DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ABCA12 and Abca12

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011509253.1 Gene:ABCA12 / 26154 HGNCID:14637 Length:2598 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001414620.1 Gene:Abca12 / 301482 RGDID:1304586 Length:2595 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2598 Identity:2319/2598 - (89%)
Similarity:2454/2598 - (94%) Gaps:3/2598 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MASLFHQLQILVWKNWLGVKRQPLWTLVLILWPVIIFIILAITRTKFPPTAKPTCYLAPRNLPST 65
            |||.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
  Rat     1 MASQFHQLRILVWKNWLGVKRQPLWTLVLILWPVIIFIILAITRTKFPPAAKPTCYLAPRNLPSA 65

Human    66 GFFPFLQTLLCDTDSKCKDTPYGPQDLLRRKGIDDALFKDSEILRKSSNLDKDSSLSFQSTQVPE 130
            ||||||||||||||||||||||||:|||||||||..:||:||:|:||||..:||:||.|||||||
  Rat    66 GFFPFLQTLLCDTDSKCKDTPYGPRDLLRRKGIDGTIFKESEVLKKSSNPKRDSNLSLQSTQVPE 130

Human   131 RRHASLATVFPSPSSDLEIPGTYTFNGSQVLARILGLEKLLKQNSTSEDIRRELCDSYSGYIVDD 195
            |.|.||||:.|.||.|.|..||..|||||:|.|||.||||||||||.||||||||:||.||..|.
  Rat   131 RSHTSLATIPPRPSYDSEGMGTENFNGSQLLTRILDLEKLLKQNSTPEDIRRELCESYPGYTADY 195

Human   196 AFSWTFLGRNVFNKFCLSNMTLLESSLQELNKQFSQLSSDPNNQKIVFQEIVRMLSFFSQVQEQK 260
            ||||..||:|||||||||||||||||||||..|.||:||||||||.||:.:|::||||||||:|:
  Rat   196 AFSWVTLGKNVFNKFCLSNMTLLESSLQELKYQVSQMSSDPNNQKRVFRGLVQVLSFFSQVQQQR 260

Human   261 AVWQLLSSFPNVFQNDTSLSNLFDVLRKANSVLLVVQKVYPRFATNEGFRTLQKSVKHLLYTLDS 325
            .|||.|||.|:||||||||:::|.||:|||.|||||::||||..|:|||.||||||||||.||||
  Rat   261 EVWQFLSSLPDVFQNDTSLNSIFGVLQKANRVLLVVREVYPRVQTDEGFSTLQKSVKHLLNTLDS 325

Human   326 PAQGDSDNITHVWNEDDGQTLSPSSLAAQLLILENFEDALLNISANSPYIPYLACVRNVTDSLAR 390
            |.||  ||.||.|.:||.|||||||||||||||||||||:||||:.|||.||||||||:||:||:
  Rat   326 PTQG--DNSTHAWTDDDEQTLSPSSLAAQLLILENFEDAILNISSRSPYSPYLACVRNMTDNLAK 388

Human   391 GSPENLRLLQSTIRFKKSFLRNGSYEDYFPPVPEVLKSKLSQLRNLTELLCESETFSLIEKSCQL 455
            |||:||:.|||||.|:|.||:||||||.|||..|:||||||||||||||||||||||.||||||.
  Rat   389 GSPDNLKFLQSTIHFRKPFLQNGSYEDGFPPFLEILKSKLSQLRNLTELLCESETFSTIEKSCQF 453

Human   456 SDMSFGSLCEESEFDLQLLEAAELGTEIAASLLYHDNVISKKVRDLLTGDPSKINLNMDQFLEQA 520
            .:|||..|||:..|.:||:|.|||||::|:.||||||::|.|:|||||||||||||:||..||||
  Rat   454 PNMSFKRLCEDHAFHVQLIEVAELGTDLASGLLYHDNILSAKLRDLLTGDPSKINLDMDWLLEQA 518

Human   521 LQMNYLENITQLIPIIEAMLHVNNSADASEKPGQLLEMFKNVEELKEDLRRTTGMSNRTIDKLLA 585
            ||||||||||:|||.:|||||||.||||||:||||:|||||::.||||| |..||||.:||||||
  Rat   519 LQMNYLENITRLIPTVEAMLHVNTSADASEQPGQLIEMFKNIDLLKEDL-RAIGMSNTSIDKLLA 582

