DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-5 and Dnah17

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001015499.4 Gene:kl-5 / 26067054 FlyBaseID:FBgn0267433 Length:4559 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943440.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4588 Identity:2374/4588 - (51%)
Similarity:3154/4588 - (68%) Gaps:173/4588 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    12 DNRPEFFWNYLTKTMRLKLDKWTKMITTNEFRDVIIEFLNNPNKKRIIFTINSGGQLYPSYSFPV 76
            |.|.::.....:..::.|.|||:|::...|...:..||.:......::.|:|..|.:.|...||.
  Rat     3 DPRIDYLETVSSALLKFKPDKWSKLVGAEENMALFTEFFDKTENPVLVMTLNPAGIIIPCLGFPE 67

  Fly    77 RPRYKVAYFIRYLTPLHLTDENMLNSLLIGDLLPNPLANLSILCDEVFFPLLNNTVNQVGWTNVI 141
            ..:.|..|||| ..|.::|.:|....|:.||:.|.|:..|..:.:||.:.|||...|..||..|:
  Rat    68 SLKTKGVYFIR-TKPENITKDNYKTRLIYGDISPTPVDQLIAVVEEVLYSLLNQNENMDGWPRVV 131

  Fly   142 ANDMKTESQEMRNGIAQMKGLVINRTIFPLPICMD------EVMQAAPAIAMGDISVVNPLMKHS 200
            :.|:..:...::|.:..|.|.:..:|:.|:|..:.      |.|:..|:      |:.|.|: ||
  Rat   132 SEDIVKQVHRLKNEMFVMGGKIKGKTLLPIPEHLGSLDGTLESMERIPS------SLDNSLL-HS 189

  Fly   201 LEFMVVKWLDSVEDLVNIKAGEKIYSKENFPLPEAIFSFWESRLENLENLAEQLGDRRIKTIGFV 265
            :|.:::.|...:.|:::..:.:.:....: |||...|.||::||.||:.:.|||...::..|..:
  Rat   190 IETIIIDWSHQIRDVLSKDSAQALLDGLH-PLPRVEFEFWDARLMNLQCIHEQLNRPKVNKIVEI 253

  Fly   266 LEKIQSIFEHSYRRIVELVLESLAEARDITKCLSPLKRKMDKFETNDMDENRSDIRPLMLTIGLV 330
            |||.:|.:..:.:.:...|.:.|.||.||...|.||:..:::.|..|.....|.|..::.||..:
  Rat   254 LEKAKSCYWPALQNVYMNVTQGLKEANDIVLYLKPLRILLEEMEQADFTVLPSFIVKVLSTICFI 318

  Fly   331 WGHSRYFHTLNNMTLFFNLFHNSLIDCVNRTVEPDSI---FQGDVDEAYKKLDINMQHLEYYKLI 392
            |..|.:::|.:.:.:....|.|.:|:.....:.|:.:   .||:::|....:..::..|:.....
  Rat   319 WATSEHYNTPSRVIVILREFSNQIIEMTRTYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGGISQSVGVLKELFHA 383

  Fly   393 YNECRNSLKKFKIGTTFNSQ---DWTWHQDEIFGRLDKFLVRLEELKDLFNTVRDFQKLEKIVMG 454
            |:.|..::|.|     |..:   .|.:.....|.|::.|..|::.::||:.|..:|.|||||.:|
  Rat   384 YDFCCANMKLF-----FKDRPPVPWEFPSSLAFSRMNAFFHRVQTIEDLYKTAIEFLKLEKIELG 443

  Fly   455 GLKGRQITFALEKILEEYNSIYREWTNIQYNPIDPDAENSLFQRDRLSFKAKTDVMERMVSFQFE 519
            |::|..:...:.:|.:|...:.:.:...:|:|:||.  :|.|..|...|:.|...::|.::..|.
  Rat   444 GVRGNILGNLVTQIYDEVFELVKVFAECKYDPLDPG--DSSFDDDYNDFETKIQDLDRRLATIFC 506

