DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CNTNAP2 and cntnap2a

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_054860.1 Gene:CNTNAP2 / 26047 HGNCID:13830 Length:1331 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_009295628.1 Gene:cntnap2a / 559157 ZFINID:ZDB-GENE-120328-3 Length:1326 Species:Danio rerio


Alignment Length:1342 Identity:942/1342 - (70%)
Similarity:1105/1342 - (82%) Gaps:33/1342 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     5 PRAGCGAALLLWIVSSCLCRAWTAPSTSQKCDEPLVSGLPHVAFSSSSSISGSYSPGYAKINKRG 69
            |.||.|..|||||:|........:|| ||||||.||:.|.|.||:|||..:.||.|||||:||||
Zfish     3 PPAGIGLKLLLWILSHISISQAASPS-SQKCDEALVTQLLHNAFTSSSVFASSYVPGYAKLNKRG 66

Human    70 GAGGWSPSDSDHYQWLQVDFGNRKQISAIATQGRYSSSDWVTQYRMLYSDTGRNWKPYHQDGNIW 134
            |||||||.|||||||||||.|:|||::|:|||||||||||.|:||:|||||||||||||||||||
Zfish    67 GAGGWSPLDSDHYQWLQVDLGSRKQVTAVATQGRYSSSDWTTRYRLLYSDTGRNWKPYHQDGNIW 131

Human   135 AFPGNINSDGVVRHELQHPIIARYVRIVPLDWNGEGRIGLRIEVYGCSYWADVINFDGHVVLPYR 199
            ||.||.|::.||||:||:|::|||:||:||||:.|||||||.|:|||.||||||||||..|:.||
Zfish   132 AFAGNSNTESVVRHDLQNPVVARYLRIIPLDWSEEGRIGLRFEIYGCPYWADVINFDGQGVISYR 196

Human   200 FRNKKMKTLKDVIALNFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLELKKAKLVLSLNLGSNQLGPIYGHTS 264
            |:.||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||::.:|:|.:||||||.|.|.||||
Zfish   197 FKMKKMKILKDVIALKFKTSESEGVILHGEGQQGDYITLELRRGRLLLQINLGSNQHGSILGHTS 261

Human   265 VMTGSLLDDHHWHSVVIERQGRSINLTLDRSMQHFRTNGEFDYLDLDYEITFGGIPFSGKPSSSS 329
            |.:||||||||||||||||..|::|.|||:..||||||||||:||||||:||||:|:||||....
Zfish   262 VTSGSLLDDHHWHSVVIERYRRNVNFTLDQHTQHFRTNGEFDHLDLDYELTFGGMPYSGKPVIGG 326

Human   330 RKNFKGCMESINYNGVNITDLARRKKLEPSNVGNLSFSCVEPYTVPVFFNATSYLEVPGRLNQDL 394
            |:|||||||||||||.|||||||||||:.|:..||:||||:.:|.|||||.||:|::|||.:.::
Zfish   327 RRNFKGCMESINYNGENITDLARRKKLDTSSFRNLTFSCVDTHTFPVFFNGTSFLQLPGRRDHNM 391

Human   395 FSVSFQFRTWNPNGLLVFSHFADNLGNVEIDLTESKVGVHINITQTKMSQIDISSGSGLNDGQWH 459
            .||.||||:|||:|||:||..||  |.:|:.|.:.||..|||:||.|..::||:||||||||:||
Zfish   392 VSVGFQFRSWNPSGLLLFSSLAD--GMLELALNDGKVTAHINVTQQKNMRVDIASGSGLNDGEWH 454

Human   460 EVRFLAKENFAILTIDGDEASAVRTNSPLQVKTGEKYFFGGFLNQMNNSSHSVLQPSFQGCMQLI 524
            :||||||||||:||||||||||||||||:.:.||..|.|||:..:   :..|.:|.|||||||||
Zfish   455 DVRFLAKENFAMLTIDGDEASAVRTNSPVLITTGSTYHFGGYFLR---TRASPIQRSFQGCMQLI 516

Human   525 QVDDQLVNLYEVAQRKPGSFANVSIDMCAIIDRCVPNHCEHGGKCSQTWDSFKCTCDETGYSGAT 589
            ||||||.:|..|.|.:.|:|.|||:|||||||||:||||||||:||||||||.||||.|||:|||
Zfish   517 QVDDQLADLTAVEQGRIGAFENVSLDMCAIIDRCMPNHCEHGGRCSQTWDSFTCTCDGTGYTGAT 581

Human   590 CHNSIYEPSCEAYKHLGQTSNYYWIDPDGSGPLGPLKVYCNMTEDKVWTIVSHDLQMQTPVVGYN 654
            ||.|:||.|||||||||::|:.|||||||||||||.||.||||||||||.|.::|..||.|.|.:
Zfish   582 CHTSVYEQSCEAYKHLGRSSDAYWIDPDGSGPLGPFKVICNMTEDKVWTTVVNNLPAQTAVTGSS 646

Human   655 PEKYSVTQLVYSASMDQISAITDSAEYCEQYVSYFCKMSRLLNTPDGSPYTWWVGKANEKHYYWG 719
            .|:.:|.||.|||||:|::|||:|||:|||:|||.|:||||||||||:|||||||:.||||:|||
Zfish   647 RERRTVLQLNYSASMEQVTAITNSAEHCEQHVSYACRMSRLLNTPDGTPYTWWVGRGNEKHFYWG 711

