DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment kl-3 and Dnah6

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001104482.3 Gene:kl-3 / 26067053 FlyBaseID:FBgn0267432 Length:4593 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038964640.1 Gene:Dnah6 / 117250 RGDID:621797 Length:4156 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4366 Identity:1311/4366 - (30%)
Similarity:2137/4366 - (48%) Gaps:537/4366 - (12%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   532 DLDFEKFVNEVEEAEV----------GMQQFVKLLSTECPSAASVML---------VLKRFEALS 577
            ::|.:...|:.||..|          |:..:..|...| |...:::.         ..||.:.:.
  Rat    21 EIDLKSMENQEEENPVLTRLNKIRAKGVLNYASLKENE-PEPQTLVFRHTTKAQEKTRKRQQPVK 84

  Fly   578 LECLCLDRRYLEVAEMLEREMFLLKDVYNEERGNPFIPRNLPPVAGRIIWIRSIFKKIDLPMQAL 642
            ||.|.:.:.|.:..:.        :.:|.:.|........|.|....|  .||....:: ..:||
  Rat    85 LEPLPVLKLYQDHKQP--------EYIYEQNRQQLMSTGILKPSPSMI--ERSSIGSLE-AQEAL 138

  Fly   643 KLRQCV--------LAHKKAQRT---------VRYYNYMNGIICHYEMAYHKAWFDYVEEVRCLL 690
            |.:|.:        |:..|..||         :|...|                           
  Rat   139 KRKQVLRPSADVFSLSPSKLPRTSIGRRGLFGMRSSTY--------------------------- 176

  Fly   691 NAPIMTINKEEAIYIVNI--DRAILQLISETEWMWKLNL--EVPNMAATITYCKDRLLGPATTLK 751
              |..|.|..|.:...||  ...|::::.|.|.:..|.:  .||.  ::|.|         .|..
  Rat   177 --PKYTFNDREEVVKANIRDPLQIIKIVHENEHLGFLYMIPAVPK--SSIEY---------DTYN 228

  Fly   752 LMLQRYDRL---------RTSLTPVFINIMRF--------------RLQEISI--LLKPSLSTVT 791
            |.:..|:.:         :.::|.||.:.:.:              .|.:|.|  |.:...:...
  Rat   229 LKVVSYENINKNDYYTISKDAVTHVFNDDIEYIETERWEQEYLYHRELTKIPIFSLFRKWKAFSV 293

  Fly   792 WISENLEDYVEKVCMKIKEVETFF-NLILDIEDLRILQEMYSISDYLYIYVPEEPVSSYEFVEES 855
            | .:|:.......|.|......|. |..|....|:|....|.:|.....|:  |...:|...|..
  Rat   294 W-RKNVRSKKITGCRKALRKNLFIVNPYLRPALLKINDMCYQLSFMGLCYI--EKFHTYTLQEFK 355

  Fly   856 NKLRSEIERILEKKSVCMERAVVDIINMFIDLLDFEQTD--SKGRRVFQLPPEKLNDTNWRTEGF 918
            ......::.:.|:                ::...||..|  .|..| |.|          |..||
  Rat   356 AAQVVRVQEVTER----------------LEYFRFEAKDVVRKSCR-FAL----------RAAGF 393

  Fly   919 LPIDKWDFIQFHKIYRTIYL-----APEDVLRTLQFRNYENIRY-ELYHLRNDCMDL--FSYYNS 975
            :|.|  ..::.|:.|..|.:     ||.| |.|  :...|.:.| |....|:.||.|  |...|.
  Rat   394 IPDD--CEVETHEDYFKINIASFIDAPSD-LPT--YGESEKMTYTEQASKRHHCMRLTCFIRLND 453

  Fly   976 KII-----LALVAGSKRSLDFVRQNILRT-------NWRTN-----------PMK---------- 1007
            .:|     :..|..:...|:::...:.||       .|.|.           ||.          
  Rat   454 YLIQNTLHVLTVNTASSLLNYLSDKLKRTPSADVIQKWITEDKPEVIEKKGAPMMEKQEEDESLI 518

