DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-3 and Dnah2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001104482.3 Gene:kl-3 / 26067053 FlyBaseID:FBgn0267432 Length:4593 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008766120.1 Gene:Dnah2 / 303242 RGDID:1565087 Length:4508 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4737 Identity:1409/4737 - (29%)
Similarity:2365/4737 - (49%) Gaps:486/4737 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    73 GIDPEEIVTGIVDESKY----VENVNGIFEEKGP---------MAIMISNATMLGY--PTDSGRY 122
            |::.|.....|:.|.:|    .|:...:.|.:.|         ..|.:|.|.:.|.  .|.:..:
  Rat    33 GVEKETSQLPIIPEPEYEPMKEESEQDLEEPEEPKEPDLSTDVKPIFLSRAMLTGLADSTWTAEH 97

  Fly   123 QEKLKYTEIQRSVCLRSDLVDLIGKWTVVYRLNNEKSIDNRSVSDEVAIFMISAEERNSCLNVVK 187
            ...|::.....||.:.:..||      .|:.|..|..              :..:.:|..:..::
  Rat    98 DAVLEHFAQDPSVPVLTIFVD------PVFGLKLELG--------------MPVQTQNQIVYFIR 142

  Fly   188 TFMDHVLKPSIEAVTEFGLAEKEQTQKFFHILN-MYNTFLKSSEATVSSRVNFDIS--HELFKGL 249
            .....:...:.|...::|............:|: :|...:..:::...|..|..:|  |.....|
  Rat   143 QAPVPITPENFEETVQYGTVRGAYIPALLRLLSGVYVPQIFMNKSWPESIRNHFVSHLHRFLASL 207

  Fly   250 LLVRWQIEASS-----------------KILTRVRLVERYFEQWLRQIQGILVEGKQIQRDT-PD 296
            ...|:::|..:                 |....|:.:|.....|.|||:.:|...:.:  || .:
  Rat   208 TDTRYKLEGHTVLYIPAEAITMDPAVVIKDKELVQRLETSMIHWTRQIKEVLSAQESV--DTGEN 270

  Fly   297 VGPLQMLVNWRRMLARYTTITEFVTSRAFNNHKDCLTLSRSSKLLNRWAEIDNQVTLALNEAKDN 361
            :|||:.:..|.......:.|::.:..:...:.:..|.|::|| .|..:.::..|:.....:|:.|
  Rat   271 LGPLEEIEFWNNRCMDLSGISKQLVKQGVKHIESILLLAKSS-YLAPFRKLAQQIQDGSRQAQSN 334

  Fly   362 VRYISSLQKFWDPLYRSSPNVIISSLPGLMVAIRNVSKTAHYFNTPVNVTGLMVKISNQ------ 420
            :.::|.|::.:..|....|..|...||.|:..||.:...:.::||...:|||..|:||:      
  Rat   335 LTFLSILREPYQELAFMKPKDISDKLPKLISLIRIIWVNSPHYNTRERLTGLFRKMSNEIIRLCC 399

  Fly   421 ----LTITSKNYITDNEHS-----KVMENYKNIYIHTVDEMKNSNERPWTVSSVYILTCLQKFLQ 476
                |....:.|::.::..     .....:|..|:..|......:.|.|.:....|...:..|:|
  Rat   400 HSVSLDRIFEGYVSSSKEDLQGCISCCHAWKEHYLRAVQMHTQFSNRGWVLDQTSIFAQVDAFVQ 464

  Fly   477 RLEKV-----------KWIANT-------------DITYSIL--DRIMISGMERFNAMIKGARMT 515
            |.:.:           :|:..|             .||.::|  :.|....::...|:..|.   
  Rat   465 RCKDLIEVCDCQYHFARWLDGTQGPLPCFFGAQGPQITRNLLEIEDIFHKNLQTLRAVRGGI--- 526

  Fly   516 ISSQLYDPLNYRIETFDLDFEKFVNEVEEAEVGMQQFVKLLSTECPSAASVMLVLKRFEAL-SLE 579
                    |:.:..::..|:.||...:::.||..|..:.............:|:|..|..| :.|
  Rat   527 --------LDVKNTSWHEDYNKFRAGIKDLEVMTQNLITSAFELVRDVEHGVLLLDTFHRLANRE 583

