Protein Alignment ABCA12 and CG1494

DIOPT Version :10

• Sequence 1: XP_011509253.1
• Gene: ABCA12 / 26154
• HGNCID: 14637
• Length: 2598
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_608444.2
• Gene: CG1494 / 33102
• FlyBaseID: FBgn0031169
• Length: 1695
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1932
• Identity: 409/1932 - (21%)
• Similarity: 767/1932 - (39%)
• Gaps: 455/1932 - (23%)

Human   849 FMNSFHLLNQAIPMLQNTLRNP--------------FVQVFVKFSVGL----DAVELLKQIDELD 895
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  Fly     6 YIRKFLLMNWKNHKLQ--LANPLELLVILLVPPLFTLVAVLMRFFIPVNHRSDTV-----YDPID 63

Human   896 ILRL------KLENNIDIIDQLNTLSS-----LTVNISS------CVLYDRIQAAKTIDEME--- 940
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  Fly    64 LDRSWMQMVEKLEKARQVADTYNVKGNPFTPHLVIGWAPKRYGIFQAMMRRVQ--KQIEPMTSVG 126

Human   941 ----REAKRLYKSNELFGSVIFKLPSNRSWHRGYDSGNVF----------------LPPVIKYTI 985
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  Fly   127 FEDCEEMRESVIENGLFAGLCF-------------DGSPFVEDQVFEEDTLESYSNIQPMLNYTI 178

Human   986 RMSLKTAQTTRSLRTKIWAPGPHNSPSH------NQIY--------GRAFIYLQDSIERAIIELQ 1036
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  Fly   179 LLPSELRMLDGDFRMANWMTLYNDDPNTFVLTRLNQPYEGGFVGYVREGFIRLQKSVSESFLVLT 243

Human  1037 TGRNSQEIAVQVQAIPYPCFMKDNFLTSVSYSLPIVLMVAWVVFIAAFVKKLVYEKDLRLHEYMK 1101
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  Fly   244 SHKSLP--TIQIRRFPITGREQDPLMGNLNYGMPFIIIIGFLFPAQLFVWQVVSEKQSQVRQFLI 306

Human  1102 MMGVNSCSHFFAWLIESVGFLLVTIVILIIILKF-----GNILPKTNGFILFLYFSDYSFSVIAM 1161
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  Fly   307 NMNIGNLIHFVSWYLKGLIYEMISSLIIAALLKIRWDQDHGVLTQTPWYILILVLFCYNCAAVAF 371

Human  1162 SYLISVFFNNTNIAALIGSLIYIIAFFP-FIVLVTVENEL------SYVL-KVFMSLLSPTAFSY 1218
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  Fly   372 AIMVAAFFRNALNAVRVLTILWIMSYVPTFILSNNLEGNIHALRYVSYALPNVVATLVIEFLIER 436

Human  1219 ASQYIARYEEQGIGLQWENMYTSPVQDDTTSFGWLCCLILADSFIYFLIAWYVRNVFPGTYGMAA 1283
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  Fly   437 ESIVHITWEDSGYRLNYDGGHIT-----VTASSW---IFMLNALVYCAIGLYV------------ 481

Human  1284 PWYFPILPSYWK--ERFGCAEVKPEKSNGLMFTNIMMQNTNPSASKTSPEYMFSSNIEPEPKDLT 1346
                    ..|:  :|.|....||              |||.|..: .|.:....:...:.:  .
  Fly   482 --------DMWRGGDRSGKKMKKP--------------NTNASVQE-DPYHERGDSFTHQGQ--A 521

Human  1347 VGVALHGVTKIY----------------------GSKVAVDNLNLNFYEGHITSLLGPNGAGKTT 1389
            :||   ..||||                      ..:.|::..:.|.||..:|.|:|.||.||:|
  Fly   522 IGV---NSTKIYEVEPSHRRFKLKIKKLCKRFATNDRPALNLFSWNVYENEVTVLMGHNGCGKST 583

Human  1390 TISMLTGLFGASAGTIFVYGKDIKTDLHTVRKNMGVCMQHDVLFSYLTTKEHLLLYGSIKVPHWT 1454
            .:.:|.||...|.||:.:...:|:|:.......:|:...||:|.:..|..::|.....:
  Fly   584 LLKILAGLVEPSRGTVMISSHNIQTERKAASMELGIAFGHDMLLTGFTVIDYLRFICRV------ 642

