DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Myo81F and Myo7b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001303492.1 Gene:Myo81F / 26067052 FlyBaseID:FBgn0267431 Length:2082 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001424233.1 Gene:Myo7b / 498834 RGDID:1561153 Length:2114 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2244 Identity:570/2244 - (25%)
Similarity:974/2244 - (43%) Gaps:391/2244 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 GFADMTEMSEIDEIGINQNLNVRYNSDIIYTYTGSILLAVNPYKTINIFNKQTISEYHTCKLGDL 73
            |..||..:.:::|.|:..||.:||....|||||||||:||||::.:.::..:.:..|::..:|:|
  Rat    66 GVDDMIRLGDLNEAGVVHNLLIRYQQHKIYTYTGSILVAVNPFQMLPLYTLEQVQIYYSRHMGEL 130

  Fly    74 SPHVFAVAEAAYTSIVDDNINQACVISGESGAGKTESTKFILQYLCTITSNVSSWVQQQILEANT 138
            .|||||:|.:.|.::..:..:|.|:|||||||||||:||.|||:|.|: |...||::||:||||.
  Rat   131 PPHVFAIANSCYFNMKKNKRDQCCIISGESGAGKTETTKLILQFLATV-SGQHSWIEQQVLEANP 194

  Fly   139 ILEAFGNAKTTRNDNSSRFGKFMQVCFDDNNCIKGCVILDYLLEQSRITFQSEGERNYHIMYQL- 202
            ||||||||||.||||||||||::.:.|:.:..|:|..|..:|||:||:..|:..||||||.|.: 
  Rat   195 ILEAFGNAKTIRNDNSSRFGKYIDIHFNSSGVIEGASIEHFLLEKSRVCRQAAEERNYHIFYCML 259

  Fly   203 --VAQGQKN-IGIANTFHLRPAEFYKYLNTSNSEKINMNLESKKFDAVTMAFTVLQIPQFVIDGV 264
              ::..:|| :|:.     .|:| |.||...|........::|.:..|..|..:||........:
  Rat   260 MGMSLEEKNMLGLG-----MPSE-YHYLTMGNCTSYEGLSDAKDYAHVRSAMKILQFSDSENWDI 318

  Fly   265 FKVISSILWLGNIEFIDVDGEVTDLTRSD---QEAISIISMLLGLSRCDFKKVLLIRQINVRGNI 326
            .|::::||.|||:.|:....|  :|..||   ..|......||.:.....:..|:...|.:.|..
  Rat   319 SKLLAAILHLGNVGFMAAVFE--NLDSSDVMETPAFPFAMKLLEVQHQALRDCLIKHTIPILGEF 381

  Fly   327 TEIPLKIKEALENRHALAKALYSKMFTWLVSKINNC--TNPGQDD---AKFLGVLDIFGFENFSH 386
            ...||.|.:|.:.|.|..|.:|..:|.|:|.|||..  |...||.   .:.:|:|||||||||.:
  Rat   382 VSRPLNIAQAADRRDAFVKGIYGHLFLWIVKKINAAIFTPQAQDPQNVRRAIGLLDIFGFENFQN 446

  Fly   387 NSFEQLCINYTNEKLHKFFNHYVFALEQSIYEHEGIYFNHVEFTDNTPCLEILEKPPRCVFKLLT 451
            |||||||||:.||.|.:||..:||.:||..|..|.|.:|::.:|||.|.|::|...|..:..||.
  Rat   447 NSFEQLCINFANEHLQQFFVKHVFTMEQEEYLSENITWNYIHYTDNQPILDMLALKPMSIISLLD 511

  Fly   452 EQCHMPQGSDLAFLSNMHTEFESHPNYIKGSDRRHWETEFGIKHYAGLVIYAVGGFVEKNRDVQQ 516
            |:...|||:|:..|..:::...::.::::  .:...:|.|||.|:||.|.|...||:||||||..
  Rat   512 EESRFPQGTDVTMLQKLNSIHANNKSFLR--PKSIHDTRFGIAHFAGDVYYQAEGFLEKNRDVLS 574

