DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AUTS2 and Auts2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011514312.1 Gene:AUTS2 / 26053 HGNCID:14262 Length:1266 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_063127358.1 Gene:Auts2 / 304419 RGDID:2323959 Length:1268 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1269 Identity:1181/1269 - (93%)
Similarity:1213/1269 - (95%) Gaps:4/1269 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MDGPTRGHGLRKKRRSRSQRDRERRSRGGLGAGAAGGGGAGRTRALSLASSSGSDKEDNGKPPSS 65
            |||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|.|||||.|||||||||||||||||||
  Rat     1 MDGPTRGHGLRKKRRSRSQRDRERRSRAGLGTGAAGGIGTGRTRAPSLASSSGSDKEDNGKPPSS 65

Human    66 APSRPRPPRRKRRESTSAEEDIIDGFAMTSFVTFEALEKDVALKPQERVEKRQTPLTKKKREALT 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||
  Rat    66 APSRPRPPRRKRRESTSAEEDIIDGFAMTSFVTFEALEKDVAVKPQERVEKRQNPLTKKKREALT 130

Human   131 NGLSFHSKKSRLSHPHHYSSDRENDRNLCQHLGKRKKMPKALRQLKPGQNSCRDSDSESASGESK 195
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.:|||||||||||||||||||||||
  Rat   131 NGLSFHSKKSRLSHSHHYSSDRENDRNLCQHLGKRKKMPKGVRQLKPGQNSCRDSDSESASGESK 195

Human   196 GFHRSSSRERLSDSSAPSSLGTGYFCDSDSDQEEKASDASSEKLFNTVIVNKDPELGVGTLPEHD 260
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||.|||| 
  Rat   196 GFQRSSSRERLSDSSAPSSLGTGYFCDSDSDQEEKASDASSEKLFNTVLVNKDPELGVGALPEH- 259

Human   261 SQDAGPIVPKISGLERSQEKSQDCCKEPIFEPVVLKDPCPQVAQPIPQPQTEPQLRAPSPDPDLV 325
            :|||||||||||||||||||||||||||:|||||||||.||:.|...|||.||||:.|||||:||
  Rat   260 NQDAGPIVPKISGLERSQEKSQDCCKEPVFEPVVLKDPHPQLPQLPSQPQAEPQLQIPSPDPNLV 324

Human   326 QRTEAPPQPPPLSTQPPQGPPEAQLQPAPQPQVQRPPRPQSPTQLLHQNLPPVQAHPSAQSLSQP 390
            .|||||||.||.||||..|||||||||||.||||||||||||:.||.|.|||||:||.:||||||
  Rat   325 PRTEAPPQFPPPSTQPAPGPPEAQLQPAPLPQVQRPPRPQSPSHLLQQTLPPVQSHPPSQSLSQP 389

Human   391 LSAYNSSSLSLNSLSSSRSSTPAKTQPAPPHISHHPSASPFPLSLPNHSPLHSFTPTLQPPAHSH 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   390 LSAYNSSSLSLNSLSSSRSSTPAKTQPAPPHISHHPSASPFPLSLPNHSPLHSFTPTLQPPAHSQ 454

Human   456 HPNMFAPPTALPPPPPLTSGSLQVAGHPAGSTYSEQDILRQELNTRFLASQSADRGASLGPPPYL 520
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   455 HPNMFAPPTALPPPPPLTSGSLQVPGHPAGSTYSEQDILRQELNTRFLASQSADRGASLGPPPYL 519

Human   521 RTEFHQHQHQHQHTHQHTHQHTFTPFPHAIPPTAIMPTPAPPMVRTPGRNFDKYPTKVDPFYRHS 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   520 RTEFHQHQHQHQHTHQHTHQHTFTPFPHAIPPTAIMPTPAPPMVRTPGRNFDKYPTKVDPFYRHS 584

Human   586 LFHSYPPAVSGIPPMIPPTGPFGSLQGAFQPKTSNPIDVAARPGTVPHTLLQKDPRLTDPFRPML 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   585 LFHSYPPAVSGIPPMIPPTGPFGSLQGAFQPKTSNPIDVAARPGTVPHTLLQKDPRLTDPFRPML 649