  Fly  1008 PILHTDLEIDFYNGCYIQPNLEI-------MQNDFNNAVLCCTEI------NYFVSTWGKQAKTQ 1059
            |:..|:| |........:|:||.       :.|.|.|.||....:      |.|.|.:..: |.:
  Rat   519 PMFLTEL-ILTVQSLLFEPSLEDFLDGISGIINHFENTVLSVPNLVPDSYFNAFTSPFINK-KVE 581

  Fly  1060 ERR----DRRVTVDENKYERSYFRYVMEHKDVIRAVQNLANGLLSYKSDMEEFQRDMFEKYKYLW 1120
            |:.    .....|.|:  :|::...:.:.|:.|.:.           .|........|||::..:
  Rat   582 EKTCGPGPSLSAVFED--DRNFLTIIQQIKETIHSA-----------FDSARLYAATFEKFQIFF 633

  Fly  1121 AEDREDIINSFVLTNPLTVDIRDMF---------LHYDNISLK---------IETMSAKRIIGPI 1167
            .|:....:.:.....|   |: :.|         .|.|:::||         |:|...|..:.|.
  Rat   634 KENESLDLEALKEEEP---DV-EFFSSQLEKYHKQHKDSVALKPTRNVGLLLIDTKQLKEKLIPS 694

  Fly  1168 EVRMGSTIEKLVSESKKWKV--LLGHLLSVQYKKQLDEMIEFITEQNNILDKPINDLDDVRQAMV 1230
            .:|....:..::....|.||  ::......:||      :||:..........:..||::::.:.
  Rat   695 PLRCLEVLNLMLPRLSKKKVDAIISEAQDAEYK------LEFVPTTTIEYVNSLVFLDEIQERIE 753

  Fly  1231 VLEKVRDNYIEMDVSLQLITDTYSLFSQFYIYVPQEDYDKVEGLQVLFNKM------LENA--KK 1287
            .||:..:..::|          |.|..|:.:..|.||:       .:|..|      :.||  |.
  Rat   754 TLEEEGNTVVQM----------YKLIEQYQVLTPPEDF-------AVFATMKPSITAVRNAIDKS 801

  Fly  1288 VSDRISEMEEPLL---RELNDGIATFVQEFYDFNLDFDLN-------GPMVEGISAKEASDRVFL 1342
            |.||.|.:::..|   |:|.|             |:.::|       .|.:..|||.....:..|
  Rat   802 VGDRESSIKQFCLHLGRDLED-------------LNNEVNEVKLLAQDPQILDISADPEKIKTML 853

  Fly  1343 --FQNRFDELWRKFEMYSSGEKLFGLPITDYPLLHQRKREFNYLNRLYSLYIQVLKTITDYYEMP 1405
              .|:..|:|.::...|.|.:|.|.:.::.:..|.:...|......|:....:..|...::.:..
  Rat   854 SDLQSVLDDLQKRAFQYKSYQKNFKVEVSKFDALEEVCAELRLKQLLWDSLSEWDKLQQEWLKSK 918

  Fly  1406 WADVNIEKISAELSDFQLRCRKLPKGMQSWPAFIDLKTKIDDFNETCPLLELMTNKAMKERHWIR 1470
            :..::.|.::.:::.:.....:|.||:........||.|::...|..|::..:.|..:|.|||..
  Rat   919 FDCLDPEVLNGQVTKYAKFVTQLEKGLPPNSVVPQLKQKVERMKEKLPVINDLRNPTLKPRHWSA 983

  Fly  1471 LNALFNTDFDPTNPKFTLGKLLEAPILKYKEDVEDICVGASKELDIEAKLKQIVSDWSLVSLQLG 1535
            :....:..........||.:|.|..:..:.::::||...||.|..:|..||::...|......:.
  Rat   984 IEQTVDALLVDIEIPLTLERLSELHVFDFAQEIQDISGQASGEAALEIILKKVEDSWKTTEFVIL 1048