  Fly   580 CL--CLDRRYLEVAEMLEREMFLLKDVYNEERGNPFIPRNLPPVAGRIIWIRSIFKKIDLPMQAL 642
            .:  ..:::.:::..:...|:.|:....|::.  |::...:...:|:..|:|.:.::||..|..|
  Rat   584 AIMRTYEKKAVDLYMLFNSELALVNRELNKKW--PYLEPYMAQYSGQAHWVRILRRRIDRVMNCL 646

  Fly   643 KLRQCVLAHKKAQRTVRYYNYMNGIICHYEMAYHKAWFDYVEEVRCL--LNAPIMTINKEEA-IY 704
            .....:......:.||..|..|...|........:.|...::: .|:  |:.|::.|::|:| :.
  Rat   647 SGAHFLPHIGTGEETVHTYQQMVQAIDELVRKTFQEWTATLDK-DCIRRLDMPLLRISQEKAGML 710

  Fly   705 IVNIDRAILQLISETEWMWKLNLEVPNMAATITYCKDRLLGPATTLKLMLQRYDRLRTSLTPVFI 769
            .||.|:.:|.|..|.::..:|..|.|:....:....:.|......|.|:.:.|:|:...|:|...
  Rat   711 DVNFDKTLLILFVEIDYWERLLFETPHYVMNVADRAEDLRILRENLLLVARDYNRIIAMLSPDEQ 775

  Fly   770 NIMRFRLQEISILLKPSLSTVTWISENLEDYVEKVC----MKIKEVETFFNLILDIEDLRILQEM 830
            .:.:.|::.:...:.|.|..:.|..:....:....|    .|::.:...|.    ...|.|..:.
  Rat   776 ALFKERIRFLDKKIHPGLKKLNWALKGASAFFITECRIHASKVQMIVNDFK----ASTLTIGWKA 836

  Fly   831 YSISDYLYIYVPEEPV-SSYEFVEESNKLRSEIERILEKKSVCMERAVVDIINMFIDLLDFEQTD 894
            ..:|:.|.:::..:.| ...||.|...:.|..:    ::|.|.:.:   |:||:..:..:..:.|
  Rat   837 QEMSELLLVHITGKQVYRDLEFEEAQREHRMAV----QQKLVNLHQ---DVINILTNSFEVFKND 894

  Fly   895 SKGRRVFQLPPEKLNDTNWRTEGFLPIDKWDFIQFHKIYRTIYL--APEDVLRTLQFRNYENIRY 957
            .         ||                    ||...:..||.|  ..||.||.       |:::
  Rat   895 G---------PE--------------------IQQQWLLYTIRLDHMMEDALRL-------NVKW 923

  Fly   958 ELYHLRNDCMDLFSYYNSKIILALVAGSKRSLDFVRQNILRTNWRTNPM---KPILHTDL----- 1014
            .|..|            ||   |:....|.|              .||:   ..||.:|:     
  Rat   924 SLLEL------------SK---AINGDGKTS--------------PNPLFRVLVILQSDVQGGGA 959

  Fly  1015 EIDFYNGCYIQPNLEIMQ---NDFNNAVLCCTEINYFVSTWGKQAKTQERRDRRVTVDENKYERS 1076
            :::|      .|.|:.:.   ||..:.:.  :.|:.|             |.....:.:.|..|.
  Rat   960 QVEF------SPTLQTLASVVNDIGSHLF--STISVF-------------RHLPDILTKRKMTRE 1003

  Fly  1077 YFRYVMEHKDVIRAVQ-NLANGLLSYKSDMEEFQRDMFEKYKYLWAEDREDIINSFVLTNPLTVD 1140
            ....|:|..:.||.:| .:::|:.:..|.::.:.: .::.|:.:|..:::..|..:...||....
  Rat  1004 PIHVVVERDEDIRKIQAQISSGMTNNASLLQNYLK-TWDMYREIWEINKDSFIRRYQRLNPPVSS 1067

  Fly  1141 IRDMFLHYDNISLKIETMSAKRIIGPIEVRMGSTIEKLVSESKKWKVLLGHLLSVQYKKQLDEMI 1205
            .......|..::..::.......|..:.:........||....:|:.....||......:|.::.
  Rat  1068 FDADIARYTEVANNVQKEETVLNIQFVMLDCSHLKFSLVQHCNEWQNKFTTLLKEMAAGRLMDLH 1132

