DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-3 and Dnah10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001104482.3 Gene:kl-3 / 26067053 FlyBaseID:FBgn0267432 Length:4593 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008767494.2 Gene:Dnah10 / 117252 RGDID:619988 Length:4592 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4774 Identity:1450/4774 - (30%)
Similarity:2384/4774 - (49%) Gaps:511/4774 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    76 PEEIVTGIVDESKYVENVNGIFEEKGPMAIMISNATMLGYPTDSGRYQEKLKYTEIQ-------- 132
            |||:      |.:.:|::...|||:|.                    :|:.:|.:::        
  Rat    64 PEEV------EVEEIEDIPTTFEEEGE--------------------EEESEYQKVEVTDKTAVK 102

  Fly   133 ----RSVCLRSDLVDL------IGKWTVVYRLNNEKSIDNR--------SVSDE-----VAIFMI 174
                ::..|...|.|:      |..::..|.....|.|.||        .:|:|     |..|:.
  Rat   103 PSKPKNDSLTPPLFDMEDDEPDIENYSKPYNKRLVKRIINRLELHVSLTPLSEEFLEQNVVFFLR 167

  Fly   175 SAEE------------------------RNSCLNVVKTFMDHVLKPSI---EAVTEFG-LAEKEQ 211
            |:::                        .:..|..:|..:..|..|::   :..:|.| :|...:
  Rat   168 SSKDAIPEASDMKEAMEIMPETMEYGIINSQVLQFLKDIICQVFMPALSFNQHKSESGQVASPPE 232

  Fly   212 TQKF-----------------FHILNMY-NTFLKSSEATVSSRVNFDISHELFKG---LLLVRWQ 255
            .|:|                 :|.:.:. :.||.:.:...:   |...:.:..:|   |.:....
  Rat   233 VQEFSSYDITDLPSMLGETMEYHSIQLIRDEFLMNLQKFAN---NIQRTMQQLEGEIKLEMPSIS 294

  Fly   256 IEAS-SKILTRVRLVERYFEQ----WLRQIQGILVEGKQIQRDTPDVGPLQMLVNWRRMLARYTT 315
            :|.. |:::....|||. .||    ||.||.  .....|:::.....|||..:..||...|..:.
  Rat   295 VEGEVSELVADPELVET-LEQCVINWLGQIS--YAVDSQLKKKPQGNGPLAEIEFWRERNATLSA 356

  Fly   316 ITE-----FVTSRAFNNHKDCLTLSRSSKLLNRWAEIDNQVTLALN-----------EAKDNVRY 364
            :.|     ||                 .|:|....|.::.:|..:.           ||.||||:
  Rat   357 LYEQTKLPFV-----------------RKVLEVIKEAESMLTANVQPVLTELFKLHMEASDNVRF 404

  Fly   365 ISSLQK-FWDPLYRSSPNVIISSLPGLMVAIRNVSKTAHYFNTPVNVTGLMVKIS---------- 418
            :|:::: |.:..:.|:.:|::.::|.:|.|:|.|...:.::|....:..||.:|:          
  Rat   405 LSTVERHFKNITHGSNFHVVLDTIPSMMSALRMVWIISRHYNRDERMIPLMERIAWEIAERVCRV 469

  Fly   419 -NQLTITSKN----YITDNEHSKVMENYKNIYIHTVDEMKNS-NERPW----------TVSSVYI 467
             |..|:..:|    .....|....::.:|..|.....:::.| .|..|          |.....|
  Rat   470 INLRTLFKENRANAQFKTQEAKNTLKLWKKSYFDIRAKIEASGREARWEFDRKRLFERTDYMANI 534

  Fly   468 LTCLQKFLQRLEKVKWIANTDITY---------SILDRI--MISGMERFNAMIKGARMTISSQLY 521
            ...|...|:.||:...|...::..         .:|.|:  :::.||..|              :
  Rat   535 CQDLSDILRVLEEFYNIFGPELKAVTGDPKRIDDVLCRVDSLVAPMETLN--------------F 585

  Fly   522 DPLNYRIETF------DLDFEKFVNEVEEAEVGMQQFVKLLSTECPSAASVMLVLKRF---EALS 577
            ||.|.|...:      |...|..|.|.|......:.|..|.|.|  :|..::|..|..   ||::
  Rat   586 DPFNIRSAPYWKYVMEDFKLEVLVIEKEAKNFIDESFKTLRSAE--AAFDMLLKFKHIRSREAIN 648

