DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG8176 and Fcho2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097723.1 Gene:CG8176 / 261329 FlyBaseID:FBgn0037702 Length:1220 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063137759.1 Gene:Fcho2 / 309129 RGDID:1565396 Length:875 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1232 Identity:352/1232 - (28%)
Similarity:512/1232 - (41%) Gaps:451/1232 - (36%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 FNDYFWGEKNNGYDVLYHNMKFGLIASKELSEFLREKSNIEEQNSKMMSKLAHKAGTLN--STFA 67
            |.:.||||||||:||||||||.|.|::|||::|:||::.|||..|:.|:|||..|...:  .|||
  Rat    52 FVENFWGEKNNGFDVLYHNMKHGQISTKELADFVRERATIEEAYSRSMTKLAKSASNYSQLGTFA 116

  Fly    68 PVWTILRTSAEKLSTLHLQMVQKLTELVKDVAKYADELHKKHKSVKEEESQTLECVQAIQTSTVA 132
            |||.:.:||.|||:..||.:|:||.||:|:|.||.:|..|.||..|||.:.|||.|||||..|.|
  Rat   117 PVWDVFKTSTEKLANCHLDLVRKLQELIKEVQKYGEEQVKSHKKTKEEVAGTLEAVQAIQNITQA 181

  Fly   133 VQKLRDLYASKVQELEKLRKDNGSHKDAEKLESKLKKLQEEYKALLDKHNPIKNEFERRMTQTCK 197
            :||.::.|.:|..|.|:|:|:..:.::.||...|.||..:.||..::|:...|.:||::||:|.:
  Rat   182 LQKSKENYNAKCVEQERLKKEGATPREIEKAAVKSKKATDTYKLYVEKYALTKADFEQKMTETAQ 246

  Fly   198 RFQEIEEVHLRQMKEFLSTYLEMLQNNHDMVGQVHSDFKRQFVDMSVDKLLEQFVLNKYTGLEKP 262
            :||:|||.||..:||.:.:....::..|..:||||.:|.....:.:::.|:::|..:|.||.|:|
  Rat   247 KFQDIEETHLIHIKEIIGSLSNAIKEIHLQIGQVHEEFINNMANTTIESLIQKFAESKGTGKERP 311

  Fly   263 EMPELEYVALSSGSRLQQPQVSASASNSNSATSIQAALRAGNAATTASGSAVSMDQRGDALAAIS 327
                                                                             
  Rat   312 ----------------------------------------------------------------- 311

  Fly   328 LGSGSAASGSIPFAE-DPILGAMGSPRPTSPDMLAGANASGIQSQPTGGATSTVKSLRSWFLPTA 391
                    |.|.|.| ||                                .|.|:.::       
  Rat   312 --------GLIEFEECDP--------------------------------ASAVEGIK------- 329

  Fly   392 KQQPSAGAGNFGMAGSGSTNNTTTTTTASNNSNNLNTNNTTATTTTTTGTNNLTTNITKNSPNSE 456
                                                                             
  Rat   330 ----------------------------------------------------------------- 329

  Fly   457 DTSNQDQTQQQPAEALTPTASATAIAAASAPGKKQLNATTSEQQLSKSLNEQEHLQQTAAATAAT 521
                                          |.|::..|                           
  Rat   330 ------------------------------PRKRKTFA--------------------------- 337

  Fly   522 TAAATTATTTTSRRATSLLNIFTSNSQVSGILRSRRDKTKTKKAKKKKDNEAAENIQEERLTSLD 586
                                       :.||:            ||:||.|:.|           
  Rat   338 ---------------------------LPGII------------KKEKDAESVE----------- 352

  Fly   587 RGNNTLLDYDDHGRSMKTQNSSGSSAGGGLAALSVTSAQGSVDSAGASSMGGSGGAAVASGSLPN 651
                                                                          .|:
  Rat   353 --------------------------------------------------------------CPD 355

  Fly   652 AGALTNSASITAPGAASGTGTGYEVDEEGFSIQPAKEIAWEEGQDKSGSFYSDSDTDSDNDKQER 716
            |.      |:..|          :||||||||:|..    .:...|...|||.||:||: |::.:
  Rat   356 AD------SLNIP----------DVDEEGFSIKPEA----NQNDTKENHFYSSSDSDSE-DEEPK 399