  Fly  1206 EFITEQNNILDKPINDLDDVRQAMVVLEKVRDNYIEMDVSLQLITDTYSLFSQFYIYVPQEDYDK 1270
            .::.:....:.:|...|:::..::.:::.::.:...::..:..|.:.:::..::.:.||....:.
  Rat  1133 TYLKDNAEKISRPPQTLEELGVSLQLMDTLQHDLPNLETQIPPIHEQFTILEKYEVPVPDTVLEM 1197

  Fly  1271 VEGLQ---VLFNKMLENAKKVSDRISE-MEEPLLRELNDGIATFVQEFYDFNLDFDLNGPMVEGI 1331
            :|.|.   :.|.::|.:::::..:..| .:..|:...:|    |.::.::...||:|.||....:
  Rat  1198 LESLNGEWLTFQQILLDSEQMLKKHKEKFKTGLIHAADD----FKKKAHNLLEDFELKGPFTSNV 1258

  Fly  1332 SAKEASD-----RVFLFQNRFDELWRKFEMYSSGEKLFGLPITDYPL---LHQRKREFNYLNRLY 1388
            ....|.|     |..|...|.:|        |:.....|:...:.|:   |...::|.:.|.:::
  Rat  1259 GHTAALDQIAQVRAMLMAMREEE--------SNLRSNLGIFKIEQPISKDLQNLEKELDALQQVW 1315

  Fly  1389 SLYIQVLKTITDYYEMPW--------ADVNIEKISAELSDFQLRCRKLPKGM--QSWPAFIDLKT 1443
            .        ||..:|..|        ..:..|.:.:.......|..:|.|..  ::|......:.
  Rat  1316 E--------ITRDWEESWNQWKTGCFLTLQTEAMESMAHGLFRRLTRLAKEYKDRNWEVIETTRA 1372

  Fly  1444 KIDDFNETCPLLELMTNKAMKERHWIRLNALFNTDFDPTNPKFTLGKLLEAPILKYKEDVEDICV 1508
            ||:.|..|.||:..:.|.|::||||.::......:||..:..|||.::::..:.::.|.:.:|..
  Rat  1373 KIEQFKRTMPLISDLRNPALRERHWDQVKEEIQREFDQESESFTLEQIVKLGMDQHVEKIAEISA 1437

  Fly  1509 GASKELDIEAKLKQIVSDWSLVSLQLGQFKNRGDLVLKGGETLEIISSLEDSLMIMNSLASNRYN 1573
            .|:|||.||..|:.|...|....|.:..:|::|...|:|.|  |:..:|||:.:.::::.::|:.
  Rat  1438 SATKELAIEVGLQNIAKTWDSTQLDIVPYKDKGHHRLRGTE--EVFQALEDNQVALSTMKASRFV 1500

  Fly  1574 APFKKDIQLWLSKLVNTGDILEKWLMVQNLWIYLEAVFVGGDISKQLPMEAKRFTNIDKSYVKIM 1638
            ..|:||:..|...|....:::|..|.||..|:|||.:|:|.||.||||.|:..|..::.::..||
  Rat  1501 KAFEKDVDHWERCLSLILEVIEMVLTVQRQWMYLENIFLGEDIRKQLPNESALFDQVNNNWKGIM 1565

  Fly  1639 MRAREIPNAVDCCTGDESLATNLTWLLDQ-------LETCQKSLTGYLESKRLVFPRFFFVSDPV 1696
            .|..:..||:        .:|:...||:.       ||..||||..|||:||.:||||:|:|:..
  Rat  1566 DRMNKDNNAL--------RSTHYPGLLETLIEMNTILEDIQKSLDMYLETKRHMFPRFYFLSNDD 1622

  Fly  1697 LLEILGQASDPTSIQPHLLSIFDAIATVDFQE--------KSIDIIESMNSMNREKVKFENTVQC 1753
            |||||||:.:|.::||||...||.|..:..|:        :::    .|.|.:.|.:.|.:.|..
  Rat  1623 LLEILGQSRNPEAVQPHLKKCFDNIKLLKIQKVGGSSSKWEAV----GMFSGDGEYIDFLHPVLL 1683

  Fly  1754 LGSVELWLGRLLKEMQDTIRTILAQMSVSLNDPEF-NFAEEF-PSFCGQAGVVGVQLLWTKDSEY 1816
            .|:||.|||.:.:.|:.|:|.:|....::|.  :| |..::: ..:.||..:...|:.||.|   
  Rat  1684 EGAVESWLGDVERAMRMTLRDLLRNCRMALK--KFLNKRDKWVKDWAGQMVITASQIQWTAD--- 1743