  Fly  1536 QFKNRGDLVLKGGETLEIISSLEDSLMIMNSLASNRYNAPFKKDIQLWLSKLVNTGDILEKWLMV 1600
            ..::..|:.:.|| |.:|...|:||.:.:.::||:||..|.|..:..|..:|......||:||..
  Rat  1049 PHRDSKDVFILGG-TDDIQVLLDDSTINVATIASSRYVGPLKTRVDDWQKQLSLFNQTLEEWLNC 1112

  Fly  1601 QNLWIYLEAVFVGGDISKQLPMEAKRFTNIDKSYVKIMMRAREIPNAVDCCTGDESLAT--NLTW 1663
            |..|:|||::|...||.:|||.|||.|..:|||:.:||.:...:|||:...|....|.|  |...
  Rat  1113 QRNWLYLESIFNAPDIQRQLPAEAKMFLQVDKSWKEIMRKVNRLPNALRAATQPGLLETFQNNNA 1177

  Fly  1664 LLDQLETCQKSLTGYLESKRLVFPRFFFVSDPVLLEILGQASDPTSIQPHLLSIFDAIATVDF-- 1726
            ||||::.|   |..||||||::||||:|:|:..|||||.|..:|.::||||...||:|:.::|  
  Rat  1178 LLDQIQKC---LEAYLESKRVIFPRFYFLSNDELLEILAQTRNPQAVQPHLRKCFDSISKLEFAL 1239

  Fly  1727 --------------QEK--SIDIIESMNSMNREKVKFENTVQCLGSVELWLGRLLKEMQDTIRTI 1775
                          .||  :.||: :|.|...|:|.....::..|:||.|||::.:.|..::|.:
  Rat  1240 MPPTEGKIPGIDTEPEKVFTNDIL-AMLSPEGERVGLGKGLKARGNVEEWLGKVEEAMFSSLRRL 1303

  Fly  1776 LAQMSVSLNDPEFNFAEEF-----PSFCGQAGVVGVQLLWTKDSEYALRKCRTDK-TIMKRTNNK 1834
               ...::.|.:.....|:     ||   |..:...|::|.:|...:| :|..:. ..:::....
  Rat  1304 ---CKAAIADYQGKLRTEWVIAGHPS---QVILTISQIMWCRDLTESL-ECEDNHLEALEKFEQV 1361

  Fly  1835 FLVLLNFFIDLTVKDLTSLDRIRFETMVTIHVHQRDIFDDLCTLRIKSAGDFEWQKQARFYYNED 1899
            ....||....:....|..|.|.....::||.||.|||..:|...::.||..|:||:|.|:|::.|
  Rat  1362 NFERLNALAAIVRGSLPKLHRNIITALITIDVHARDIVSELVQSKVDSAESFDWQRQLRYYWDVD 1426

  Fly  1900 NDDVIVGITDVNFVYQNEYLGVTERLAITPLTDRCYITLAQAVGMCMGGAPAGPAGTGKTETTKD 1964
            .|:.:..:....:.|..||||...||.|||||||||:.|..|:.:.:||||||||||||||||||
  Rat  1427 LDNCVARMALSQYTYAYEYLGACPRLVITPLTDRCYLCLMGALQLDLGGAPAGPAGTGKTETTKD 1491

  Fly  1965 MGRALGKLVVVFNCSDQMDFRGLGRIYKGLAQSGSWGCFDEFNRIELPVLSVAAQQIYIVLTARK 2029
            :.:||....|||||||.:|::.:||.:.||||||:|.||||||||::.||||.|||:..:..|:.
  Rat  1492 LAKALAIQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQSGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRNAKA 1556

  Fly  2030 EKRSTFIFLDGDIVSLNPEFGIFITMNPGYAGRQELPENLKIMFRTVAMMVPDRQIIIRVKMASC 2094
            .|.|.|:| :|..:.|......|||||||||||.|||:|||.:||.:|||||:..:|..|.:.|.
  Rat  1557 AKLSRFMF-EGREIKLVMTCAAFITMNPGYAGRTELPDNLKALFRPMAMMVPNYALIAEVILYSE 1620