  Fly   517 DVMFEYMSYSKDVFIKDL------------STYQDIQFINSSY---PRGSSKSKCTVSDNFRNQL 566
            ..:...:..||:.|:|::            .|...::......   |..|:|...|:|..|:..|
  Rat   575 TDILILIHSSKNKFLKEIFNLDLPQTKLGHGTICQVKTKTGGQIFKPSDSTKRSVTLSSQFKQSL 639

  Fly   567 QSLIDVLQNTKPWYVRCIKPNLQKRPNNYNSSLVLDQLKYLGVVDIIRIRREGFPIHLSHKDFIV 631
            :.|:.:|.|.:|::|||||||..|:|..::..|.:.||:|.|:::.:.||:.||||..:..:|..
  Rat   640 EQLMKILTNCQPYFVRCIKPNEYKKPLLFDRELCIQQLRYSGMMETVHIRKSGFPIRYTFDEFSQ 704

  Fly   632 RYKCLI---KNKSFEYPQKYLTNILEKNGMPT-TEWQIGKSKIFLRNAAYELLETNRKDTLYKNA 692
            |::.|:   :...|:...:.:|:.:....:.| .||::||:||||::....:||..|...|...|
  Rat   705 RFRVLLPSPERVQFQNKHRQMTSRIADLCLGTDKEWKMGKTKIFLKDHQDTMLEIQRSQALDGAA 769

  Fly   693 VIIQKNWKKYYIQKSFLRNKQAVLRIQHAYRGWRLRIRF-------------------MR----M 734
            :.||:..:.:..:|.|||.|:|.:.:|..:||...|..|                   ||    |
  Rat   770 IRIQRVLRGHKYRKEFLRQKRAAVTLQAVWRGHNQRKNFKLILMGFERLQAIARSHLLMRQFQTM 834

  Fly   735 RRSAIVIQSRLRGVFAREVAAALREMKRVDEE----LKKRDGIYEQLTSITTKTLADCERSIQEE 795
            |:..:.:|:|.||...|:...|.|....:.:.    :..|...::|.:|.....||         
  Rat   835 RQKIVQLQARCRGYLVRQQVQAKRRAVVIIQAHARGMVARKSYWQQKSSGPPVILA--------- 890

  Fly   796 LSVLAHISDNIRASAKPLSDKNDSDSNTARSSIKQNTVNLDNMFDFLCESKGAFENALIKEINDN 860
                    ...:.....|..|..|..:|.     .:|..::.:|.||....|..|........  
  Rat   891 --------KEPKGQGVALDRKRKSIYDTV-----TDTAMVEKVFGFLPAMIGGQEGPAPTRFE-- 940

  Fly   861 WNNLVKNLDEEIGLCIHTEDSFDSQKTGKLFTTKTVRTLPEPTVPPPPPPVSISANL--NSEPIY 923
                    |.|:             ||.||      ..:...|||....|......|  .:.|.:
  Rat   941 --------DLEV-------------KTQKL------HEVDLDTVPMTEMPGEDVDGLAEYTFPKF 978

  Fly   924 EAINLYKLTTTKEIKKE-KYMLLDYKSIKDNSKKPSTSSVFVKYQIDERENRRKQRVEKKIHELT 987
            ......|..:...|:|. :|.||.:::..|:|...:...:.:::..|..|.:...|     ..||
  Rat   979 AVTYFQKSASHTHIQKPLRYPLLYHENDTDHSAALAVWIIILRFMGDLPEPQAYGR-----SSLT 1038

  Fly   988 LIDIHKDIHIDNSFYNILEFAENYFNTHDLSSDCNFISTPTQKGKSSDKTAKHEMT---MFSKSD 1049
            ...:.:.||                                      |:..|..:|   ..::|.
  Rat  1039 GSSVMRQIH--------------------------------------DRLDKDSVTQGPQHNRST 1065

  Fly  1050 KIPTSHIHMYDPENVVLSCSMFRELCKYMRGELNAE--RELQIIQYIVGLGIEREELRDEIFIQC 1112
            ::.:..             ::..|:.|: .|.::..  ..|:.:.:|||..|.|..|||||:.|.
  Rat  1066 QVASQQ-------------NIGEEVFKF-DGPISDRPMSNLEKVHFIVGYAIMRPGLRDEIYCQI 1116