  Fly   717 RIHVSIKPL-KNGQAPMSASVDELRATVENISLSPTGVFSHHSQQLQAARGAPASRQQSPEISNA 780
            |..:.|||: .|......||:|||:.::.||:|||  ..|.|| .:|..|.  :|.::..:...:
  Rat   400 RYRIEIKPVHPNNVHHTMASLDELKVSIGNITLSP--AVSRHS-PVQMNRN--SSNEELTKSKPS 459

  Fly   781 STPTA----SVHPYAPL-------QSPTLSNNNNANNTTNSRYADLGDIFSELGDMSMSAPSSAT 834
            |.||.    .:..:.||       .|..|:::::|..||.   ..||.|.               
  Rat   460 SLPTEKGTNDLLAWDPLFGSSLESSSAPLTSSSSARPTTP---LSLGTIV--------------- 506

  Fly   835 LGKPPGRQIPTP--TSASTGGSIAIPRPPSRRSDMIAIGPAATGTAPGRGRMSPAPVTAMNRAES 897
               ||.|....|  ||....|...||||         ..|..|...      ||.|...:.||||
  Rat   507 ---PPPRPASRPKLTSGKLSGINEIPRP---------FSPPITSNT------SPPPTAPLARAES 553

  Fly   898 IGSLEFRTAIGGV-------------------------GSSRGPSPLTIGISDTIPLAVAFHEII 937
            ..|:....::...                         |.||||||:::|..||:|:|:|..|.:
  Rat   554 SSSISSSASLSAANTPTVEDDNLIGTLSEIEKHCETTPGVSRGPSPVSLGNQDTLPVAIALTESV 618

  Fly   938 HAYFRGSDESRCQVKVSGDMMLSFPAGIAGLLANNPNPAKLGFRIKHVQNLENLVPNGKLVQIDR 1002
            :|||:|:|.::|.||::||:.:|||:||..:..:||:||.|.||:|::..||.::||.:||..|.
  Rat   619 NAYFKGADPTKCIVKITGDVTISFPSGIIKVFTSNPSPAVLCFRVKNISRLEQILPNSQLVFSDP 683

  Fly  1003 QQSSSVSTMLEFNMGALTALLRRQAENNPTASYFNVDILKYQVRTKPGASSCPFQLVSYWKCESS 1067
            .|..|.:.....||.|:|..|::.:|.||.|||:|||:|||||.:. |..|.|..|.:||||.:|
  Rat   684 SQCDSNTKDFWMNMQAVTVYLKKLSEQNPAASYYNVDVLKYQVSSN-GIQSTPLNLATYWKCSAS 747

  Fly  1068 YTALKVDYKYNNHAMASASPLLNVTLSVPVNGSVRNVQSKPHSAWLGESNRLVWNFTDISQNSQD 1132
            .|.|:||||||..||.:.|.|.|:.:.|||:|.|.|:||.|.:.|..|..:..|..:.||:.|..
  Rat   748 TTDLRVDYKYNPEAMVAPSVLSNIQVVVPVDGGVTNMQSLPPAIWNAEQMKAFWKLSGISEKSDS 812

  Fly  1133 GGVGTLRARLELNDGPSTPALLATQFNCEGTTLSGIEFELQGSGYRLSLVKRRFVSGKYVCE 1194
            ||.|:|||:.:|::|||.||.||.||..||.||||::.||.|:||||||||:||.:|:|:.:
  Rat   813 GGSGSLRAKFDLSEGPSKPATLAVQFLSEGNTLSGVDIELVGTGYRLSLVKKRFATGRYLAD 874

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG8176NP_001097723.1 F-BAR_FCHO 11..269 CDD:153332 114/259 (44%)
PHA03307 731..>921 CDD:223039 57/227 (25%)
AP_Syp1_like_MHD 928..1194 CDD:271171 129/265 (49%)
Fcho2XP_063137759.1 None

Return to query results.
Submit another query.