  Fly   520 KGLEDTHD-------LLLAGSLLLRPIIKKHVEPLMHVIVDDFEEEIMCVKKEFINFKNVFTA-L 576
            :..:|.:.       |.:.|.||.||:|...|.|...|:::.|..|:       .|.|.::.| :
  Rat   507 QAFDDCNCIESSAKLLYMCGGLLERPLILVEVVPRYSVMLEMFNTEL-------DNAKLMYDAQM 564

  Fly   577 GLNE----LPTDDCFPKVSGAISFLKKLRHRIIGLHKEHELYEYPLFDNERGGYVSDIFNIMVQE 637
            ..:|    .|.....|.|:|.:.:..:|:.|:....|..:..::|:..:.....|.|.::.|:..
  Rat   565 AASEDGQIPPIHKNMPPVAGQLKWSLELQERLEVSMKYLKHIDHPVMSSVEAKLVYDKYDEMIGL 629

  Fly   638 IDDFTKMLLDKWTVECWQGIQQD----ITLTLIEKDEANEL-RVNFTERLIFALKDIKVVRL-LG 696
            :..:.:....:|.    :|:.||    :...||::|..:.| :|||::.|:..|:::|.:.. ..
  Rat   630 LKGYREKKYQQWV----EGVDQDCHFNLGQPLIQRDPFSSLIQVNFSKALVAVLREVKYLNFQQQ 690

  Fly   697 CDVSVNLTKFFCREDELWQARV-KLMRIAEWYNDTFERAHPTEKRLIAAEMILIEEQMKPLLDFI 760
            .::..:..|.| .|:|:::..| .|..|..|||:........|..||.:|:..|:.::......:
  Rat   691 KEIPSSAEKLF-SENEIFRKFVGNLELIVGWYNEIKTTVMEVEFPLIKSELEEIDVKLMSAETTL 754

  Fly   761 KWNAFSQRFIVMIFKMVKYLH---DRLVAAQENLEAIKESIRSWGKVPLFQRKDLNPALLLHTDP 822
            .||  .:..:..|.:|.:.||   :|:...::|:|.|.::::.|...|||:|||.....||..|.
  Rat   755 FWN--GENVMEYIQEMREILHNLQNRIQKTKQNIEGITQAMQEWSANPLFERKDNKKEALLDLDG 817

  Fly   823 REPILSIRAANAADTQRLIDLLMYVNLKLFFDIPRRYSLPPGEHGEEDEESDGIWPPIISLSVMT 887
            |...|:.|.|...|....|..::..|.:||                   ::|....|        
  Rat   818 RVANLNKRYAAVKDAGVRIQAMVTENAELF-------------------KADTTSQP-------- 855

  Fly   888 SVKFKKKREVIDEEDDLEEFEEEQSESEEEIITPFHRYELLKGLSQEERALFREYEIYVDEIIAE 952
                                                               :::|..|:|.::.:
  Rat   856 ---------------------------------------------------WKDYVNYIDAMVLD 869

  Fly   953 NLVDSVITSSTYL--RMEVDNRYENNTPIFEIFMELQEPNVVYFRNLDTSSKTGFAFFIETILDD 1015
            .....:..|..||  .|.:|   ||..|:|||.|||.|..:.:...|:...:..|...||.:::|
  Rat   870 EFDRFIRKSLNYLMDNMTMD---ENIAPLFEIRMELDEDGLTFNPTLEMGDEDSFLSLIEGLIND 931

  Fly  1016 MNNMMSLLKRVAQDPTEVTNMNPYSFYDELQDKSELDKQRVEIMNKIKLALQAVRVHGKGFMEFS 1080
            :.|:..|:.|:|:        ...::..:|:|.::|.:.|.|:.:.:..|::....:...|..:|
  Rat   932 LYNVARLIPRLAK--------GRINYKSDLEDITDLIEMREELSSLVIGAMKVAEEYQDSFERYS 988