  Fly  1113 IRQSRNNPNIDWTDRIWIILCLSIVAFQPSKLLFRYFVSFIKKSMIELDGKLRQYSQWCFDNCKS 1177
            .:|...|.......|.||:|.|.:..|.||:...:|.::||.:..       ..|..:|.:..:.
  Rat  1117 CKQLSENYKTSSRARGWILLSLCLGCFPPSERFMKYLLNFISQGP-------ASYGPFCAERLQR 1174

  Fly  1178 TKVS-TRMYPPSSVEVAAMRRLGTIVCRFFFLDARTKAIDVHPTDTAGDAVQKLAEKLNLTTTDG 1241
            |..: .|..||:.:|:.|::....|..:......|:..|.|....|:.:..|::|:|..|....|
  Rat  1175 TFANGVRAEPPTWLELQAVKSKKHIPIQVILATGRSLTISVDSASTSREICQQIAQKQGLRDKLG 1239

  Fly  1242 W----AIYQ------NRPDGEEHIKSYDYLYDVIS-----SWEMKQATYAGTKKTTNGSSSGENQ 1291
            :    |:|.      |         |.|::.|.::     :||                 .||:|
  Rat  1240 FSLQVAVYDKFWSLGN---------SCDHVMDAVAQCEQLAWE-----------------RGESQ 1278

  Fly  1292 ------FVFKKRLFKSTHELSQDPVEVSMLYSQAVHSVVKKDEFPVSEKVALQLAGLQAQVALGD 1350
                  ..|:|..|...|:..:|||...::|.|.:..|...:.....|:..::|......|.||.
  Rat  1279 RQAPWRIYFRKEFFTPWHDSREDPVSTELIYHQVLRGVWSGEYNFEKEEDLVELLARHCYVQLGA 1343

  Fly  1351 --PSNQPKPEYYSDINSFLPIRISKTREQQFWIPILAQAHRQYGSSRNALT-----------AKV 1402
              .||..:    ..:.|.:|.::.:|:..:.|..::..||.:...:::..|           |::
  Rat  1344 TVKSNAVQ----ELLPSCVPSKLYRTKSPEKWASLVIAAHAKAPYTQSKATPLEVKEQTVEAARL 1404

  Fly  1403 LYLSCVMQYPLYGTTMFKV-NYKGYWNLASNIILGIHYDGIMFINPEDKSVVFQFKYVDIESILL 1466
            |       :||..:.:|:| ...|.....:.:||.|::.|:.|::.:::::: ...:.::..:: 
  Rat  1405 L-------WPLLFSRLFEVTTLSGPRLPKTQLILAINWKGMYFLDQKERTLL-GLSFAEVMGLI- 1460

  Fly  1467 DPSDSFITISLNRSAQLLKTSLYGSSLIESQKCFVFETPQKNDIGSLIISYYPALSNWILNNLEC 1531
                      .||.|...| ||..|:|.|.   :.|.:|....|..::..:...|....:..:..
  Rat  1461 ----------ANRDAPGGK-SLLLSTLHEE---YEFASPSSVAIAEMVALFLAGLKERSVFAMAL 1511

  Fly  1532 SKKYKGT----------------TKEDRLRLYQNVVLCRRH------------LVDMNIVKKPHD 1568
            ..: |.|                ||:..|...:|.||.:..            |..:..|.||  
  Rat  1512 QDR-KATDDVTLLPFKKGDLLILTKKQGLLASENWVLGQNDRTGKTGLVPTACLYTIPSVTKP-- 1573

  Fly  1569 FGGFLRNTL------RRLSKHRLEKLRSEVGSNTQEHGETYKGFSHTF----------------- 1610
             ...|.|.|      |:|:...::.....:.....|...|.:.||:.:                 
  Rat  1574 -SAQLLNLLAMSPEKRKLAAQEVQASEPPLEEQLTELPYTLEEFSYQYFRAPEKETISRAAMPMA 1637