  Fly  2095 GFKENVVLSRKMYTLYKLCEEQLSKQVHYDFGLRNILSVLRTLGSQKRSNPNDTEETIVMRVLRD 2159
            ||:.:.:|:|||..:||||.||||:|.|||||:|.:.|||...||.||.||:.:|:.:::|.|||
  Rat  1621 GFESSKILARKMTQMYKLCSEQLSQQDHYDFGMRAVKSVLVMAGSLKRENPDLSEDVVLIRALRD 1685

  Fly  2160 MNVSKLIDEDEGLFVSLVDDMFPGIKLTTNVYKDLQKAIIKVCDELGYVNNPEWNL--KVVQLYE 2222
            .|:.|.:.:|..||..::.|:|||:::..:.|..|...|:.|.  :.....||..:  ||:||||
  Rat  1686 SNLPKFLTDDALLFSGIISDLFPGVQIPEHDYGILHSTIVDVM--ISQNLQPEICMVKKVIQLYE 1748

  Fly  2223 TSLVRHGLMLMGPTGSGKTSCTVCMLRCFTEMGRTH---------KEMRMNPKAITAPQMFGRLD 2278
            |.|||||:||:||||.|||:....:......:.:.:         |...:|||:||..:::|.::
  Rat  1749 TMLVRHGVMLVGPTGGGKTTVYQVLAETLGNLEKLNTGNPFYQPVKTFVLNPKSITMGELYGEVN 1813

  Fly  2279 VATNDWTDGIFSTLWRRSLKVPQHQNCWIVLDGPVDAVWIENLNSVLDDNKTLTLANGDRIKMAD 2343
            ..|.:|.||:.:...|.::......:.||:.||||||:||||:|:||||||.|.|||.:|||:..
  Rat  1814 NVTLEWKDGLMALSVRAAVNDTSEDHKWIISDGPVDALWIENMNTVLDDNKMLCLANSERIKLTP 1878

  Fly  2344 NSKLVFEPDNVDNASPATVSRVGMVFTSSSVLSWKIYMEAWL----LKQGED-SEVFRRCYDVLY 2403
            ...::||..::..||||||||.||||.....|.|..|::.|:    .|..|: .|.....::...
  Rat  1879 QVHMLFEVQDLKVASPATVSRCGMVFVDPEELKWMPYVKTWMSTLSKKLSEEIREYLLNLFNRYV 1943

  Fly  2404 DDAHVFLQSRL--------LAKMRILEAIYIRQMLDIMDGLLLDL-PLRTEKALERIFLFSLMWS 2459
            ||...|:..:.        ::|:..| ...:..:|...||.:|.| .::....:.:.|:|..:||
  Rat  1944 DDGLRFVNKKCTQAIPQVDISKVTTL-CCLLESLLLSKDGNILSLEQMKLNTVVCQTFVFCYLWS 2007

  Fly  2460 LGAVLELSEREKLEEFLLKHVS---KLRWPKRGVNETIFEYYVD-DNGNWQHWSTRVEEFRYPED 2520
            ||..|..:..:..:.|:.....   ..|.|..|   .::..:|| |......|...:..|:|.. 
  Rat  2008 LGGNLTENHWDSFDTFIRTQFDDNPDARLPSSG---DLWSIHVDFDTKRLDPWERIIPTFKYSR- 2068

  Fly  2521 EIPEFSSILVPNVDNVRTAFLLHNIAKQLKQVLLIGEQGTAKTVMIKAYMGHYDPEV-HIFKSFN 2584
            |:| |..:|||..|.||..:|:..:......||..|..|..|:|:.|..:....... ::....|
  Rat  2069 EVP-FFEMLVPTADTVRYGYLMEKLLAVRHSVLFTGTTGVGKSVIAKGLLNRIQESAGYVPVYLN 2132