  Fly  1081 SLWIWDKSTYLSEVKKFGRNLTLDERDAEADLEGSSGVKLLGLEYPPLSVYKEQLDKFIELQDQI 1145
            .||:.|...::.....||...|.:|.|.:.|       ..:....|.|:.:::|:|.:.:|.:::
  Rat   989 YLWVDDLQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTKID-------DTIPKTQPTLAQFQQQIDSYEKLYEEV 1046

  Fly  1146 RTWETYEDFFVFLRLNMTGFKVAVLSQVGQWISLFKLDLINRVKNSLKELQDFVDEANIVLKIEL 1210
            ...|..:.|..:|:.:...||.|:|:.:.:|..|||..|.:.|.|||.:|:.|:......||..|
  Rat  1047 SRCENTKVFHGWLQCDCRPFKQALLNTIKRWSLLFKRYLSDHVINSLADLESFMGVTRTGLKKPL 1111

  Fly  1211 QKDDFEGLVKILSVLNQINEKQCIYDSMFDPLKEIIDLLRQYNYEFKDTELAQINELPDAWMKVK 1275
            ::.|::|||:::..|.::.|:|...||||:|||:.|:||:.|..|..:....::.|||:.|...|
  Rat  1112 KEGDYDGLVEVMGHLMKVKERQVATDSMFEPLKQTIELLKSYGEEMPEETYLKLQELPEQWTNTK 1176

  Fly  1276 RLAATTKQLIAPIQSYQVDLIEKRILLCDNMANTYRKKFLSKKFFFVPCLSCYELIDESDLELVA 1340
            :||...||.:||:|:.:|:::.::....:...:.:|:||.....|.......|:.:::....:.|
  Rat  1177 KLAIQVKQNVAPLQANEVNILRRKCQQFELKQHEFREKFRRDAPFTFSDPDPYKSLNKQQKSISA 1241

  Fly  1341 LEERQRSLAESAVLFELQGPDPVKIELCRFDLKLVKIMWDFAITIQSTINDWKKTPWKKIDIENM 1405
            :|....:|.:|..|||:..||..:::.|..:::|:|.:||..:.:.::|:|||.|.||.|::|.|
  Rat  1242 MEGVMEALCKSGSLFEVTVPDYKQLKACHKEVRLLKELWDMIVMVNTSIDDWKTTKWKDINVEQM 1306

  Fly  1406 DQECKKFGRELRGLDKAMRTWEPFIFMEASLKNLMTSLRAVTELQNPAIRDRHWIELMQTTKVKF 1470
            |.:||||.:::|.|||.|:.|:.|:.::.::||::||||||:||||||||:|||.:|||.|:|||
  Rat  1307 DIDCKKFAKDVRSLDKEMKAWDAFVGLDNTVKNMITSLRAVSELQNPAIRERHWQQLMQATQVKF 1371

  Fly  1471 SMDDSTTLKDLIDLNLHEYEEEVKNIVDKSVKEMAMEKQLRDIATAWGTMEFGTDIHDRTSIKLL 1535
            .|.:.|||.||:.||||:||:||:|||||:|||..|||.|:.:.:.|.||||..::|.||...||
  Rat  1372 EMSEETTLADLLQLNLHKYEDEVRNIVDKAVKESGMEKVLKTLDSTWSTMEFEHELHPRTGTMLL 1436

  Fly  1536 KASEELIETLEDHQGQLQNMASSKYIAFFEHEVRLWQNRLSNADQIIGSWFEVQRKWQYLESIFI 1600
            |:.|.|:|||||:|.||||:..|||::.|..||..||.:||.||.:|..||||||.|.:||||||
  Rat  1437 KSDELLVETLEDNQVQLQNLMMSKYLSHFLKEVTSWQQKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFI 1501