Human  1455 KKQLHEEVK---------RTLKDTGLYSHRHKRVGTLSGGMKRKLSISIALIGGSRVVILDEPST 1510
             |.||..::         ..|:..||   :.||:.||:......:||..|.:|.|.::::|:..:
  Fly   643 -KGLHNNIEIDGQSNYFLNVLQIGGL---KTKRIRTLTDRDLCLVSICCAFVGNSPIILIDDVHS 703

Human  1511 GVDPCSRRSIWDVISKNKTARTIILSTHHLDEAEVLSDRIAFLEQGGLRCCGSPFYLKEAFGDGY 1575
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  Fly   704 DLDKRTQSLVWNLINEEKSKRTIILVSNSPALAENIADRMAIMSNGELKCTGTKPFLKNMYGHGY 768

Human  1576 HLTLTKKKSPNLNANAVCDTMAVTAMIQSHLPEAYLKEDIGGELVYVLPPFSTKVSGAYLSLLRA 1640
            .||..|.|:...:        .:..|:.|::|...::.|||.::.:||   ..|....:..|:..
  Fly   769 RLTCVKGKNYKRD--------ELFGMMNSYMPNMSIERDIGYKVTFVL---ENKFEDQFPMLIDD 822

Human  1641 LDNGMGDLNIGCYGISDTTVEEVFLNLTKESQKNSAMSLEHLTQKKIGNSNANGISTPDDLSVSS 1705
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  Fly   823 LEENMQQLGVVSFRIRDTSMEEIFLRFGCEDNDQSGAFQSH--------ENAQVL-----LEEYY 874

Human  1706 SNFTDRDDKILTRGERLDGFGLLLKKIMAILIKRFHHTRRNWKGLIAQVILPIVFVTTAMGLGTL 1770
            |...:.::|    |.| .|:.|......|::.||:....|:|        :.::|...||.|..:
  Fly   875 STLAEANEK----GRR-TGWKLFFLHGRAVIYKRWIAAHRHW--------IVLIFEVLAMALVAV 926

Human  1771 RNSSNSYPEIQISPSLYGTSEQTAFYANYHPSTEALVSAMWDFPGIDNMCLNTSDLQCLNKDSLE 1835
            ...|:.:        :||        .||.               ::.:..|.|.|..:  |:..
  Fly   927 CTFSSIF--------IYG--------KNYE---------------LEPLTFNLSQLHTV--DAFV 958

Human  1836 KWNTSGEPITNFGVCSCSENVQECPKFNYSPPHRRTYSSQVIY-------NLTGQRVENYLISTA 1893
            :            :.|..|:|::          ...|.::::|       .||..|...|.:.|.
  Fly   959 E------------LFSEEEDVKD----------MHAYYTELLYWYDAHVATLTKNRHNAYALLTQ 1001

Human  1894 NEF---VQKRYGGWSFGLPLTKDLRFDITGVPANRTLAKVWYDPEGYHSLPAYLNSLNNFLLRVN 1955
            |:|   |..||                |.|...::.:...|::....||.|..||.::|.:
  Fly  1002 NQFTAHVNSRY----------------IFGATFDQKIVTAWFNNIPLHSAPYALNVVHNAV---- 1046

Human  1956 MSKYDAARHGIIMYSHPYPGVQDQEQATISSLIDIL-------------------VALSILMGYS 2001
                  |||..            .|:|||...:..|                   :|..|....:
  Fly  1047 ------ARHLF------------DEEATIDVTLAPLPFRTAINTFPPSSHTFGGCLAFGICFVLT 1093

Human  2002 VTTASFVTYVVREHQTKAKQLQHISGIGVTCYWVTNFIYDMVFYLVPVAFSIGIIAIFKLPAFYS 2066
            ....:|..|::.|..:..|:.|.::|:.|..||....:||::|.|:..|..:.::|:::.|
  Fly  1094 FIWPAFAIYMITERGSLLKKQQFLAGVRVCSYWTFTVLYDLLFLLIFCACVVVMVALYENP---- 1154