  Fly  1817 ALRKC------RTDKTIMKRTNNKFLVLLNFFIDLTVKDLTSLDRIRFETMVTIHVHQRDIFDDL 1875
             :.||      |:||.|:|....|.:.:||.:.:....:||.:.|::...:|||.:|.||:.:.|
  Rat  1744 -VTKCLMTAKERSDKKILKVMKKKQVSILNKYSEAIRGNLTKIMRLKIVALVTIEIHARDVLEKL 1807

  Fly  1876 CTLRIKSAGDFEWQKQARFYYNEDNDDVIVGITDVNFVYQNEYLGVTERLAITPLTDRCYITLAQ 1940
            ....:.....|:|..|.|||:.:|.||.|:..|:..|.|..||||.:.||.|||||||||:||..
  Rat  1808 YKGGLMDVNAFDWLSQLRFYWEKDVDDCIIRQTNTQFQYGYEYLGNSGRLVITPLTDRCYMTLTT 1872

  Fly  1941 AVGMCMGGAPAGPAGTGKTETTKDMGRALGKLVVVFNCSDQMDFRGLGRIYKGLAQSGSWGCFDE 2005
            |:.:..||:|.||||||||||.||:|:|||..|:|.|||:.:|::.:||:|.||||:|:||||||
  Rat  1873 ALHLHRGGSPKGPAGTGKTETVKDLGKALGTYVIVVNCSEGLDYKSMGRMYSGLAQTGAWGCFDE 1937

  Fly  2006 FNRIELPVLSVAAQQIYIVLTARKEKRSTFIFLDGDIVSLNPEFGIFITMNPGYAGRQELPENLK 2070
            ||||.:.||||.||||..:|:|.....:.|.| :|..::|....|||||||||||||.|||||||
  Rat  1938 FNRINIEVLSVVAQQILSILSALTANLTRFYF-EGFEINLVWSCGIFITMNPGYAGRTELPENLK 2001

  Fly  2071 IMFRTVAMMVPDRQIIIRVKMASCGFKENVVLSRKMYTLYKLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLR 2135
            .|||.:||:|||..:|..:.:...||....:|::|:||||.|..:|||:|.|||||||.:.|:||
  Rat  2002 SMFRPIAMVVPDSTLIAEIILFGEGFGNCKILAKKVYTLYSLAVQQLSRQDHYDFGLRALTSLLR 2066

  Fly  2136 TLGSQKRSNPNDTEETIVMRVLRDMNVSKLIDEDEGLFVSLVDDMFPGIKLTTNVYKDLQKAIIK 2200
            ..|.::|..|:.|:|.:::..:||||::||...|..||.::|.|:||.|:|....|..|:..|.:
  Rat  2067 YAGKKRRLQPDLTDEEVLLLSMRDMNIAKLTSVDVPLFNAIVQDLFPNIELPVIDYGKLRDTIEQ 2131

  Fly  2201 VCDELGYVNNPEWNLKVVQLYETSLVRHGLMLMGPTGSGKTSCTVCMLRCFTEMGRTH------- 2258
            ...|:|....|....||:|||||...||..|::|.|||.||:....:....|.:.|..       
  Rat  2132 EIREMGLQITPFTLTKVLQLYETKNSRHSTMIVGGTGSSKTTSWRILQASLTSLCRAGEPNFNIV 2196

  Fly  2259 KEMRMNPKAITAPQMFGRLDVATNDWTDGIFSTLWRRSLKVPQHQNCWIVLDGPVDAVWIENLNS 2323
            ||..:||||::..:::|..|:.||:|||||.|::.|.:....:....||:.|||||.:|||::||
  Rat  2197 KEFPLNPKALSLGELYGEYDLNTNEWTDGILSSVMRAACADEKPDEKWILFDGPVDTLWIESMNS 2261

  Fly  2324 VLDDNKTLTLANGDRIKMADNSKLVFEPDNVDNASPATVSRVGMVFTSSSVLSWKIYMEAWLLKQ 2388
            |:||||.|||.||:||.|.:...|:||.:|:..||||||||.|||:|....|.|..|:::||.|:
  Rat  2262 VMDDNKVLTLINGERIAMPEQVSLLFEVENLAVASPATVSRCGMVYTDYVDLGWTPYVQSWLEKR 2326