  Fly  1601 GSEDIRSQLPEDSRRFDYIDKEFKALLAQMNADRNVVRSTNRSGSKLYEHLEILLKMLLLCEKAL 1665
            ||||||:||||||||||.||:|||||:.......|||.:||:.|  ||:.||.|.|.|.:|||||
  Rat  1502 GSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVVEATNKPG--LYDKLERLKKSLAVCEKAL 1564

  Fly  1666 NDYLETKRLSYPRFYFVSSADLLDILSNGNNPALVARHLTKLYDSMGKLNL---ISGS--KNAAG 1725
            .:|||||||::|||||||||||||||||||:|..|:|||:||:||:.||..   .||:  |...|
  Rat  1565 AEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHLSKLFDSLCKLKFRLDASGNPIKVGLG 1629

  Fly  1726 MVAKELEEYVPFLENCDCSGKVEVWLNRITDKMRDTLRDQLKRSLTFYDHKPRHVWIFEWPAQPA 1790
            |.:|| :||:.|.:.||.||:|||||||:.|:|..|||.::..::..|:.|||..|||::|||.|
  Rat  1630 MYSKE-DEYMDFDKECDLSGQVEVWLNRVLDRMCATLRHEIPEAVVTYEEKPREQWIFDYPAQVA 1693

  Fly  1791 LVGTQIMWTTETNDAFAKVQQRYENALKDYNKKQITQLNNLIILLLGDLTAAERQKIMTICTIDV 1855
            |..|||.||||...|||::::.||||:||||||||:|||.||.||:|:|:|.:|.||||||||||
  Rat  1694 LTCTQIWWTTEVGLAFARLEEGYENAIKDYNKKQISQLNALITLLIGNLSAGDRMKIMTICTIDV 1758

  Fly  1856 HSRDVVGTIIAKKVEVQTAFQWQSQLRHRWDPKIDDCFANICDAQFRYDYEYLGNTPRLVITPLT 1920
            |:||||..:|..|||...||.||||||||||.:...|||||||||.:|.||||||||||||||||
  Rat  1759 HARDVVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDEEKKHCFANICDAQIQYSYEYLGNTPRLVITPLT 1823

  Fly  1921 DRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYKSIGDIHKGLAQ 1985
            |||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|:|:|||||
  Rat  1824 DRCYITLTQSLHLIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGTMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKGLAQ 1888

  Fly  1986 TGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKCIQDAIKSKKQTFSFLGEHIALRTTVGVFITMNPGYAGR 2050
            ||||||||||||||||||||:||||||:||||::||:.|:||||.|:|..|||:|||||||||||
  Rat  1889 TGAWGCFDEFNRISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFNFLGEMISLIPTVGIFITMNPGYAGR 1953

  Fly  2051 AELPENLKALYRPCAMVVPDFALISEIMLVAEGFQEARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGL 2115
            .|||||||||:||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1954 TELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGL 2018

  Fly  2116 RAIKSVLVVAGALRRDDRQRPEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDVPVFMGLIGDLFPALDVPRKRNP 2180
            |||||||||||:|:|.|..|.|||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:.
  Rat  2019 RAIKSVLVVAGSLKRGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDLPVFMGLIGDLFPALDVPRKRDL 2083

  Fly  2181 EFEAVIKRSALDLKLQPEDGFILKIVQLEELFAVRHSVFIIGFAGTGKSEVWKTLNKTYQNQKRK 2245
            .||.:||:|.::||||.||.|:||:||||||..||||||:||.||:|||:|.|:|||||||.|||
  Rat  2084 NFEKIIKQSIVELKLQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSVFVIGNAGSGKSQVLKSLNKTYQNMKRK 2148

  Fly  2246 PHYNDLNPKAVTNDELFGIVNPSTREWKDGLFSILMRDQANLGGTGPKWIVLDGDIDPMWIESLN 2310
            |...||:|||||.||||||:||:||||||||||.:|||.||:...||||||||||||||||||||
  Rat  2149 PVAVDLDPKAVTCDELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLANITHDGPKWIVLDGDIDPMWIESLN 2213