  Fly  2585 FSSATTPNMYQRIIESYVEKRQGTTYGPPNQRAMTIFIDDINMPVINEWGDQITNEIVRQMIEQR 2649
            ||:.|:....|.||||.:|:::....|.|..:.:.||:||:|||.::.:|.|...|::||..:..
  Rat  2133 FSAQTSSARTQEIIESKLERKRKNILGAPGNKQVVIFVDDLNMPRLDRYGSQPPIELLRQYQDFG 2197

  Fly  2650 GFYSLERPGDFSTIMDIQMLSAMIHPGGGRNDIPNRLKRHLCIFNCTLPSNNSMDQIFKSIGAGY 2714
            |||...:. .:..|.|:.::||...||||||.:..|..||..:....:||.:|:.|||::|..|:
  Rat  2198 GFYDRNKL-FWKEIQDVTIVSACAPPGGGRNPVTPRFIRHFSMLCLPMPSEHSLKQIFQAILNGF 2261

  Fly  2715 FSPDRLGDEVVEVIPLLVPLTRIFWQNVKAKMLPTPANFHYVFNLRDLSRIWEGILKVKHEECKS 2779
            .:.  ..:.|.:....:|......:..:...:|||||..||||||||||:..:|||:......:.
  Rat  2262 LAD--FTEAVKQTSSNIVEAAVEIYNRMSVDLLPTPAKSHYVFNLRDLSKCVQGILQCDPGTIRE 2324

  Fly  2780 VDQILKLWCHECTRVISDRFTAEKDKIWFSSKMISDAELNIKEF-----MEFYPEEPTYWVDFLR 2839
            ..||.:|:||||.||..||....:||.:|.   :...|:..|.|     :|::..:|..:.||::
  Rat  2325 EMQIFRLFCHECQRVFHDRLINNEDKHYFH---VILTEMANKHFGIAIDLEYFLSKPIIFGDFIK 2386

  Fly  2840 DAPEGQEEEDEEMSFEPPKIYEEIPSFDFVRSKVLVFMSQFNEYIRGYNM------DLVFFMDAL 2898
               .|.::.|        :||:::|..:.:.:.:       .:|:..||:      .||||.||:
  Rat  2387 ---FGADKAD--------RIYDDLPDIEKIENVL-------QDYLDDYNLTNPKEVKLVFFQDAI 2433

  Fly  2899 KHLMIVSRIISNPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLSSFIAGYKFFQMTLTRSYNTGNLTEDLKFLYR 2963
            :|:..::|:|...|||||||||||:||||||||::.|.|||..|:.|:|.||..:..|||:.||:
  Rat  2434 EHVSRIARMIRQERGNALLVGVGGTGKQSLTRLAAHICGYKCLQIELSRGYNYDSFHEDLRKLYK 2498

  Fly  2964 TAGLDGNGMTFIFTANEIKEESFLEFINNILSSGEIANLFAKDELDEMYSELIPVMKKHQPRRPA 3028
            .||::...|.|:||..:|..|.|||.|||||:|||:.|||.||||:::.:...| ..|.......
  Rat  2499 MAGVEDKNMVFLFTDTQIVVEEFLEDINNILNSGEVPNLFEKDELEQVLAATRP-KAKEVGISEG 2562

  Fly  3029 TQDNLYDFFISRARYNLHIALCFSPVGEKFRMRSLKFPGLISGCVIDWFQKWPEDARIAVSRHYL 3093
            .:|.::.:||||.|..|||.||.|||||.||.|...||.|::.|.||||.:||.:|.::||:.: 
  Rat  2563 NRDEVFQYFISRVRQKLHIVLCMSPVGEAFRSRCRMFPSLVNCCTIDWFVQWPREALLSVSKSF- 2626

  Fly  3094 TDYQIV--CSEKVKDQVIDIMSWIHESVQETCLSYYDRFRRVTFVTPKSLISFLESYKLLYKDKQ 3156
              :.:|  .:|::|:::..:...:|.||......||...||..:.||.|.:..:..|..:..:|:
  Rat  2627 --FSVVDTGNEELKEKLSLMCVNVHLSVSHMADRYYSELRRRYYTTPTSYLELINLYLTMLTEKR 2689