  Fly  2389 GE-DSEVFRRCYDVLYDDAHVFLQSRLLAKMRILE---AIYIRQMLDIM----DGLLLDLPLRTE 2445
            .: :.|..:|.::...:....|.:......:.:.|   .|.:.::..::    :|:   .|..||
  Rat  2327 PKAEIEPLQRMFEKFINKILTFKKDNCNELVPVTEYSGIISLCKLYTVLATPENGV---NPADTE 2388

  Fly  2446 K---ALERIFLFSLMWSLGAVLELSEREKLEEFLLKHVSKLRWPKRGVNETIFEYYVDDNGNWQH 2507
            .   .:|..|:||::||:.|.::...|:|::.:|.:....  :|.:   :|::||||  |...:.
  Rat  2389 NHAFMVEMTFVFSMIWSVCASVDEDGRKKIDSYLREIEGS--FPNK---DTVYEYYV--NPKMRT 2446

  Fly  2508 WSTRVEE----FRYPEDEIPEFSSILVPNVDNVRTAFLLHNIAKQLKQVLLIGEQGTAKTVMIKA 2568
            ||:..|:    :|||.:  ..|..|:||.||.||..:|:..:......|||:|..||.||.:.::
  Rat  2447 WSSFEEQLPKSWRYPPN--APFYKIMVPTVDTVRYNYLVSTLVANQNPVLLVGPVGTGKTSIAQS 2509

  Fly  2569 YMGHYDPEVHIFKSFNFSSATTPNMYQRIIESYVEKRQGTTYGPPNQRAMTIFIDDINMPVINEW 2633
            .:.............|.|:.||.|..|.||||.||||....|.|...::|..|:||:|||..:.:
  Rat  2510 VLQSLPSSQWSVLVVNMSAQTTSNNVQSIIESRVEKRTKGVYVPFGGKSMITFMDDLNMPAKDMF 2574

  Fly  2634 GDQITNEIVRQMIEQRGFYSLERPGDFSTIMDIQMLSAMIHPGGGRNDIPNRLKRHLCIFNCTLP 2698
            |.|...|::|..|:. ||:..........|.|:.:::||..|||||..|..||:....|.|.|.|
  Rat  2575 GSQPPLELIRLWIDY-GFWYDRVKQTIKHIRDMFLMAAMGPPGGGRTVISPRLQSRFNIINMTFP 2638

  Fly  2699 SNNSMDQIFKSIGAGYFSPDRLGDEVVEVIPL---LVPLTRIFWQNVKAKMLPTPANFHYVFNLR 2760
            :.:.:.:||     |.....:|.|...||.|:   :...|...:..|..:.|||||..||:||||
  Rat  2639 TESQIIRIF-----GTMINQKLQDFEEEVKPIGNVVTEATLDVYNTVVQRFLPTPAKIHYLFNLR 2698

  Fly  2761 DLSRIWEGILKVKHEECKSVDQILKLWCHECTRVISDRFTAEKDKIWF----SSKMISDAELNIK 2821
            |:|::::|:|:...:...:...|.:||.|||.||.|||.....|...|    |.|:.:..:|.  
  Rat  2699 DISKVFQGMLRANKDFHDTKASITRLWIHECFRVFSDRLVDTTDMEAFIGILSDKLGTFFDLT-- 2761

  Fly  2822 EFMEFYP-EEPTYWVDFLRDAPEGQEEEDEEMSFEPPKIYEEIPSFDFVRSKVLVFMSQFNEYIR 2885
             |....| :.|..:.|||::                ||:||::.....:::.:...::::|....
  Rat  2762 -FHHLCPNKRPPIFGDFLKE----------------PKVYEDLVDLSVLKTAMETALNEYNLSPS 2809

  Fly  2886 GYNMDLVFFMDALKHLMIVSRIISNPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLSSFIAGYKFFQMTLTRSYN 2950
            ...|.||.|.:|::|:..:.|:|..||||.||||:||||:|||.||:|.|..|..||:.:|:.|.
  Rat  2810 VVQMQLVLFREAIEHITRIVRVIGQPRGNMLLVGIGGSGRQSLARLASSICEYNTFQIEVTKHYR 2874

  Fly  2951 TGNLTEDLKFLYRTAGLDGNGMTFIFTANEIKEESFLEFINNILSSGEIANLFAKDELDEMYSEL 3015
            .....:|:|.|||.||::....:|:|...:|.:|||||.|||||||||:.||:..||.:|:.:::
  Rat  2875 KQEFRDDIKRLYRQAGVELQATSFLFVDTQIADESFLEDINNILSSGEVPNLYKADEFEEIQNQI 2939