  Fly  2311 TVMDDNKVLTLASNERIALTKEMRLLFEIASLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWTPFIQSWLGT 2375
            |||||||||||||||||.|.:.|||:|||:.|||||||||||||||||||.||||.|.:.||:..
  Rat  2214 TVMDDNKVLTLASNERIPLNRTMRLVFEISHLRTATPATVSRAGILYINPADLGWNPVVSSWIER 2278

  Fly  2376 RTNSSEVSMLNVLFDKYVPPLLDIFRTRLRSITPISDIARLQMTCYLLDSMLTPQNVPNDCPKDW 2440
            |...||.:.|.:|||||:|..||..|...:.|||:.:|..:|...|||:.:||.:|.|.|.||:.
  Rat  2279 RKVQSEKANLIILFDKYLPTCLDKLRFGFKRITPVPEITVIQTILYLLECLLTEKNAPPDSPKEL 2343

  Fly  2441 YEIYFVFCIVWGFGSSLFQDQIIDWSNEFSKWFLNEYKAVKFPLSGTIFSFYIDHETKKFFPWTN 2505
            ||:||||...|.||.::||||:||:..|||||::||:|.:|.|..||||.:|||.|||||.|||:
  Rat  2344 YELYFVFACFWAFGGAMFQDQLIDYRVEFSKWWINEFKTIKLPSQGTIFDYYIDPETKKFLPWTD 2408

  Fly  2506 LVPQFELDMDLPLQSNLVNTAETTRLRFFMDTLIEADHPLMLIGPSGSGKTILMNAKLSALPSDK 2570
            .||.||||.|:|||::||:|.||.|:|:|||.|:....|:||:|.:|:||::||..||..|.:|.
  Rat  2409 KVPNFELDPDIPLQASLVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWPVMLVGNAGTGKSVLMGDKLENLSTDD 2473

  Fly  2571 YSVTNVPFNFYTTSEMLQRILEKPLEKKAGRNYGPIGNKRMIYFVDDMNMPEVDKYFTVQPHTLI 2635
            |.|..|||||||||.|||.:||||||||:||||||.|.|::|||:|||||||||||.||.|||||
  Rat  2474 YLVQAVPFNFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTKKLIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLI 2538

  Fly  2636 RQFMDYHHWYDRQKMTLRDIHKCNIVACMNPSAGSFTIDPRLQRHFCSFAVNPPSQDALFHILNS 2700
            ||.||:.|||||||:||:|:|.|..||||||::||||||||||||||.|||:.|..:||..|.|:
  Rat  2539 RQHMDHRHWYDRQKLTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFTIDPRLQRHFCVFAVSFPGHEALITIYNT 2603

  Fly  2701 ILSQHMDNPIQKFDKAVIKLCENMVTTAITLHLKVVSSFLPTAIKFHYNFNLRDIANIFTGVLYS 2765
            ||:||:.  .:.....:.:||.::||.|:.||.||.::||||||||||.|||||::|||.|:|:|
  Rat  2604 ILAQHLS--YRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATFLPTAIKFHYIFNLRDLSNIFQGILFS 2666

  Fly  2766 NSETCPNSNQMIRLWIHECYRVYGDKLVDYTDINSFKKIVSDIVRKGIEGVNDDVVYAQPLIYCH 2830
            ..|.......::|||:||..||||||:||..|..:.:::.....:|..:.:.::.::|:|.|:||
  Rat  2667 TLEILRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRVTMASTKKFFDDLGEEHLFAKPNIFCH 2731

  Fly  2831 FAKGLTDIKYMPISGWDRLKSLLDEAQDRYNDYIGAMNLVLFDDAMSHVCRISRILESSRGYALL 2895
            |.:|:.|.||.|::....|..||.:..|.||:....||||||:||::|:|||:|||||.||.|||
  Rat  2732 FTQGIGDPKYFPVTDVAHLNKLLKDVLDSYNEVNAVMNLVLFEDAVAHICRINRILESPRGNALL 2796