  Fly  3157 DHIVIMSERMSSGLDKLDEAGASVAILKKDLIEMNKVIALASEEAEDVLATVEQSKAAAEIVKVE 3221
            ..:|...:|:::||.||.|....|..:|.||..:..|:...|::.|.::..:...:.:|:.|:..
  Rat  2690 KQLVSARDRVTNGLTKLLETNILVDKMKLDLSALEPVLFQKSQDVEALMEKLVVDQESADQVRNV 2754

  Fly  3222 VAEKKGQAEVLVKNISAVKHVAEAKLEKALPALEEAEAALKTIKAADIATVRKLGKPPYLITLIM 3286
            |.|.:..|:|..:...|:...|:..||:||||||.|..||.::..|||:.:|...|||.|:..:|
  Rat  2755 VQEDEAIAKVKAEETQAIADDAQRDLEEALPALEAANKALDSLDKADISEIRVFTKPPDLVMTVM 2819

  Fly  3287 DCVCILFRRKVKPIRPDTEKAFIQSSWDESLKVMSDTSFLRKIVEYPTDLINAEMVDMMVPYFQY 3351
            :.:.||...|     ||         |..:.:::.|::|||:::||..:.|..:::..:..|...
  Rat  2820 EAISILLNAK-----PD---------WPTAKQLLGDSNFLRRLLEYDKENIKPQILSKLQRYINN 2870

  Fly  3352 PQYTFEAAKVACGNVAGLLSWTMAMSKYFEVNKEVLPLKANLAVQEAKYQKASSDLQEAEELLQQ 3416
            |.:..|..:........:..|..||..|..|.|||.|.:..|...:|:.....:.|:|.:.||:|
  Rat  2871 PDFVPEKVEKVSKACKSMCMWVRAMDLYSRVVKEVEPKRQKLRAAQAELDATITTLKEKQALLKQ 2935

  Fly  3417 KENELAEVQQTLEDAVSKKDAVLDEAKKCQDKMDAATALIGGLAGEKIRWTEQIASFKSETDRLV 3481
            .|.::..:|:..:..|::|:::.......:.::..|..|...|..|::||.|.|..|:.|...:|
  Rat  2936 VEEQIRALQEEYDKGVNEKESLAKTMALTKARLVRAGKLTAALGDEQVRWEESIEKFQEEIANIV 3000

  Fly  3482 GDVILLTAFLSYTGPFNQEFRSDLQSIWTKQIIEKMIPISANVNIIESLTDRSQIGEWNIQGLPT 3546
            |:|.:..|.::|.|.|..::|..|...|....:...|||..:.::|.:|.|..:|.:||..|||.
  Rat  3001 GNVFIAAACVAYYGAFTAQYRQLLIECWIDSCLALDIPIDPSFSLINTLGDPYEIRQWNADGLPR 3065

  Fly  3547 DELSIQNGIISTKAMRFPLLIDPQSQGKVWIKNKEKQNKVIVTTLNHKYFRNHLEDSVSMGIPII 3611
            |.:|.:|||:.|:..|:||:||||.|...||:|||.::.:.|..|....|...||:|:.:|:|::
  Rat  3066 DLISTENGILVTQGRRWPLMIDPQDQANRWIRNKESKSGLKVIKLTDTNFLRILENSIRLGLPVL 3130

  Fly  3612 IEDVAEELDPCLDNLLDRNLLKVGTQYKIKIGDKEVDWNPAFRCYITTKLPNPAYTPEIFARTSI 3676
            :|::.|.|||.|:.:|.:.....|.:..|::||.::|::.:||.|:|||:|||.|.||:..:.:|
  Rat  3131 LEELREVLDPALEPILLKQTFMSGGRLLIRLGDSDIDYDKSFRFYMTTKMPNPHYLPEVCIKVTI 3195