  Fly  3016 IPVMKKHQPRRPATQDNLYDFFISRARYNLHIALCFSPVGEKFRMRSLKFPGLISGCVIDWFQKW 3080
            |...:..|...  :.|:|:.:.|.|.|.||||.||.||||:.||....::|.|::...|:||.:|
  Rat  2940 IDQARAEQISE--SSDSLFAYLIERVRNNLHIVLCLSPVGDPFRNWIRQYPALVNCTTINWFSEW 3002

  Fly  3081 PEDARIAVSRHYLTDYQIVCSEKVKDQVIDIMSWIHESVQETCLSYYDRFRRVTFVTPKSLISFL 3145
            |.:|.:.|:..||....:...|.:..:|..|...:|.||.:.........||..:|||.:.:..:
  Rat  3003 PREALLEVAEKYLVGVDLGTQENIHRKVAQIFVTMHWSVAQYSQKMLLELRRHNYVTPTNYLELV 3067

  Fly  3146 ESYKLLYKDKQDHIVIMSERMSSGLDKLDEAGASVAILKKDLIEMNKVIALASEEAEDVLATV-- 3208
            ..||.|..:|:..::..:.::.:||.|:||....|.::..:|.:..|.:|...::.|:.|..:  
  Rat  3068 SGYKKLLGEKRQELLDQANKLRTGLFKIDETREKVEVMSLELEDAKKKVAEFQKQCEEYLVIIVQ 3132

  Fly  3209 ------EQSKA-AAEIVKVEVAEKKGQAEVLVKNISAVKHVAEAKLEKALPALEEAEAALKTIKA 3266
                  ||.|| .|...|:.:.|.|.||  |..|       |:..||:||||||||..||:::..
  Rat  3133 QKREADEQQKAVTANSEKIAIEEVKCQA--LADN-------AQKDLEEALPALEEAMRALESLNK 3188

  Fly  3267 ADIATVRKLGKPPYLITLIMDCVCILFRRKVKPIRPDTEKAFIQSSWDESLKVMSDTSFLRKIVE 3331
            .||..::..|:||..:.::|..|.||  |..:|            :|.|:.:.:.:.:|::.::.
  Rat  3189 KDIGEIKSYGRPPAQVEIVMQAVMIL--RGNEP------------TWAEAKRQLGEQNFIKSLIY 3239

  Fly  3332 YPTDLINAEMVDMMVPYFQYPQYTFE-------AAKVACGNVAGLLSWTMAMSKYFEVNKEVLPL 3389
            :..|.|:.:::..:..|...|.:..:       |||..|       .|..||..|..:.:.|.|.
  Rat  3240 FDKDNISDKVLKKIGAYCAQPDFQPDIIGRVSLAAKSLC-------MWVRAMELYGRLYRVVEPK 3297

  Fly  3390 KANLAVQEAKYQKASSDLQEAEELLQQKENELAEVQQTLEDAVSKKDAVLDEAKKCQDKMDAATA 3454
            :..:....|:.|:..:.|.||:|.|::...:|..:::..::.:::|:.:..::::.:.|::.|..
  Rat  3298 RIRMNAAIAQLQEKQAALAEAQEKLREVAEKLEMLKKQYDEKLAQKEELRKKSEEMELKLERAGM 3362

  Fly  3455 LIGGLAGEKIRWTEQIASFKSETDRLVGDVILLTAFLSYTGPFNQEFRSDL-QSIWTKQIIEKMI 3518
            |:.||||||.||.|.:...:.:...||||.::..|||||.|||...:|.:: ..||.|:|.|..:
  Rat  3363 LVSGLAGEKARWEETVQGLEEDLGYLVGDCLIAAAFLSYMGPFLTNYRDEIVNQIWIKKIWELQV 3427

  Fly  3519 PISANVNIIESLTDRSQIGEWNIQGLPTDELSIQNGIISTKAMRFPLLIDPQSQGKVWIKNKE-K 3582
            |.|....|...||:.:::.:|||||||:|..|.:||||.|:..|:.|:||||:|...||||.| .
  Rat  3428 PCSPRFAIDNFLTNPTKVRDWNIQGLPSDSFSTENGIIVTRGNRWALMIDPQAQALKWIKNMEGN 3492