  Fly   578 LECLCLDRRYLEVAEMLEREMFLLKDVYNEERGNPFIPRNLPPVAGRIIWIRSIFKKIDLPMQAL 642
            .:.:   .::.::.....:|:.::..::.:...||.:.:|.|||||.|.|.||:|.:|...:...
  Rat   649 RQMM---MKFNDILAQYYKEIDIVNKIFEQNLDNPPLYKNHPPVAGAICWERSLFYRIKHTILRF 710

  Fly   643 KLRQCVLAHKKAQRTVRYYNYMNGIICHYEMAYHKAWFDYVEE-VRCLLNAPIM---TINKEEA- 702
            ...:.:|..::.|...:.|..:...:..||...::.|.:..|: :..|:...::   ||..|:: 
  Rat   711 MEVEELLDSERGQEVKQRYLEVGRKMKEYEDVKYEHWKETTEQSLPNLMKKSLLTKNTITSEDSA 775

  Fly   703 ------IYIVNIDRAILQLISETEWMWKLNLEVPNMAATITYCKDRLLGPATTLKLMLQRYDRLR 761
                  ::::|....:.::|:||:::.:|...||.:|..:...:|:.|.....::.||..|..|.
  Rat   776 VIDRGTMFVINFSPVLREIINETKYLEQLGFTVPELARNVALQEDKFLRYTEGIQRMLDHYHLLV 840

  Fly   762 TSLTPVFINIMRFRLQEISILLKPSLSTVTWISENLEDYVEKVCMKIKEVETFFNLI-LDIEDLR 825
            .:|......::....||:..:.:.....:.|.|..:.||:.:....|.:.|:..:.| .:.||:.
  Rat   841 NTLNEAESVLLDDHSQELLRVFRSGYKRLNWNSLGIADYITRCKQAIGKFESLVHQIHKNAEDIN 905

  Fly   826 ILQEMYSISDYLYIYVPEEPVSSYEFVEESNKLRSEIERILEKKSVCMERAVVDIINMFIDLLDF 890
                                 |....:|..|..||.:.:..:|         :..:..|.:.::.
  Rat   906 ---------------------SRLTLIESINLFRSPVIKTEDK---------LPGVKEFFEYIER 940

  Fly   891 EQTDSKGRRVFQLPPEKLNDTNW---------RTEGFLPIDKWDFIQFHKIYRTIYLAPEDVLRT 946
            |::......|           .|         :.||.:            ::.....||      
  Rat   941 ERSRDVDHMV-----------RWYMAIGPLLTKVEGLV------------VHTNTGRAP------ 976

  Fly   947 LQFRNYENIRYELYHLRNDCMDLFSYYNSKIILALVAGSKRSLDFVRQNILRTNWRTNPMKPILH 1011
             :..:|                 :.|:..||...||....::|......|||.       .|:..
  Rat   977 -KLASY-----------------YEYWEGKIYDVLVKLILKNLQAFNSLILRN-------VPLFQ 1016

  Fly  1012 TDL-----EIDFYNGCYIQPNLEIMQNDFNNAVLCCTEINYFVSTWGK----QAKTQERRDRRVT 1067
            .:.     ||      .:.||...:.....:.:..|.|:..:...|..    :...|:..:..:.
  Rat  1017 AETILSAPEI------ILHPNANEIDKMCVHCIRGCVEVTKYFVRWMNGSCIECPPQKGEEEEIV 1075

  Fly  1068 VDENKYERSYFRYVMEHKDVI-RAV---QNLANGLLSYKSDMEEFQRDMFEKYKYLWAEDREDII 1128
            :      .|::..:.::..:: :||   ||:...|::.   |:..||  :::|:.||..|:..::
  Rat  1076 I------ISFYNDISQNSQIMDQAVMIPQNIHRLLVNI---MKYLQR--WKRYRPLWKLDKSIVM 1129

  Fly  1129 NSFVLTNPLTVDIRDMFLHYDNISLKIETMSAKRIIGPIEVRMGSTIEKLVSESKKWKVLLGHLL 1193
            ..|....|..|...:....|..|:..:......:....|.:::......:...:|.|...||.||
  Rat  1130 EKFAAKKPPCVAYDEKLQFYAKIAADVMRHPLVKDEHCIRLQLEPLANTVQENAKSWVTSLGKLL 1194