Human   720 GSGPGIQKCACGIERNCTDPKYYCNCDADYKQWRKDAGFLSYKDHLPVSQVVVGDTDRQGSEAKL 784
            ||.||||||||||||||:|.|||||||||.||||.|:|.|.||||||||||.||||:|.||||||
Zfish   712 GSAPGIQKCACGIERNCSDSKYYCNCDADQKQWRDDSGLLVYKDHLPVSQVAVGDTNRPGSEAKL 776

Human   785 SVGPLRCQGDRNYWNAASFPNPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTLTPWGVFLENMGKEDFIKLE 849
            :||||||.|||:|||||||..||||||||||||||||||||||||..|:||||||:|..|||:||
Zfish   777 TVGPLRCHGDRSYWNAASFNTPSSYLHFSTFQGETSADISFYFKTSAPYGVFLENLGNTDFIRLE 841

Human   850 LKSATEVSFSFDVGNGPVEIVVRSPTPLNDDQWHRVTAERNVKQASLQVDRLPQQIRKAPTEGHT 914
            |||...|||||||||||||:.|.|||||||||||||:||||.|:|.||:|:..::||.|||:|||
Zfish   842 LKSPMVVSFSFDVGNGPVELNVHSPTPLNDDQWHRVSAERNTKEAILQLDQKYKEIRPAPTQGHT 906

Human   915 RLELYSQLFVG----------GAGGQQGFLGCIRSLRMNGVTLDLEERAKVTSGFISGCSGHCTS 969
            ||||||||:||          .||||:|||||||||:|||||||||||||||.|...||||||||
Zfish   907 RLELYSQLYVGKPALWACQDSAAGGQRGFLGCIRSLKMNGVTLDLEERAKVTPGVKPGCSGHCTS 971

Human   970 YGTNCENGGKCLERYHGYSCDCSNTAYDGTFCNKDVGAFFEEGMWLRYNFQAP----ATNARDSS 1030
            :|..|.|||||:|:|:||||||:.|||||.||:||||.|||.|..::||. .|    |.::.|..
Zfish   972 FGMYCRNGGKCVEKYNGYSCDCTTTAYDGPFCSKDVGGFFEAGTLVKYNL-VPEVLAAASSLDEK 1035

Human  1031 SRVDNAPDQQNSHPDLAQEEIRFSFSTTKAPCILLYISSFTTDFLAVLVKPTGSLQIRYNLGGTR 1095
            |.:.|.|.:.|    |..|::.|||||:.:|.:|:|:||.|.|::||:::..|:||:||:|||.|
Zfish  1036 SIIHNLPVETN----LTHEDLTFSFSTSTSPSLLVYVSSKTQDYMAVVLRHNGTLQLRYSLGGLR 1096

Human  1096 EPYNIDVDHRNMANGQPHSVNITRHEKTIFLKLDHYPSVSYHLPSSSDTLFNSPKSLFLGKVIET 1160
            ||:.||:|.||:||||||:|||:|.|:.|.::|||||:|:|.||.:|||.|...||||||||.||
Zfish  1097 EPFTIDIDQRNLANGQPHTVNISRVERDIEVQLDHYPAVTYSLPEASDTQFTLVKSLFLGKVFET 1161

Human  1161 GKIDQE-IHKYNTPGFTGCLSRVQFNQIAPLKAALRQTNASAHVHIQGELVESNCGASPLTLSPM 1224
            |.||.. |.|||||||.|||||||||.||||||||| :..|..|..||:||||||||||||:.||
Zfish  1162 GYIDPVLIEKYNTPGFVGCLSRVQFNSIAPLKAALR-SRGSVSVSHQGKLVESNCGASPLTIPPM 1225

Human  1225 SSATDPWHLDHLDSASADFPYNPGQGQAIRNGVNRNSAIIGGVIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRH 1289
            |:||||||||    |.||||:|  :.:.|.:|||||||||||:||||||||||||||||||||||
Zfish  1226 SAATDPWHLD----AGADFPFN--EERVIPDGVNRNSAIIGGIIAVVIFTILCTLVFLIRYMFRH 1284

Human  1290 KGTYHTNEAKGAESAESADAAIMNNDPNFTETIDESKKEWLI 1331
            |||||||||||.||:|||||||:..:.|||||||||||||.|
Zfish  1285 KGTYHTNEAKGGESSESADAAIIGTEANFTETIDESKKEWFI 1326

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CNTNAP2NP_054860.1 FA58C <70..180 CDD:238014 85/109 (78%)
Laminin_G_2 216..345 CDD:460494 99/128 (77%)
LamG 375..527 CDD:238058 94/151 (62%)
EGF_CA 555..590 CDD:238011 29/34 (85%)
GGGWT_bact 598..634 CDD:468872 29/35 (83%)
LamG 800..943 CDD:238058 111/152 (73%)
EGF 967..>992 CDD:394967 17/24 (71%)
Laminin_G_2 1055..1187 CDD:460494 83/132 (63%)
4.1m 1282..1300 CDD:128590 17/17 (100%)
cntnap2aXP_009295628.1 FA58C 46..177 CDD:238014 99/130 (76%)
Laminin_G_2 213..342 CDD:460494 99/128 (77%)
LamG 372..519 CDD:238058 94/151 (62%)
EGF_CA 547..582 CDD:238011 29/34 (85%)
GGGWT_bact 590..626 CDD:468872 29/35 (83%)
LamG 792..945 CDD:238058 111/152 (73%)
EGF_CA 969..1003 CDD:238011 23/33 (70%)
Laminin_G_2 1064..1189 CDD:460494 79/124 (64%)
4.1m 1277..1295 CDD:128590 17/17 (100%)

Return to query results.
Submit another query.