  Fly  3583 QNKVIVTTLNHKYFRNHLEDSVSMGIPIIIEDVAEELDPCLDNLLDRNLLKVGTQYKIKIGDKEV 3647
            |...|:....|.|.| .||.::..|.|:::::|.|.|||.|:.:|::::.::|.:..::|.||||
  Rat  3493 QGLKIIDLQMHDYLR-VLEHAIQFGFPVLLQNVQEYLDPSLNPVLNKSVARIGGRMLMRIADKEV 3556

  Fly  3648 DWNPAFRCYITTKLPNPAYTPEIFARTSIIDFTVTMRGLEDQLLGRVILAERKELEDERVQLVET 3712
            ::||.||.|:||||.||.|:||..|:|:|::|.|..:|||.||||.|:..||.|||:::..||..
  Rat  3557 EYNPNFRFYLTTKLSNPHYSPETSAKTTIVNFAVKEQGLEAQLLGIVVRKERPELEEQKDSLVIN 3621

  Fly  3713 VTGNMKKMKELEANLLQKLSTTKGSLLDDVTVIEVLNTSKNTAIEVKEKIEIAKVTEAKINAARE 3777
            :....:|:||||..:|:.|:...|||||||.::..|.|||.||.||.|::|.::.||..|:.|||
  Rat  3622 IAAGKRKLKELEDEILRLLNEATGSLLDDVQLVNTLQTSKITATEVTEQLETSETTEINIDLARE 3686

  Fly  3778 EYRVVATRGSVLYFLVCSMARVNNMYQTSLVQFLERFDASMYNSSKTHITQKRIKRIINYLTFEI 3842
            .||..|.|.|||:|::..|.|::.|||.||..::..|..|:..|.:::..:.||:.:.:|.|:.:
  Rat  3687 AYRPCAQRASVLFFVLNDMGRIDPMYQFSLDAYISLFILSIDKSHRSNKLEDRIEYLNDYHTYAV 3751

  Fly  3843 YRYKSRGLYEKDKFLFVLLMALSIDRQLELITFDEFQVFIKGGAALNL-----NDCPPVPFRWTT 3902
            |||..|.|:|:.|.||...|...|......:..||:..|::||..|:.     |.|.    .|..
  Rat  3752 YRYTCRTLFERHKLLFSFHMCAKILETSGKLNMDEYNFFLRGGVVLDREGQMDNPCT----SWLA 3812

  Fly  3903 DETWLNLVQLTNLTPFVNILSKVSGNERAWFTWYKKDAPENEIIPDGY-NSLDPFRKMLLVRSWC 3966
            |..|.|:.:|..||.|..:::......|.|..||....||..::|..: |:.:..::||:|||..
  Rat  3813 DAYWDNITELDKLTNFHGLMNSFEQYPRDWHLWYTNSNPEKAMLPGEWENACNEMQRMLIVRSLR 3877

  Fly  3967 MDRTISQCRKYIANSLGDRFAEPVVLNFEELLLESRELMPMICFLSLGSDPSSNIELLAKKNEL- 4030
            .||.......:|.::||.||.||.|||.:.::.:|....|::..||.|.||:|.:..||:...: 
  Rat  3878 QDRVAFCVTSFIVSNLGSRFIEPPVLNMKLVMEDSTPRSPLVFILSPGVDPTSALLQLAEHTGMA 3942

  Fly  4031 -KCHPISMGQGQEIHARKLILSCLEDGGWVLLQNCHLGLEYMVELTVQILELERQGKDAAVNPNF 4094
             :.|.:|:||||...|.:|:...:..|.||.|.||||.|.:|..|...:.:|:.:..    :|:|
  Rat  3943 HRFHALSLGQGQAPIAARLLREGVNQGHWVFLANCHLSLSWMPNLDKLVEQLQVEDP----HPSF 4003

  Fly  4095 RIWITTEPHPKFPITLLQMCLKYTNEPPAGIRAGLKRTYTNLSQ-DFLDYSQSPFYLPLVYSISF 4158
            |:|:::.|||.|||::||..:|.|.|||.|::|.:.|.|..::: .|...|:...|..|::::.|
  Rat  4004 RLWLSSSPHPDFPISILQASIKMTTEPPKGLKANMTRLYQLMTEAQFTHCSKPTKYKKLLFALCF 4068

  Fly  4159 LHTVVQERRKFGPLGWNIPYEFNSSDWYASCLFVQNHLDDIEQGKGISWVTVRYMLGEVQYGGRV 4223
            .|:::.||:||..|||||.|.||.||:..|...:..:||:.|:   ..|..::|::..|.|||.|
  Rat  4069 FHSILLERKKFLQLGWNIIYGFNDSDFEVSENLLSLYLDEYEE---TPWDALKYLIAGVNYGGHV 4130