Human   586 IPIPDNRAEIISQVFWLHSCDTNITTPKLEDAMKEFCNLSLSERSRQSYLIGLTLLHYLNIYNFT 650
            ||||||||||||.||||||||||:|.|||||.|||||.|.|.|||.|||||||||||||:|||.|
  Rat   583 IPIPDNRAEIISHVFWLHSCDTNVTNPKLEDTMKEFCKLPLPERSHQSYLIGLTLLHYLDIYNLT 647

Human   651 YKVFFPRKDQKPVEKMMELFIRLKEILNQMASGTHPLLDKMRSLKQMHLPRSVPLTQAMYRSNRM 715
            ||||||||||||:|:||||||:|:|||||:||||||||||||||:||||||:||||||||||.||
  Rat   648 YKVFFPRKDQKPMERMMELFIKLREILNQLASGTHPLLDKMRSLRQMHLPRNVPLTQAMYRSTRM 712

Human   716 NTPQGSFSTISQALCSQGITTEYLTAMLPSSQRPKGNHTKDFLTYKLTKEQIASKYGIPINSTPF 780
            |||.|||||||||||||||||||||:||||||:|||||||||||||||||:||||||||:|:|||
  Rat   713 NTPAGSFSTISQALCSQGITTEYLTSMLPSSQKPKGNHTKDFLTYKLTKEEIASKYGIPLNATPF 777

Human   781 CFSLYKDIINMPAGPVIWAFLKPMLLGRILYAPYNPVTKAIMEKSNVTLRQLAELREKSQEWMDK 845
            |||||||||||||||||||||||||||:||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   778 CFSLYKDIINMPAGPVIWAFLKPMLLGKILYAPYNPTTKAIMEKSNVTLRQLAELREKSQEWMDK 842

Human   846 SPLFMNSFHLLNQAIPMLQNTLRNPFVQVFVKFSVGLDAVELLKQIDELDILRLKLENNIDIIDQ 910
            ||:||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||:||:||||||||||||||
  Rat   843 SPIFMNSFHLLNQTIPMLQNTLRNPFVQVFVKFSVGLDAVELLKQIDDLDVLRLKLENNIDIIDQ 907

Human   911 LNTLSSLTVNISSCVLYDRIQAAKTIDEMEREAKRLYKSNELFGSVIFKLPSNRSWHRGYDSGNV 975
            |||||||||||||||||||||||.|:||||..||:||||||||||||||||||.|.|||:||..|
  Rat   908 LNTLSSLTVNISSCVLYDRIQAADTVDEMEMIAKQLYKSNELFGSVIFKLPSNGSSHRGFDSERV 972

Human   976 FLPPVIKYTIRMSLKTAQTTRSLRTKIWAPGPHNSPSHNQIYGRAFIYLQDSIERAIIELQTGRN 1040
            .|||:::|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   973 SLPPIVRYTIRMSLKTAQTTRSIRTKIWAPGPHNSPSHNQIYGRAFIYLQDSIERAIIELQTGRN 1037

Human  1041 SQEIAVQVQAIPYPCFMKDNFLTSVSYSLPIVLMVAWVVFIAAFVKKLVYEKDLRLHEYMKMMGV 1105
            |||:||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1038 SQEVAVQVQAVPYPCFMKDNFLTSVSYSLPIVLMVAWVVFIAAFVKKLVYEKDLRLHEYMKMMGV 1102

Human  1106 NSCSHFFAWLIESVGFLLVTIVILIIILKFGNILPKTNGFILFLYFSDYSFSVIAMSYLISVFFN 1170
            |||||||||||||:|||||||.|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1103 NSCSHFFAWLIESIGFLLVTIAILIVILKFGNILPKTNGFILFLYFSDYSFSVIAMSYLISVFFN 1167

Human  1171 NTNIAALIGSLIYIIAFFPFIVLVTVENELSYVLKVFMSLLSPTAFSYASQYIARYEEQGIGLQW 1235
            |||||||||||||:|||||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1168 NTNIAALIGSLIYVIAFFPFIVLVTVEDELSYVIKVFMSLLSPTAFSYASQYIARYEEQGIGLQW 1232