  Fly  1194 SVQYKKQLDEMIEFITEQNNILDKPINDLDDVRQAMVVLEKVRDNYIEMDVSLQLITDTYSLFSQ 1258
            :...:::|..:.:.|......|.|..|.|||::..:..:.::|...:.|::..:.:.:.|...:.
  Rat  1195 NESAREELYSLRDEIEHLAKNLKKSPNTLDDLKFVLATISEIRTKSLIMELRYKDVQERYRTMAI 1259

  Fly  1259 FYIYVPQEDYDKVEGLQVLFNKMLENAKKVSDRISEMEEPLLRELNDGIATFVQEFYDFNLDFDL 1323
            :.|:.|:.:.:.|:.::.::..:..::..|...:..::..........|..:..:..:|...|..
  Rat  1260 YSIFPPEAEQELVDNIENMWETLFTDSVNVEHALGGIKRTFTEITRSEIINYRSQVDEFAKRFYS 1324

  Fly  1324 NGPMVEGISAKEASDRVFLFQNRFDELWRKFEMYSSGEKLFGLPITDYPLLHQRKREFNYLNRLY 1388
            .||...|....:.|:.:..|:.......:..:..::.||||.||||.||.|.:.::|...|..:|
  Rat  1325 EGPGAVGEDLDKGSELLGSFEKELARHEKNRQELANAEKLFDLPITMYPELMKVQKEMAGLRMIY 1389

  Fly  1389 SLYIQVLKTITDYYEMPWADVNIEKISAELSDFQLRCRKLPKGMQSWPAFIDLKTKIDDFNETCP 1453
            .||..:.....::.:..|.::|::.:...:..|....||||:.::|......|:||:..|.::.|
  Rat  1390 DLYDSLKIAKEEWSQTLWINLNVQYLQEGIEGFLKNLRKLPRHVRSLSVAFHLETKMKAFKDSIP 1454

  Fly  1454 LLELMTNKAMKERHWIRLNALFNTDFDPTNPKFTLGKLLEAPILKYKEDVEDICVGASKELDIEA 1518
            ||..:.::|::||||..|.......|:.|. .|||..:....:.|:.|.:.:|...|.||:.||.
  Rat  1455 LLLDLKHEALRERHWKELMEKTGVFFEMTE-TFTLDNMFAMELHKHTEVLNEIVTAAVKEVAIEK 1518

  Fly  1519 KLKQIVSDWSLVSLQLGQF----KNRGDLVLKGGETLEIISSLEDSLMIMNSLASNRYNAPFKKD 1579
            .:|:|:..|..:...:.::    :.||.::   |...:||..|:|:.:.:.|::.:|:..||.:.
  Rat  1519 AVKEILDTWENMKFTVVKYYKGTQERGYIL---GSVDDIIQCLDDNTVNLQSISGSRFVGPFLQT 1580

  Fly  1580 IQLWLSKLVNTGDILEKWLMVQNLWIYLEAVFVGGDISKQLPMEAKRFTNIDKSYVKIMMRAREI 1644
            :..|...|...|:::|.|::||..|:|||::|:||||..|||.|||:|..||:.:.:||....:.
  Rat  1581 VHKWEKTLSLIGEVIEIWMLVQRKWMYLESIFIGGDIRSQLPEEAKKFDVIDRIFKRIMGDTLKD 1645

  Fly  1645 PNAVDCCTGDESLATNLTWLLDQLETCQKSLTGYLESKRLVFPRFFFVSDPVLLEILGQASDPTS 1709
            |....||.....| .:|..:.:.||.|||||..||:|||..||||||:||..||.|||. |||..
  Rat  1646 PVIKRCCEAPNRL-HDLQTVSEGLEKCQKSLNDYLDSKRNAFPRFFFISDDELLSILGN-SDPLC 1708

  Fly  1710 IQPHLLSIFDAIATVDFQ--EKSIDIIESMNSMNREKVKFENTVQCLGSVELWLGRLLKEMQDTI 1772
            :|.|::.::|.||.:.|.  :....::.:|.|...|.:.|...|:..|.||.|:..:|.||:.|.
  Rat  1709 VQEHMIKMYDNIAMLRFHDGDSGEKLVSAMISAEGEVMVFRKIVRAEGRVEDWMTTVLNEMRRTN 1773