Human   651 RKPGKWCAMHVHIAWQIYHHQQKVKKQMQSDPHKLDFGLKPEFLSRPPGPSLFGAIHHPHDLARP 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   650 RKPGKWCAMHVHIAWQIYHHQQKVKKQMQSDPHKLDFGLKPEFLSRPPGPSLFGAIHHPHDLARP 714

Human   716 STLFSAAGAAHPTGTPFGPPPHHSNFLNPAAHLEPFNRPSTFTGLAAVGGNAFGGLGNPSVTPNS 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   715 STLFSAAGAAHPTGTPFGPPPHHSNFLNPAAHLEPFNRPSTFTGLAAVGGNAFGGLGNPSVTPNS 779

Human   781 MFGHKDGPSVQNFSNPHEPWNRLHRTPPSFPTPPPWLKPGELERSASAAAHDRDRDVDKRDSSVS 845
            :|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   780 VFGHKDSPSVQNFSNPHEPWNRLHRTPPSFPTPPPWLKPGELERSASAAAHDRDRDVDKRDSSVS 844

Human   846 KDDKERESVEKRHSSHPSPAPVLPVNALGHTRSSTE-QIRAHLNTEAREKDKPKERERDHSESRK 909
            |||||||||||||.|||||||.:||:||||.||||: ..|.||||||||||||||||||||.|||
  Rat   845 KDDKERESVEKRHPSHPSPAPPVPVSALGHNRSSTDPTTRGHLNTEAREKDKPKERERDHSGSRK 909

Human   910 DLAADEHKAKEGHLPEKDGHGHEGRAAGEEAKQLARVPSPYVRTPVVESARPNSTSSREAEPRKG 974
            ||..:|||||||||||:|||.|||||||||.|||:||||||||||.|:|.|||||||||||||||
  Rat   910 DLTTEEHKAKEGHLPERDGHSHEGRAAGEEPKQLSRVPSPYVRTPGVDSTRPNSTSSREAEPRKG 974

Human   975 EPAYENPKKSSEVKVKEERKEDHDLPPEAPQTHRASEPPPPNS--SSSVHPGPLASMPMTVGVTG 1037
            |||||||||::|||||||||||||||.||||.||.||.|||:|  |:||||||||||||||||||
  Rat   975 EPAYENPKKNAEVKVKEERKEDHDLPTEAPQAHRTSEAPPPSSSASASVHPGPLASMPMTVGVTG 1039

Human  1038 IHPMNSISSLDRTRMMTPFMGISPLPGGERFPYPSFHWDPIRDPLRDPYRELDIHRRDPLGRDFL 1102
            ||.||||.|||||||||||||:||:|||||||||||||||:|||||||||:||:|||||||||||
  Rat  1040 IHAMNSIGSLDRTRMMTPFMGLSPIPGGERFPYPSFHWDPMRDPLRDPYRDLDMHRRDPLGRDFL 1104

Human  1103 LRNDPLHRLSTPRLYEADRSFRDREPHDYSHHHHHHHHPLSVDPRREHERGGHLDERERLHMLRE 1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:|||
  Rat  1105 LRNDPLHRLSTPRLYEADRSFRDREPHDYSHHHHHHHHPLAVDPRREHERGGHLDERERLHVLRE 1169

Human  1168 DYEHTRLHSVHPASLDGHLPHPSLITPGLPSMHYPRISPTAGNQNGLLNKTPPTAALSAPPPLIS 1232
            ||||.|||.|||||||||||||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat  1170 DYEHPRLHPVHPASLDGHLPHPSLLTPGLPSMHYPRISPTAGHQNGLLNKTPPTAALSAPPPLIS 1234

Human  1233 TLGGRPVSPRRTTPLSAEIRERPPSHTLKDIEAR 1266
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1235 TLGGRPGSPRRTTPLSAEIRERPPSHTLKDIEAR 1268

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AUTS2XP_011514312.1 PHA03247 <298..456 CDD:223021 134/157 (85%)
Auts2 652..864 CDD:464656 208/211 (99%)
PTZ00121 <846..>1009 CDD:173412 138/163 (85%)
Auts2XP_063127358.1 None

Return to query results.
Submit another query.