  Fly  2896 IGVGGSGKQSLTRLASFISSLDVFQIQLTKDYSVSDLKANIATLYMKAGVKTSACCFLMTDSEVA 2960
            :||||||||||:|||::||:||||||.|.|.|::.|||.::|..|:|:.||.....||||||:||
  Rat  2797 VGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQITLKKGYAIPDLKMDLAAQYIKSAVKNVPSVFLMTDSQVA 2861

  Fly  2961 REQFLVLVNDLLASGDIHELFPDDEVENIVNAVRNEVKQLGIVDNRENCWKYFIEKVRSLLKVVL 3025
            .||||||:|||||||:|..||.||::|||::::|.:||.||:.|.||.|||:||||||..|||:|
  Rat  2862 EEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDDDLENIISSMRPQVKSLGMTDTREACWKFFIEKVRKQLKVIL 2926

  Fly  3026 CFSPVGATLRVRSRKFPALVNCTTIDWFHEWPQQALESVSLRFLSEITVLPKELALPVSNFMAFV 3090
            ||||||:.||||:|||||:||||.||||||||:.||.|||.|||.|...:..|:...:|.||::|
  Rat  2927 CFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCTAIDWFHEWPEDALVSVSARFLQETQGIQPEVKTSISLFMSYV 2991

  Fly  3091 HKTVNDISKLYLANAKRYNYTTPKSFLELIALYSKLLHEKVKANLDRRLRLENGLIKLASCTKEV 3155
            |.|||::||.|||..:||||||||:|||.|.||..||.:|....:.:..||||||:||.|...:|
  Rat  2992 HTTVNEMSKTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAKIERLENGLMKLQSTASQV 3056

  Fly  3156 DALQDVLKVQEVELKIKNQEADNLIIVVGTENEKVSKERAFASKEEKNVRQIEEDVTAKAKLCEE 3220
            |.|:..|.|||.|||.||:.||.||.|||.|.||||||:|.|.:||..|..|.::||.|.|.||.
  Rat  3057 DDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEIKVEVINKNVTEKQKACET 3121

  Fly  3221 DFLKAQPALIAAQEALNTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVSVCGAVLVLFSSKGKIPKDRSWKACRA 3285
            |..||:|||:||||||:|||||||||||||||||||||:|..||::|.:..||||||:||||.:.
  Rat  3122 DLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMILTAPGGKIPKDKSWKAAKI 3186

  Fly  3286 FMGNVDKFLDNLINYDKKHIHPDVIKALQPYILDAEFSPEKILAKSSAAAGLCSWVININRFYDV 3350
            .||.||.|||:|..:||:||....:||.:||..:..|.||.|.:||:||||||||.|||.|||:|
  Rat  3187 MMGKVDTFLDSLKRFDKEHIPEACLKAFKPYQGNPTFDPEFIRSKSTAAAGLCSWCINIVRFYEV 3251

  Fly  3351 YLVVEPKERALLESEKEVKDARDKLTALNLRLTELEEQLNALQMEYDEALAKKQKCQDEASKTAF 3415
            |..|.||.:||.|:..|:.:|:|||:.:..::.||...||.|...:::|.|:|.|||.||..|..
  Rat  3252 YCDVAPKRQALEEANAELAEAQDKLSRIKNKIAELNANLNNLTSAFEKATAEKIKCQQEADATNR 3316

  Fly  3416 TIDIANRLIGGLATEKIRWMESVKVLTFGIQQLPGDILIISCFISYVGCFTRAYRQELQEKLWMP 3480
            .|.:||||:||||:|.:||.|||:........|.||:|:||.|:||||.||:.||.||.||.|:|
  Rat  3317 VISLANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTLCGDVLLISAFVSYVGYFTKKYRNELMEKFWIP 3381