  Fly  1773 RTILAQMSVSLNDPEFNFAEE------FPSFCGQAGVVGVQLLWTKDSEYALRKCRT-DKTIMKR 1830
            |.|       ..:..|.:.|:      ...:.|...:...|:.||.:.|....|.:. ||..||.
  Rat  1774 RLI-------TKEAIFRYCEDRSRVDWMMMYQGMVVLAASQVWWTWEVEDVFNKVKQGDKQAMKN 1831

  Fly  1831 TNNKFLVLLNFFIDLTVKDLTSLDRIRFETMVTIHVHQRDIFDDLCTLRIKSAGDFEWQKQARFY 1895
            ...|....::..:......|:..||.::.|::.|.||.|||.|......|..|.:|||:.|.|||
  Rat  1832 YGKKMHRQIDDLVTRITMQLSKNDRKKYNTVLIIDVHARDIVDSFIRGSILEAREFEWESQLRFY 1896

  Fly  1896 YNEDNDDVIVGITDVNFVYQNEYLGVTERLAITPLTDRCYITLAQAVGMCMGGAPAGPAGTGKTE 1960
            ::.:.|::.:......|.|..||:|:..||.|||||||.|:||.||:.|.:||||||||||||||
  Rat  1897 WDREPDELNIRQCTGTFGYGYEYMGLNGRLVITPLTDRIYLTLTQALSMYLGGAPAGPAGTGKTE 1961

  Fly  1961 TTKDMGRALGKLVVVFNCSDQMDFRGLGRIYKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVL 2025
            ||||:.:|||.|.||.||.:.||::.:|:|:.||||.|:||||||||||:..||||.:.||..:.
  Rat  1962 TTKDLAKALGLLCVVTNCGEGMDYKAVGKIFSGLAQCGAWGCFDEFNRIDASVLSVISSQIQTIR 2026

  Fly  2026 TARKEKRSTFIFLDGDIVSLNPEFGIFITMNPGYAGRQELPENLKIMFRTVAMMVPDRQIIIRVK 2090
            .|...:.:||.| :|..:||:...|||||||||||||.||||::|.:||.|.::|||.|.|..:.
  Rat  2027 NALIHQLTTFQF-EGQEISLDSRMGIFITMNPGYAGRTELPESVKALFRPVVVIVPDLQQICEIM 2090

  Fly  2091 MASCGFKENVVLSRKMYTLYKLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGSQKRSNPNDTEETIVMR 2155
            :.|.||.....|::||..||||..||||||.|||||||.:.|||...|..||.:.:..|:.::||
  Rat  2091 LFSEGFLGAKTLAKKMTVLYKLAREQLSKQHHYDFGLRALKSVLVMAGELKRGSADLQEDVVLMR 2155

  Fly  2156 VLRDMNVSKLIDEDEGLFVSLVDDMFPGIKLTTNVYKDLQKAIIKVCDELGYVNNPEWNLKVVQL 2220
            .|||||:.|.:.||..||:.|:.|:|||:......|.|...|:..|.:|.|||..|....||||:
  Rat  2156 ALRDMNLPKFVFEDVPLFLGLISDLFPGLDCPRVRYPDFNDAVEDVLEENGYVLLPVQVDKVVQM 2220

  Fly  2221 YETSLVRHGLMLMGPTGSGKTSCTVCMLRCFTEMGRTHKEMRMNPKAITAPQMFGRLDVATNDWT 2285
            :||.|.||..|::||||.||:.....:.:..|::|...|...:||||::..:::|.||..|.|||
  Rat  2221 FETMLTRHTTMVVGPTGGGKSVVINTLCQAQTKLGILTKLYILNPKAVSVIELYGILDPTTRDWT 2285

  Fly  2286 DGIFSTLWRRSLK-VPQHQNCWIVLDGPVDAVWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIKMADNSKLVF 2349
            ||:.|.::|...| ..:.:..:|:.||.|||:|:||:|||:||||.||||||:||::..:..|:|
  Rat  2286 DGVLSNIFREINKPTDKKERKYILFDGDVDALWVENMNSVMDDNKLLTLANGERIRLQSHCALLF 2350

  Fly  2350 EPDNVDNASPATVSRVGMVFTSSSVLSWKIYMEAWL------LKQGEDSEVFRRCYDVLYD-DAH 2407
            |..::..||||||||.|||:.....|.::.|.:.||      ::|...:::|.:...:|.| ...
  Rat  2351 EVGDLQYASPATVSRCGMVYVDPKNLKYQPYWKKWLQQIQNKVEQKYLNDLFEKYVPILIDLIIE 2415

