTCYWVTNFIYDMVFYLVPVAFSIGIIAIFKLP-----AFYSE 2067
            |..:|.|.....:.|||::|:|:..:|..|..:|...:.|   :|:.|:.|..|.     .|| |
  Fly  1048 VIPLVEEEIYDVRFLQHMAGLGLKVFWGINLFWDWFTFFV---YSVIIVVIMSLMGIGGFGFY-E 1108

Human  2068 NNLGAVSLLLLLFGYATFSWMYLLAGLFHETGM-AFITYVCVNLFFGINSIVSLSVVYFLSKEKP 2131
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  Fly  1109 NAIMVV--LLTTFGLAALPLTYLVSMFVNKSIVRAFLVSV---LLQGVSGLV-LYIIYW---DVA 1164

Human  2132 NDPTLELISETLKRIFLIFPQFCF--GYGLIE-LS-------QQQSVLDFLKAYG---VEYPNET 2183
            |..|            :.|...|.  |:.|:: :|       :|...:|..:|..   .|..||.
  Fly  1165 NSNT------------IFFYAACMSPGFSLLDGVSNVYAQNLEQAICIDKCEATDSCTEENMNEV 1217

Human  2184 FEMNKLGAMF---VALVSQGTMFFSLRLLINESLIKKLRLFFR--KFNSSHVRETIDEDEDVRAE 2243
            ....|....|   ...:....::..|..||...||..:.|..|  ||::|         .|:|..
  Fly  1218 VPNCKFDTFFKWAAPGILPPILYMVLSALIFLMLIFWIELHRREKKFHTS---------RDLRKM 1273

Human  2244 RLR-----------VESGAAEFDLVQLYCLTKTYQLIHKKIIAVNNISIGIPAG----------- 2286
            |..           |:...||.|      .||..|    .:..|:.:...:||.
  Fly  1274 RTATYPFDDGDVADVKQKIAEAD------NTKAKQ----SVFLVDQVEARVPAAGKRIHTVSFAL 1328

Human  2287 ---ECFGLLGVNGAGKTTIFKMLTGDIIPSSGNILIRNKTGSLGHVDSHSSLVGYCPQEDALDDL 2348
               ...|:.|...:||:.:.:.|.|....:.|.|.:|...... .::|..:.:||.||...|.:.
  Fly  1329 NKYMSMGIFGPRNSGKSHLMRQLVGQRGFAFGEIYVRGLDFKY-DLESIHTYMGYSPQHRGLLNE 1392

Human  2349 VTVEEHLYFYARVHGIPEKDIKETVHKLLRRLHLMPFKDRATSMCSYGTKRKLSTALALIGKPSI 2413
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  Fly  1393 LTPREHIRLLCMIRGVPEAKIGEKMHDLCLMLNMTGWMHRKCSLLTAEKRHKLKIALALVAYNKI 1457

Human  2414 LLLDEPSSGMDPKSKRHLWKIISEEVQNKCSVILTSHSMEECEALCTRLAIMVNGKFQCIGSLQH 2478
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  Fly  1458 LVLDEPTCGMPATTRREIWNILRYIRYCGKTIIFATNDELECKILADFIILFQDSEMLAIGSLQY 1522

Human  2479 IKSRFGRGFTVKVHL-----------KNNKVTMETLTKFMQLHFPKTYLKDQHLSMLEYHVPVTA 2532
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  Fly  1523 LRYKYSHGFYLEVRLIRDGATLAESEENLRKDVENLAKFVNFLHNRSELVGRLNNWFKFYVPVGH 1587

Human  2533 GGVANIFDLLETNKTALNITNFLVSQTTLEEV 2564
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  Fly  1588 IVYSFLYGAMEKNKLRLNVSDYCIYQADMMSV 1619

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ABCA12	XP_011509253.1	rim_protein	7..>86	CDD:130324
		rim_protein	752..2579	CDD:130324	387/1852 (21%)
CG1801	NP_728408.3	ABC2_membrane_3	<246..379	CDD:463674	26/150 (17%)
		rim_protein	<514..1537	CDD:130324	270/1212 (22%)