  Fly  3481 AFKNSQPPIPSTDGVDPFEMICDDAQIAEWNNQGLPSDRMSAENAAILVQSERYPLMIDPQLQGI 3545
            ...|.:.|||.|:|:||..::.|||.:|.||||||||||||.|||.||..:||:||::|.|||||
  Rat  3382 YVNNLKVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQGLPSDRMSTENATILCNTERWPLIVDAQLQGI 3446

  Fly  3546 KWVKTKYGTGLVVLRLSQRNYLDQVERAVSNGSVLLIENIGENIDPVLNPLLGRQLIKKGTVLKI 3610
            ||:|.|||:.|..:||.|::|||.:|:|:|.|..||||||||.:||||:|||||..||||..:||
  Rat  3447 KWIKNKYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEGDTLLIENIGETVDPVLDPLLGRNTIKKGRFIKI 3511

  Fly  3611 GDREIDFNSRFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKVERPDLEAMRT 3675
            ||:|::::..||||||||..|||||||||||.|||||.||||||||||||.||..||||||.::.
  Rat  3512 GDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQAQCTLINFLVTRDGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKA 3576

  Fly  3676 RLTQQQNHFKITLKFLEDDLLARLSSAGDNVLEDVTLVMNLEKTKKTADEIEVKVAEAKITGVQI 3740
            .||:.||.|||.||.|||.||||||:|..|.|.|..||.|||.||.||:|||.||.|||||..:|
  Rat  3577 NLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGNFLGDTALVENLETTKHTANEIEEKVQEAKITETKI 3641

  Fly  3741 DSAREAYRPAAERASIIYFILNDLFKINPIYQFSLKAFTVVFNNAMLKAMAAEKLKDRVENLIDS 3805
            :.|||.|||||.|||::|||||||.|||||||||||||.|||..|:.|...||:::.||.||.|.
  Rat  3642 NEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPIYQFSLKAFNVVFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDE 3706

  Fly  3806 ITFCSFVYTSRGLFEQDKLIFLTQLCIQILVNLGEVEPTELDFLLRFPYMPNQTSNFTWLTHVGW 3870
            ||:..::||:|||||:||||||.|:..|:|....|:.|.|||||||||:.....|...:|.|..|
  Rat  3707 ITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVLSMKKELNPVELDFLLRFPFKAGVVSPVDFLQHQSW 3771

  Fly  3871 GGIRALNNQAVFKGLEKDIEGSHKRWKKFVDSESPENEKFPGEWKGKSAIQRLCIMRCIRPDRMS 3935
            |||:||:....||.|:.|||||.|||||.|:||:||.|.||.|||.|:|:|:||::||:|||||:
  Rat  3772 GGIKALSEMDEFKNLDSDIEGSAKRWKKLVESEAPEKEIFPKEWKNKTALQKLCMVRCMRPDRMT 3836

  Fly  3936 YAMRSFIEEKLGSKYIDARSMEFSRTFEESSPETHIFFVLSPGVDPLKDVEKLGKSLGFSFDHEN 4000
            ||:::|:|||:|||:::.||:|||:::|||||.|.|||:||||||||||||.|||.|||:.|:..
  Rat  3837 YAVKNFVEEKMGSKFVEGRSVEFSKSYEESSPSTPIFFILSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNGK 3901

  Fly  4001 FHSVSLGQGQEIVAENAIEIASQYGHWVILQNIHLVARWLPSLEKKMESSLSNVHTSYRLFLSAE 4065
            .|:||||||||:|||:|:::|::.||||||||||||||||..|:||:|...|..|..||:|:|||
  Rat  3902 LHNVSLGQGQEVVAEDALDVAAEKGHWVILQNIHLVARWLSILDKKVERYSSGSHEDYRVFISAE 3966

  Fly  4066 PAGDPAAHILPQGILESAIKITNEPPTGMMANIHKALDNFSDETLEMCSKETEFKAILFSLCYFH 4130
            ||.....||:||||||:||||||||||||.||:|||||.|:.:|||||:||.|||.|||:|||||
  Rat  3967 PAPSVETHIIPQGILENAIKITNEPPTGMYANLHKALDLFTQDTLEMCTKEIEFKCILFALCYFH 4031