  Fly  2408 VFLQSRLLAKMRIL----EAIYIRQMLDIMDGLLLDLPLRTEKALERIFLFSLMWSLGAVLELSE 2468
            ..|..|...|::::    :...:.|:..:||. ||:..:.....||..||.:|..|||:.|....
  Rat  2416 GILDGRQGEKLKMVVPQTDLNMVTQLTKMMDS-LLEGEIEDPDLLECFFLEALYCSLGSSLLEEG 2479

  Fly  2469 REKLEEFLLKHVSKL-------RWPKRGV----NETIFEYYVDDNGN-WQHWSTRVEEFRYPEDE 2521
            |.|.:| .:|::|.:       .|.:.|.    ..|::|::.|...| |..|:..|.|  |..:.
  Rat  2480 RIKFDE-CIKNLSSMPTAETEGNWARPGELPGHLPTLYEFHFDSKRNYWIPWNKLVPE--YVHNH 2541

  Fly  2522 IPEFSSILVPNVDNVRTAFLLHNIAKQLKQVLLIGEQGTAKTVMIKAYMGHYDPEVHIFKSFNFS 2586
            ...|..|||..||..||.::|..:.|....||.:||.||:||...:.::.:.:.|.:|....|||
  Rat  2542 QKRFVDILVHTVDTTRTTWILEQMVKIKHPVLFVGESGTSKTATTQNFLKNLNEETNIVLMVNFS 2606

  Fly  2587 SATTPNMYQRIIESYVEKRQGTTYGPPNQRAMTIFIDDINMPVINEWGDQITNEIVRQMIEQRGF 2651
            |.||....||.:|:.||||...|||||..:.:.:|:||:|||.::|:|.|....:::.::|:...
  Rat  2607 SRTTSLDIQRNLEANVEKRTKDTYGPPMGKRLLVFMDDMNMPKVDEYGTQQPIALLKLLLEKGYL 2671

  Fly  2652 YSLERPGDFSTIMDIQMLSAMIHPGGGRNDIPNRLKRHLCIFNCTLPSNNSMDQIFKSIGAGYFS 2716
            |...:..:..:|.|:..::||...|||||::..|......:||...||..|:..|:.||..|:.|
  Rat  2672 YDRGKELNCKSIRDLGFIAAMGKAGGGRNEVDPRFLSLFSVFNVPFPSEESLHLIYYSILKGHTS 2736

  Fly  2717 PDRLGDEVVEVIPLLVPLTRIFWQNVKAKMLPTPANFHYVFNLRDLSRIWEGILKVKHEECKSVD 2781
              ...:.:..|...|...|...::|:...:.|||:.|||:||||||||::.|::....:..::|.
  Rat  2737 --TFAESISGVSRKLTFCTLTLYKNIVQDLPPTPSKFHYIFNLRDLSRVFNGLVLTNPDRFQTVS 2799

  Fly  2782 QILKLWCHECTRVISDRFTAEKDKIWFSSKMISDAELN-IKEFM----EFYPEEPTYWVDFLRDA 2841
            |::::|.:||.||..||...|.||     :::.|...| :||..    |....:|..:.|| |.|
  Rat  2800 QMVRVWRNECLRVFHDRLINEVDK-----QLVQDYIGNLVKEHFNDDYEMVMRDPILFGDF-RTA 2858

  Fly  2842 PEGQEEEDEEMSFEPPKIYEEIPSFDFVRSKVLVFMSQFNEYIRGYN-----MDLVFFMDALKHL 2901
            .  ||||        |:|||:|.  |:..:|.|     |.|.:..||     |:||.|.|||:||
  Rat  2859 L--QEEE--------PRIYEDIQ--DYEAAKAL-----FEEILEEYNEVNTKMNLVLFDDALEHL 2906

  Fly  2902 MIVSRIISNPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLSSFIAGYKFFQMTLTRSYNTGNLTEDLKFLYRTAG 2966
            ..|.|||...||:||||||||||||||.||::|.|||:.|::.|:|.|:..|..:|||.||...|
  Rat  2907 TRVHRIIRMDRGHALLVGVGGSGKQSLARLAAFTAGYEVFEILLSRGYSENNFRDDLKNLYMKLG 2971