Human  1236 ENMYTSPVQDDTTSFGWLCCLILADSFIYFLIAWYVRNVFPGTYGMAAPWYFPILPSYWKERFGC 1300
            ||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat  1233 ENMYKSPVQDDTTSFGWLCCLILADSFIYFFIAWYVRNVFPGTYGMAAPWYFPVLPSYWKERFGC 1297

Human  1301 AEVKPEKSNGLMFTNIMMQNTNPSASKTSPEYMFSSNIEPEPKDLTVGVALHGVTKIYGSKVAVD 1365
            ||||.||||||||||||||:|||||:||||:..|.||||||||||.||||||||||.||||.|||
  Rat  1298 AEVKHEKSNGLMFTNIMMQSTNPSANKTSPDCAFPSNIEPEPKDLQVGVALHGVTKSYGSKTAVD 1362

Human  1366 NLNLNFYEGHITSLLGPNGAGKTTTISMLTGLFGASAGTIFVYGKDIKTDLHTVRKNMGVCMQHD 1430
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat  1363 NLNLNFYEGHITSLLGPNGAGKTTTISMLTGLFGATAGTIFVYGKDIKTDLNTVRKNMGVCMQHD 1427

Human  1431 VLFSYLTTKEHLLLYGSIKVPHWTKKQLHEEVKRTLKDTGLYSHRHKRVGTLSGGMKRKLSISIA 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1428 VLFSYLTTKEHLLLYGSIKVPHWTKKQLHEEVKRTLKDTGLYSHRHKRVGTLSGGMKRKLSISIA 1492

Human  1496 LIGGSRVVILDEPSTGVDPCSRRSIWDVISKNKTARTIILSTHHLDEAEVLSDRIAFLEQGGLRC 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1493 LIGGSRVVILDEPSTGVDPCSRRSIWDVISKNKTARTIILSTHHLDEAEVLSDRIAFLEQGGLRC 1557

Human  1561 CGSPFYLKEAFGDGYHLTLTKKKSPNLNANAVCDTMAVTAMIQSHLPEAYLKEDIGGELVYVLPP 1625
            |||||||||||||||||||||||||||:.||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1558 CGSPFYLKEAFGDGYHLTLTKKKSPNLDTNAICDTVAVTAMIQSHLPEAYLKEDIGGELVYVLPP 1622

Human  1626 FSTKVSGAYLSLLRALDNGMGDLNIGCYGISDTTVEEVFLNLTKESQKNSAMSLEHLTQKKIGNS 1690
            |||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||:|||...||||||||:|:||.
  Rat  1623 FSTKVSGAYLSLLRALDKGMGKLNIGCYGISDTTVEEVFLNLTKDSQKCGNMSLEHLTQRKVGNP 1687

Human  1691 NANGISTPDDLSVSSSNFTDRDDKILTRGERLDGFGLLLKKIMAILIKRFHHTRRNWKGLIAQVI 1755
            :|||.|||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat  1688 SANGTSTPDDLSVSSSNFTDRDDKVLTRSERLDGFGLLLKKIMAILIKRFHHTRRNWKGLIAQVV 1752

Human  1756 LPIVFVTTAMGLGTLRNSSNSYPEIQISPSLYGTSEQTAFYANYHPSTEALVSAMWDFPGIDNMC 1820
            ||||||.|||||||||:|||||||:.||||:||.|||||||||:.|||.|||||:|:||||||:|
  Rat  1753 LPIVFVATAMGLGTLRDSSNSYPELLISPSIYGNSEQTAFYANFDPSTNALVSALWNFPGIDNVC 1817

Human  1821 LNTSDLQCLNKDSLEKWNTSGEPITNFGVCSCSENVQECPKFNYSPPHRRTYSSQVIYNLTGQRV 1885
            |||||.|||.||:|.|||||||.|.||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:.:
  Rat  1818 LNTSDSQCLKKDNLGKWNTSGEAIDNFGVCSCSDNVQECPKFNYSPPHRRTYSSQVIYNLTGKHM 1882

Human  1886 ENYLISTANEFVQKRYGGWSFGLPLTKDLRFDITGVPANRTLAKVWYDPEGYHSLPAYLNSLNNF 1950
            |||||||||.||||||||||||:.||.|||||:|.||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1883 ENYLISTANHFVQKRYGGWSFGMKLTNDLRFDVTAVPVNRTLAKVWYDPEGYHSLPAYLNSLNNF 1947

