DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AUTS2 and auts2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011514312.1 Gene:AUTS2 / 26053 HGNCID:14262 Length:1266 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031752079.1 Gene:auts2 / 100498056 XenbaseID:XB-GENE-987496 Length:1045 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1052 Identity:792/1052 - (75%)
Similarity:876/1052 - (83%) Gaps:44/1052 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human   230 KASDASSEKLFNTVIVNKDPELGVGTLPEHDSQDA-GPIVPKISGLERSQEKSQDCCKEPIFEPV 293
            :.|||||||||:| |.|.|.||||..|....|::| |.:|||:||||||||||||..||...:.:
 Frog    23 QVSDASSEKLFHT-ISNNDTELGVRLLTTRGSKNATGQVVPKVSGLERSQEKSQDSDKELQLDVL 86

Human   294 VLKDP-CPQVAQPIPQPQTEPQLRAPSPDPDLVQRTEAPPQPP---PLSTQPPQGP--PEAQLQP 352
            |.||| .|.:  |:.....|.:....||.|.|...||.|.|..   |..|...:.|  |:|.:|.
 Frog    87 VSKDPILPSL--PVVHADLESRPILVSPGPTLDSCTEIPLQTQSEFPHVTLDHEAPSQPQAPVQK 149

Human   353 APQPQV--QRPPRPQSPTQLLHQNLPPVQAHPSAQSLSQPLSAYNSSSLSLNSLSSSRSSTPAKT 415
            ||:||:  |.|..|..||         ||..|.:|:|.|.|.:|||||||:|||||||||||||:
 Frog   150 APKPQLLSQTPVLPSPPT---------VQQRPPSQNLPQSLCSYNSSSLSVNSLSSSRSSTPAKS 205

Human   416 QPAPPHISHHPSASPFPLSLPNHSPLHSFTPTLQPPAHSHHPNMFAPPTALPPPPPLTSGSLQVA 480
            |....|:.||||.||:|||||:|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||:|||.
 Frog   206 QATSSHLGHHPSTSPYPLSLPSHSPLHRFTPTLQPPAHQHHPNMFAPPTALPPPPPLTSGTLQVP 270

Human   481 GHPAGSTYSEQDILRQELNTRFLASQSADRGASLGPPPYLRTEF--HQHQHQHQHTHQHTHQHTF 543
            ||||.|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
 Frog   271 GHPANSTYSEQDLLRQELNTRFLASQSADRGASLGPPPYLRTEFHQHQHQHQHQHTHQHTHQHTF 335

Human   544 TPFPHAIPPTAIMPTPAPPMVRTPGRNFDKYPTKVDPFYRHSLFHSYPPAVSGIPPMIPPTGPFG 608
            ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   336 TPFPHAIPPTAIMPTPAPPM-------FDKYPTKVDPFYRHSLFHSYPPAVSGIPPMIPPTGPFG 393

Human   609 SLQGAFQPKTSNPIDVAARPGTVPHTLLQKDPRLTDPFRPMLRKPGKWCAMHVHIAWQIYHHQQK 673
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   394 SLQGAFQPKTSNPIDVAGRPGTVPHTLLQKDPRLTDPFRPMLRKPGKWCAMHVHIAWQIYHHQQK 458

Human   674 VKKQMQSDPHKLDFGLKPEFLSRPPGPSLFGAIH---HPHDLARPSTLFSAAGAAHPTGTPFGPP 735
            ||||||:|||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||..||...|||||
 Frog   459 VKKQMQTDPHKLDFGLKPEFLSRPPGPSLFGAIHPHPHPHDLARPSTLFSAAGGTHPAAAPFGPP 523

Human   736 PHHSNFLNPAAHLEPFNRPSTFTGLAAVGGNAFGGLGNPSVTPNSMFGHKDGPSVQNFSNPHEPW 800
            |||||||||:||||.|||||||:|||||||:|||||||||||.||||.||:||::|:|:||||||
 Frog   524 PHHSNFLNPSAHLEQFNRPSTFSGLAAVGGSAFGGLGNPSVTSNSMFSHKEGPNMQSFNNPHEPW 588