  Fly  2967 LDGNGMTFIFTANEIKEESFLEFINNILSSGEIANLFAKDELDEMYSELIPVMKKHQPRRPATQD 3031
            |:...|.|:||...:.||.|||.|||:|:||.:..||.::|.|.:.|::.....|| ...|| ::
  Rat  2972 LENKLMIFLFTDAHVAEEGFLELINNMLTSGMVPALFTEEEKDNILSQIGQEALKH-GMGPA-KE 3034

  Fly  3032 NLYDFFISRARYNLHIALCFSPVGEKFRMRSLKFPGLISGCVIDWFQKWPEDARIAVSRHYLTDY 3096
            :::.||::::..||||.|..||||:..|.|...||||::...||||..||..|..||::.:|.:.
  Rat  3035 SVWQFFVNKSANNLHIVLGMSPVGDTLRTRCRNFPGLVNNTGIDWFMPWPPQALHAVAKSFLGNN 3099

  Fly  3097 QIVCSEKVKDQVIDIMSWIHESVQETCLSYYDRFRRVTFVTPKSLISFLESYKLLYKDKQDHIVI 3161
            .::.|||::| :::.:..:|:||.|....:..:.||..:||||:.:.|:.:|..|..:|..:.:.
  Rat  3100 SMIPSEKLED-LVEHVVLVHQSVGEFSKQFQQKLRRSNYVTPKNYLDFINTYSKLLDEKTQYNIA 3163

  Fly  3162 MSERMSSGLDKLDEAGASVAILKKDLIEMNKVIALASEEAEDVLATVEQSKAAAEIVKVEVAEKK 3226
            ..:|:..|||||.||...:..|.:.|.|...|:|..|...|.:|..:..:.|.||..|....||.
  Rat  3164 QCKRLEGGLDKLKEATIQLDELNQKLAEQKIVLAEKSAACETLLEEIATNTAIAEEKKKLAEEKA 3228

  Fly  3227 GQAEVLVKNISAVKHVAEAKLEKALPALEEAEAALKTIKAADIATVRKLGKPPYLITLIMDCVCI 3291
            .:.|...|.|:..|..||..|.:.:|.||.|:..|:.:..:|:..:|...|||..:..:.:|:.|
  Rat  3229 IEIEEQNKIIAVEKAEAETALAEVMPILEAAKLELQKLDKSDVTEIRSFAKPPKQVQTVCECILI 3293

  Fly  3292 LFRRKVKPIRPDTEKAFIQSSWDESLKVMSDTSFLRKIVEYPTDLINAEMVDMMVPYFQYPQYTF 3356
            :             |.:.:.:|..:..:|||.:|||.::|...|.|....|..:....:....|.
  Rat  3294 M-------------KGYKELNWKTAKGMMSDPNFLRSLMELDFDSITQGQVKNIKGLLKTLNTTI 3345

  Fly  3357 EAAKVACGNVAGLLSWTMAMSKYFEVNKEVLPLKANLAVQEAKYQKASSDLQEAEELLQQKENEL 3421
            |..:.......|:|.:..|:..|.:|.:|:.|.:..:|..|..:.....:|:..       :|||
  Rat  3346 EEMEAVSKAGLGMLKFVEAVMGYCDVFREIKPKRDKVARLERNFFLTKRELERI-------QNEL 3403

  Fly  3422 AEVQQTLEDAVSKKDAVLDEAKKCQDKMD-------AATALIGGLAGEKIRWTEQIASFKSETDR 3479
            |.:|:.||...:|.:|.:.|.:|.|::.:       ||..||.||..|.:||...:........:
  Rat  3404 AAIQKELEALGAKYEAAILEKQKLQEEAEIMERRLIAADKLISGLGSENVRWLNDLDELMHRRVK 3468

  Fly  3480 LVGDVILLTAFLSYTGPFNQEFRSDL-QSIWTKQIIEKMIPISANVNIIESLTDRSQIGEWNIQG 3543
            |:||.:|..|||||.|.|..|||..: ...|...|:::.||:|....:...|||..:|..|..||
  Rat  3469 LLGDCLLCAAFLSYEGAFTWEFRDAMVNQEWRNDILDRDIPLSQPFRLENLLTDDVEISRWGSQG 3533