  Fly  3677 IDFTVTMRGLEDQLLGRVILAERKELEDERVQLVETVTGNMKKMKELEANLLQKLSTTKGSLLDD 3741
            |:||||..|||||||..|:..|:.|||.:||||:..:..:..::|.:|..:|:.|.|::|::||:
  Rat  3196 INFTVTKSGLEDQLLSDVVRLEKPELEGQRVQLIVRINSDKNQLKSIEDKILKLLFTSEGNILDN 3260

  Fly  3742 VTVIEVLNTSKNTAIEVKEKIEIAKVTEAKINAAREEYRVVATRGSVLYFLVCSMARVNNMYQTS 3806
            ..:|:.|..||.|:..:|.:::.|:.||..||.|||.||.|||:|||:||::.|::.::.|||.|
  Rat  3261 EELIDTLQDSKITSGAIKTRLKEAESTELMINIARERYRPVATQGSVMYFVIASLSEIDPMYQYS 3325

  Fly  3807 LVQFLERFDASMYNSSKTHITQKRIKRIINYLTFEIYRYKSRGLYEKDKFLFVLLMALSIDRQLE 3871
            |..|.:.|:.::..|.|:...|:|:..::.......|...||||:|:.|.::..::.:.|.||.|
  Rat  3326 LKYFKQLFNTTIETSEKSDSLQERLAILLQQTLLTAYTNVSRGLFEQHKLIYSFMLCVDIMRQQE 3390

  Fly  3872 LITFDEFQVFIKGGAALNLNDCPPVP-FRWTTDETWLNLVQLTNLTPFVN------ILSKVS--- 3926
            .:|..|:..|::|.|.:. .:.||.| ..|...:.|.:...|....|...      :|..:|   
  Rat  3391 QLTEAEWNFFLRGSAGME-KERPPKPEAPWLPIQMWFSCCDLEEWFPIFEGLTRHILLHPISISL 3454

  Fly  3927 G------NERAWFTWYKKDAPENEIIPDGYNSLDPFRKMLLVRSWCMDRTISQCRKYIANSLGDR 3985
            |      |.::| ..|.|...|.|......::...|.|::||:....::.:.....::..:||.:
  Rat  3455 GSFETYINPQSW-EGYPKQRHEEEKEHVWGSNFSSFHKLILVKCCKEEKVVFALTDFVIENLGKQ 3518

  Fly  3986 FAEPVVLNFEELLLESRELMPMICFLSLGSDPSSNIELLAKKNEL--KCHPISMGQGQEIHARKL 4048
            |.|...::...|..:.....|::..||.||||....:..|:::..  :...||:||||...|.|:
  Rat  3519 FIETPPVDLATLYQDMSSSTPLVFILSTGSDPMGAFQRFARESGYAERVQSISLGQGQGPIAEKM 3583

  Fly  4049 ILSCLEDGGWVLLQNCHLGLEYMVELTVQILELERQGKD--AAVNPNFRIWITTEPHPKFPITLL 4111
            |....:.|.||.||||||.:.:|:.:.    ||.:...|  .::...||:::::.|...||:|:|
  Rat  3584 IKDATKSGNWVFLQNCHLAVSWMLAME----ELIKTFTDPNQSIKDTFRLFLSSMPCSTFPVTVL 3644

  Fly  4112 QMCLKYTNEPPAGIRAGLKRTYTNLSQDFLDYS-QSPFYLPLVYSISFLHTVVQERRKFGPLGWN 4175
            |..:|.|||||.|:||.::|.:|.::..|.:.: ....:..|::.|.|.|.::|||:||||||||
  Rat  3645 QNSVKVTNEPPKGLRANIRRAFTEMTPSFFEENILGMKWRKLIFGICFFHAIIQERKKFGPLGWN 3709

  Fly  4176 IPYEFNSSDWYASCLFVQNHLDDIEQGKGISWVTVRYMLGEVQYGGRVTDDYDKRLLNTFTRVWF 4240
            |.||||.||  ..|..:..:| ...:|| |.|..:.|:.||:.|||||||.:|:|.|.|..:.:|
  Rat  3710 ICYEFNDSD--RECALLNLNL-YCHEGK-IPWDALIYITGEITYGGRVTDTWDQRCLRTVLKRFF 3770