Human   801 NRLHRTPPSFPTPPPWLKPGELERSASAAAHDRDRDVDKRDSSVSKDDKERESVEKRHSSHPSPA 865
            |||||||||||||||||||||.|||:|.|:|  :||.|||::: :|||||||:||||||||||||
 Frog   589 NRLHRTPPSFPTPPPWLKPGESERSSSVASH--ERDADKRETA-TKDDKERENVEKRHSSHPSPA 650

Human   866 PVLPVNALGHTRSSTEQIRAHLNTEAREKDKPKERERDHSESRKDLAADEHKAKEGHLPEKDGHG 930
            |:..||:.||.||.:||.|.:||.:.|||:|||||||:||:|.|:.:.:|||.|:.|:.|||...
 Frog   651 PINQVNSTGHNRSLSEQNRNNLNNDVREKEKPKEREREHSDSWKEASIEEHKTKDNHILEKDNLV 715

Human   931 HEGRAAGEEAKQLARVPSPYVRTPVVESARPNSTSSREAEPRKGEPAYENPKKSSEVKVKEERKE 995
            ||.|.. :|||||.||||||||.|.:|:.||||.|:||.| ||.| .|:|.|||::|||||||||
 Frog   716 HESRTI-DEAKQLNRVPSPYVRPPTMENTRPNSNSNRETE-RKTE-TYDNQKKSNDVKVKEERKE 777

Human   996 DHDL-PPEAPQTHRASEPPPPNSSSSVHPGPLASMPMTVGVTGIHPMNSISSLDRTRMMTPFMGI 1059
            :||: .|:..|.||.||.|||.|:|:|||..|||:||.:||.|:||||||..|||||||||||||
 Frog   778 EHDIVVPDGSQIHRTSEQPPPISTSNVHPSHLASLPMAMGVAGMHPMNSIGGLDRTRMMTPFMGI 842

Human  1060 SPLPGGERFPYPSFHWDPIRDPLRDPYRELDIHRRDPLGRDFLLRNDPLHRLSTPRLYEADRSFR 1124
            ||:|||||||||||||||:|||||||||.|||||||||||||||||||||||:.||||||:||||
 Frog   843 SPIPGGERFPYPSFHWDPMRDPLRDPYRGLDIHRRDPLGRDFLLRNDPLHRLTAPRLYEAERSFR 907

Human  1125 DREPHDYSHHHHHHHHPLSVDPRREHERGGHLDERERLHMLREDYEHTRLHSVHPASLDGHLPHP 1189
            |||||||:|||||    |:|||||||||..||:||||||||||||||.|||:||||:||||||||
 Frog   908 DREPHDYNHHHHH----LAVDPRREHERVSHLEERERLHMLREDYEHARLHAVHPAALDGHLPHP 968

Human  1190 SLITPGLPSMHYPRISPTAGNQNGLLNKTPPTAALSAPPPLISTLGGRPVSPRRTTPLSAEIRER 1254
            ||||||||||||.|:|||.|:|||:||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||:|
 Frog   969 SLITPGLPSMHYARVSPTTGHQNGILNKTPPTAALSAPPPLISTLGGRPGSPRRTTPLSTEIRDR 1033

Human  1255 PPSHTLKDIEAR 1266
            ||||||||||||
 Frog  1034 PPSHTLKDIEAR 1045

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AUTS2XP_011514312.1 PHA03247 <298..456 CDD:223021 82/165 (50%)
Auts2 652..864 CDD:464656 180/214 (84%)
PTZ00121 <846..>1009 CDD:173412 101/163 (62%)
auts2XP_031752079.1 Auts2 437..649 CDD:464656 180/214 (84%)

Return to query results.
Submit another query.