Human  1951 LLRVNMSKYDAARHGIIMYSHPYPGVQDQEQATISSLIDILVALSILMGYSVTTASFVTYVVREH 2015
            |||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat  1948 LLRVNMSEYDAARHGIIMYSHPYPGVQDQEQATISSLIDILVALSILMGYSVTTASFVTYIVREH 2012

Human  2016 QTKAKQLQHISGIGVTCYWVTNFIYDMVFYLVPVAFSIGIIAIFKLPAFYSENNLGAVSLLLLLF 2080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||.|||||||||||||
  Rat  2013 QTKAKQLQHISGIGVTCYWVTNFIYDMVFYLVPVAFSIGVIAIFKLPAFYSGNNLGAVSLLLLLF 2077

Human  2081 GYATFSWMYLLAGLFHETGMAFITYVCVNLFFGINSIVSLSVVYFLSKEKPNDPTLELISETLKR 2145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2078 GYATFSWMYLLAGLFHETGMAFITYVCVNLFFGINSIVSLSVVYFLSKEKPNDPTLELISETLKR 2142

Human  2146 IFLIFPQFCFGYGLIELSQQQSVLDFLKAYGVEYPNETFEMNKLGAMFVALVSQGTMFFSLRLLI 2210
            |||||||||||||||||||||:||||||||||:||:|||||:|||||||||||||||||.|||||
  Rat  2143 IFLIFPQFCFGYGLIELSQQQAVLDFLKAYGVDYPSETFEMDKLGAMFVALVSQGTMFFLLRLLI 2207

Human  2211 NESLIKKLRLFFRKFNSSHVRETIDEDEDVRAERLRVESGAAEFDLVQLYCLTKTYQLIHKKIIA 2275
            ||.||||||||||||.||.|.||:||||||..|||||||||||||||||:.||||||||||||||
  Rat  2208 NEWLIKKLRLFFRKFTSSPVMETVDEDEDVHTERLRVESGAAEFDLVQLHRLTKTYQLIHKKIIA 2272

Human  2276 VNNISIGIPAGECFGLLGVNGAGKTTIFKMLTGDIIPSSGNILIRNKTGSLGHVDSHSSLVGYCP 2340
            |||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
  Rat  2273 VNNISLGIPAGECFGLLGVNGAGKTTIFKMLTGDIIPSSGNILIRNKSGSLGHVDSHSSLVGYCP 2337

Human  2341 QEDALDDLVTVEEHLYFYARVHGIPEKDIKETVHKLLRRLHLMPFKDRATSMCSYGTKRKLSTAL 2405
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|||:||||||||||||||||
  Rat  2338 QEDALDDLVTVEEHLYFYARVHGIPEKDIKETVHKLLRRLHLMAYKDRSTSMCSYGTKRKLSTAL 2402

Human  2406 ALIGKPSILLLDEPSSGMDPKSKRHLWKIISEEVQNKCSVILTSHSMEECEALCTRLAIMVNGKF 2470
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
  Rat  2403 ALIGKPSILLLDEPSSGMDPKSKRHLWRIISEEVQNKCSVILTSHSMEECEALCTRLAIMVNGRF 2467

Human  2471 QCIGSLQHIKSRFGRGFTVKVHLKNNKVTMETLTKFMQLHFPKTYLKDQHLSMLEYHVPVTAGGV 2535
            ||||||||||||||||||||||||||||:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2468 QCIGSLQHIKSRFGRGFTVKVHLKNNKVSMENLTKFMQLHFPKTYLKDQHLSMLEYHVPVTAGGV 2532

Human  2536 ANIFDLLETNKTALNITNFLVSQTTLEEVFINFAKDQKSYETADTSSQGSTISVDSQDDQMES 2598
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||:||::|
  Rat  2533 ANIFDLLETNKTALNITNFLVSQTTLEEVFINFAKDQKSYENVDTSSQGSTISVDSQEDQLDS 2595

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ABCA12XP_011509253.1 rim_protein 7..>86 CDD:130324 75/78 (96%)
rim_protein 752..2579 CDD:130324 1704/1826 (93%)
Abca12NP_001414620.1 None

Return to query results.
Submit another query.