  Fly  3544 LPTDELSIQNGIISTKAMRFPLLIDPQSQGKVWIKNKEKQNKVIVTTLNHKYFRNHLEDSVSMGI 3608
            ||.||||:||||::|:|.||||.||||.|...|||.||::|.:.|.:.|...|...||.|:..|.
  Rat  3534 LPPDELSVQNGILTTRASRFPLCIDPQQQALNWIKRKEERNNLRVASFNDPDFLKQLEMSIKYGT 3598

  Fly  3609 PIIIEDVAEELDPCLDNLLDRNL-LKVGTQYKIKIGDKEVDWNPAFRCYITTKLPNPAYTPEIFA 3672
            |.:..||.|.:||.:||:|::|: :..|.|: |.:||||||::..||.|:.|||.||.|:|.:|.
  Rat  3599 PFLFHDVDEYIDPVIDNVLEKNIKISQGRQF-IILGDKEVDYDSNFRLYLNTKLANPRYSPSVFG 3662

  Fly  3673 RTSIIDFTVTMRGLEDQLLGRVILAERKELEDERVQLVETVTGNMKKMKELEANLLQKLSTTKGS 3737
            :..:|::|||::|||||||..::..||:|||::|..|::..:.|...:|:||.:||::|:|:.|:
  Rat  3663 KAMVINYTVTLKGLEDQLLSVLVAYERRELEEQREHLIQETSENKNLLKDLEDSLLRELATSTGN 3727

  Fly  3738 LLDDVTVIEVLNTSKNTAIEVKEKIEIAKVTEAKINAAREEYRVVATRGSVLYFLVCSMARVNNM 3802
            :||:|.:::.|..:|:.|.||.||:::|:.|...|:..|:.||..|.||::|:|::..||.||:|
  Rat  3728 MLDNVELVQTLEETKSKATEVSEKLKLAEKTALDIDRLRDGYRPAARRGAILFFVLSEMALVNSM 3792

  Fly  3803 YQTSLVQFLERFDASMYNSSKTHITQKRIKRIINYLTFEIYRYKSRGLYEKDKFLFVLLMALSID 3867
            ||.||:.|||.|..|:..|....|..||:|.|::.|||.||.|...||:||.|.||...|.:.|:
  Rat  3793 YQYSLIAFLEVFGLSLKKSLPDSILLKRLKNIMDTLTFNIYNYGCTGLFEKHKLLFSFNMTIKIE 3857

  Fly  3868 RQLELITFDEFQVFIKGGAALNLNDCPPVPFRWTTDETWLNLVQLTNLTP--FVNILSKVSGNER 3930
            :....:..||...|:||..:|..:.... |..|.:|:.|.:::.|:....  |.|:...:..|..
  Rat  3858 QAEGRVPQDELDFFLKGNISLEKSKWKK-PCTWLSDQGWEDIILLSEKFSDIFGNLPFDIEHNLP 3921

  Fly  3931 AWFTWYKKDAPENEIIPDGYNS-LDPFRKMLLVRSWCMDRTISQCRKYIANSLGDRFAEPVVLNF 3994
            .|..||.||:.|....|..|:. :..|:|:|::|.:.:||.......|:..::|:::.:|.:::|
  Rat  3922 TWQEWYDKDSLEQFPFPLRYDDHITAFQKLLILRCFRVDRVYRAVTDYVTLTMGEKYVQPPMISF 3986

  Fly  3995 EELLLESRELMPMICFLSLGSDPSSNIELLAKKN-----ELKCHPISMGQGQEIHARKLILSCLE 4054
            |.:..:|....|::..||.||||:|::..||:::     .||.  ::||||||..|.:|:.:.:.
  Rat  3987 EAIFEQSTPNSPIVFILSPGSDPASDLMKLAERSGFGGTRLKF--LAMGQGQEKVALQLLETAVA 4049

  Fly  4055 DGGWVLLQNCHLGLEYMVELTVQILELERQGKDAAVNPNFRIWITTEPHPKFPITLLQMCLKYTN 4119
            .|.|::||||||.::::.:|.   ..|||..|.   :|:||:|:||:|...|||.:||..||...
  Rat  4050 RGQWLMLQNCHLLVKWLKDLE---KSLERITKP---HPDFRLWLTTDPTKGFPIGILQKSLKVVT 4108