  Fly  4241 HDTLFEDCFQFFKGYKVYSFKEQEAYLAA-----------IDDMANVDPPQVYGFHSNAEITYQT 4294
            .....||         .|::.|...|.|.           |:|:..:|.|:::|.|.||.:.:|.
  Rat  3771 SPETLED---------EYTYSESGIYFAPLADSLQEFKDYIEDLPLIDDPEIFGMHENANLVFQY 3826

  Fly  4295 NTMRNILDEIMSIQPKESSAGTGESREDRVARQVKEMLSKTPLAFDLFDVKQHLIA---MGATSS 4356
            .....::..|:.:||:.||.|.|:|.::.|...|..:.::.|.:..:....:.|..   .|..:|
  Rat  3827 KETNTLITTILEVQPRSSSGGEGKSNDEIVQELVASIRTRVPESLQMEGASETLFVKDPQGRLNS 3891

  Fly  4357 MNIFLRQEIDRMQRIIILVRSIFKDLLLAVEGTIIMSENLRDALDNIFNARVPTVFKRGSWVS-S 4420
            :...|.||:||...::.|:....:.|..|:.|.::|||.:.....:..|.:||:::...::.| .
  Rat  3892 LTTVLGQEVDRFNNLLKLIHISLETLNKAIAGLVVMSEEMEKVYQSFLNNQVPSLWSNTAYPSLK 3956

  Fly  4421 SLGFWFTELLERHTQFYN-WCFGARPVVFWMSGFFNPQGFLTAMRQEVARAHQGWALDQVTMHND 4484
            .||.|..:|:.| |.|.: |....:|..||:||||.||||||...|..||.: ...:|:::...:
  Rat  3957 PLGSWVKDLILR-TAFVDLWLKRGQPKSFWISGFFFPQGFLTGTLQNHARKY-NLPIDELSFKYN 4019

  Fly  4485 VLKVG-------------------PEECKKP-PKEGVFVYGLFVDGAGWDKRTSRLVEATNKVLF 4529
            ::.|.                   |.:.:.| |::||.|:|:|:|.:.||.:...:.:|....:.
  Rat  4020 MIPVYRDQALVIEAAKDIQFGTELPMDKELPTPEDGVLVHGMFMDASRWDDKDMIIEDALPGQMN 4084

  Fly  4530 TLMPVIHI-----YAIFSTAAKNSKLYTCPVYKKINRT--------DLNYICALWLQSNKHPDHW 4581
            .::||:|.     |....|      ||..|:||...|.        ..|::..:.|.|.:..|:|
  Rat  4085 PMLPVVHFEPQQNYEPIQT------LYHSPLYKTGARAGTLSTTGHSTNFVVTVLLPSKRPSDYW 4143

  Fly  4582 TLRGVALLCDV 4592
            ..:|.||||.:
  Rat  4144 IAKGSALLCQL 4154

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
kl-3NP_001104482.3 DHC_N1 266..800 CDD:285571 58/332 (17%)
DHC_N2 1378..1778 CDD:285579 126/419 (30%)
P-loop_NTPase 1914..2145 CDD:304359 132/230 (57%)
P-loop_NTPase 2229..2364 CDD:304359 56/143 (39%)
P-loop_NTPase 2521..2790 CDD:304359 89/269 (33%)
P-loop_NTPase 2889..3151 CDD:304359 116/269 (43%)
MT 3164..3506 CDD:289543 95/341 (28%)
AAA_9 3538..3754 CDD:289547 90/215 (42%)
Dynein_heavy 3900..4582 CDD:281078 213/750 (28%)
Dnah6XP_038964640.1 DHC_N2 887..1307 CDD:400618 127/427 (30%)
DYN1 <1127..3774 CDD:227570 956/2718 (35%)
AAA_6 1441..1767 CDD:403853 173/328 (53%)
Dynein_C 3827..4152 CDD:408026 87/332 (26%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.