  Fly  1611 ------WAFSKQQI--PFCISTISDQEEA--LMIQVFDSILTYSGLGSSGESISRAEDEHIRIIQ 1665
                  ||:|.:.:  |. :.::.|:.:.  ...|:|.:||.|     :|:..||.....:.:..
  Rat  1638 RSRGHLWAYSPEPLRQPL-LKSVHDKAKLRDSACQIFLAILKY-----TGDYPSRQSWHSLELTD 1696

  Fly  1666 SIMDKCMKKESLLNELYLQLIKQTTDHPDANSRVNLKNWALLSVLCSVILPSMKAVRKYLIAHLK 1730
            .:....:|:.:|.:|||.|::||.|.:....|..  :.|.|| .||:.:.|..||    |:.|.:
  Rat  1697 QMFSLALKEPALQDELYCQILKQLTHNSIRFSEE--RAWQLL-WLCTGLFPPGKA----LLPHAQ 1754

  Fly  1731 RCSSDFLSEEGKYARYAENCFFRTQGTRR---RQWTPSREEI-LCTTNRRPCYSKFYFMDGQYYS 1791
            :    |: :..|....|.:|..|.....|   |:..|...|: ....|....:.:.|..:....:
  Rat  1755 K----FI-DSRKKKPLALDCSRRLHRILRVGPRKQPPHHVEVKAAEQNVSKLHHEVYLPNDTNKT 1814

  Fly  1792 IEFQPSSTANDVLEIIKKKIGLLDNAKGYSIYEVIGNSERSLSSEEKVCDVM---AKWEKYQITS 1853
            :|...||...|:.|.|..::.|. :..|.|::..|.:...||...:...|.:   :.|.|.....
  Rat  1815 LEVSSSSRVRDLCEGIATRLQLA-SWDGCSLFIKITDKVISLKEGDFFFDSLRQVSDWVKKNRPQ 1878

  Fly  1854 QQGFQKNTTLISQQNQYMFLFKKHLFFD----NYINLEDIVEKELLYHQILHNLRSERYPITEME 1914
            ::|  .:|||     .|...|.:.|:.:    ..:|.:.|    |.|||.|.......:..:..:
  Rat  1879 KEG--ASTTL-----PYQVFFMRKLWLNVTPGKDVNADTI----LHYHQELPKYMRGFHKCSRED 1932

  Fly  1915 AIMLTALQSQLERGDCCESITDYRAVASHCLPPRFVPNIPHE----AVAMHHQSLRGMLPIEAKK 1975
            ||.|..|..:::.|.....:.....:....:|......:..|    ::.:.....:.....|||.
  Rat  1933 AIYLAGLIYKIQFGSDRSQMASVSKILKELVPQNLTRLMSSEEWKKSLLLECDKHKNKSVAEAKV 1997

  Fly  1976 AFLNLIKSWPLHRATIFDVMQSFTTNWPRTLWLAIDQKGIHLLEHRSRNVLCTYGYDSIISFSPN 2040
            .||..|..||...:..|:|.|:...::|..|.:||::.|:.|:..:::.:|.|:.:..|.|:|..
  Rat  1998 EFLKRIYRWPTFGSAFFEVKQTSEPSYPDILLIAINRHGLLLIHPKTKELLDTFPFTKISSWSSG 2062

  Fly  2041 LNSLMIFTGTEKKQSKVILTTPQAYQITTLIREY 2074
            .....:..|:..:.|:::..|...|::..|:..|
  Rat  2063 NTYFHMALGSLGQGSRLLCETSLGYKMDDLLTSY 2096

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Myo81FNP_001303492.1 Motor_domain 23..673 CDD:473979 255/680 (38%)
MyTH4 1091..1194 CDD:459939 31/103 (30%)
FERM_F1_DdMyo7_like 1198..1299 CDD:340728 23/121 (19%)
B41 1202..1419 CDD:214604 48/250 (19%)
PH-like 1415..1523 CDD:473070 21/108 (19%)
MyTH4 1664..1771 CDD:459939 29/110 (26%)
FERM_F1_DdMyo7_like 1775..1880 CDD:340728 23/107 (21%)
B41 1781..1992 CDD:214604 45/221 (20%)
PH-like 1988..2076 CDD:473070 20/87 (23%)
Myo7bNP_001424233.1 None

Return to query results.
Submit another query.