  Fly  4224 TDDYDKRLLNTFTRVWFHDTLFE---------DCFQFFKGYKVYSFKEQEAYLAAIDDMANVDPP 4279
            |||:|:|||.|:...:|.|....         |.:...|...:.|:||   |::.:..|   |||
  Rat  4131 TDDWDRRLLTTYINDYFCDLSLTTPSYRLSVLDTYYIPKDGSLASYKE---YISLLPSM---DPP 4189

  Fly  4280 QVYGFHSNAEITYQTNTMRNILDEIMSIQPKESSAGT-GESREDRVARQVKEMLSKTPLAFDLFD 4343
            :.:|.|.||::..|....|.:.:.::|:||:.:.... |:|||::|.....::..|.|...| ::
  Rat  4190 EAFGQHPNADVASQITEARTLFETLLSLQPQITPTRIGGQSREEKVLELAADVKQKIPEMID-YE 4253

  Fly  4344 VKQHLIAMGATSSMNIFLRQEIDRMQRIIILVRSIFKDLLLAVEGTIIMSENLRDALDNIFNARV 4408
            ..:.|:|:. .|.:|:.|.|||.|..:::..:.....||...::|.|:||.:|.:..:.||:|.|
  Rat  4254 GTRKLLALD-PSPLNVVLLQEIQRYNKLMKTILFSLTDLEKGIQGLIVMSTSLEEIFNCIFDAHV 4317

  Fly  4409 PTVFKRGSWVSSSLGFWFTELLERHTQFYNWCFGAR-PVVFWMSGFFNPQGFLTAMRQEVARAHQ 4472
            |.::.:.......|..|..:|..|..||..|...|. ||:||:|||..|.|||||:.|..|| ..
  Rat  4318 PPLWGKVYPSQKPLASWTRDLAVRVEQFETWANRAHPPVLFWLSGFTFPTGFLTAVLQSAAR-QN 4381

  Fly  4473 GWALDQVTMHNDVLKVGPEECKKPPKEGVFVYGLFVDGAGWDKRTSRLVEATNKVLFTLMPVIHI 4537
            ..::|.::....|..|.......|||:||:|.||:::|||||::.|.||||....|..|||.||.
  Rat  4382 NISVDSLSWEFIVSTVDDSNLVYPPKDGVWVRGLYLEGAGWDRKNSCLVEAEPMQLVCLMPTIHF 4446

  Fly  4538 YAIFSTAAKNSKLYTCPVYKKINRTD----LNYICALWLQSN-KHPDHWTLRGVALL 4589
            ....|.......:|:||.|...||..    .:::..:.|:|. ...|||..||.|||
  Rat  4447 RPAESRKKSAKGMYSCPCYYYPNRAGSADRASFVIGIDLRSGAMTSDHWIKRGTALL 4503

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-3NP_001104482.3 DHC_N1 266..800 CDD:285571 114/581 (20%)
DHC_N2 1378..1778 CDD:285579 129/424 (30%)
P-loop_NTPase 1914..2145 CDD:304359 130/230 (57%)
P-loop_NTPase 2229..2364 CDD:304359 61/141 (43%)
P-loop_NTPase 2521..2790 CDD:304359 91/271 (34%)
P-loop_NTPase 2889..3151 CDD:304359 104/261 (40%)
MT 3164..3506 CDD:289543 98/358 (27%)
AAA_9 3538..3754 CDD:289547 100/216 (46%)
Dynein_heavy 3900..4582 CDD:281078 235/701 (34%)
Dnah2XP_008766120.1 DHC_N1 239..806 CDD:285571 114/583 (20%)
DHC_N2 1304..1709 CDD:285579 129/426 (30%)
P-loop_NTPase 1846..2076 CDD:304359 130/230 (57%)
P-loop_NTPase 2162..2303 CDD:304359 62/140 (44%)
P-loop_NTPase 2462..2728 CDD:304359 91/273 (33%)
P-loop_NTPase 2813..3074 CDD:304359 104/262 (40%)
MT 3087..3419 CDD:289543 99/361 (27%)
AAA_9 3447..3663 CDD:289547 100/216 (46%)
Dynein_heavy 3805..4496 CDD:281078 237/710 (33%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
21.810

Return to query results.
Submit another query.