  Fly  4131 AVVAERRKFGPQGWNRSYPFNVGDLTISVYVLYNYLEANTRVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWD 4195
            ||||||||||.||||||||||.||||||:.|||||||||.:|||:||||||||||||||||||||
  Rat  4032 AVVAERRKFGAQGWNRSYPFNNGDLTISINVLYNYLEANPKVPWDDLRYLFGEIMYGGHITDDWD 4096

  Fly  4196 RRLCRTYLEEFMQPELIDGELEYCQGFPAPGILKYTGYHNYIDDNLPSESPSLYGLHSNAEIGFL 4260
            ||||||||.||::.|:::||:....||..|..|.|.|||.|||:|||.|||.|||||.|||||||
  Rat  4097 RRLCRTYLIEFIRVEMLEGEVLLAPGFQIPPNLDYKGYHEYIDENLPPESPYLYGLHPNAEIGFL 4161

  Fly  4261 TTVSERLFRIVFELQPRMTGGSSGGETVSQEDIIKNIIEDILDKTPTPFNILELMGRVEDRSPYI 4325
            |..||:|||.|.|:||:.| .|..|..||:|:.:|.:::|||:|.|..||:.|:|.:..:::||:
  Rat  4162 TVTSEKLFRTVLEMQPKET-DSGAGTGVSREEKVKAVLDDILEKIPETFNMAEIMAKAAEKTPYV 4225

  Fly  4326 IVAFQECERMNNLMTELKRSLNELDLGLKGELTISSVMEDLMVCLYMDQVPEQWTKLAYPSMLGL 4390
            :||||||||||.|..|::|||.||:|||||||||::.||||...|:.|.|||.|...|||||:||
  Rat  4226 VVAFQECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMEDLSTALFYDTVPETWVARAYPSMMGL 4290

  Fly  4391 QSWFSDLMLRLRELEGWVADFRMPSSIWLAGFFNPQSLLTAIMQQTARKNEWPLDRMCLNCDVTK 4455
            .:|:|||:.|:||||.|..||.:|:::||||||||||.||||||..|||||||||:|||:.:|||
  Rat  4291 AAWYSDLLQRIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDKMCLSVEVTK 4355

  Fly  4456 KWKEELTTAPREGAYINGLFMEGARWDMKMGTIADAFLKELFPAMPVLYIKAVTQDKQDIKNVYE 4520
            |.:|::|..||||:|:.||||||||||.:.|.||:|.||:|.|.|||::|||:..|:.:.||:||
  Rat  4356 KTREDMTAPPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGVIAEAKLKDLTPVMPVIFIKAIPVDRMETKNIYE 4420

  Fly  4521 CPVYKIRLRGPTFVWTFNLKSRERASKWTLAGVCLLLQ 4558
            |||||.|:||||:|||||||::|:|:||.||.|.||||
  Rat  4421 CPVYKTRIRGPTYVWTFNLKTKEKAAKWILAAVALLLQ 4458

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-5NP_001015499.4 DHC_N1 198..763 CDD:462457 141/589 (24%)
DHC_N2 1365..1769 CDD:462462 232/408 (57%)
DYN1 1591..4206 CDD:227570 1699/2619 (65%)
AAA_6 1903..2229 CDD:463697 277/325 (85%)
MT 3140..3480 CDD:463699 192/339 (57%)
AAA_9 3508..3726 CDD:463702 146/217 (67%)
Dynein_C 4261..4557 CDD:465677 177/295 (60%)
Dnah17XP_038943440.1 DHC_N1 187..764 CDD:462457 143/599 (24%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:462462 232/408 (57%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 1705/2635 (65%)
AAA_6 1806..2132 CDD:463697 277/325 (85%)
MT 3040..3383 CDD:463699 193/342 (56%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:465677 177/295 (60%)

Return to query results.
Submit another query.