Human  2067 ENN----LGAVSLLLLLFGYATFSWMYLLAGLFHETGMAFITYVCVNLFFGINSI--VSLSVVYF 2125
             |:    .|.:|:.|:|.|:......||:|.|.......|: ::|     |||||  |..|..|.
  Fly  1155 -NHDVMLYGYISVTLMLGGFWVILLAYLMASLCRNPCYGFL-WLC-----GINSIGLVCFSQFYR 1212

Human  2126 LSKE----KPNDPTLELISETLKRIFLIFPQFCFGYGLIELSQQQSVLDFLKAYGVEYPNETFEM 2186
            ...|    :|....:..::..:.::|:|:.        .:|.....|::|...       |.|:.
  Fly  1213 THPESMLLEPTFMAMYTVATVICKLFMIYE--------FKLICMDPVVNFTSV-------EVFKC 1262

Human  2187 NKLGAMFVALVSQGT----MFFSLRLLINESLIKKLRLFFRKFNS----------SHVRETIDED 2237
            |.:....:. .:.||    ::..|.:|....:|....||..:::|          :...|:.|.:
  Fly  1263 NSIPNCCIK-SNYGTFTAGIYHDLVILTLLDIILLACLFVSEYHSILGFADCRLDTRTNESPDSN 1326

Human  2238 EDVRA------------------ERLRVESGAAEFDLVQLYCLTKTYQLIHKKIIAVNNISIGIP 2284
            ::.||                  .||. |...:::..|.:..::|     :::...:.::...:.
  Fly  1327 QESRAFPGILSNDTAALVDKEHTSRLN-EEERSKYAAVGIGIVSK-----YRRNRVLRDLDFTLA 1385

Human  2285 AGECFGLLGVNGAGKTTIFKMLTGDIIPSSGNILIRNKTGSLGHVDSHSSLVGYCPQEDALDDLV 2349
            ..||..:.|.|.:||||:.|::..:...::|.:.|.:.:.:...|..: .:||||||:|:|....
  Fly  1386 KSECLSITGANNSGKTTLLKVVVNETKMNAGQLWIHDYSVNTHRVQCY-RMVGYCPQKDSLPSEF 1449

Human  2350 TVEEHLYFYARVHGIPEKDIKETVHKLLRRLHLMPFKDRATSMCSYGTKRKLSTALALIGKPSIL 2414
            |..|.||.:|.:.|...:..:|....|||.:.|.|..:|:..||:.|..|:|..|.|::|.|.::
  Fly  1450 TPRELLYIHAMLQGHRHRIGRELSEALLRLVGLTPCWNRSVRMCTTGQIRRLYFAYAVLGSPDLI 1514

Human  2415 LLDEPSSGMDPKSKRHLWKIISEEVQNKCSVILTSHSMEECEALCTRLAIMVNGKFQCIGSLQHI 2479
            .:|...:|:||..||.:..:.|.......|.:.|..:..:.|.|..|..:::.|:...|..:...
  Fly  1515 CVDGVPAGLDPTGKRIILMMTSTMQAMGSSFLYTMLTGLDAERLSLRTPLLLEGQLWMIRPMDTE 1579

Human  2480 KSRFGRGFTVKVHLK---NNKVTMETLT----------------KFMQLHFPKTYLKDQHLSMLE 2525
            ...:..|:.::|..|   |..|:|...|                .||::.||...|..:....:.
  Fly  1580 TENYKSGYQLEVRFKRKVNPNVSMSRATWNLINHFPMSPNKKFSAFMEIKFPDAVLTIERDDSMV 1644

Human  2526 YHVPVTAGGVANIFDLLETNKTALNITNFLVSQTTLEEVFINFAKDQ 2572
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  Fly  1645 FVLPLGTTTFSEIFLTLRKDAFEMNIEDYFITRNMLVG-FQIFTYDQ 1690

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
ABCA12	XP_011509253.1	rim_protein	7..>86	CDD:130324
		rim_protein	752..2579	CDD:130324	409/1932 (21%)
CG1494	NP_608444.2	rim_protein	<223..1689	CDD:130324	363/1690 (21%)
		ABC_subfamily_A	541..761	CDD:213230	60/229 (26%)