  Fly  4120 EPPAGIRAGLKRTYTNLSQDFLDYSQSPFYLPLVYSISFLHTVVQERRKFGPLGWNIPYEFNSSD 4184
            |||.|::..::.||..:|.|.|:......:.||||.::|.|.|||||||||.:|||:.|:||.||
  Rat  4109 EPPNGLKLNMRATYFKISHDMLEQCPHTAFKPLVYVLAFFHAVVQERRKFGKIGWNVYYDFNESD 4173

  Fly  4185 WYASCLFVQNHLDDI--EQGKGISWVTVRYMLGEVQYGGRVTDDYDKRLLNTFTRVWFHDTLFED 4247
            :......:..:|...  :....|.|.:::|::|||.||||..|.:|:|:|.|:...:..|.:| |
  Rat  4174 FQVCMEILNTYLTKAFQQHDPRIPWGSLKYLIGEVMYGGRAIDSFDRRILTTYMDEYLGDFIF-D 4237

  Fly  4248 CFQ---FFKG----YKVYSFKEQEAYLAAIDDMANVDPPQVYGFHSNAEITYQTNTMRNILDEIM 4305
            .||   ||:.    ||:.....::.::.||:.:...:.|:|:|.||||||.|.|...|::...::
  Rat  4238 TFQPFHFFRNKDVDYKIPVGDVKDKFVEAIEALPLANTPEVFGLHSNAEIGYYTQAARDMWGHLL 4302

  Fly  4306 SIQPKESSAGTGESREDRVARQVKEMLSKTPLAFDLFDVKQHL-IAMGATSSMNIFLRQEIDRMQ 4369
            .:||:...:.:|.||:|.:.:..|::.:|.|..|||..|::|| :.:..||   :.|.||:.|..
  Rat  4303 ELQPQTGESSSGVSRDDYIGQVAKDIENKMPKIFDLDQVRKHLGLNISPTS---VVLLQELGRFN 4364

  Fly  4370 RIIILVRSIFKDLLLAVEGTIIMSENLRDALDNIFNARVPTVFKR-GSWVSSSLGFWFTELLERH 4433
            :::|.:.....:|..|:.|.:.||..|.|...::|...:|.:::: ......:||.|....|.|.
  Rat  4365 KLVIRMTRSLAELQRALAGEVGMSNELDDVARSLFLGHIPHIWRKLAPDTLKTLGNWMVYFLRRF 4429

  Fly  4434 TQFYNWCFGARPVVFWMSGFFNPQGFLTAMRQEVARAHQGWALDQVTMHNDVLKV-GPEECKKPP 4497
            .|:..|...:.|.|.|:||...|:.:|||:.|...| ..||.||:.|:...|.|. ..:|..:..
  Rat  4430 NQYTLWVTESEPSVMWLSGLHIPESYLTALVQATCR-RNGWPLDRSTLFTQVTKFQDADEVNERA 4493

  Fly  4498 KEGVFVYGLFVDGAGWDKRTSRLVEATNKVLFTLMPVIHIYAIFSTAAKNSKLYTCPVY---KKI 4559
            .:|.||.||:::||.||.....||::..|||...:|::.|..|.....|....:..|||   .:.
  Rat  4494 GQGCFVSGLYLEGADWDIERGCLVKSKPKVLVVDLPILKIIPIEGHRLKLQNTFRTPVYTTSMRR 4558

  Fly  4560 NRTDLNYICALWLQSNKHPDHWTLRGVAL 4588
            |...:..:....|.:.||..||.|:||.|
  Rat  4559 NAMGVGLVFEADLFTAKHISHWVLQGVCL 4587

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-3NP_001104482.3 DHC_N1 266..800 CDD:462457 126/611 (21%)
DHC_N2 1374..1778 CDD:462462 135/409 (33%)
DYN1 <1615..4240 CDD:227570 1005/2686 (37%)
AAA_6 1914..2241 CDD:463697 174/326 (53%)
Dynein_C 4294..4590 CDD:465677 90/301 (30%)
Dnah10XP_008767494.2 DHC_N1 309..879 CDD:462457 125/608 (21%)
DHC_N2 1375..1780 CDD:462462 135/417 (32%)
DYN1 <1616..4234 CDD:227570 1005/2689 (37%)
AAA_6 1915..2241 CDD:463697 174/326 (53%)
AAA_8 2894..3153 CDD:463701 114/261 (44%)
Dynein_C 4291..4589 CDD:465677 90/301 (30%)

Return to query results.
Submit another query.